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The map label for this gene is 54294010

Identifier: 54294010

GI number: 54294010

Start: 1200795

End: 1202768

Strand: Reverse

Name: 54294010

Synonym: lpl1071

Alternate gene names: NA

Gene position: 1202768-1200795 (Counterclockwise)

Preceding gene: 54294013

Following gene: 54294009

Centisome position: 35.95

GC content: 34.5

Gene sequence:

>1974_bases
TTGACATCCGGTGACAATAATTTGTTGGCACCATTATCTTTATTAAAAGAGAATGAATATTTTATGATTAATCCAGAATA
TATATTTACCCTAATAACAAAAGACTCAACAGTTTATTTCTTCGTCTCATTCATTTTCGCAATCGCTTTAATTCCATTTT
GGCAAGCCACCTATACAATAGGCAAAGTAAATCGAGCTATAAAGAAAGCAAATGAACTAATTAAATCATTGGGAAATGAA
TCACCTTCTAAATTCTATAATGAATTTGAGAACATAAAAGCTCAATTGAATGGCATTGATTATTTGAAAAATATTTGGGG
AGAATTCATTGGTAGCACTTATTATTTAACAAATAATAATACACAACAAATTAACTCCAATAAAATTTTCCTATCACATC
GTCCCTCCTATTATTTTAATAAAGAATCTGTGCTTGGATCACAATTGAATCTAAATCAGTTTTTTTCCTTCCCTAATTAT
TTGATTGGATTAGGCTTAGCTTTTACTTTTATTGGATTAGCAGCTGCATTGCATATAGCACAATCAGGTCTCGCAAATGG
CGAAGGCCAAACGGCATTAAGTGAGCTACTTAAAGTTGCTTCAGTTAAATTTTTCAGTTCTATAACAGGTATCGGTTGCA
GTTTGATTATATCTTTTATACAAAAAATACGTATTAAAGGATTTCAAAATAATTTGAATAATTTCTGTGGGTTGCTAGAG
AAATGTACAGAATACAAACCTGCTGAAAAATTGATCTTTGAAAGTATACAGGAAGAAAAAACTCACACTTTAGCGTTGCA
AAGTATGGCAAATGATATCTCTATCGGAATTGGAGATGTCCTAAATAATCAACTTCCTGCTAGTGTAGCAAATGCCTTGG
CTCCATTAGCTGATGAAATAAGAGCTCTTGCTCAAAAATTTTCTGGAAGCAACGAAAATGCCCTGGAGAAGGTACTTAAT
GAATTTCTTGATCAACTACGTAAAAGTTCTGGTGATGAGATGCAAGGGCTCATTGACGGTGTAAATACTCTAAAAGATTC
CCTTCTTCGACTAGTTGAAAATATGGAAACCATGGGTAAATCATTTGGTTCTAATACAAAAGACTCTACCGACCGGCTAA
TGGCCTCCCTTGATGCATTTACGTCGACTTTCACACCTGTACAACAAGGTATTGGAAAATTTGGACAGTCTCTTGATTCT
CTTGAAAACATCGCAAGAAGTATTCAACAGGCAAGTGGCAACATTACTGGTGCCGCTGATATTAGCAATCAAAGCATGTC
TAACCTTGCAGGTACAGTTACTCAAATTACCGAAAACTTAACTCCAATTCAGGATCTTTTGAATGTGATTAATCTTTCAT
TGAAAAAAGTTGATGAATCATCGGAAAACCTTCATGGGGCAGGGAGAACCATAGCATCAGCTGCAGATGGGTTTAAAAAT
TCTGCAGAATCCATTGAGCAAGCAAGTAATAGATTTGATCAAAAAATTAATAAATTTGAAGTTGTAATAGATGGAATCTC
AGGAACAGCAAATGTTCTTGAACGAGCTTCAAACAACGTGAGTAATGCCATTAAACCACTATCTGAAACTTCAGAAGGAT
TAACTAAAGTTATTCATGCAATTCAAGAAACCGAATCAAGAATACATGGAAGTCAAAAACAACTCTCTGATTTATTAATT
AATCTTGAAAACTTCACTGAGAAACTACCCTCTCTTTTATCTCAATATGAAGAGCGCTTCAGCAAAGTAGATCAAGATCT
TGCAAACGCCTTTGGAGAGTTAGCTAAAGGAAGCGACGAATTCAGAACTAGCATAAGTCAATTTGTAATATCATTTGATC
AACAATTTGACAAAGCAATACGACAACTTAGCGGTGTTATTCAAGACCTTCAAGAAGAGCGAGAAAACGCTGAACTAACA
ACAAACAATTACCATAAAGCAGAGTATGTAGATGCAGACACCAGAATCGCATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTATTCTCCCACTAATAATCATAATAACAACTCGTGGTTGAAATCGGACTTATCAAACGAACTTAATGCCCAAAAACCA
AATTATGGCAAAAAGTTGAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAAAGCTATTTCGCATCATTCACGGATATGCTTGTTGGAATTATTTTCATATTTATTATTTTGCTAATGATTGTGGCAA
ATAACTTTCAAAGTGCAACA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 657; Mature: 656

Protein sequence:

>657_residues
MTSGDNNLLAPLSLLKENEYFMINPEYIFTLITKDSTVYFFVSFIFAIALIPFWQATYTIGKVNRAIKKANELIKSLGNE
SPSKFYNEFENIKAQLNGIDYLKNIWGEFIGSTYYLTNNNTQQINSNKIFLSHRPSYYFNKESVLGSQLNLNQFFSFPNY
LIGLGLAFTFIGLAAALHIAQSGLANGEGQTALSELLKVASVKFFSSITGIGCSLIISFIQKIRIKGFQNNLNNFCGLLE
KCTEYKPAEKLIFESIQEEKTHTLALQSMANDISIGIGDVLNNQLPASVANALAPLADEIRALAQKFSGSNENALEKVLN
EFLDQLRKSSGDEMQGLIDGVNTLKDSLLRLVENMETMGKSFGSNTKDSTDRLMASLDAFTSTFTPVQQGIGKFGQSLDS
LENIARSIQQASGNITGAADISNQSMSNLAGTVTQITENLTPIQDLLNVINLSLKKVDESSENLHGAGRTIASAADGFKN
SAESIEQASNRFDQKINKFEVVIDGISGTANVLERASNNVSNAIKPLSETSEGLTKVIHAIQETESRIHGSQKQLSDLLI
NLENFTEKLPSLLSQYEERFSKVDQDLANAFGELAKGSDEFRTSISQFVISFDQQFDKAIRQLSGVIQDLQEERENAELT
TNNYHKAEYVDADTRIA

Sequences:

>Translated_657_residues
MTSGDNNLLAPLSLLKENEYFMINPEYIFTLITKDSTVYFFVSFIFAIALIPFWQATYTIGKVNRAIKKANELIKSLGNE
SPSKFYNEFENIKAQLNGIDYLKNIWGEFIGSTYYLTNNNTQQINSNKIFLSHRPSYYFNKESVLGSQLNLNQFFSFPNY
LIGLGLAFTFIGLAAALHIAQSGLANGEGQTALSELLKVASVKFFSSITGIGCSLIISFIQKIRIKGFQNNLNNFCGLLE
KCTEYKPAEKLIFESIQEEKTHTLALQSMANDISIGIGDVLNNQLPASVANALAPLADEIRALAQKFSGSNENALEKVLN
EFLDQLRKSSGDEMQGLIDGVNTLKDSLLRLVENMETMGKSFGSNTKDSTDRLMASLDAFTSTFTPVQQGIGKFGQSLDS
LENIARSIQQASGNITGAADISNQSMSNLAGTVTQITENLTPIQDLLNVINLSLKKVDESSENLHGAGRTIASAADGFKN
SAESIEQASNRFDQKINKFEVVIDGISGTANVLERASNNVSNAIKPLSETSEGLTKVIHAIQETESRIHGSQKQLSDLLI
NLENFTEKLPSLLSQYEERFSKVDQDLANAFGELAKGSDEFRTSISQFVISFDQQFDKAIRQLSGVIQDLQEERENAELT
TNNYHKAEYVDADTRIA
>Mature_656_residues
TSGDNNLLAPLSLLKENEYFMINPEYIFTLITKDSTVYFFVSFIFAIALIPFWQATYTIGKVNRAIKKANELIKSLGNES
PSKFYNEFENIKAQLNGIDYLKNIWGEFIGSTYYLTNNNTQQINSNKIFLSHRPSYYFNKESVLGSQLNLNQFFSFPNYL
IGLGLAFTFIGLAAALHIAQSGLANGEGQTALSELLKVASVKFFSSITGIGCSLIISFIQKIRIKGFQNNLNNFCGLLEK
CTEYKPAEKLIFESIQEEKTHTLALQSMANDISIGIGDVLNNQLPASVANALAPLADEIRALAQKFSGSNENALEKVLNE
FLDQLRKSSGDEMQGLIDGVNTLKDSLLRLVENMETMGKSFGSNTKDSTDRLMASLDAFTSTFTPVQQGIGKFGQSLDSL
ENIARSIQQASGNITGAADISNQSMSNLAGTVTQITENLTPIQDLLNVINLSLKKVDESSENLHGAGRTIASAADGFKNS
AESIEQASNRFDQKINKFEVVIDGISGTANVLERASNNVSNAIKPLSETSEGLTKVIHAIQETESRIHGSQKQLSDLLIN
LENFTEKLPSLLSQYEERFSKVDQDLANAFGELAKGSDEFRTSISQFVISFDQQFDKAIRQLSGVIQDLQEERENAELTT
NNYHKAEYVDADTRIA

