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The map label for this gene is 54295285

Identifier: 54295285

GI number: 54295285

Start: 2699064

End: 2701829

Strand: Reverse

Name: 54295285

Synonym: lpl2370

Alternate gene names: NA

Gene position: 2701829-2699064 (Counterclockwise)

Preceding gene: 54295287

Following gene: 54295284

Centisome position: 80.76

GC content: 36.91

Gene sequence:

>2766_bases
TTGAAAGACCAATTAGCCAAAATATTCGAAAAATACCCCTTTGTTCATTTAGATAAATCAGGTGAGCTATCAATAATTGT
GCCTTTAACAGGCGCGGCCAGTATTTCCGACAATTTTACTGCCGATGAAACCAAGCCAATTTTTCTTTATTTATTTGGCG
ATAATACGTGCAAATCAGATCTGGAAAGAAGCACTTTTTTTTATGGTAAGCAGAAATCCGGAGGTCGTCACTCAGTAAAA
CCCTTTACCGAATTGTTCTCCAATCTGATTCATGAATTAAATGGTCTCAAATCGTCTACTGAAATCCGTGTGGATGAGCA
ACTATTTCTTGAAACAATCATAGCAAATCTCAATGAGTTGAAAGAGCAAGCTCTCGCTTTCAGAAAAGGAAATCCAGGCT
TTGAAGACATGAAAAATGATTTTAGTCACAGCGATGAAATCATGGTATCAAAGAGCGAGTTTGTTGTAACGGTGTATCCA
GACAGAGTGCGACAATTTGATTTGCCAAACGTAATGAGTCTTATAAACCCCGGTGTATCCCGCTACAAGCAACTACTTGC
CCAGTCCGACATTAATCAATGCCTGGAAGCATTGTCTCTTGTGCAAAAGCCTGCTGCAGAGGGTAACTTGGACCTGATTG
CTGATGCGCTGGGAAAACTGGATGCAGACCCCATCGATTACTTATGCAAAAAAGACAATAAAGATCCTCAAGCTTTATTT
AAAGCGGTTTATGAAATTCTGCAAAAACAGGATACCTCTTTAGAAAATCAACAATCAGCTGTTTTCGAAGTCATGGAAGG
CAATTTGGTCGCTGCCTTTGGAGACAACGAAGACTTTAGTGCCTGGCAAAAGGAAGAGATAGTCGATGCCATTAAATCAA
TATTTAAACAAGCAAATTTGCTGAGTGAACAATCAGGAACCAAGCAAAAAACATTTGCAGATTTCTACAATCAGGCTTTT
GATAAATATAACGAAAGCACTAATGATGATTCTGAATCAGGATGTAAACGCAGGAACACTTATCAGCTGTTTATTTTACA
AACGTTTCTCTATTTGTGTTCTTTGCAGTTGCGTTTAAAAAACAAAGAAAAGGCAAAAAAATTCCTGGGTTTGTTTGAAG
ACAGGGGTACGTTGAATAATTTGGTATTACAATTATGTAACGATGAAAAAGCGTTTATGAGAATGATGGCCGATGAATTT
GATCTGACTTCTGCAGAATACGCGTCTATTGCTGAATCAACTTATGGCATCGTCTTGGCTCATATTGATGCTGAACATTT
TGATGAACTAAGAATAGCATGCAGTGCTCAATTGCTCCAGGATTCCAATTATATCGTGATGGGAGGGCGTCTTTGTTGGA
GCACCAGTTCTATTAATGAAGAGGGAAATATACGAAGTTTGGAGCAGCAAAAGAAAATTTCATCTGAAAATTTTGAAATT
TTTTATAATCAAAGACAATCTTATATTGATAAATCAAGAGAGTTTCAACAGATAAAAGTTCTGCTAGATAAAGAAGTGAA
TGACGAAGGGATAGCTGAAGCTGTGGCGTCAAAAGTTCGCTACCTGACGAAATATCAAAAGTCACAAATCTTAAGTGAAG
TGATTCAAAAAAAGAAATACGAACATGCAAAACTTTTAATTGAAAACTATGCCAATCTTGTTTTCCCATCCGTGTTTATT
TCAGTGATAAAGAGTAGACCGGTTCATATTGATTTGATTCGAGCGTTTCTCAACGCAGACTCTCGTCATGCGTTGAATAT
TGACGGGAATGATTTAATTCAGGCAGCAAAAAAAGGAGATTTTGAGCTGGTTAAAATCATTATAGAACATAGACCGGATT
TATTGGAATCTAAAGACCCTTTCCAACAAACTCCATTGCTTTGGGCTTGTGTCAATGGCTATGTGGATATCGTGGAATAT
TTAATGGATTCAGGTGCTGATATTCATGTCAGAACAAAAGTGTCTGGGAGTCATCGATATAAAATTGGAGAAACCCCAAC
TGGGGGACGAACCGCACTTGATTGGGCGCGATGCTATGATAAAACCGATCCTGTAAAGGCATCAAAGATAATTGCCTTAT
TTGATACTTATTATCAGCGCATGGAAGACCATTTTAAAGCCAACAGTGCTTATAAAGACCAATTCAACAAGGCTCATTTA
ACCCAGGCGATAAATAATGGGGATTTAAAATTAATCGCATTGTTTTTAAAGTATTGTCCACACCTCGAAAAATTTTTTAC
TCAAGAAGATCAACTACGTGCAAAACAACGACATAATCAACAGATGTTGCGTTCTCAAATTATGCCGTATCAAAATTCAT
TCAATAAATTATTAGATGAATTACAAAGAAAAGCAGAATTACTGAATAAAAAATATGGTACTCTTCACGAAGCAACCAAT
GTCATGCAAGCACTAATTAATGACTTATCCACAGTAGGAAATGATTTTTTTATGGATGATATTACGCCTCAATCTTTTCA
AAAATTTGAAAGGAAGTGTAAACAGGTTCTTGAGGAGGCCAGCCCAGTTTTATCAACTCATCGTGGTTGGCATGGCTATC
CTGATTTTGTCAGAAGATTTATAGGAGTTATTGCAACCTTGGCAGTTATTCCTGCATTGGTTGTACACTTTTCATCAGCA
AAGGGATATGTAGGAGTTTTCTTTTCGAGCAAAGAAAATATAAAAACAGACTCTTCTGAAAAAATAGGTGAATTTGCGCA
TAACCTGGAAACCCTAAAAACAGAAATATCCAATAAACTGGCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGCTGGGCTTATTTATACCCACAGTGTTATTAATTTTGTCTTAAGCAAACTATATTACAATGGTGCCAAAAAAGCTTAA
AATGAAAGAGTATAACGAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTGGATAGTTTAACCGCTGAAACCAAGTGTTTCTTTCTATTCTGTTTGGGCTGTGGACAAAGGGTTCTATGGAACCCTTG
ATTTTTGTTCTAATTAAACA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 921; Mature: 921

Protein sequence:

>921_residues
MKDQLAKIFEKYPFVHLDKSGELSIIVPLTGAASISDNFTADETKPIFLYLFGDNTCKSDLERSTFFYGKQKSGGRHSVK
PFTELFSNLIHELNGLKSSTEIRVDEQLFLETIIANLNELKEQALAFRKGNPGFEDMKNDFSHSDEIMVSKSEFVVTVYP
DRVRQFDLPNVMSLINPGVSRYKQLLAQSDINQCLEALSLVQKPAAEGNLDLIADALGKLDADPIDYLCKKDNKDPQALF
KAVYEILQKQDTSLENQQSAVFEVMEGNLVAAFGDNEDFSAWQKEEIVDAIKSIFKQANLLSEQSGTKQKTFADFYNQAF
DKYNESTNDDSESGCKRRNTYQLFILQTFLYLCSLQLRLKNKEKAKKFLGLFEDRGTLNNLVLQLCNDEKAFMRMMADEF
DLTSAEYASIAESTYGIVLAHIDAEHFDELRIACSAQLLQDSNYIVMGGRLCWSTSSINEEGNIRSLEQQKKISSENFEI
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SVIKSRPVHIDLIRAFLNADSRHALNIDGNDLIQAAKKGDFELVKIIIEHRPDLLESKDPFQQTPLLWACVNGYVDIVEY
LMDSGADIHVRTKVSGSHRYKIGETPTGGRTALDWARCYDKTDPVKASKIIALFDTYYQRMEDHFKANSAYKDQFNKAHL
TQAINNGDLKLIALFLKYCPHLEKFFTQEDQLRAKQRHNQQMLRSQIMPYQNSFNKLLDELQRKAELLNKKYGTLHEATN
VMQALINDLSTVGNDFFMDDITPQSFQKFERKCKQVLEEASPVLSTHRGWHGYPDFVRRFIGVIATLAVIPALVVHFSSA
KGYVGVFFSSKENIKTDSSEKIGEFAHNLETLKTEISNKLA

Sequences:

>Translated_921_residues
MKDQLAKIFEKYPFVHLDKSGELSIIVPLTGAASISDNFTADETKPIFLYLFGDNTCKSDLERSTFFYGKQKSGGRHSVK
PFTELFSNLIHELNGLKSSTEIRVDEQLFLETIIANLNELKEQALAFRKGNPGFEDMKNDFSHSDEIMVSKSEFVVTVYP
DRVRQFDLPNVMSLINPGVSRYKQLLAQSDINQCLEALSLVQKPAAEGNLDLIADALGKLDADPIDYLCKKDNKDPQALF
KAVYEILQKQDTSLENQQSAVFEVMEGNLVAAFGDNEDFSAWQKEEIVDAIKSIFKQANLLSEQSGTKQKTFADFYNQAF
DKYNESTNDDSESGCKRRNTYQLFILQTFLYLCSLQLRLKNKEKAKKFLGLFEDRGTLNNLVLQLCNDEKAFMRMMADEF
DLTSAEYASIAESTYGIVLAHIDAEHFDELRIACSAQLLQDSNYIVMGGRLCWSTSSINEEGNIRSLEQQKKISSENFEI
FYNQRQSYIDKSREFQQIKVLLDKEVNDEGIAEAVASKVRYLTKYQKSQILSEVIQKKKYEHAKLLIENYANLVFPSVFI
SVIKSRPVHIDLIRAFLNADSRHALNIDGNDLIQAAKKGDFELVKIIIEHRPDLLESKDPFQQTPLLWACVNGYVDIVEY
LMDSGADIHVRTKVSGSHRYKIGETPTGGRTALDWARCYDKTDPVKASKIIALFDTYYQRMEDHFKANSAYKDQFNKAHL
TQAINNGDLKLIALFLKYCPHLEKFFTQEDQLRAKQRHNQQMLRSQIMPYQNSFNKLLDELQRKAELLNKKYGTLHEATN
VMQALINDLSTVGNDFFMDDITPQSFQKFERKCKQVLEEASPVLSTHRGWHGYPDFVRRFIGVIATLAVIPALVVHFSSA
KGYVGVFFSSKENIKTDSSEKIGEFAHNLETLKTEISNKLA
>Mature_921_residues
MKDQLAKIFEKYPFVHLDKSGELSIIVPLTGAASISDNFTADETKPIFLYLFGDNTCKSDLERSTFFYGKQKSGGRHSVK
PFTELFSNLIHELNGLKSSTEIRVDEQLFLETIIANLNELKEQALAFRKGNPGFEDMKNDFSHSDEIMVSKSEFVVTVYP
DRVRQFDLPNVMSLINPGVSRYKQLLAQSDINQCLEALSLVQKPAAEGNLDLIADALGKLDADPIDYLCKKDNKDPQALF
KAVYEILQKQDTSLENQQSAVFEVMEGNLVAAFGDNEDFSAWQKEEIVDAIKSIFKQANLLSEQSGTKQKTFADFYNQAF
DKYNESTNDDSESGCKRRNTYQLFILQTFLYLCSLQLRLKNKEKAKKFLGLFEDRGTLNNLVLQLCNDEKAFMRMMADEF
DLTSAEYASIAESTYGIVLAHIDAEHFDELRIACSAQLLQDSNYIVMGGRLCWSTSSINEEGNIRSLEQQKKISSENFEI
FYNQRQSYIDKSREFQQIKVLLDKEVNDEGIAEAVASKVRYLTKYQKSQILSEVIQKKKYEHAKLLIENYANLVFPSVFI
SVIKSRPVHIDLIRAFLNADSRHALNIDGNDLIQAAKKGDFELVKIIIEHRPDLLESKDPFQQTPLLWACVNGYVDIVEY
LMDSGADIHVRTKVSGSHRYKIGETPTGGRTALDWARCYDKTDPVKASKIIALFDTYYQRMEDHFKANSAYKDQFNKAHL
TQAINNGDLKLIALFLKYCPHLEKFFTQEDQLRAKQRHNQQMLRSQIMPYQNSFNKLLDELQRKAELLNKKYGTLHEATN
VMQALINDLSTVGNDFFMDDITPQSFQKFERKCKQVLEEASPVLSTHRGWHGYPDFVRRFIGVIATLAVIPALVVHFSSA
KGYVGVFFSSKENIKTDSSEKIGEFAHNLETLKTEISNKLA

Specific function: Unknown

COG id: COG0666

COG function: function code R; FOG: Ankyrin repeat

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 105079; Mature: 105079

Theoretical pI: Translated: 6.10; Mature: 6.10

Prosite motif: PS50088 ANK_REPEAT ; PS50297 ANK_REP_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKDQLAKIFEKYPFVHLDKSGELSIIVPLTGAASISDNFTADETKPIFLYLFGDNTCKSD
CCHHHHHHHHHCCEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHH
LERSTFFYGKQKSGGRHSVKPFTELFSNLIHELNGLKSSTEIRVDEQLFLETIIANLNEL
HHHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEQALAFRKGNPGFEDMKNDFSHSDEIMVSKSEFVVTVYPDRVRQFDLPNVMSLINPGVS
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCEEEEECCHHHHHCCCHHHHHHHCCCHH
RYKQLLAQSDINQCLEALSLVQKPAAEGNLDLIADALGKLDADPIDYLCKKDNKDPQALF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHH
KAVYEILQKQDTSLENQQSAVFEVMEGNLVAAFGDNEDFSAWQKEEIVDAIKSIFKQANL
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSEQSGTKQKTFADFYNQAFDKYNESTNDDSESGCKRRNTYQLFILQTFLYLCSLQLRLK
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NKEKAKKFLGLFEDRGTLNNLVLQLCNDEKAFMRMMADEFDLTSAEYASIAESTYGIVLA
CHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCEEEE
HIDAEHFDELRIACSAQLLQDSNYIVMGGRLCWSTSSINEEGNIRSLEQQKKISSENFEI
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHE
FYNQRQSYIDKSREFQQIKVLLDKEVNDEGIAEAVASKVRYLTKYQKSQILSEVIQKKKY
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EHAKLLIENYANLVFPSVFISVIKSRPVHIDLIRAFLNADSRHALNIDGNDLIQAAKKGD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCHHHHHHHHCCC
FELVKIIIEHRPDLLESKDPFQQTPLLWACVNGYVDIVEYLMDSGADIHVRTKVSGSHRY
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCEE
KIGETPTGGRTALDWARCYDKTDPVKASKIIALFDTYYQRMEDHFKANSAYKDQFNKAHL
ECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
TQAINNGDLKLIALFLKYCPHLEKFFTQEDQLRAKQRHNQQMLRSQIMPYQNSFNKLLDE
HHHHCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
LQRKAELLNKKYGTLHEATNVMQALINDLSTVGNDFFMDDITPQSFQKFERKCKQVLEEA
HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SPVLSTHRGWHGYPDFVRRFIGVIATLAVIPALVVHFSSAKGYVGVFFSSKENIKTDSSE
HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHH
KIGEFAHNLETLKTEISNKLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKDQLAKIFEKYPFVHLDKSGELSIIVPLTGAASISDNFTADETKPIFLYLFGDNTCKSD
CCHHHHHHHHHCCEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHH
LERSTFFYGKQKSGGRHSVKPFTELFSNLIHELNGLKSSTEIRVDEQLFLETIIANLNEL
HHHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEQALAFRKGNPGFEDMKNDFSHSDEIMVSKSEFVVTVYPDRVRQFDLPNVMSLINPGVS
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCEEEEECCHHHHHCCCHHHHHHHCCCHH
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HIDAEHFDELRIACSAQLLQDSNYIVMGGRLCWSTSSINEEGNIRSLEQQKKISSENFEI
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FYNQRQSYIDKSREFQQIKVLLDKEVNDEGIAEAVASKVRYLTKYQKSQILSEVIQKKKY
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EHAKLLIENYANLVFPSVFISVIKSRPVHIDLIRAFLNADSRHALNIDGNDLIQAAKKGD
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FELVKIIIEHRPDLLESKDPFQQTPLLWACVNGYVDIVEYLMDSGADIHVRTKVSGSHRY
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCEE
KIGETPTGGRTALDWARCYDKTDPVKASKIIALFDTYYQRMEDHFKANSAYKDQFNKAHL
ECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
TQAINNGDLKLIALFLKYCPHLEKFFTQEDQLRAKQRHNQQMLRSQIMPYQNSFNKLLDE
HHHHCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
LQRKAELLNKKYGTLHEATNVMQALINDLSTVGNDFFMDDITPQSFQKFERKCKQVLEEA
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SPVLSTHRGWHGYPDFVRRFIGVIATLAVIPALVVHFSSAKGYVGVFFSSKENIKTDSSE
HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHH
KIGEFAHNLETLKTEISNKLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA