Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is trkH [H]

Identifier: 58617610

GI number: 58617610

Start: 1405621

End: 1407072

Strand: Reverse

Name: trkH [H]

Synonym: ERGA_CDS_08830

Alternate gene names: 58617610

Gene position: 1407072-1405621 (Counterclockwise)

Preceding gene: 58617613

Following gene: 58617609

Centisome position: 93.81

GC content: 28.03

Gene sequence:

>1452_bases
ATGTATAAGAGTTTACGTAATATCATCTTTATTACTGGTATTTTTTCTTCAATTTTTGTATTTTTAATGTTTATTCCGGT
TGTAGTTAATTGTTACACTGGATACCCTTGGCAAAGTTTTTTTTGTGCATGTTTTATTACTCTATTATTTAGTTTAATTT
GTATACTTTATGGAAAATTATCTCGTGTAAGAAAGCAAGAGATTTTTTTTATTACAGTTAGTGTATGGATTATACTGTCC
ATAATTTCAGCTATACCATTTATGTTTGATGTTAAGATTTCTTATGTGAATGCATTATTTGAATCAGTATCTGGTCTTAC
TACTACAGGTGCAACAATATTGACTGATTTACATAATAAATCACCAGGTATTCTATTATGGAGATGTTTATTAAATGCTA
TAGGGGGATTAGGAATTATTATGACTGGTATTTTCCTTTTTCCTTGTTTAAAAGTTGTTGGTTTGTATGAACTATATCGT
TCAGAATCCTCAGATAATTCAAAGGGTTTTAAATACGGTATAGTGAAGTCTTCTATGTATGTTTTTATTATATATTGTAT
TTTTATTGTTTTGTGTGCAATTTTATATTTAATGGCAGGAATGTCAGGTTTTGATGCTATATGTCATGCTATGTCCACTG
TATCTACTGGTGGTTTCTCTAATTATGATGATTCTTTGCAACATTTTAATAATGTATATATTGAAATTATAGCAATAGTA
TTTATGTTATTGAGTTCTTGTCCATTTATTATGTATTTAAAAATGGTAACAAAACAGTGTTTTTATGATGAACAAGTAAT
TTTATTTGCAATTATTCTGTTATTTTTTTCAATGCTATCTGTGGTAGTCTCTTGTTATGATGAAGTGCTATCTAGTTATT
CATTTTTCAACATATTAAGATATTCTGTATTTTCGGTTGTTTCATTGAGTAGCTCTACTGGTTTTGTTAATTATGATTAT
AATAATTGGTGTTTTTTTTCTGTAGTTGGAATGGTATTAATGCTTATGGGGGGCTGTAGTGGATCTACTAATAGTGGGAT
TAAAATCTATAGGATTGGATTATTGTTCAAAGCTATAAACTGTTATACTAGTGGTTTAGTACATTCTGATAAGACAGTTC
TTATTCGGTATGGGCGAAAATGTATGAATAATGTTGCTATTAGTAATATAGGGTTATTCTTTATTCTATATATTTTTATA
TTGTTTGTGGGGTGTATCCTTGTATCTATTAGTGGAGTTGATGTTGTAACTGCATTTAGTGCAGTAGCTGCAACTTTTAG
TAATACAGGTCCTGGTATTGGAAATATAATAGGTCCACGATATAATTATTATAGCTTGCTACCTTCAGTAAAGTTATTAT
TATCTTTCTTGATGTTAATGGGAAGATTAGAGATTATGCCGTTTTATGTGTGTATGTATTTAATAGTGCATAATATATTT
AAGTTTAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAACTGGTTCTATGTTGTAACATATATAAATCCAAATATAGTTAATTATGTATTAATTATTCTATATTACAAAGGTTTAG
AAATTAAATAATACAAAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTGTGTTATGTTTGTTCTATTGTCTACTATCTTAGAAAATGTAATGATAAACTGATAATGTAGGTGTCTGATATTTTGAA
AAATTGTCCGTGTATGTAAT

Product: Trk system potassium uptake protein trkH

Products: Proton [Cytoplasm]; K (I) [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 483; Mature: 483

Protein sequence:

>483_residues
MYKSLRNIIFITGIFSSIFVFLMFIPVVVNCYTGYPWQSFFCACFITLLFSLICILYGKLSRVRKQEIFFITVSVWIILS
IISAIPFMFDVKISYVNALFESVSGLTTTGATILTDLHNKSPGILLWRCLLNAIGGLGIIMTGIFLFPCLKVVGLYELYR
SESSDNSKGFKYGIVKSSMYVFIIYCIFIVLCAILYLMAGMSGFDAICHAMSTVSTGGFSNYDDSLQHFNNVYIEIIAIV
FMLLSSCPFIMYLKMVTKQCFYDEQVILFAIILLFFSMLSVVVSCYDEVLSSYSFFNILRYSVFSVVSLSSSTGFVNYDY
NNWCFFSVVGMVLMLMGGCSGSTNSGIKIYRIGLLFKAINCYTSGLVHSDKTVLIRYGRKCMNNVAISNIGLFFILYIFI
LFVGCILVSISGVDVVTAFSAVAATFSNTGPGIGNIIGPRYNYYSLLPSVKLLLSFLMLMGRLEIMPFYVCMYLIVHNIF
KFK

Sequences:

>Translated_483_residues
MYKSLRNIIFITGIFSSIFVFLMFIPVVVNCYTGYPWQSFFCACFITLLFSLICILYGKLSRVRKQEIFFITVSVWIILS
IISAIPFMFDVKISYVNALFESVSGLTTTGATILTDLHNKSPGILLWRCLLNAIGGLGIIMTGIFLFPCLKVVGLYELYR
SESSDNSKGFKYGIVKSSMYVFIIYCIFIVLCAILYLMAGMSGFDAICHAMSTVSTGGFSNYDDSLQHFNNVYIEIIAIV
FMLLSSCPFIMYLKMVTKQCFYDEQVILFAIILLFFSMLSVVVSCYDEVLSSYSFFNILRYSVFSVVSLSSSTGFVNYDY
NNWCFFSVVGMVLMLMGGCSGSTNSGIKIYRIGLLFKAINCYTSGLVHSDKTVLIRYGRKCMNNVAISNIGLFFILYIFI
LFVGCILVSISGVDVVTAFSAVAATFSNTGPGIGNIIGPRYNYYSLLPSVKLLLSFLMLMGRLEIMPFYVCMYLIVHNIF
KFK
>Mature_483_residues
MYKSLRNIIFITGIFSSIFVFLMFIPVVVNCYTGYPWQSFFCACFITLLFSLICILYGKLSRVRKQEIFFITVSVWIILS
IISAIPFMFDVKISYVNALFESVSGLTTTGATILTDLHNKSPGILLWRCLLNAIGGLGIIMTGIFLFPCLKVVGLYELYR
SESSDNSKGFKYGIVKSSMYVFIIYCIFIVLCAILYLMAGMSGFDAICHAMSTVSTGGFSNYDDSLQHFNNVYIEIIAIV
FMLLSSCPFIMYLKMVTKQCFYDEQVILFAIILLFFSMLSVVVSCYDEVLSSYSFFNILRYSVFSVVSLSSSTGFVNYDY
NNWCFFSVVGMVLMLMGGCSGSTNSGIKIYRIGLLFKAINCYTSGLVHSDKTVLIRYGRKCMNNVAISNIGLFFILYIFI
LFVGCILVSISGVDVVTAFSAVAATFSNTGPGIGNIIGPRYNYYSLLPSVKLLLSFLMLMGRLEIMPFYVCMYLIVHNIF
KFK

Specific function: Low-affinity potassium transport system. Interacts with trk system potassium uptake protein trkA. TrkE increases the affinity of the system [H]

COG id: COG0168

COG function: function code P; Trk-type K+ transport systems, membrane components

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the trkH potassium transport family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787626, Length=415, Percent_Identity=32.7710843373494, Blast_Score=196, Evalue=3e-51,
Organism=Escherichia coli, GI48994987, Length=478, Percent_Identity=30.9623430962343, Blast_Score=172, Evalue=4e-44,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003445
- InterPro:   IPR004772 [H]

Pfam domain/function: PF02386 TrkH [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 54253; Mature: 54253

Theoretical pI: Translated: 8.48; Mature: 8.48

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

3.7 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
7.9 %Cys+Met (Translated Protein)
3.7 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
7.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HCC
>Mature Secondary Structure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HCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; K (I) [Periplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + K (I) [Periplasm] = Proton [Cytoplasm] + K (I) [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 2022616; 9097039; 9278503 [H]