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 72466; Mature: 72335

Theoretical pI: Translated: 4.71; Mature: 4.71

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTSGDNNLLAPLSLLKENEYFMINPEYIFTLITKDSTVYFFVSFIFAIALIPFWQATYTI
CCCCCCCCHHHHHHHCCCCEEEECHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GKVNRAIKKANELIKSLGNESPSKFYNEFENIKAQLNGIDYLKNIWGEFIGSTYYLTNNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCC
TQQINSNKIFLSHRPSYYFNKESVLGSQLNLNQFFSFPNYLIGLGLAFTFIGLAAALHIA
CCEECCCEEEEEECCCCEECHHHHCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QSGLANGEGQTALSELLKVASVKFFSSITGIGCSLIISFIQKIRIKGFQNNLNNFCGLLE
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KCTEYKPAEKLIFESIQEEKTHTLALQSMANDISIGIGDVLNNQLPASVANALAPLADEI
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
RALAQKFSGSNENALEKVLNEFLDQLRKSSGDEMQGLIDGVNTLKDSLLRLVENMETMGK
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFGSNTKDSTDRLMASLDAFTSTFTPVQQGIGKFGQSLDSLENIARSIQQASGNITGAAD
HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
ISNQSMSNLAGTVTQITENLTPIQDLLNVINLSLKKVDESSENLHGAGRTIASAADGFKN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
SAESIEQASNRFDQKINKFEVVIDGISGTANVLERASNNVSNAIKPLSETSEGLTKVIHA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IQETESRIHGSQKQLSDLLINLENFTEKLPSLLSQYEERFSKVDQDLANAFGELAKGSDE
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
FRTSISQFVISFDQQFDKAIRQLSGVIQDLQEERENAELTTNNYHKAEYVDADTRIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TSGDNNLLAPLSLLKENEYFMINPEYIFTLITKDSTVYFFVSFIFAIALIPFWQATYTI
CCCCCCCHHHHHHHCCCCEEEECHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GKVNRAIKKANELIKSLGNESPSKFYNEFENIKAQLNGIDYLKNIWGEFIGSTYYLTNNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCC
TQQINSNKIFLSHRPSYYFNKESVLGSQLNLNQFFSFPNYLIGLGLAFTFIGLAAALHIA
CCEECCCEEEEEECCCCEECHHHHCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QSGLANGEGQTALSELLKVASVKFFSSITGIGCSLIISFIQKIRIKGFQNNLNNFCGLLE
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KCTEYKPAEKLIFESIQEEKTHTLALQSMANDISIGIGDVLNNQLPASVANALAPLADEI
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
RALAQKFSGSNENALEKVLNEFLDQLRKSSGDEMQGLIDGVNTLKDSLLRLVENMETMGK
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFGSNTKDSTDRLMASLDAFTSTFTPVQQGIGKFGQSLDSLENIARSIQQASGNITGAAD
HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
ISNQSMSNLAGTVTQITENLTPIQDLLNVINLSLKKVDESSENLHGAGRTIASAADGFKN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
SAESIEQASNRFDQKINKFEVVIDGISGTANVLERASNNVSNAIKPLSETSEGLTKVIHA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IQETESRIHGSQKQLSDLLINLENFTEKLPSLLSQYEERFSKVDQDLANAFGELAKGSDE
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
FRTSISQFVISFDQQFDKAIRQLSGVIQDLQEERENAELTTNNYHKAEYVDADTRIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA