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The map label for this gene is rfbX [C]

Identifier: 84489259

GI number: 84489259

Start: 525710

End: 527158

Strand: Direct

Name: rfbX [C]

Synonym: Msp_0448

Alternate gene names: 84489259

Gene position: 525710-527158 (Clockwise)

Preceding gene: 84489253

Following gene: 84489261

Centisome position: 29.74

GC content: 26.5

Gene sequence:

>1449_bases
TTGATATTCATGAATGTAACATCTCGTGTCATAAAGAATTCAAGTTTACTGTTATTTGCAAGTGTTATAAATAATGTGAT
GACATTTATATTAACACTTTTCACAGCAAGGTATCTTGGAACATATAATTTTGGTTTAATTTCATCAGCTACTTCTTTGG
TTGGTGTATTTGGTATATTCTGTGATTTAGGTTTTGCCACATATGCTATTAGGGAAGTATCACGAAATAAGGATTTAACA
GGAGTTTATTTTGGTACTGTATTTTTACTTAGAGTTATATCATCCATATTGACTTGTATTGTTTATGTTATTTTCATATT
CTTTAGTAATTTTAGTACAGATGGAACTAATGTAATGATAATATTTGGAATATATATGTTGTTTAATTCATTTGTTCTTT
GTTATTATTCATTGTTCCAAAGTAATGAGAAAATGGAGTATCAGACAATAGGTAATGTTATTTATAGTGTGTCTGTTCTT
TTAATTATTTTATTAATAATTTTTAGAAGTGGAAATGTTACAATAGTAGCTGCAGCATATCCTATAGCAATAATTTTATC
GTTTATTTACTGTAGTTATATTACAATTAAGAAGTATCCTAGACTCAGTGTTTGTTTAGAAAAATCATTTATAAAACAAA
TTCTCATTAAGGGTATTCCATTCGGTATAACATCAGTATTTACTTCAATATACTTCTGGATAGCATTAATTATACTAACT
TATATGGCTGGAAGTGTATCTGTAGGATTATTTAGTTCATCACAGAAGTTGTTACTTGTCTTATCAGCGATATTTTATTT
AATATCCAATGCAATATTTCCAGTAATGAGTGAATTATTTACTACAGATAAAAATGCTCTTGTAGATTTGTATCATAAGT
TAATGAAGTACTTGTTGATTGTTGGTATGGCAATTGCTGTGGGAACATCAATATATTCTAAGGAAATTATTGGTATTATA
TATGGTAGTGAATATGTGGTAGGTGCTCATGCATTAACTATACTTATATGGGCGGGTATTTTCATGTTTCTTAGTGGTTT
AACTTCAACCTTACTTGGAGCTATAAATAAACAAGTATCTGTAACAAAGAATGCTGCTATAGGAGCAATATTTAGTATAA
TTCTAAATTTAATATTAATATATTATTTATCATATATTGGTGCTAGTATTTCTACTGTTTCAACTGAATTTTTAATATTG
GTGTTGATGTTATATGCCTTGTCTAAAACAGAATTTAAATTAAATCTTAAAAAATCAGTGCTTCCATGTATACAAGTTAT
CTTGGCAAATATAATTATGGGTGTTGTTTTATTATATTTAAATTTACCATTCATATTTGCTATTGTTGTTGCAGTAATTG
TTTATATTGTTGCATTAATTGTAACTGGAGCAATAAATAGAAATGATATTAGTATTGTCTTGAATTTTATAAATGATTTT
AAAAAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTATATTTCTAATTAATTTATATTAAGTTATTATACAAATATATTATAATATAAAAAAAATAATAGAAAAATTCAACTA
TTTATAAAAACTAATAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATTGATCATTATAAAAAAAAGATTATTATATTAACTCTAATTAAGTTAATATACTTTACTTCTTTTTGTATAAAATTT
ATGAATCATGTTTTTTTAGG

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: lipopolysaccharide [Periplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 482; Mature: 482

Protein sequence:

>482_residues
MIFMNVTSRVIKNSSLLLFASVINNVMTFILTLFTARYLGTYNFGLISSATSLVGVFGIFCDLGFATYAIREVSRNKDLT
GVYFGTVFLLRVISSILTCIVYVIFIFFSNFSTDGTNVMIIFGIYMLFNSFVLCYYSLFQSNEKMEYQTIGNVIYSVSVL
LIILLIIFRSGNVTIVAAAYPIAIILSFIYCSYITIKKYPRLSVCLEKSFIKQILIKGIPFGITSVFTSIYFWIALIILT
YMAGSVSVGLFSSSQKLLLVLSAIFYLISNAIFPVMSELFTTDKNALVDLYHKLMKYLLIVGMAIAVGTSIYSKEIIGII
YGSEYVVGAHALTILIWAGIFMFLSGLTSTLLGAINKQVSVTKNAAIGAIFSIILNLILIYYLSYIGASISTVSTEFLIL
VLMLYALSKTEFKLNLKKSVLPCIQVILANIIMGVVLLYLNLPFIFAIVVAVIVYIVALIVTGAINRNDISIVLNFINDF
KK

Sequences:

>Translated_482_residues
MIFMNVTSRVIKNSSLLLFASVINNVMTFILTLFTARYLGTYNFGLISSATSLVGVFGIFCDLGFATYAIREVSRNKDLT
GVYFGTVFLLRVISSILTCIVYVIFIFFSNFSTDGTNVMIIFGIYMLFNSFVLCYYSLFQSNEKMEYQTIGNVIYSVSVL
LIILLIIFRSGNVTIVAAAYPIAIILSFIYCSYITIKKYPRLSVCLEKSFIKQILIKGIPFGITSVFTSIYFWIALIILT
YMAGSVSVGLFSSSQKLLLVLSAIFYLISNAIFPVMSELFTTDKNALVDLYHKLMKYLLIVGMAIAVGTSIYSKEIIGII
YGSEYVVGAHALTILIWAGIFMFLSGLTSTLLGAINKQVSVTKNAAIGAIFSIILNLILIYYLSYIGASISTVSTEFLIL
VLMLYALSKTEFKLNLKKSVLPCIQVILANIIMGVVLLYLNLPFIFAIVVAVIVYIVALIVTGAINRNDISIVLNFINDF
KK
>Mature_482_residues
MIFMNVTSRVIKNSSLLLFASVINNVMTFILTLFTARYLGTYNFGLISSATSLVGVFGIFCDLGFATYAIREVSRNKDLT
GVYFGTVFLLRVISSILTCIVYVIFIFFSNFSTDGTNVMIIFGIYMLFNSFVLCYYSLFQSNEKMEYQTIGNVIYSVSVL
LIILLIIFRSGNVTIVAAAYPIAIILSFIYCSYITIKKYPRLSVCLEKSFIKQILIKGIPFGITSVFTSIYFWIALIILT
YMAGSVSVGLFSSSQKLLLVLSAIFYLISNAIFPVMSELFTTDKNALVDLYHKLMKYLLIVGMAIAVGTSIYSKEIIGII
YGSEYVVGAHALTILIWAGIFMFLSGLTSTLLGAINKQVSVTKNAAIGAIFSIILNLILIYYLSYIGASISTVSTEFLIL
VLMLYALSKTEFKLNLKKSVLPCIQVILANIIMGVVLLYLNLPFIFAIVVAVIVYIVALIVTGAINRNDISIVLNFINDF
KK

Specific function: May Be Involved In The Translocation Process Of The Nascent O-Polysaccharide Molecules And/Or Its Ligation To Lipid A Core Units. [C]

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53464; Mature: 53464

Theoretical pI: Translated: 9.50; Mature: 9.50

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CC
>Mature Secondary Structure
MIFMNVTSRVIKNSSLLLFASVINNVMTFILTLFTARYLGTYNFGLISSATSLVGVFGIF
CEEEHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
CDLGFATYAIREVSRNKDLTGVYFGTVFLLRVISSILTCIVYVIFIFFSNFSTDGTNVMI
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH
IFGIYMLFNSFVLCYYSLFQSNEKMEYQTIGNVIYSVSVLLIILLIIFRSGNVTIVAAAY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHH
PIAIILSFIYCSYITIKKYPRLSVCLEKSFIKQILIKGIPFGITSVFTSIYFWIALIILT
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YMAGSVSVGLFSSSQKLLLVLSAIFYLISNAIFPVMSELFTTDKNALVDLYHKLMKYLLI
HHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGMAIAVGTSIYSKEIIGIIYGSEYVVGAHALTILIWAGIFMFLSGLTSTLLGAINKQVS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
VTKNAAIGAIFSIILNLILIYYLSYIGASISTVSTEFLILVLMLYALSKTEFKLNLKKSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEHHHHH
LPCIQVILANIIMGVVLLYLNLPFIFAIVVAVIVYIVALIVTGAINRNDISIVLNFINDF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
KK
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: lipopolysaccharide [Cytoplasm] [C]

Specific reaction: lipopolysaccharide [Cytoplasm] = lipopolysaccharide [Periplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]