| Definition | Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007799 |
| Length | 1,176,248 |
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The map label for this gene is fbpB2 [H]
Identifier: 88658658
GI number: 88658658
Start: 995355
End: 996920
Strand: Reverse
Name: fbpB2 [H]
Synonym: ECH_0972
Alternate gene names: 88658658
Gene position: 996920-995355 (Counterclockwise)
Preceding gene: 88657906
Following gene: 88657754
Centisome position: 84.75
GC content: 29.31
Gene sequence:
>1566_bases ATGTTTATAGCACCAATATTTTCATTGGTTTCTATTATATTTACTGAGAATAAGACGATGGATTTACTAACATCTGTTTT ACCTGAATATGCTTTTAATACTATTATTTTGATGTTAGGAGTAGGAATAATAGCACTTATTATTGGGGTATCAACAGCTT GGTTTGTAACTTATTATTCATTTTTTGGACGTAAATTTTTTGAAATAGCTCTTTTTTTACCGCTTTCAATACCAGGATAT ATAGTTGCATATGTTTATGTAAATATTTTTGAGTTTTCAGGTCCTTTACAGGTTTTTTTACGAGAGACCTTTCATTGGAG TAAAGGTGATTATTATTTCCCTAGTATTAAATCTTTGGAATGGGGAATTATTATTATAGGATTTAATCTATATCCTTATG TATATATGTTAGTTAGAACAGGTCTAATAGCTATTCGTAGTACTGTTGCAGTTGCTACTACGTTATGTTCTTCTAGGTAT AAAATTTTAACTTCTATTGCTTTACCTGTAGTACGTCCAGCTATTGCTGTTAGTGTATCATTTGTATTAATGGAAGTAAT ATCTGATTTTGGTACACCACAGTTTCTTGCAATCGATACTTTTACTAGAGGAATATATAGAAATTGGTTTTTATTGCATG ATAAGTATTCTGCTTGTTTATTTGCTTTTATTGCATTGTTTTTTATATTTTTGCTTATCATATTGGAAAAATTATTTCGT GGGAAAGGTATATCGTATTCAACAATAAAGATGAATACGGAATATTATCATACTTGGCAAGTTAAGAGTAAGTTGAAACT TATACTAATATATTGTGTGTGTTTATTGCCAGTGTTAATAGGATTTGTAATACCTGTAGTTCCTTTATTATATTGGACTG TTCAAAAAATAGGAACATTGGCACTTAATAATCGATTTTATATGTCTGTATTCAATAGTGTTAGTATAGCATTTATAACA GCTGTTATTGCTATTGTGATATCAATTGTTATGTCGTATATCATCAGAAAAAGGGAATCGTTGTCTTATGCAATAAAATT TATTGTGATGGGTTATGCTATTCCCAATACCATTGTTGCTGTCAGTGTTATGGTATTACTTGGAAATATATCGCATTTTG TGAACTCATATTTTTCATTTGCTCTGATTGGGACAACATTTGGGTTAATATATGCTTATGTTTTTAGATTTCTTGCTGTA TCTTTAGGTCCTATAGAATCTGGATTAAATAAAATTCCGAAAGAAATAGATTGGTCGTCTTTATTGATGGGGCATAGTAT AGTTTCTACATGTTTTAATGTTCATATTCCGATGATTAAAAAGAGTATACTAGTTGGATTTTTATTGGTATTTGTTGATG TGATAAAAGAACTTGCAGCAACATTAATTATTAGGCCTTTTAACTTTGATACTATGGCTACCAGGATGTATGAGCTTATC AGTGATGAAAGATATACTGATGCAGCTCCATATGCTCTAGTTATAGTGCTTATTGGACTGATATCAGTAGTTATATTATG TAGAATGTTTCAATATGATAAGTCTAAATATAAAATCATGTTGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTATGTATAATAAACATAGGACTGGGTAGTAATTAATTCTCAAATATAGTGTCGTTTGCAAACCTTTCGAAGAACGTTT TTCTCTGTATATTAGTTGGC
Downstream 100 bases:
>100_bases ATAGTATTTAATGGTTTATTGTGATATGGTTTAATATTATCTTAGATATATAATTGTCTGGCAGATGTAAATTCTGATTG TGGAGGATGCTTGTGTAAGT
Product: ABC transporter, permease protein
Products: NA
Alternate protein names: Iron(III)-transport system permease protein fbpB 2 [H]
Number of amino acids: Translated: 521; Mature: 521
Protein sequence:
>521_residues MFIAPIFSLVSIIFTENKTMDLLTSVLPEYAFNTIILMLGVGIIALIIGVSTAWFVTYYSFFGRKFFEIALFLPLSIPGY IVAYVYVNIFEFSGPLQVFLRETFHWSKGDYYFPSIKSLEWGIIIIGFNLYPYVYMLVRTGLIAIRSTVAVATTLCSSRY KILTSIALPVVRPAIAVSVSFVLMEVISDFGTPQFLAIDTFTRGIYRNWFLLHDKYSACLFAFIALFFIFLLIILEKLFR GKGISYSTIKMNTEYYHTWQVKSKLKLILIYCVCLLPVLIGFVIPVVPLLYWTVQKIGTLALNNRFYMSVFNSVSIAFIT AVIAIVISIVMSYIIRKRESLSYAIKFIVMGYAIPNTIVAVSVMVLLGNISHFVNSYFSFALIGTTFGLIYAYVFRFLAV SLGPIESGLNKIPKEIDWSSLLMGHSIVSTCFNVHIPMIKKSILVGFLLVFVDVIKELAATLIIRPFNFDTMATRMYELI SDERYTDAAPYALVIVLIGLISVVILCRMFQYDKSKYKIML
Sequences:
>Translated_521_residues MFIAPIFSLVSIIFTENKTMDLLTSVLPEYAFNTIILMLGVGIIALIIGVSTAWFVTYYSFFGRKFFEIALFLPLSIPGY IVAYVYVNIFEFSGPLQVFLRETFHWSKGDYYFPSIKSLEWGIIIIGFNLYPYVYMLVRTGLIAIRSTVAVATTLCSSRY KILTSIALPVVRPAIAVSVSFVLMEVISDFGTPQFLAIDTFTRGIYRNWFLLHDKYSACLFAFIALFFIFLLIILEKLFR GKGISYSTIKMNTEYYHTWQVKSKLKLILIYCVCLLPVLIGFVIPVVPLLYWTVQKIGTLALNNRFYMSVFNSVSIAFIT AVIAIVISIVMSYIIRKRESLSYAIKFIVMGYAIPNTIVAVSVMVLLGNISHFVNSYFSFALIGTTFGLIYAYVFRFLAV SLGPIESGLNKIPKEIDWSSLLMGHSIVSTCFNVHIPMIKKSILVGFLLVFVDVIKELAATLIIRPFNFDTMATRMYELI SDERYTDAAPYALVIVLIGLISVVILCRMFQYDKSKYKIML >Mature_521_residues MFIAPIFSLVSIIFTENKTMDLLTSVLPEYAFNTIILMLGVGIIALIIGVSTAWFVTYYSFFGRKFFEIALFLPLSIPGY IVAYVYVNIFEFSGPLQVFLRETFHWSKGDYYFPSIKSLEWGIIIIGFNLYPYVYMLVRTGLIAIRSTVAVATTLCSSRY KILTSIALPVVRPAIAVSVSFVLMEVISDFGTPQFLAIDTFTRGIYRNWFLLHDKYSACLFAFIALFFIFLLIILEKLFR GKGISYSTIKMNTEYYHTWQVKSKLKLILIYCVCLLPVLIGFVIPVVPLLYWTVQKIGTLALNNRFYMSVFNSVSIAFIT AVIAIVISIVMSYIIRKRESLSYAIKFIVMGYAIPNTIVAVSVMVLLGNISHFVNSYFSFALIGTTFGLIYAYVFRFLAV SLGPIESGLNKIPKEIDWSSLLMGHSIVSTCFNVHIPMIKKSILVGFLLVFVDVIKELAATLIIRPFNFDTMATRMYELI SDERYTDAAPYALVIVLIGLISVVILCRMFQYDKSKYKIML
Specific function: Part of the ABC transporter complex fbpABC (TC 3.A.1.10.1) involved in Fe(3+) ions import. Probably responsible for the translocation of the substrate across the membrane [H]
COG id: COG1178
COG function: function code P; ABC-type Fe3+ transport system, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 2 ABC transmembrane type-1 domains [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR000515 [H]
Pfam domain/function: PF00528 BPD_transp_1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 59146; Mature: 59146
Theoretical pI: Translated: 9.52; Mature: 9.52
Prosite motif: PS50928 ABC_TM1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 3.1 %Met (Translated Protein) 4.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 3.1 %Met (Mature Protein) 4.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFIAPIFSLVSIIFTENKTMDLLTSVLPEYAFNTIILMLGVGIIALIIGVSTAWFVTYYS CCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FFGRKFFEIALFLPLSIPGYIVAYVYVNIFEFSGPLQVFLRETFHWSKGDYYFPSIKSLE HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCC WGIIIIGFNLYPYVYMLVRTGLIAIRSTVAVATTLCSSRYKILTSIALPVVRPAIAVSVS CCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVLMEVISDFGTPQFLAIDTFTRGIYRNWFLLHDKYSACLFAFIALFFIFLLIILEKLFR HHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GKGISYSTIKMNTEYYHTWQVKSKLKLILIYCVCLLPVLIGFVIPVVPLLYWTVQKIGTL CCCCCEEEEEECCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALNNRFYMSVFNSVSIAFITAVIAIVISIVMSYIIRKRESLSYAIKFIVMGYAIPNTIVA HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHH VSVMVLLGNISHFVNSYFSFALIGTTFGLIYAYVFRFLAVSLGPIESGLNKIPKEIDWSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCHHH LLMGHSIVSTCFNVHIPMIKKSILVGFLLVFVDVIKELAATLIIRPFNFDTMATRMYELI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHH SDERYTDAAPYALVIVLIGLISVVILCRMFQYDKSKYKIML CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEC >Mature Secondary Structure MFIAPIFSLVSIIFTENKTMDLLTSVLPEYAFNTIILMLGVGIIALIIGVSTAWFVTYYS CCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FFGRKFFEIALFLPLSIPGYIVAYVYVNIFEFSGPLQVFLRETFHWSKGDYYFPSIKSLE HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCC WGIIIIGFNLYPYVYMLVRTGLIAIRSTVAVATTLCSSRYKILTSIALPVVRPAIAVSVS CCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVLMEVISDFGTPQFLAIDTFTRGIYRNWFLLHDKYSACLFAFIALFFIFLLIILEKLFR HHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GKGISYSTIKMNTEYYHTWQVKSKLKLILIYCVCLLPVLIGFVIPVVPLLYWTVQKIGTL CCCCCEEEEEECCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALNNRFYMSVFNSVSIAFITAVIAIVISIVMSYIIRKRESLSYAIKFIVMGYAIPNTIVA HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHH VSVMVLLGNISHFVNSYFSFALIGTTFGLIYAYVFRFLAVSLGPIESGLNKIPKEIDWSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCHHH LLMGHSIVSTCFNVHIPMIKKSILVGFLLVFVDVIKELAATLIIRPFNFDTMATRMYELI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHH SDERYTDAAPYALVIVLIGLISVVILCRMFQYDKSKYKIML CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7542800; 7927717 [H]