| Definition | Staphylococcus aureus RF122, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007622 |
| Length | 2,742,531 |
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The map label for this gene is ebh [H]
Identifier: 82751025
GI number: 82751025
Start: 1403175
End: 1408925
Strand: Reverse
Name: ebh [H]
Synonym: SAB1289c
Alternate gene names: 82751025
Gene position: 1408925-1403175 (Counterclockwise)
Preceding gene: 82751026
Following gene: 82751022
Centisome position: 51.37
GC content: 34.12
Gene sequence:
>5751_bases GTGAATACAACGAAAGCAGCATTACATGGTGATGTGAAGTTACAAAATGATAAAGATCATGCTAAACAAACGGTTAGTCA ATTAGCACATCTAAACAATGCACAAAAACATATGGAAGATACGTTAATTGATAGTGAAACAACTAGAACAGCAGTTAAGC AATATTTGACTGAAGCACAAGCATTAGATCAACTTATGAATACATTACAACAAAGTATTGCTGACAAAGATGCAACACGT GCGAGCAGTGCATATGTCAATGCAAAACCGAATAAAAAACAAGCATATGATGAAGCAGTTCAAAATGCTGAGTCTATCAT TGCAGGATTAAATAATCCGACTATCAATAAAGGAAATGTATCAAGTGCGACACAAGCAGTGACGACATCTAAAAATGGTT TAGATGGTGTTGAACGATTAGCTCAAGATAAGCAAACAGCTGGAAATTCTCTAAATCATTTAGATCAATTAACACCAGCT CAACAACAAGCGTTAGAAAATCAAATTAATAATGCAACAACTCGTGATAAAGTGGCTGAAATCATTGCACAAGCGCAAGC ATTAAATGAAGCAATGAAAGCATTAAAAGAAAGTATTAAAGATCAACCACAAACTGAAGCAAGTAGTAAATTTATTAACG AGGATCAAGCGCAAAAAGATGCTTATACGCAAGCAGTACAACACGCGAAAGATTTGATTAACAAAACAACTGATCCTACA TTAGTTAAATCAGTAATTGATCAAGCAACACAAGCAGTGAATGACGCTAAAAACAACTTACATGGTGATCAAAAATTAGC TCAAGATAAGCAACATGCAGTTACTGATTTAAATCAATTAAATGGTTTAAATAATCCGCAACGTCAAGCTCTTGAAAGTC AAATAAACAACGCAGGAACTCGTGATGAAGTAGCGCAAAAATTAGCTGAAGCAAAAGCGCTTGATCAAGCAATGCAAGCA 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Downstream 100 bases:
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Product: truncated cell surface fibronectin-binding protein
Products: NA
Alternate protein names: ECM-binding protein homolog [H]
Number of amino acids: Translated: 1916; Mature: 1916
Protein sequence:
>1916_residues MNTTKAALHGDVKLQNDKDHAKQTVSQLAHLNNAQKHMEDTLIDSETTRTAVKQYLTEAQALDQLMNTLQQSIADKDATR ASSAYVNAKPNKKQAYDEAVQNAESIIAGLNNPTINKGNVSSATQAVTTSKNGLDGVERLAQDKQTAGNSLNHLDQLTPA QQQALENQINNATTRDKVAEIIAQAQALNEAMKALKESIKDQPQTEASSKFINEDQAQKDAYTQAVQHAKDLINKTTDPT LVKSVIDQATQAVNDAKNNLHGDQKLAQDKQHAVTDLNQLNGLNNPQRQALESQINNAGTRDEVAQKLAEAKALDQAMQA LRNSIQDQQQTEAASKFINEDKPQKDAYQTAVQHAKDLINQTGNPTLDKSQVEQLKQAVTTAKDNLHGDQKLARDQQQAV TTVNTLPNLNHAQQQALTDAINAAPTRTEVAQHVQTATELDHAMETLKNKVDQVNTDKAQPNYTEASTDKKEAVDQALQA AESITDPTNGSNANKDAVEQALTKLQEKVNELNGNERVAEAKTQAKQTIDQLTHLNAEQIATAKQNIDQATKLQPIAELV DQATQLNQSMDQLQQAVNEHANVEQTVDYTQADSDKQNAYKQAIAAAENVLKQNANKQQVDQALQNILNAKQALNGDERV ALAKTNGKHDIDQLNALNNAQQDGFKGRIDQSNDLNQIQQIVDEAKALNRAMNQLSQEITGNEGRTKGSTNYVNADTQVK QVYDEAVDKAKQALDKSTGQNLTAEQVIKLNDAVTAAKKALNGEERLNNRKSEALQRLNQLTHLNNAQRQLAIQQINNAE TLNKASRAINRATKLDNAMGAVHQYIDEQHLGVISSTNYINADDNLKANYDNAIANAAHELDKVQGNAIAKAEAEQLKQN IIDAQNALNGDQNLANAKDKANALVNSLNGLNQQQQDLAHKAINNADTVSDVTDIVNNQIDLNDAMETLKHLVDNEIPNA EQTVNYQNADDNAKTNFDDAKRLANTLLNSDNTNVNDINGAIQAVNDAIQNLNGDQRLQDAKDKAIQSINQALTYKLKEI EASNATEQDKLIAKNKAEELANSIINNINKATSNQGVSQVQTAGKQAIEQVHANEIPKAKIDANKDADKQVQALIDEIDR NPNLTDKEKQALKDRINQILQQGHNDINNAMTKEEIEQAKDRLAQALQDIKDLVKAKEDAKQDVDKRVQALIDEIDQNPN LTDKEKQALKDRINQILQQGHNDINNAMTKEEIEQAKERLAQALQDIKDLVKAKEDAKNKIKALANAKRDQINSNPDLTP EQKAKALKEIDEAEKRALQNVENAQTIDQLNRGLNLGLDDIRNTHVWEVDDQPAVNEISEATPEQLLVNGELIVHRDDII TEQDVLAHINLIDQLTAEVIDTPSTATISDSLTAKVEVTLLDGSKVIVNVPVKVVEKELSVVKQQAIESIENAAQQKINE INNSVTLTLEQKEAAIAEVNKLKQQAIDHINNAPDVHSVEEIQQQEQAHIEQFNPEQFTIEQAKSNAIKSIEDAIQQMID EIKARTDLTDKEKQEAIAKLNQLKEQAIQAIQRAQSIDEITEQLEQFKAQMKAANPLAKELAKRKQEAISRIKDFSNEKM NSIRNSEIGSADEKQAAMNRINEIVLETIRDINNAHTLQQVEAALNNGIARISAVQIVTSDRAKQSLSNGNESNSHLTIG YGTANHPFNSSTIGHKKKLDEDDDIDPLHMRHFSNNFGNVIKNAIGVVGISGLLASFWFFIAKRRRKEDEEEELEIRDNN KDSIKETLDDTKHLPLLFAKRHRKEEEEDVTVEEKDSLNNGESLDKVKHTPFFLPKRRRKEEEEDVEVTNENTDEKVLKD NEHSPLLIAKRRKDKEEDVETTSIESKDEDVPLLLAKKKNQKDNQSKDKKSASKNTSKKVTAKKKKKKSKKNNLFL
Sequences:
>Translated_1916_residues MNTTKAALHGDVKLQNDKDHAKQTVSQLAHLNNAQKHMEDTLIDSETTRTAVKQYLTEAQALDQLMNTLQQSIADKDATR ASSAYVNAKPNKKQAYDEAVQNAESIIAGLNNPTINKGNVSSATQAVTTSKNGLDGVERLAQDKQTAGNSLNHLDQLTPA QQQALENQINNATTRDKVAEIIAQAQALNEAMKALKESIKDQPQTEASSKFINEDQAQKDAYTQAVQHAKDLINKTTDPT LVKSVIDQATQAVNDAKNNLHGDQKLAQDKQHAVTDLNQLNGLNNPQRQALESQINNAGTRDEVAQKLAEAKALDQAMQA LRNSIQDQQQTEAASKFINEDKPQKDAYQTAVQHAKDLINQTGNPTLDKSQVEQLKQAVTTAKDNLHGDQKLARDQQQAV TTVNTLPNLNHAQQQALTDAINAAPTRTEVAQHVQTATELDHAMETLKNKVDQVNTDKAQPNYTEASTDKKEAVDQALQA AESITDPTNGSNANKDAVEQALTKLQEKVNELNGNERVAEAKTQAKQTIDQLTHLNAEQIATAKQNIDQATKLQPIAELV DQATQLNQSMDQLQQAVNEHANVEQTVDYTQADSDKQNAYKQAIAAAENVLKQNANKQQVDQALQNILNAKQALNGDERV ALAKTNGKHDIDQLNALNNAQQDGFKGRIDQSNDLNQIQQIVDEAKALNRAMNQLSQEITGNEGRTKGSTNYVNADTQVK QVYDEAVDKAKQALDKSTGQNLTAEQVIKLNDAVTAAKKALNGEERLNNRKSEALQRLNQLTHLNNAQRQLAIQQINNAE TLNKASRAINRATKLDNAMGAVHQYIDEQHLGVISSTNYINADDNLKANYDNAIANAAHELDKVQGNAIAKAEAEQLKQN IIDAQNALNGDQNLANAKDKANALVNSLNGLNQQQQDLAHKAINNADTVSDVTDIVNNQIDLNDAMETLKHLVDNEIPNA EQTVNYQNADDNAKTNFDDAKRLANTLLNSDNTNVNDINGAIQAVNDAIQNLNGDQRLQDAKDKAIQSINQALTYKLKEI EASNATEQDKLIAKNKAEELANSIINNINKATSNQGVSQVQTAGKQAIEQVHANEIPKAKIDANKDADKQVQALIDEIDR NPNLTDKEKQALKDRINQILQQGHNDINNAMTKEEIEQAKDRLAQALQDIKDLVKAKEDAKQDVDKRVQALIDEIDQNPN LTDKEKQALKDRINQILQQGHNDINNAMTKEEIEQAKERLAQALQDIKDLVKAKEDAKNKIKALANAKRDQINSNPDLTP EQKAKALKEIDEAEKRALQNVENAQTIDQLNRGLNLGLDDIRNTHVWEVDDQPAVNEISEATPEQLLVNGELIVHRDDII TEQDVLAHINLIDQLTAEVIDTPSTATISDSLTAKVEVTLLDGSKVIVNVPVKVVEKELSVVKQQAIESIENAAQQKINE INNSVTLTLEQKEAAIAEVNKLKQQAIDHINNAPDVHSVEEIQQQEQAHIEQFNPEQFTIEQAKSNAIKSIEDAIQQMID EIKARTDLTDKEKQEAIAKLNQLKEQAIQAIQRAQSIDEITEQLEQFKAQMKAANPLAKELAKRKQEAISRIKDFSNEKM NSIRNSEIGSADEKQAAMNRINEIVLETIRDINNAHTLQQVEAALNNGIARISAVQIVTSDRAKQSLSNGNESNSHLTIG YGTANHPFNSSTIGHKKKLDEDDDIDPLHMRHFSNNFGNVIKNAIGVVGISGLLASFWFFIAKRRRKEDEEEELEIRDNN KDSIKETLDDTKHLPLLFAKRHRKEEEEDVTVEEKDSLNNGESLDKVKHTPFFLPKRRRKEEEEDVEVTNENTDEKVLKD NEHSPLLIAKRRKDKEEDVETTSIESKDEDVPLLLAKKKNQKDNQSKDKKSASKNTSKKVTAKKKKKKSKKNNLFL >Mature_1916_residues MNTTKAALHGDVKLQNDKDHAKQTVSQLAHLNNAQKHMEDTLIDSETTRTAVKQYLTEAQALDQLMNTLQQSIADKDATR ASSAYVNAKPNKKQAYDEAVQNAESIIAGLNNPTINKGNVSSATQAVTTSKNGLDGVERLAQDKQTAGNSLNHLDQLTPA QQQALENQINNATTRDKVAEIIAQAQALNEAMKALKESIKDQPQTEASSKFINEDQAQKDAYTQAVQHAKDLINKTTDPT LVKSVIDQATQAVNDAKNNLHGDQKLAQDKQHAVTDLNQLNGLNNPQRQALESQINNAGTRDEVAQKLAEAKALDQAMQA LRNSIQDQQQTEAASKFINEDKPQKDAYQTAVQHAKDLINQTGNPTLDKSQVEQLKQAVTTAKDNLHGDQKLARDQQQAV TTVNTLPNLNHAQQQALTDAINAAPTRTEVAQHVQTATELDHAMETLKNKVDQVNTDKAQPNYTEASTDKKEAVDQALQA AESITDPTNGSNANKDAVEQALTKLQEKVNELNGNERVAEAKTQAKQTIDQLTHLNAEQIATAKQNIDQATKLQPIAELV DQATQLNQSMDQLQQAVNEHANVEQTVDYTQADSDKQNAYKQAIAAAENVLKQNANKQQVDQALQNILNAKQALNGDERV ALAKTNGKHDIDQLNALNNAQQDGFKGRIDQSNDLNQIQQIVDEAKALNRAMNQLSQEITGNEGRTKGSTNYVNADTQVK QVYDEAVDKAKQALDKSTGQNLTAEQVIKLNDAVTAAKKALNGEERLNNRKSEALQRLNQLTHLNNAQRQLAIQQINNAE TLNKASRAINRATKLDNAMGAVHQYIDEQHLGVISSTNYINADDNLKANYDNAIANAAHELDKVQGNAIAKAEAEQLKQN IIDAQNALNGDQNLANAKDKANALVNSLNGLNQQQQDLAHKAINNADTVSDVTDIVNNQIDLNDAMETLKHLVDNEIPNA EQTVNYQNADDNAKTNFDDAKRLANTLLNSDNTNVNDINGAIQAVNDAIQNLNGDQRLQDAKDKAIQSINQALTYKLKEI EASNATEQDKLIAKNKAEELANSIINNINKATSNQGVSQVQTAGKQAIEQVHANEIPKAKIDANKDADKQVQALIDEIDR NPNLTDKEKQALKDRINQILQQGHNDINNAMTKEEIEQAKDRLAQALQDIKDLVKAKEDAKQDVDKRVQALIDEIDQNPN LTDKEKQALKDRINQILQQGHNDINNAMTKEEIEQAKERLAQALQDIKDLVKAKEDAKNKIKALANAKRDQINSNPDLTP EQKAKALKEIDEAEKRALQNVENAQTIDQLNRGLNLGLDDIRNTHVWEVDDQPAVNEISEATPEQLLVNGELIVHRDDII TEQDVLAHINLIDQLTAEVIDTPSTATISDSLTAKVEVTLLDGSKVIVNVPVKVVEKELSVVKQQAIESIENAAQQKINE INNSVTLTLEQKEAAIAEVNKLKQQAIDHINNAPDVHSVEEIQQQEQAHIEQFNPEQFTIEQAKSNAIKSIEDAIQQMID EIKARTDLTDKEKQEAIAKLNQLKEQAIQAIQRAQSIDEITEQLEQFKAQMKAANPLAKELAKRKQEAISRIKDFSNEKM NSIRNSEIGSADEKQAAMNRINEIVLETIRDINNAHTLQQVEAALNNGIARISAVQIVTSDRAKQSLSNGNESNSHLTIG YGTANHPFNSSTIGHKKKLDEDDDIDPLHMRHFSNNFGNVIKNAIGVVGISGLLASFWFFIAKRRRKEDEEEELEIRDNN KDSIKETLDDTKHLPLLFAKRHRKEEEEDVTVEEKDSLNNGESLDKVKHTPFFLPKRRRKEEEEDVEVTNENTDEKVLKD NEHSPLLIAKRRKDKEEDVETTSIESKDEDVPLLLAKKKNQKDNQSKDKKSASKNTSKKVTAKKKKKKSKKNNLFL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Single-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 57 FIVAR domains [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR011439 - InterPro: IPR011490 - InterPro: IPR020840 - InterPro: IPR002988 - InterPro: IPR005877 - InterPro: IPR009063 - InterPro: IPR006530 [H]
Pfam domain/function: PF07564 DUF1542; PF07554 FIVAR; PF01468 GA; PF04650 YSIRK_signal [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 212467; Mature: 212467
Theoretical pI: Translated: 5.02; Mature: 5.02
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 0.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 0.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNTTKAALHGDVKLQNDKDHAKQTVSQLAHLNNAQKHMEDTLIDSETTRTAVKQYLTEAQ CCCCHHHHCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH ALDQLMNTLQQSIADKDATRASSAYVNAKPNKKQAYDEAVQNAESIIAGLNNPTINKGNV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC SSATQAVTTSKNGLDGVERLAQDKQTAGNSLNHLDQLTPAQQQALENQINNATTRDKVAE HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH IIAQAQALNEAMKALKESIKDQPQTEASSKFINEDQAQKDAYTQAVQHAKDLINKTTDPT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH LVKSVIDQATQAVNDAKNNLHGDQKLAQDKQHAVTDLNQLNGLNNPQRQALESQINNAGT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC RDEVAQKLAEAKALDQAMQALRNSIQDQQQTEAASKFINEDKPQKDAYQTAVQHAKDLIN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH QTGNPTLDKSQVEQLKQAVTTAKDNLHGDQKLARDQQQAVTTVNTLPNLNHAQQQALTDA CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH INAAPTRTEVAQHVQTATELDHAMETLKNKVDQVNTDKAQPNYTEASTDKKEAVDQALQA 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