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Definition Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas, complete genome.
Accession NC_007799
Length 1,176,248

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The map label for this gene is gdhB [H]

Identifier: 88657677

GI number: 88657677

Start: 779215

End: 783966

Strand: Direct

Name: gdhB [H]

Synonym: ECH_0771

Alternate gene names: 88657677

Gene position: 779215-783966 (Clockwise)

Preceding gene: 88658219

Following gene: 88658662

Centisome position: 66.25

GC content: 29.17

Gene sequence:

>4752_bases
ATGCTTAATAATTTTAATCAAAAAATTATTGATTCGGTTCTAGAATTAATAAAACAAGAAGACGACTGCTTATTTAAGAG
CTTTGTTAAACAATTCTACAGTTTCTCTTATGATAGCGATATTACTTTAGATACTAACTTTTTTCTATTTATAGCACGTG
ATTTATATCAACTCATCAAGATCAAACGACCCAGAGAAAGTAAAGTTAAAATATTCAACATAGAAGAACAAGATAATGAG
ACAATAAGCAACGTAACTATTATTGAAATAATAAATGATAACCTACCATTTATAATTGATTCTATTATTATTGCAATAAA
AAAACACAATGCATCAATATATCATTATACAAATGCCGTATTAAACATTGAACGAAAAGAACAACATATACATGCAATCT
CACCTGCACAGTCTTGTTTAAATGATGAAACAAGTGAATCAATAGTATATTTTATTATTAGCAATATTGACAAAGAATCC
CATAAATCCTTAAAACATGATATTGAAAAAAATTTACAATTAGTAGGCTATTGCGTTAATGACTGGAAATCAATGTTACA
TCATTTTGATTCAGCATTGAACGTTATGAAAGATCTTTATGATAATTCTATAGAAGAAGAAATCACATTTTTAGAATGGT
TAAGGAAAGATAACTTCATCTTTTTAGGGTATGAAGAATACATTGTAGACCAACACAAATTACTAATTAATACTAAAGCT
AATCTTGGGTTACAAAAAACTAATACATCTGATGAATCTAGTAAAAATTTATCTAACTCTACAGAACATGTATATATTAT
ACAATCCAACATTTTATCTACAGTACATAGACATGAATACATGATTTGTGTCGGATTGAGGATATTCAATCAGGATAATA
TTTTGGTCAAAGAACATTGTTTTTATGGTTTCTTTGCGTCAATAATTTCATTTCAAGATGCAAACTCTATTCCATTGATT
AGAAGCAAAATAAAAGCTGTAGAAAAGAGAGCAGGATTTACTAAAGGTGGGCATAGTAATAAGGCACTGATTGACATCTT
ACAAAGGTTATCTAGAGATGAATTATTTCAATTTTCTGAAGAAGAACTATTCGAAATTTCAATCGGTATACTGTCTTTAG
CTAATAACCCAAAAATTAAGCTTTTTATAATAAAAGGTCAGAGTCACAGCTTTGTAAACTGCATTATTTTTATACCAAAA
GCCTTAGCAAGTACTGAACTTGCAAATAAAATGAGCTATATATTAGAGCAGATGCTTACAGGTAAAGTTGTCAATAATCA
ATATAACATGTTAAACGAATATAACTTAGTTAGATTACAATTTATACTCAAAGCACAAGATAAGTTATTTAGTGATTTTT
CGGAATTAGAAATTGAAGAAAAGTTAATCGCAGCATCTAGAAGATGGGAAGATAAACTACAAGATGTTATGTGCTGCAAT
TTAGGATCTATAAACCCATTTTTACAATATCTAACAGCATTTCCACCAAGCTATCAAGAATATTTTAATCCAAAAAGCGC
TTACCATGATATAATAAAATTAGAGCAAGTTTGTAAATACAATACTAGTGAAGCTGATCTTTACTTGATAAAAAATAGTG
TTCACTATCAGTTAAAAATATATATACCTCAAGAAAGTAACCTTCAACTTTCAAAAATACTAAGTATAGTTAAAAAGATG
GGAACAAATATAATCCTACACCACAGCTATACTATTACAGCAAAAATTACTGTATACCTACATCATTTTATACTGTCAAA
TACTAAACAATCTTTTGACCATAACAGTATCAAACAACAATTCGAAACTACAATTAAAAAAATATTTGCTAAAGAAATAG
AAAATGATTACTTCAATAGCTTAGTCATATTAGCTAACTTACACTGGAAAGAAGTCATGCTAATAAGAGCACTAAGTAGA
TATTTAAAACAAGTATCATTTAATTATAGTCAAATTTACACTCAAAAAGTTGCCATAAAATATCCAAAAGTCTTGTTTAA
TTTTATAAAACTATTTGAGGCTAGATTTAATCCAGAAATGGCTAATGATCAAGAATCTCATGCTATAGAAAATAAAATTA
ATGAACTGTTACTAGAAGTTACAGATGTAGTTCACGATCATATTCTACGGTCTATATATGCGCTAATCCTAGCGATTCTG
CGTACAAATTATTATAAAGATAAAGATTATTTATCTATAAAATTAGACTCAAGTAAAGTACCAAACATACCTTTACCATG
CCCTTTTAGAGAAATATATGTATACTCTAACCTATTTGAAGGTATACATTTACGAGGTGGGAAAGTAGCACGTGGAGGAA
TTAGATGGTCTGACAGAACTGAAGATTTTCGTACAGAAATATTAGGACTAATGAAAGCACAAATGACAAAAAATTCTGTA
ATTGTGCCAGTAGGATCTAAAGGAGGATTCATCTTAAAACGTGCACCAAAAAATGCAGCTCTACTAAAAAGTACTGCTGT
AGAGTGTTATAAAAACTTCTTAAGAGGTATATTAGACATTACCGATAACATTATTGATGACAAATATGTCACACCTAATG
ACATTATAAAATATGATGAATACGATCCATATTTAGTAGTTGCAGCAGATAAAGGAACCGCCACATTTTCTGATTATGCA
AATGAAATTTCTGAAGAATACAATTTTTGGCTAGGGGATGCCTTTGCATCTGGAGGATCAATAGGATTTGACCATAAAAA
AATGGGTATTACAGCTAAAGGAGCTTGGGTAGGAGCTCAAAGGCATTTTTGGCTTATGGATAAAGATATATATAACGAAC
CATTTACAGTGATTGGTATCGGGGATATGTCTGGAGATGTATTCGGGAATGGAATGTTATTATCTAATAAAATACATCTC
ATTGGAGCATTTAATCATAATCACATTTTTATTGACCCATCACCTGATCCAGAAAAAAGTTTTCTTGAACGCAAAAGGCT
ATTTAACTTAACTAGCTCTTCCTGGGAAGATTACGATAAATCATGCATCTCAAAAGGTGGAAAAATCTTTAACCGCAATT
CTAAAATATTGGACTTAACCCCTGAAATAAAAGAATTATTTAATATTAGTGAAGATCAAATTTTTCCCAATGAACTCATC
AAACACTTATTAAAAGCAGAAGTTGATATGATATGGAATGGAGGGATAGGAACATATATCAAATCCTCACAAGAAAGCAA
CGCCGTAGTAGCAGACAAAACTAACGACGCACTAAGAATTAATGGCTCAGAAGTAAAAGCCGCAATGATAATAGAAGGTG
GAAACTTGGGATGTACTCAACTTGGAAGAGTTGAATATGCACACAACGGAGGAAAGATCAACACTGATTTTACAGATAAC
TCTGGAGGAGTAATATGTTCTGACTTTGAAATCAATATAAAAATATGCCTAAGACTAGCAATGCAAAACAAGTACATTTC
TTTAGCTGAACGTAATAAGATATTAGATGATATAATGCATGAAGTACCATCAATAGTTTTAGAATCACACAATAAATTAG
AAACAAAAGCTTTAATGTTAGAATGTATACAAGCAAAAAATAGAATAGAACAACATCATAGGCTATTAAAATATTTAGAA
AAAATTCAAGTACTAAACCGAGATATAGAATTTTTACCAAGTGATGAAGAAATCACAAAAATGAGTGCTGAAATGAAAGG
GTTTACCTGCCCTCAAATTGCAATATTGATAGCATATACCAGAACATTTATAAAAAACGAAATTATGCTTTCCAATATCT
TTCACCATTCAAGCAATTTATCAAGTTTATATGAATCCCAATATCTGCTCTCCTACTTTCCTCAGTATATAAGAGATAAC
TTTGCACAGTATATAAGGCAACATCCTTTAAAAAAAGAGATATTAGCAACTTGTATAGTGAACGACATAGTAAACAGAAT
GGGATGCATTTTTGTCAATCACATTATCGAAAATATTGGAATTACCGTTGAAGATATAATTAAAATATACGTCATAACAA
CTCACATATATAACTTATATGAAATATGGAAAACACTAGATGAACTAGATAGTAAAGTTCACATTAACGTATATACTTCC
TTAATTAGAGAAGTACAAAAATTCATAGGACAAGTTACTTTCTGGTTTCTTAGAAATTCTTCTAAAATTACAAATATAGA
CACAAAATTAGATGAGTTATCATCACAAATATCATCACTTGAAGAAAACATAGAAAGTATTTTATGTAATGAATCTCTAG
AAATATACAATAATACTTTATCCTCTTTAAGCGAGCATAATATTGAAGAATCAATTACAAAAAAAATCATAAAATTAAAA
TTTTTGACTGTTTCCCTTGATATAATACACCTAACAAATAGTTCAAATTTACCTTTATTAACTGTAGGAAAAATATACTT
CCAGCTAAGATCATTATTAAACTTTAGCCGTATACGTGACCTTGCAGCACACATGGAATCAAACTCTTCATATTGGCAAC
GCATCGCTATTAGAAATCTACTTGATGACTTAAATGACTACCAGTTTATAATCACAGAAAGTATTTTAAAACAGGTAGAA
CCTACACTATCATTAGCAGTAAAATTGGATAAAGTACACAGCATAATTAATGACATAATTCAAAGTTGGTATATCAAAAA
TCAAGAAAAGCTGAACAGATATTATAATTTTTTAAATGAAATAAACACAACTCAACTTGATTTAAGTAAATTAATGCTTA
TAATAAAATCTCTTGATATGTTTATTAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAGTATCTTAAAAATTAATTGCATTATACTTTAAAGAAGTATAATAGTATTTTAACAAAAATAATTTACTATTATCATTG
TCAACTATCGCACTAAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AACAATTCCAAATGTTTAGTGTTGGTATATCGGAAATTATTGTCATAATCCTAGTAGTATGCCTAGTAATTGATCCGAAA
AAGCTTCCCTTTTTAGCAAA

Product: NAD-glutamate dehydrogenase family protein

Products: NA

Alternate protein names: NAD-GDH; NAD(+)-dependent glutamate dehydrogenase [H]

Number of amino acids: Translated: 1583; Mature: 1583

Protein sequence:

>1583_residues
MLNNFNQKIIDSVLELIKQEDDCLFKSFVKQFYSFSYDSDITLDTNFFLFIARDLYQLIKIKRPRESKVKIFNIEEQDNE
TISNVTIIEIINDNLPFIIDSIIIAIKKHNASIYHYTNAVLNIERKEQHIHAISPAQSCLNDETSESIVYFIISNIDKES
HKSLKHDIEKNLQLVGYCVNDWKSMLHHFDSALNVMKDLYDNSIEEEITFLEWLRKDNFIFLGYEEYIVDQHKLLINTKA
NLGLQKTNTSDESSKNLSNSTEHVYIIQSNILSTVHRHEYMICVGLRIFNQDNILVKEHCFYGFFASIISFQDANSIPLI
RSKIKAVEKRAGFTKGGHSNKALIDILQRLSRDELFQFSEEELFEISIGILSLANNPKIKLFIIKGQSHSFVNCIIFIPK
ALASTELANKMSYILEQMLTGKVVNNQYNMLNEYNLVRLQFILKAQDKLFSDFSELEIEEKLIAASRRWEDKLQDVMCCN
LGSINPFLQYLTAFPPSYQEYFNPKSAYHDIIKLEQVCKYNTSEADLYLIKNSVHYQLKIYIPQESNLQLSKILSIVKKM
GTNIILHHSYTITAKITVYLHHFILSNTKQSFDHNSIKQQFETTIKKIFAKEIENDYFNSLVILANLHWKEVMLIRALSR
YLKQVSFNYSQIYTQKVAIKYPKVLFNFIKLFEARFNPEMANDQESHAIENKINELLLEVTDVVHDHILRSIYALILAIL
RTNYYKDKDYLSIKLDSSKVPNIPLPCPFREIYVYSNLFEGIHLRGGKVARGGIRWSDRTEDFRTEILGLMKAQMTKNSV
IVPVGSKGGFILKRAPKNAALLKSTAVECYKNFLRGILDITDNIIDDKYVTPNDIIKYDEYDPYLVVAADKGTATFSDYA
NEISEEYNFWLGDAFASGGSIGFDHKKMGITAKGAWVGAQRHFWLMDKDIYNEPFTVIGIGDMSGDVFGNGMLLSNKIHL
IGAFNHNHIFIDPSPDPEKSFLERKRLFNLTSSSWEDYDKSCISKGGKIFNRNSKILDLTPEIKELFNISEDQIFPNELI
KHLLKAEVDMIWNGGIGTYIKSSQESNAVVADKTNDALRINGSEVKAAMIIEGGNLGCTQLGRVEYAHNGGKINTDFTDN
SGGVICSDFEINIKICLRLAMQNKYISLAERNKILDDIMHEVPSIVLESHNKLETKALMLECIQAKNRIEQHHRLLKYLE
KIQVLNRDIEFLPSDEEITKMSAEMKGFTCPQIAILIAYTRTFIKNEIMLSNIFHHSSNLSSLYESQYLLSYFPQYIRDN
FAQYIRQHPLKKEILATCIVNDIVNRMGCIFVNHIIENIGITVEDIIKIYVITTHIYNLYEIWKTLDELDSKVHINVYTS
LIREVQKFIGQVTFWFLRNSSKITNIDTKLDELSSQISSLEENIESILCNESLEIYNNTLSSLSEHNIEESITKKIIKLK
FLTVSLDIIHLTNSSNLPLLTVGKIYFQLRSLLNFSRIRDLAAHMESNSSYWQRIAIRNLLDDLNDYQFIITESILKQVE
PTLSLAVKLDKVHSIINDIIQSWYIKNQEKLNRYYNFLNEINTTQLDLSKLMLIIKSLDMFIN

Sequences:

