| Definition | Legionella pneumophila str. Lens, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006369 |
| Length | 3,345,687 |
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The map label for this gene is 54294845
Identifier: 54294845
GI number: 54294845
Start: 2161138
End: 2162427
Strand: Reverse
Name: 54294845
Synonym: lpl1924
Alternate gene names: NA
Gene position: 2162427-2161138 (Counterclockwise)
Preceding gene: 54294846
Following gene: 54294844
Centisome position: 64.63
GC content: 41.63
Gene sequence:
>1290_bases ATGTCTTTCTACATTCAGCTAGCTAGTTTATCCATTATTATTCTTTATGTTTTGCTGTTATTTCGTAACGTTGATCCATT AGTAGCGACAGCTGTTTGTGTTGGGCTAGGTTTTTTGTGGAATATAAGCACCCCAATTGACATAGGGAATGCCATGGCTG ATGCCTTGGGTTCATTTATGGCTTTGGTTGGTTTTATCATCATGTTAGGTCGAGGGTTGGGCGAAGTTTTAACGCATACC CAGGTAAGTCATACTTTAGTGCACCAAATTGTTTATGGAGTCGGGGTTAATACTCAGCGACGCGCTAAAATTGGTATAGT CCTCTCATCCTTTATTATTGTTGGTTTGCTGGGAACATTAGCGGGAGGTTTGGCTATCCTGGCCCCCAGTTTGCGTCCTA TTGCAGGGTCAGTAGGCTTGTCACGTCCCAGTTTGGCGGTACTCATGCAAGCTTCAGCTGAAGAGGCTTTAATTCTGGGG CCTTTTGCTCCCCCGGTTGTAACCTTGCTTGGTGTCACTGGATTAAGTTATGGGGCAGTATTTCTTTACGCTTCGCTCCC AATTGCTGTAGTGACTTTAATTACCACCTGGTTTATGGCTTCACGATTACAAAAATTATACATCAATGAGCCCTGCGAAG ACGAGAACAGCACTGAGCCTTTTACTCCCAATAGACAACAAAAAAGGGCTACATTAATTTTTCTGATTTCCTTTTTGTTT TGTGTTGTCTATGGCTTATTTACTCAAGCAAAAACCTCTTATGTGATCTTTGTCATGTTATTTCTGGCGCTGATTACCGG ATTATCCTGTCGACTCGGTTTGAAACAAATTTTTAACCTGTTATTTGAAGGAATGCAAAAAAGCTTGCATCTCTTCTTTT TGTTTATTTTATTTGATCCTTTTATGGCACTAATCCATCAAGCTGGAGGATTTAATGCATTAACTGAGTTATTAACACCA TTAATTAACCTGGGAGGGAAACCAGTATTATCGATCTTAATAGGATTTACCGGCGCTTTTGGTATGCCAGGCGCTGCAGA AGCAACCATCAAAATGCTTCACCAGCTCTTTAGCCCTTCTGTCCTCCAGATGCAATTGCCTCTTATCACTTTTGCTTTGT GCATGCTCTTTGCAACTCGCGTCACAAATTACGCTTACCCTGGCGCCAATATGTTCGCGGCAATGGGTTTTGCTGGAAGT GAGAATGTCAAAGCCATGATACAAAATGGCCTTGTAGTGACTGGCGTCCAGGTTGCATTTTTAATTGTTTATAGTTTATT CATACCCTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GGGCACAAAGTCTCAGCAATAAAATTATCCTGGCAGACAAACCGGGATTAGGGATTGAAGGCATCACACAGGGACTGAAT CTAATTGGAGTGATCCGCTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TGTTTGTGATCGCTTTAATCCTTTAAATCAATGAGTTTGCACCACACAGGGCTATGCTTAGGGCTTATATAGATGCAGAA GTTGGTAAAGAAAAGTGTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Permease; H+/Gluconate Symporter And Related Permeases; Sodium/Proton Antiporter; H Gluconate Symporter
Number of amino acids: Translated: 429; Mature: 428
Protein sequence:
>429_residues MSFYIQLASLSIIILYVLLLFRNVDPLVATAVCVGLGFLWNISTPIDIGNAMADALGSFMALVGFIIMLGRGLGEVLTHT QVSHTLVHQIVYGVGVNTQRRAKIGIVLSSFIIVGLLGTLAGGLAILAPSLRPIAGSVGLSRPSLAVLMQASAEEALILG PFAPPVVTLLGVTGLSYGAVFLYASLPIAVVTLITTWFMASRLQKLYINEPCEDENSTEPFTPNRQQKRATLIFLISFLF CVVYGLFTQAKTSYVIFVMLFLALITGLSCRLGLKQIFNLLFEGMQKSLHLFFLFILFDPFMALIHQAGGFNALTELLTP LINLGGKPVLSILIGFTGAFGMPGAAEATIKMLHQLFSPSVLQMQLPLITFALCMLFATRVTNYAYPGANMFAAMGFAGS ENVKAMIQNGLVVTGVQVAFLIVYSLFIP
Sequences:
>Translated_429_residues MSFYIQLASLSIIILYVLLLFRNVDPLVATAVCVGLGFLWNISTPIDIGNAMADALGSFMALVGFIIMLGRGLGEVLTHT QVSHTLVHQIVYGVGVNTQRRAKIGIVLSSFIIVGLLGTLAGGLAILAPSLRPIAGSVGLSRPSLAVLMQASAEEALILG PFAPPVVTLLGVTGLSYGAVFLYASLPIAVVTLITTWFMASRLQKLYINEPCEDENSTEPFTPNRQQKRATLIFLISFLF CVVYGLFTQAKTSYVIFVMLFLALITGLSCRLGLKQIFNLLFEGMQKSLHLFFLFILFDPFMALIHQAGGFNALTELLTP LINLGGKPVLSILIGFTGAFGMPGAAEATIKMLHQLFSPSVLQMQLPLITFALCMLFATRVTNYAYPGANMFAAMGFAGS ENVKAMIQNGLVVTGVQVAFLIVYSLFIP >Mature_428_residues SFYIQLASLSIIILYVLLLFRNVDPLVATAVCVGLGFLWNISTPIDIGNAMADALGSFMALVGFIIMLGRGLGEVLTHTQ VSHTLVHQIVYGVGVNTQRRAKIGIVLSSFIIVGLLGTLAGGLAILAPSLRPIAGSVGLSRPSLAVLMQASAEEALILGP FAPPVVTLLGVTGLSYGAVFLYASLPIAVVTLITTWFMASRLQKLYINEPCEDENSTEPFTPNRQQKRATLIFLISFLFC VVYGLFTQAKTSYVIFVMLFLALITGLSCRLGLKQIFNLLFEGMQKSLHLFFLFILFDPFMALIHQAGGFNALTELLTPL INLGGKPVLSILIGFTGAFGMPGAAEATIKMLHQLFSPSVLQMQLPLITFALCMLFATRVTNYAYPGANMFAAMGFAGSE NVKAMIQNGLVVTGVQVAFLIVYSLFIP
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 46208; Mature: 46077
Theoretical pI: Translated: 8.68; Mature: 8.68
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 3.7 %Met (Translated Protein) 4.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 3.5 %Met (Mature Protein) 4.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSFYIQLASLSIIILYVLLLFRNVDPLVATAVCVGLGFLWNISTPIDIGNAMADALGSFM CCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH ALVGFIIMLGRGLGEVLTHTQVSHTLVHQIVYGVGVNTQRRAKIGIVLSSFIIVGLLGTL HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AGGLAILAPSLRPIAGSVGLSRPSLAVLMQASAEEALILGPFAPPVVTLLGVTGLSYGAV HHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH FLYASLPIAVVTLITTWFMASRLQKLYINEPCEDENSTEPFTPNRQQKRATLIFLISFLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH CVVYGLFTQAKTSYVIFVMLFLALITGLSCRLGLKQIFNLLFEGMQKSLHLFFLFILFDP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FMALIHQAGGFNALTELLTPLINLGGKPVLSILIGFTGAFGMPGAAEATIKMLHQLFSPS HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCC VLQMQLPLITFALCMLFATRVTNYAYPGANMFAAMGFAGSENVKAMIQNGLVVTGVQVAF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCEEHHHHHHH LIVYSLFIP HHHHHHHCC >Mature Secondary Structure SFYIQLASLSIIILYVLLLFRNVDPLVATAVCVGLGFLWNISTPIDIGNAMADALGSFM CEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH ALVGFIIMLGRGLGEVLTHTQVSHTLVHQIVYGVGVNTQRRAKIGIVLSSFIIVGLLGTL HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AGGLAILAPSLRPIAGSVGLSRPSLAVLMQASAEEALILGPFAPPVVTLLGVTGLSYGAV HHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH FLYASLPIAVVTLITTWFMASRLQKLYINEPCEDENSTEPFTPNRQQKRATLIFLISFLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH CVVYGLFTQAKTSYVIFVMLFLALITGLSCRLGLKQIFNLLFEGMQKSLHLFFLFILFDP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FMALIHQAGGFNALTELLTPLINLGGKPVLSILIGFTGAFGMPGAAEATIKMLHQLFSPS HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCC VLQMQLPLITFALCMLFATRVTNYAYPGANMFAAMGFAGSENVKAMIQNGLVVTGVQVAF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCEEHHHHHHH LIVYSLFIP HHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA