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Definition Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas, complete genome.
Accession NC_007799
Length 1,176,248

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The map label for this gene is fbpB2 [H]

Identifier: 88658658

GI number: 88658658

Start: 995355

End: 996920

Strand: Reverse

Name: fbpB2 [H]

Synonym: ECH_0972

Alternate gene names: 88658658

Gene position: 996920-995355 (Counterclockwise)

Preceding gene: 88657906

Following gene: 88657754

Centisome position: 84.75

GC content: 29.31

Gene sequence:

>1566_bases
ATGTTTATAGCACCAATATTTTCATTGGTTTCTATTATATTTACTGAGAATAAGACGATGGATTTACTAACATCTGTTTT
ACCTGAATATGCTTTTAATACTATTATTTTGATGTTAGGAGTAGGAATAATAGCACTTATTATTGGGGTATCAACAGCTT
GGTTTGTAACTTATTATTCATTTTTTGGACGTAAATTTTTTGAAATAGCTCTTTTTTTACCGCTTTCAATACCAGGATAT
ATAGTTGCATATGTTTATGTAAATATTTTTGAGTTTTCAGGTCCTTTACAGGTTTTTTTACGAGAGACCTTTCATTGGAG
TAAAGGTGATTATTATTTCCCTAGTATTAAATCTTTGGAATGGGGAATTATTATTATAGGATTTAATCTATATCCTTATG
TATATATGTTAGTTAGAACAGGTCTAATAGCTATTCGTAGTACTGTTGCAGTTGCTACTACGTTATGTTCTTCTAGGTAT
AAAATTTTAACTTCTATTGCTTTACCTGTAGTACGTCCAGCTATTGCTGTTAGTGTATCATTTGTATTAATGGAAGTAAT
ATCTGATTTTGGTACACCACAGTTTCTTGCAATCGATACTTTTACTAGAGGAATATATAGAAATTGGTTTTTATTGCATG
ATAAGTATTCTGCTTGTTTATTTGCTTTTATTGCATTGTTTTTTATATTTTTGCTTATCATATTGGAAAAATTATTTCGT
GGGAAAGGTATATCGTATTCAACAATAAAGATGAATACGGAATATTATCATACTTGGCAAGTTAAGAGTAAGTTGAAACT
TATACTAATATATTGTGTGTGTTTATTGCCAGTGTTAATAGGATTTGTAATACCTGTAGTTCCTTTATTATATTGGACTG
TTCAAAAAATAGGAACATTGGCACTTAATAATCGATTTTATATGTCTGTATTCAATAGTGTTAGTATAGCATTTATAACA
GCTGTTATTGCTATTGTGATATCAATTGTTATGTCGTATATCATCAGAAAAAGGGAATCGTTGTCTTATGCAATAAAATT
TATTGTGATGGGTTATGCTATTCCCAATACCATTGTTGCTGTCAGTGTTATGGTATTACTTGGAAATATATCGCATTTTG
TGAACTCATATTTTTCATTTGCTCTGATTGGGACAACATTTGGGTTAATATATGCTTATGTTTTTAGATTTCTTGCTGTA
TCTTTAGGTCCTATAGAATCTGGATTAAATAAAATTCCGAAAGAAATAGATTGGTCGTCTTTATTGATGGGGCATAGTAT
AGTTTCTACATGTTTTAATGTTCATATTCCGATGATTAAAAAGAGTATACTAGTTGGATTTTTATTGGTATTTGTTGATG
TGATAAAAGAACTTGCAGCAACATTAATTATTAGGCCTTTTAACTTTGATACTATGGCTACCAGGATGTATGAGCTTATC
AGTGATGAAAGATATACTGATGCAGCTCCATATGCTCTAGTTATAGTGCTTATTGGACTGATATCAGTAGTTATATTATG
TAGAATGTTTCAATATGATAAGTCTAAATATAAAATCATGTTGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTATGTATAATAAACATAGGACTGGGTAGTAATTAATTCTCAAATATAGTGTCGTTTGCAAACCTTTCGAAGAACGTTT
TTCTCTGTATATTAGTTGGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAGTATTTAATGGTTTATTGTGATATGGTTTAATATTATCTTAGATATATAATTGTCTGGCAGATGTAAATTCTGATTG
TGGAGGATGCTTGTGTAAGT

Product: ABC transporter, permease protein

Products: NA

Alternate protein names: Iron(III)-transport system permease protein fbpB 2 [H]

Number of amino acids: Translated: 521; Mature: 521

Protein sequence:

>521_residues
MFIAPIFSLVSIIFTENKTMDLLTSVLPEYAFNTIILMLGVGIIALIIGVSTAWFVTYYSFFGRKFFEIALFLPLSIPGY
IVAYVYVNIFEFSGPLQVFLRETFHWSKGDYYFPSIKSLEWGIIIIGFNLYPYVYMLVRTGLIAIRSTVAVATTLCSSRY
KILTSIALPVVRPAIAVSVSFVLMEVISDFGTPQFLAIDTFTRGIYRNWFLLHDKYSACLFAFIALFFIFLLIILEKLFR
GKGISYSTIKMNTEYYHTWQVKSKLKLILIYCVCLLPVLIGFVIPVVPLLYWTVQKIGTLALNNRFYMSVFNSVSIAFIT
AVIAIVISIVMSYIIRKRESLSYAIKFIVMGYAIPNTIVAVSVMVLLGNISHFVNSYFSFALIGTTFGLIYAYVFRFLAV
SLGPIESGLNKIPKEIDWSSLLMGHSIVSTCFNVHIPMIKKSILVGFLLVFVDVIKELAATLIIRPFNFDTMATRMYELI
SDERYTDAAPYALVIVLIGLISVVILCRMFQYDKSKYKIML

Sequences:

>Translated_521_residues
MFIAPIFSLVSIIFTENKTMDLLTSVLPEYAFNTIILMLGVGIIALIIGVSTAWFVTYYSFFGRKFFEIALFLPLSIPGY
IVAYVYVNIFEFSGPLQVFLRETFHWSKGDYYFPSIKSLEWGIIIIGFNLYPYVYMLVRTGLIAIRSTVAVATTLCSSRY
KILTSIALPVVRPAIAVSVSFVLMEVISDFGTPQFLAIDTFTRGIYRNWFLLHDKYSACLFAFIALFFIFLLIILEKLFR
GKGISYSTIKMNTEYYHTWQVKSKLKLILIYCVCLLPVLIGFVIPVVPLLYWTVQKIGTLALNNRFYMSVFNSVSIAFIT
AVIAIVISIVMSYIIRKRESLSYAIKFIVMGYAIPNTIVAVSVMVLLGNISHFVNSYFSFALIGTTFGLIYAYVFRFLAV
SLGPIESGLNKIPKEIDWSSLLMGHSIVSTCFNVHIPMIKKSILVGFLLVFVDVIKELAATLIIRPFNFDTMATRMYELI
SDERYTDAAPYALVIVLIGLISVVILCRMFQYDKSKYKIML
>Mature_521_residues
MFIAPIFSLVSIIFTENKTMDLLTSVLPEYAFNTIILMLGVGIIALIIGVSTAWFVTYYSFFGRKFFEIALFLPLSIPGY
IVAYVYVNIFEFSGPLQVFLRETFHWSKGDYYFPSIKSLEWGIIIIGFNLYPYVYMLVRTGLIAIRSTVAVATTLCSSRY
KILTSIALPVVRPAIAVSVSFVLMEVISDFGTPQFLAIDTFTRGIYRNWFLLHDKYSACLFAFIALFFIFLLIILEKLFR
GKGISYSTIKMNTEYYHTWQVKSKLKLILIYCVCLLPVLIGFVIPVVPLLYWTVQKIGTLALNNRFYMSVFNSVSIAFIT
AVIAIVISIVMSYIIRKRESLSYAIKFIVMGYAIPNTIVAVSVMVLLGNISHFVNSYFSFALIGTTFGLIYAYVFRFLAV
SLGPIESGLNKIPKEIDWSSLLMGHSIVSTCFNVHIPMIKKSILVGFLLVFVDVIKELAATLIIRPFNFDTMATRMYELI
SDERYTDAAPYALVIVLIGLISVVILCRMFQYDKSKYKIML

Specific function: Part of the ABC transporter complex fbpABC (TC 3.A.1.10.1) involved in Fe(3+) ions import. Probably responsible for the translocation of the substrate across the membrane [H]

COG id: COG1178

COG function: function code P; ABC-type Fe3+ transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 2 ABC transmembrane type-1 domains [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000515 [H]

Pfam domain/function: PF00528 BPD_transp_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59146; Mature: 59146

Theoretical pI: Translated: 9.52; Mature: 9.52

Prosite motif: PS50928 ABC_TM1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEC
>Mature Secondary Structure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CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800; 7927717 [H]