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The map label for this gene is 78779767

Identifier: 78779767

GI number: 78779767

Start: 1296135

End: 1298240

Strand: Reverse

Name: 78779767

Synonym: PMT9312_1383

Alternate gene names: NA

Gene position: 1298240-1296135 (Counterclockwise)

Preceding gene: 78779769

Following gene: 78779766

Centisome position: 75.96

GC content: 31.91

Gene sequence:

>2106_bases
TTGGAACTCCCTTTAGACCATTTTCGTTTAATTGGCGTAAGCCCCTCTGCAACCTCTGAGGAAATATTAAGGGCGTTTCA
ATTACGGCTGGACAAAACGCCTGATGAAGGTTTTACTTACGAAGTTTTAACCCAAAGATCGGAGTTGCTTCGCCTAACTG
CTGATTTACTTACAGATCCAGAAAGTAGGAGAGAGTACGAAAATTTGTTATTAAATGGGGCATCTGGACTGGAGTTTTCC
TCAAATAGAGAAGTGGCAGGATTAATACTTCTTTGGGAATCGGGTTCCCCAAAAGAAGCGTTTAAAATCACAAGAAAAGC
ATTACAGCCGCCACAAACTCCAGCTTTAGGAAGTAGTAGAGAAGCTGATTTAACTTTATTGGCTGCTTTAACAGCTAGAG
ATTCTGCAATTCAAGAACAACAGCTTAGATCCTATTCAAACGCTGCAGACTTTTTACATGAGGGTATACAACTTCTTCAA
AGAATGGGAAAGCTTGGAGAAAGAAGGAAAGAACTTGAAGAAGACTTGGTTGCTCTGCTTCCTTACAGGATCCTAGATCT
ACTTAGTAGGGATTTAAATGAACAGGAGTCTCATAAAAAAGGCTTAACTATGTTGGAAAATTTAATAATTAAAAGAGGTG
GCTTGGAAGGTAATAATAAATCTGAATATGGAGATTATCTAAATCAGCAAGAATTTGAAGCCTTTTTTCAACAAATAAAG
CCGTATTTGACAGTTCAAGAACAGATTGATTTGTTTCTTGAATTACAAAAAAAAGGATCATTAGAAGCAGGATTTTTAGC
TTTTCTATCCTTGTCAGCAATTGGTTTCTCAAGAAGAAAGCCGGAAAAATTATTTGAAGCCAGGAGAATCTTGAAGAAAC
TGAATTTATCAGGTCTTGATTCAATGCCTCTTATTGGTTGTCTAGACTTGCTTTTGGCAGATATTGATCAGGCATCTGCA
AGGTTCTCTAGCAGTTCTGATGAGAAATTACGGGATTGGCTTAATAATTATCCAGGAAATAAGTTAGAAGCGATATGTGT
TTTTTGTAAAAATTGGTTAGAGAATGATGTTTTAGTTGGCTATAGAGATATTGACTCAAAAGAGGTGGATTTAGATTCTT
GGTTTGAAGATAGGGAAATTCAAGAATTTATTGAGAAATTAGAAAAGAAATCAAATAAAACTACAATCAAATCAAATCTT
CAGAATCAACAGATTGAAAAAGAATCTTATACAAAAATTACTGATGCTTTTGATAGTAATATAGCCAATGCTGATGAAAG
GAGATTACCTTGGCCAGGTGGGATAAAACAAGAATATGAAAAACTTGACTTAGAAGAAAATAAATTTAATGAGGAAATAT
TTAAAAATAAACCAATAGAGTTTTATAGGTACTTAATTGAAAAAATTGCTGAATTAAAGTTTAGTTTTGGGGAATTTTTG
AAAAATCAAGAGTTTAATAATAATTCACCTTACTTAATTTATCTATATGCGTTTTTGATATTATTTGCATTTGGTATTGG
GATTGGATTTTTAAGAAATAATTTTAAAAATTCAATTCAAGATAAAACTGTTACGGATAAACCTTTAATAGCTGTAGATA
AAAATGAAAAGGTTATAGATAAAGTAATTATTAAAGAAATCAAAAAAGACTCTCTAAATGAATTGAAGCCTATTATTAAA
AACCCCAATGCCAAGAATTCCTTTCAGGTTAAAGAAGTCAATCAAGCCTCGCCTTCTTTAGAAGATATAAGAAATTTAAT
TAATGTTTGGCTTATAAGTAAAAGTAATTACTTAGCTGGAAAGAGTGAAATTAATCTCTCCAAGATTGTTAGTAATGGTT
TGATTGACAGAACAATTGAAGAAAGAAAAAATGATATAAAGAAAGGAATATACAAAGAAATTAATTCCCAAATAATTAAG
ATAGATTTGGAATCACAAACTTCTTCGAGGATAGTTGTTTTAGTTGAATTAAATTACTTAGAAAGAATAATAAAGAGTTC
TGGAGAGTTTGTTAATGAAACATCGTTGACTCCTCTAAAAGTCAAATATATTTTGGGTTTTTCTAATAAATCATGGAAGT
TGGTTGATTTTGTAAGCGGCCTGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGGCGATTTTCATTATTTTTTTTTAAAAGTCTATAAGACCTTATGAAAAAAATTTTTAACTTGATAAAATTTGTCTAAGA
ATTTTCAATAGGATAATTGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATAAACTTCTAGATCATCTATAATAATTAAAATTACTTTTTAATAATGTTTGATGAACTCTCATCACGCTTTGAAGAC
GCAGTAAAAGGTTTAAGAGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 701; Mature: 701

