Definition | Staphylococcus aureus RF122, complete genome. |
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Accession | NC_007622 |
Length | 2,742,531 |
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The map label for this gene is nhaK [H]
Identifier: 82750333
GI number: 82750333
Start: 643132
End: 645174
Strand: Direct
Name: nhaK [H]
Synonym: SAB0580
Alternate gene names: 82750333
Gene position: 643132-645174 (Clockwise)
Preceding gene: 82750332
Following gene: 82750337
Centisome position: 23.45
GC content: 31.72
Gene sequence:
>2043_bases TTGGAAATATTTGAAACAATTCTTATATTTATAGTTGTTGTGATACTAAGTTCGTTTGTCCATACTTTCATACCTAAAGT ACCCCTAGCATTTATACAAATTTTCTTGGGCATGTTACTTTTTATTACCCCAATCCCTGTTCAATTTAATTTTGATTCTG AATTGTTTATGGTAACAATGATTGCGCCTTTGTTATTTGTAGAAGGTGTTAATGTTTCTAGAGTCCATTTAAGGAAATAT ATTAAGCCAGTGATGATGATGGCATTAGGATTAGTCATTACTACTGTGATAGGTGTAGGTTTATTTATTCATTGGATTTG GCCAGATTTACCTATTGGAGCAGCATTTGCAATTGCTGCCATTCTTTGTCCTACTGATGCAGTAGCAGTGCAAGCAATCA CTAAAGGAAAGGTCTTGCCAAAAGGAGCAATGACAATTCTTGAAGGTGAGTCATTATTGAATGATGCTGCTGGTATTATT TCATTTAAAATAGCTGTTGGAGTATTAGTTACAGGTGCTTTTTCACTTGTTGATGCTGTTCAGTTGTTTTTAATTGCATC AATTGGTGGCGCAGTGGTTGGTTTACTTATAGGTATGGCATTAGTAAGGTTCCGATTAACATTGATGCGTCGAGGATATG AAAACATTAATATGTTTACAATTATTCAATTGTTAACACCATTTGTTACGTATTTAATTGCTGAATTGTTTCACGCATCA GGAATCATTGCAGCAGTAGTTGCAGGACTTGTACATGGTTTCGAACGTGACAGAATTATGCAAGTACGTACACAACTACA AATGAGTTACAATCATACATGGAATATACTAGGTTATGTTTTAAATGGCTTTGTTTTTTCAATACTAGGATTTTTAGTAC CTGAAGTTATTATTAAAATTATTAAAACAGAACCGCACAATTTAATCTTTTTAATAGGCATCACTATAGTTGTTGCTTTA GCTGTCTATCTATTTAGATTTGTTTGGGTTTATGTCTTATATCCTTATTTTTATTTAGCCATCAGTCCATTCCAAAAAAT GATGACTAAAAATGATGATGATAATCCAACGACTGAGAAACCACCAAAGCGAAGTTTATACGCTTTAATTATGACGTTAT GTGGTGTGCATGGAACAATTTCTTTAGCAATCGCATTAACGTTACCGTATTTTTTAGCAGGTCATCATGCTTTTACGTAT AGAAACGACTTATTATTTATTGCATCTGGTATGGTTATTATTAGTTTGGTAGTTGCACAAGTATTATTGCCATTATTAAC GAAACCTGCACCTAAAACAGTAATTGGCAATATGTCGTTTAAAGTTGCTAGAATTTATATATTAGAACAAGTTATTGATT ATCTAAATCAAAAATCTACTTTCGAAACAAGTTTTAAATATGGTAACGTGATTAAGGAATATCATGATAAATTAGCATTT TTAAAAACTGTAGAGAAAGATGATGAAAACTCTAAAGAATTAGAACGTCTACAAAAAATTGCTTTTAATGTAGAAACAAA AACATTAGAGTCTTTAGTAGATGAAGGACAAATAACGAATAGTGTACTTGAAAACTATATGCGTTATGCTGAAAGAACAC AAGTATATAGACAAGCATCATTAATAAGAAGAATGATTGTATTATTACGAGGTGCTTTATTAAAACGAAGAGTACAAACT AGAGTGAACTCGGCATCTTCACTTAGTGTTACGGATAACTTAATGGAATTAAATAAAATTAATAAATTAGTCCATTATAA TGTGGTTAGTCGTTTGTCTAAGGAAACAACAAACGATAATACACTTGAAGTTGGAATGGTTTGTGACGGTTATTTAATTC GAATTGAAAACTTAACACCATCTAATTTCTTCAACTCAGCAAGTGAAGATACGATTACTAAAATTAAATTAAATGCATTG AGAGAACAACGTCGCATTTTACGTGAGTTGATTGATACAGATGAAGTATCAGAAGGTACAGCGTTAAAACTAAGAGAAGC CATCAATTATGATGAAATGGTTATTGTAGATAGTATGACGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases CTTTTGTGGTCGCTAACTCAATTTATCCTCTAAAGTATAATTACAACGAGATGTGATACTTAATTTTCAATTAAACAATA CTTTTTAGAGAGGTGAAAGT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTCGTAATTATGCTAAAAGGGATTGATGAAAAACTGAATGGCTTTTCATCAATCCCTTTTATTTTAGGAGAATTGAATAG ATAGTTTTAAACTATACGAA
Product: sodium-hydrogen exhange family protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 680; Mature: 680
Protein sequence:
>680_residues MEIFETILIFIVVVILSSFVHTFIPKVPLAFIQIFLGMLLFITPIPVQFNFDSELFMVTMIAPLLFVEGVNVSRVHLRKY IKPVMMMALGLVITTVIGVGLFIHWIWPDLPIGAAFAIAAILCPTDAVAVQAITKGKVLPKGAMTILEGESLLNDAAGII SFKIAVGVLVTGAFSLVDAVQLFLIASIGGAVVGLLIGMALVRFRLTLMRRGYENINMFTIIQLLTPFVTYLIAELFHAS GIIAAVVAGLVHGFERDRIMQVRTQLQMSYNHTWNILGYVLNGFVFSILGFLVPEVIIKIIKTEPHNLIFLIGITIVVAL AVYLFRFVWVYVLYPYFYLAISPFQKMMTKNDDDNPTTEKPPKRSLYALIMTLCGVHGTISLAIALTLPYFLAGHHAFTY RNDLLFIASGMVIISLVVAQVLLPLLTKPAPKTVIGNMSFKVARIYILEQVIDYLNQKSTFETSFKYGNVIKEYHDKLAF LKTVEKDDENSKELERLQKIAFNVETKTLESLVDEGQITNSVLENYMRYAERTQVYRQASLIRRMIVLLRGALLKRRVQT RVNSASSLSVTDNLMELNKINKLVHYNVVSRLSKETTNDNTLEVGMVCDGYLIRIENLTPSNFFNSASEDTITKIKLNAL REQRRILRELIDTDEVSEGTALKLREAINYDEMVIVDSMT
Sequences:
>Translated_680_residues MEIFETILIFIVVVILSSFVHTFIPKVPLAFIQIFLGMLLFITPIPVQFNFDSELFMVTMIAPLLFVEGVNVSRVHLRKY IKPVMMMALGLVITTVIGVGLFIHWIWPDLPIGAAFAIAAILCPTDAVAVQAITKGKVLPKGAMTILEGESLLNDAAGII SFKIAVGVLVTGAFSLVDAVQLFLIASIGGAVVGLLIGMALVRFRLTLMRRGYENINMFTIIQLLTPFVTYLIAELFHAS GIIAAVVAGLVHGFERDRIMQVRTQLQMSYNHTWNILGYVLNGFVFSILGFLVPEVIIKIIKTEPHNLIFLIGITIVVAL AVYLFRFVWVYVLYPYFYLAISPFQKMMTKNDDDNPTTEKPPKRSLYALIMTLCGVHGTISLAIALTLPYFLAGHHAFTY RNDLLFIASGMVIISLVVAQVLLPLLTKPAPKTVIGNMSFKVARIYILEQVIDYLNQKSTFETSFKYGNVIKEYHDKLAF LKTVEKDDENSKELERLQKIAFNVETKTLESLVDEGQITNSVLENYMRYAERTQVYRQASLIRRMIVLLRGALLKRRVQT RVNSASSLSVTDNLMELNKINKLVHYNVVSRLSKETTNDNTLEVGMVCDGYLIRIENLTPSNFFNSASEDTITKIKLNAL REQRRILRELIDTDEVSEGTALKLREAINYDEMVIVDSMT >Mature_680_residues MEIFETILIFIVVVILSSFVHTFIPKVPLAFIQIFLGMLLFITPIPVQFNFDSELFMVTMIAPLLFVEGVNVSRVHLRKY IKPVMMMALGLVITTVIGVGLFIHWIWPDLPIGAAFAIAAILCPTDAVAVQAITKGKVLPKGAMTILEGESLLNDAAGII SFKIAVGVLVTGAFSLVDAVQLFLIASIGGAVVGLLIGMALVRFRLTLMRRGYENINMFTIIQLLTPFVTYLIAELFHAS GIIAAVVAGLVHGFERDRIMQVRTQLQMSYNHTWNILGYVLNGFVFSILGFLVPEVIIKIIKTEPHNLIFLIGITIVVAL AVYLFRFVWVYVLYPYFYLAISPFQKMMTKNDDDNPTTEKPPKRSLYALIMTLCGVHGTISLAIALTLPYFLAGHHAFTY RNDLLFIASGMVIISLVVAQVLLPLLTKPAPKTVIGNMSFKVARIYILEQVIDYLNQKSTFETSFKYGNVIKEYHDKLAF LKTVEKDDENSKELERLQKIAFNVETKTLESLVDEGQITNSVLENYMRYAERTQVYRQASLIRRMIVLLRGALLKRRVQT RVNSASSLSVTDNLMELNKINKLVHYNVVSRLSKETTNDNTLEVGMVCDGYLIRIENLTPSNFFNSASEDTITKIKLNAL REQRRILRELIDTDEVSEGTALKLREAINYDEMVIVDSMT
Specific function: Transporter involved in the efflux of sodium, potassium, lithium and rubidium [H]
COG id: COG0025
COG function: function code P; NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the monovalent cation:proton antiporter 1 (CPA1) transporter (TC 2.A.36) family. Nhak (TC 2.A.36.3.2) subfamily [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1790501, Length=440, Percent_Identity=35.4545454545455, Blast_Score=213, Evalue=4e-56, Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6320663, Length=418, Percent_Identity=25.8373205741627, Blast_Score=70, Evalue=7e-13,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR006153 - InterPro: IPR018422 - InterPro: IPR018417 - InterPro: IPR004705 [H]
Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 76421; Mature: 76421
Theoretical pI: Translated: 8.81; Mature: 8.81
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 3.5 %Met (Translated Protein) 4.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 3.5 %Met (Mature Protein) 4.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEIFETILIFIVVVILSSFVHTFIPKVPLAFIQIFLGMLLFITPIPVQFNFDSELFMVTM CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHH IAPLLFVEGVNVSRVHLRKYIKPVMMMALGLVITTVIGVGLFIHWIWPDLPIGAAFAIAA HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH ILCPTDAVAVQAITKGKVLPKGAMTILEGESLLNDAAGIISFKIAVGVLVTGAFSLVDAV HHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QLFLIASIGGAVVGLLIGMALVRFRLTLMRRGYENINMFTIIQLLTPFVTYLIAELFHAS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GIIAAVVAGLVHGFERDRIMQVRTQLQMSYNHTWNILGYVLNGFVFSILGFLVPEVIIKI CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKTEPHNLIFLIGITIVVALAVYLFRFVWVYVLYPYFYLAISPFQKMMTKNDDDNPTTEK HCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC PPKRSLYALIMTLCGVHGTISLAIALTLPYFLAGHHAFTYRNDLLFIASGMVIISLVVAQ CCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VLLPLLTKPAPKTVIGNMSFKVARIYILEQVIDYLNQKSTFETSFKYGNVIKEYHDKLAF HHHHHHCCCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKTVEKDDENSKELERLQKIAFNVETKTLESLVDEGQITNSVLENYMRYAERTQVYRQAS HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIRRMIVLLRGALLKRRVQTRVNSASSLSVTDNLMELNKINKLVHYNVVSRLSKETTNDN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC TLEVGMVCDGYLIRIENLTPSNFFNSASEDTITKIKLNALREQRRILRELIDTDEVSEGT CEEEEEEECCEEEEEECCCCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH ALKLREAINYDEMVIVDSMT HHHHHHHCCCCCEEEEECCC >Mature Secondary Structure MEIFETILIFIVVVILSSFVHTFIPKVPLAFIQIFLGMLLFITPIPVQFNFDSELFMVTM CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHH IAPLLFVEGVNVSRVHLRKYIKPVMMMALGLVITTVIGVGLFIHWIWPDLPIGAAFAIAA HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH ILCPTDAVAVQAITKGKVLPKGAMTILEGESLLNDAAGIISFKIAVGVLVTGAFSLVDAV HHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QLFLIASIGGAVVGLLIGMALVRFRLTLMRRGYENINMFTIIQLLTPFVTYLIAELFHAS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GIIAAVVAGLVHGFERDRIMQVRTQLQMSYNHTWNILGYVLNGFVFSILGFLVPEVIIKI CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKTEPHNLIFLIGITIVVALAVYLFRFVWVYVLYPYFYLAISPFQKMMTKNDDDNPTTEK HCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC PPKRSLYALIMTLCGVHGTISLAIALTLPYFLAGHHAFTYRNDLLFIASGMVIISLVVAQ CCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VLLPLLTKPAPKTVIGNMSFKVARIYILEQVIDYLNQKSTFETSFKYGNVIKEYHDKLAF HHHHHHCCCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKTVEKDDENSKELERLQKIAFNVETKTLESLVDEGQITNSVLENYMRYAERTQVYRQAS HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIRRMIVLLRGALLKRRVQTRVNSASSLSVTDNLMELNKINKLVHYNVVSRLSKETTNDN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC TLEVGMVCDGYLIRIENLTPSNFFNSASEDTITKIKLNALREQRRILRELIDTDEVSEGT CEEEEEEECCEEEEEECCCCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH ALKLREAINYDEMVIVDSMT HHHHHHHCCCCCEEEEECCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9384377 [H]