>Translated_1583_residues
MLNNFNQKIIDSVLELIKQEDDCLFKSFVKQFYSFSYDSDITLDTNFFLFIARDLYQLIKIKRPRESKVKIFNIEEQDNE
TISNVTIIEIINDNLPFIIDSIIIAIKKHNASIYHYTNAVLNIERKEQHIHAISPAQSCLNDETSESIVYFIISNIDKES
HKSLKHDIEKNLQLVGYCVNDWKSMLHHFDSALNVMKDLYDNSIEEEITFLEWLRKDNFIFLGYEEYIVDQHKLLINTKA
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RSKIKAVEKRAGFTKGGHSNKALIDILQRLSRDELFQFSEEELFEISIGILSLANNPKIKLFIIKGQSHSFVNCIIFIPK
ALASTELANKMSYILEQMLTGKVVNNQYNMLNEYNLVRLQFILKAQDKLFSDFSELEIEEKLIAASRRWEDKLQDVMCCN
LGSINPFLQYLTAFPPSYQEYFNPKSAYHDIIKLEQVCKYNTSEADLYLIKNSVHYQLKIYIPQESNLQLSKILSIVKKM
GTNIILHHSYTITAKITVYLHHFILSNTKQSFDHNSIKQQFETTIKKIFAKEIENDYFNSLVILANLHWKEVMLIRALSR
YLKQVSFNYSQIYTQKVAIKYPKVLFNFIKLFEARFNPEMANDQESHAIENKINELLLEVTDVVHDHILRSIYALILAIL
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IVPVGSKGGFILKRAPKNAALLKSTAVECYKNFLRGILDITDNIIDDKYVTPNDIIKYDEYDPYLVVAADKGTATFSDYA
NEISEEYNFWLGDAFASGGSIGFDHKKMGITAKGAWVGAQRHFWLMDKDIYNEPFTVIGIGDMSGDVFGNGMLLSNKIHL
IGAFNHNHIFIDPSPDPEKSFLERKRLFNLTSSSWEDYDKSCISKGGKIFNRNSKILDLTPEIKELFNISEDQIFPNELI
KHLLKAEVDMIWNGGIGTYIKSSQESNAVVADKTNDALRINGSEVKAAMIIEGGNLGCTQLGRVEYAHNGGKINTDFTDN
SGGVICSDFEINIKICLRLAMQNKYISLAERNKILDDIMHEVPSIVLESHNKLETKALMLECIQAKNRIEQHHRLLKYLE
KIQVLNRDIEFLPSDEEITKMSAEMKGFTCPQIAILIAYTRTFIKNEIMLSNIFHHSSNLSSLYESQYLLSYFPQYIRDN
FAQYIRQHPLKKEILATCIVNDIVNRMGCIFVNHIIENIGITVEDIIKIYVITTHIYNLYEIWKTLDELDSKVHINVYTS
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PTLSLAVKLDKVHSIINDIIQSWYIKNQEKLNRYYNFLNEINTTQLDLSKLMLIIKSLDMFIN
>Mature_1583_residues
MLNNFNQKIIDSVLELIKQEDDCLFKSFVKQFYSFSYDSDITLDTNFFLFIARDLYQLIKIKRPRESKVKIFNIEEQDNE
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KHLLKAEVDMIWNGGIGTYIKSSQESNAVVADKTNDALRINGSEVKAAMIIEGGNLGCTQLGRVEYAHNGGKINTDFTDN
SGGVICSDFEINIKICLRLAMQNKYISLAERNKILDDIMHEVPSIVLESHNKLETKALMLECIQAKNRIEQHHRLLKYLE
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FLTVSLDIIHLTNSSNLPLLTVGKIYFQLRSLLNFSRIRDLAAHMESNSSYWQRIAIRNLLDDLNDYQFIITESILKQVE
PTLSLAVKLDKVHSIINDIIQSWYIKNQEKLNRYYNFLNEINTTQLDLSKLMLIIKSLDMFIN

Specific function: Involved in arginine catabolism by converting L- glutamate, into 2-oxoglutarate, which is then channeled into the tricarboxylic acid cycle. Can also utilize other amino acids of the glutamate family [H]

COG id: COG2902

COG function: function code E; NAD-specific glutamate dehydrogenase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenases family [H]

Homologues:

Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6319986, Length=519, Percent_Identity=23.8921001926782, Blast_Score=75, Evalue=7e-14,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR016040
- InterPro:   IPR007780 [H]

Pfam domain/function: PF05088 Bac_GDH [H]

EC number: =1.4.1.2 [H]

Molecular weight: Translated: 182859; Mature: 182859

Theoretical pI: Translated: 6.62; Mature: 6.62

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLNNFNQKIIDSVLELIKQEDDCLFKSFVKQFYSFSYDSDITLDTNFFLFIARDLYQLIK
CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHH
IKRPRESKVKIFNIEEQDNETISNVTIIEIINDNLPFIIDSIIIAIKKHNASIYHYTNAV
CCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHEECCCEEEEEEHHE
LNIERKEQHIHAISPAQSCLNDETSESIVYFIISNIDKESHKSLKHDIEKNLQLVGYCVN
EEEHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEEHH
DWKSMLHHFDSALNVMKDLYDNSIEEEITFLEWLRKDNFIFLGYEEYIVDQHKLLINTKA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHCCHHEEEEECC
NLGLQKTNTSDESSKNLSNSTEHVYIIQSNILSTVHRHEYMICVGLRIFNQDNILVKEHC
CCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEECCCCEEEHHHH
FYGFFASIISFQDANSIPLIRSKIKAVEKRAGFTKGGHSNKALIDILQRLSRDELFQFSE
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHCCH
EELFEISIGILSLANNPKIKLFIIKGQSHSFVNCIIFIPKALASTELANKMSYILEQMLT
HHHHHHEEEHEEECCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GKVVNNQYNMLNEYNLVRLQFILKAQDKLFSDFSELEIEEKLIAASRRWEDKLQDVMCCN
CHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LGSINPFLQYLTAFPPSYQEYFNPKSAYHDIIKLEQVCKYNTSEADLYLIKNSVHYQLKI
CCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCEEEEEEE
YIPQESNLQLSKILSIVKKMGTNIILHHSYTITAKITVYLHHFILSNTKQSFDHNSIKQQ
EECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHH
FETTIKKIFAKEIENDYFNSLVILANLHWKEVMLIRALSRYLKQVSFNYSQIYTQKVAIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
YPKVLFNFIKLFEARFNPEMANDQESHAIENKINELLLEVTDVVHDHILRSIYALILAIL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RTNYYKDKDYLSIKLDSSKVPNIPLPCPFREIYVYSNLFEGIHLRGGKVARGGIRWSDRT
HHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCC
EDFRTEILGLMKAQMTKNSVIVPVGSKGGFILKRAPKNAALLKSTAVECYKNFLRGILDI
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TDNIIDDKYVTPNDIIKYDEYDPYLVVAADKGTATFSDYANEISEEYNFWLGDAFASGGS
HHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCEEEEHHHCCCCC
IGFDHKKMGITAKGAWVGAQRHFWLMDKDIYNEPFTVIGIGDMSGDVFGNGMLLSNKIHL
CCCCCHHCCEEECCCEECCCCEEEEECHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEECCEEE
IGAFNHNHIFIDPSPDPEKSFLERKRLFNLTSSSWEDYDKSCISKGGKIFNRNSKILDLT
EEEECCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCEEECC
PEIKELFNISEDQIFPNELIKHLLKAEVDMIWNGGIGTYIKSSQESNAVVADKTNDALRI
HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHCCCCCCCCEEEEECCCCEEEE
NGSEVKAAMIIEGGNLGCTQLGRVEYAHNGGKINTDFTDNSGGVICSDFEINIKICLRLA
CCCCEEEEEEEECCCCCCCHHCCEEEECCCCEEECCEECCCCCEEEECCEEEHHHHHHHH
MQNKYISLAERNKILDDIMHEVPSIVLESHNKLETKALMLECIQAKNRIEQHHRLLKYLE
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KIQVLNRDIEFLPSDEEITKMSAEMKGFTCPQIAILIAYTRTFIKNEIMLSNIFHHSSNL
HHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
SSLYESQYLLSYFPQYIRDNFAQYIRQHPLKKEILATCIVNDIVNRMGCIFVNHIIENIG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
ITVEDIIKIYVITTHIYNLYEIWKTLDELDSKVHINVYTSLIREVQKFIGQVTFWFLRNS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECC
SKITNIDTKLDELSSQISSLEENIESILCNESLEIYNNTLSSLSEHNIEESITKKIIKLK
CCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHE
FLTVSLDIIHLTNSSNLPLLTVGKIYFQLRSLLNFSRIRDLAAHMESNSSYWQRIAIRNL
EEEEEEEEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
LDDLNDYQFIITESILKQVEPTLSLAVKLDKVHSIINDIIQSWYIKNQEKLNRYYNFLNE
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
INTTQLDLSKLMLIIKSLDMFIN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MLNNFNQKIIDSVLELIKQEDDCLFKSFVKQFYSFSYDSDITLDTNFFLFIARDLYQLIK
CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHH
IKRPRESKVKIFNIEEQDNETISNVTIIEIINDNLPFIIDSIIIAIKKHNASIYHYTNAV
CCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHEECCCEEEEEEHHE
LNIERKEQHIHAISPAQSCLNDETSESIVYFIISNIDKESHKSLKHDIEKNLQLVGYCVN
EEEHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEEHH
DWKSMLHHFDSALNVMKDLYDNSIEEEITFLEWLRKDNFIFLGYEEYIVDQHKLLINTKA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHCCHHEEEEECC
NLGLQKTNTSDESSKNLSNSTEHVYIIQSNILSTVHRHEYMICVGLRIFNQDNILVKEHC
CCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEECCCCEEEHHHH
FYGFFASIISFQDANSIPLIRSKIKAVEKRAGFTKGGHSNKALIDILQRLSRDELFQFSE
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHCCH
EELFEISIGILSLANNPKIKLFIIKGQSHSFVNCIIFIPKALASTELANKMSYILEQMLT
HHHHHHEEEHEEECCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GKVVNNQYNMLNEYNLVRLQFILKAQDKLFSDFSELEIEEKLIAASRRWEDKLQDVMCCN
CHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LGSINPFLQYLTAFPPSYQEYFNPKSAYHDIIKLEQVCKYNTSEADLYLIKNSVHYQLKI
CCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCEEEEEEE
YIPQESNLQLSKILSIVKKMGTNIILHHSYTITAKITVYLHHFILSNTKQSFDHNSIKQQ
EECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHH
FETTIKKIFAKEIENDYFNSLVILANLHWKEVMLIRALSRYLKQVSFNYSQIYTQKVAIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
YPKVLFNFIKLFEARFNPEMANDQESHAIENKINELLLEVTDVVHDHILRSIYALILAIL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RTNYYKDKDYLSIKLDSSKVPNIPLPCPFREIYVYSNLFEGIHLRGGKVARGGIRWSDRT
HHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCC
EDFRTEILGLMKAQMTKNSVIVPVGSKGGFILKRAPKNAALLKSTAVECYKNFLRGILDI
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TDNIIDDKYVTPNDIIKYDEYDPYLVVAADKGTATFSDYANEISEEYNFWLGDAFASGGS
HHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCEEEEHHHCCCCC
IGFDHKKMGITAKGAWVGAQRHFWLMDKDIYNEPFTVIGIGDMSGDVFGNGMLLSNKIHL
CCCCCHHCCEEECCCEECCCCEEEEECHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEECCEEE
IGAFNHNHIFIDPSPDPEKSFLERKRLFNLTSSSWEDYDKSCISKGGKIFNRNSKILDLT
EEEECCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCEEECC
PEIKELFNISEDQIFPNELIKHLLKAEVDMIWNGGIGTYIKSSQESNAVVADKTNDALRI
HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHCCCCCCCCEEEEECCCCEEEE
NGSEVKAAMIIEGGNLGCTQLGRVEYAHNGGKINTDFTDNSGGVICSDFEINIKICLRLA
CCCCEEEEEEEECCCCCCCHHCCEEEECCCCEEECCEECCCCCEEEECCEEEHHHHHHHH
MQNKYISLAERNKILDDIMHEVPSIVLESHNKLETKALMLECIQAKNRIEQHHRLLKYLE
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KIQVLNRDIEFLPSDEEITKMSAEMKGFTCPQIAILIAYTRTFIKNEIMLSNIFHHSSNL
HHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
SSLYESQYLLSYFPQYIRDNFAQYIRQHPLKKEILATCIVNDIVNRMGCIFVNHIIENIG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
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