Protein sequence:

>701_residues
MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDPESRREYENLLLNGASGLEFS
SNREVAGLILLWESGSPKEAFKITRKALQPPQTPALGSSREADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSNAADFLHEGIQLLQ
RMGKLGERRKELEEDLVALLPYRILDLLSRDLNEQESHKKGLTMLENLIIKRGGLEGNNKSEYGDYLNQQEFEAFFQQIK
PYLTVQEQIDLFLELQKKGSLEAGFLAFLSLSAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLDSMPLIGCLDLLLADIDQASA
RFSSSSDEKLRDWLNNYPGNKLEAICVFCKNWLENDVLVGYRDIDSKEVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKSNKTTIKSNL
QNQQIEKESYTKITDAFDSNIANADERRLPWPGGIKQEYEKLDLEENKFNEEIFKNKPIEFYRYLIEKIAELKFSFGEFL
KNQEFNNNSPYLIYLYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKNSIQDKTVTDKPLIAVDKNEKVIDKVIIKEIKKDSLNELKPIIK
NPNAKNSFQVKEVNQASPSLEDIRNLINVWLISKSNYLAGKSEINLSKIVSNGLIDRTIEERKNDIKKGIYKEINSQIIK
IDLESQTSSRIVVLVELNYLERIIKSSGEFVNETSLTPLKVKYILGFSNKSWKLVDFVSGL

Sequences:

>Translated_701_residues
MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDPESRREYENLLLNGASGLEFS
SNREVAGLILLWESGSPKEAFKITRKALQPPQTPALGSSREADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSNAADFLHEGIQLLQ
RMGKLGERRKELEEDLVALLPYRILDLLSRDLNEQESHKKGLTMLENLIIKRGGLEGNNKSEYGDYLNQQEFEAFFQQIK
PYLTVQEQIDLFLELQKKGSLEAGFLAFLSLSAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLDSMPLIGCLDLLLADIDQASA
RFSSSSDEKLRDWLNNYPGNKLEAICVFCKNWLENDVLVGYRDIDSKEVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKSNKTTIKSNL
QNQQIEKESYTKITDAFDSNIANADERRLPWPGGIKQEYEKLDLEENKFNEEIFKNKPIEFYRYLIEKIAELKFSFGEFL
KNQEFNNNSPYLIYLYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKNSIQDKTVTDKPLIAVDKNEKVIDKVIIKEIKKDSLNELKPIIK
NPNAKNSFQVKEVNQASPSLEDIRNLINVWLISKSNYLAGKSEINLSKIVSNGLIDRTIEERKNDIKKGIYKEINSQIIK
IDLESQTSSRIVVLVELNYLERIIKSSGEFVNETSLTPLKVKYILGFSNKSWKLVDFVSGL
>Mature_701_residues
MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDPESRREYENLLLNGASGLEFS
SNREVAGLILLWESGSPKEAFKITRKALQPPQTPALGSSREADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSNAADFLHEGIQLLQ
RMGKLGERRKELEEDLVALLPYRILDLLSRDLNEQESHKKGLTMLENLIIKRGGLEGNNKSEYGDYLNQQEFEAFFQQIK
PYLTVQEQIDLFLELQKKGSLEAGFLAFLSLSAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLDSMPLIGCLDLLLADIDQASA
RFSSSSDEKLRDWLNNYPGNKLEAICVFCKNWLENDVLVGYRDIDSKEVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKSNKTTIKSNL
QNQQIEKESYTKITDAFDSNIANADERRLPWPGGIKQEYEKLDLEENKFNEEIFKNKPIEFYRYLIEKIAELKFSFGEFL
KNQEFNNNSPYLIYLYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKNSIQDKTVTDKPLIAVDKNEKVIDKVIIKEIKKDSLNELKPIIK
NPNAKNSFQVKEVNQASPSLEDIRNLINVWLISKSNYLAGKSEINLSKIVSNGLIDRTIEERKNDIKKGIYKEINSQIIK
IDLESQTSSRIVVLVELNYLERIIKSSGEFVNETSLTPLKVKYILGFSNKSWKLVDFVSGL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 80429; Mature: 80429

Theoretical pI: Translated: 5.13; Mature: 5.13

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
0.6 %Met     (Translated Protein)
1.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
0.6 %Met     (Mature Protein)
1.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDP
CCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ESRREYENLLLNGASGLEFSSNREVAGLILLWESGSPKEAFKITRKALQPPQTPALGSSR
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
EADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSNAADFLHEGIQLLQRMGKLGERRKELEEDLVALL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PYRILDLLSRDLNEQESHKKGLTMLENLIIKRGGLEGNNKSEYGDYLNQQEFEAFFQQIK
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHC
PYLTVQEQIDLFLELQKKGSLEAGFLAFLSLSAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLD
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
SMPLIGCLDLLLADIDQASARFSSSSDEKLRDWLNNYPGNKLEAICVFCKNWLENDVLVG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
YRDIDSKEVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKSNKTTIKSNLQNQQIEKESYTKITDAFDSN
EECCCCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
IANADERRLPWPGGIKQEYEKLDLEENKFNEEIFKNKPIEFYRYLIEKIAELKFSFGEFL
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNQEFNNNSPYLIYLYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKNSIQDKTVTDKPLIAVDKNEKVID
CCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCHHHHH
KVIIKEIKKDSLNELKPIIKNPNAKNSFQVKEVNQASPSLEDIRNLINVWLISKSNYLAG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
KSEINLSKIVSNGLIDRTIEERKNDIKKGIYKEINSQIIKIDLESQTSSRIVVLVELNYL
CCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEEHHHH
ERIIKSSGEFVNETSLTPLKVKYILGFSNKSWKLVDFVSGL
HHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDP
CCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ESRREYENLLLNGASGLEFSSNREVAGLILLWESGSPKEAFKITRKALQPPQTPALGSSR
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EADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSNAADFLHEGIQLLQRMGKLGERRKELEEDLVALL
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PYRILDLLSRDLNEQESHKKGLTMLENLIIKRGGLEGNNKSEYGDYLNQQEFEAFFQQIK
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHC
PYLTVQEQIDLFLELQKKGSLEAGFLAFLSLSAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLD
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SMPLIGCLDLLLADIDQASARFSSSSDEKLRDWLNNYPGNKLEAICVFCKNWLENDVLVG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
YRDIDSKEVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKSNKTTIKSNLQNQQIEKESYTKITDAFDSN
EECCCCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
IANADERRLPWPGGIKQEYEKLDLEENKFNEEIFKNKPIEFYRYLIEKIAELKFSFGEFL
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNQEFNNNSPYLIYLYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKNSIQDKTVTDKPLIAVDKNEKVID
CCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCHHHHH
KVIIKEIKKDSLNELKPIIKNPNAKNSFQVKEVNQASPSLEDIRNLINVWLISKSNYLAG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
KSEINLSKIVSNGLIDRTIEERKNDIKKGIYKEINSQIIKIDLESQTSSRIVVLVELNYL
CCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEEHHHH
ERIIKSSGEFVNETSLTPLKVKYILGFSNKSWKLVDFVSGL
HHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA