Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 54020528

Identifier: 54020528

GI number: 54020528

Start: 579726

End: 581507

Strand: Reverse

Name: 54020528

Synonym: mhp468

Alternate gene names: NA

Gene position: 581507-579726 (Counterclockwise)

Preceding gene: 54020529

Following gene: 54020527

Centisome position: 65.14

GC content: 27.33

Gene sequence:

>1782_bases
TTGACTTTGTTACAAGTCAGGACAAATATTTTTAGATCTAATCAATATTTTAGATTTCTATTCAAGTTAAGTTTTAAAAA
AAAAGTAATTTATGTTTTCATTACTCTTTCCTTCTTAATGACAATGATGCTTGCTTTAATTGCAAAATTCTATGCAACTG
AGAAAAGTTTTAGTTTGTTCTCATTTATTATTTTATTTATAAATCTTTCTTTGACAATAATTATTGCCTCTTATATGTTT
TTATCAATTTTTAAGGATTTATCAACTTCAAGTGTTGATATAATAACTTTTATAAAACCTTATTCGCGGCAATATTTTAT
TCTTACAAAACTTTTGTTTTTAACTTTTTTTGGGATTTTATGGTCAGTTTTTATCAGCTTTTTACTTGTTTCCTTTTATA
TGATAAATTTTAAATATTTAGGTCAGGTAAATTCGCCTTTATTATGAGGTTTTTTATCTTCTTTTTTTTCCTTTATGATT
TTTGGCGCAATGACAGCTTTATTTGGCAATAAATTTAGTTCAAAATTATCGCTTTCAATTGCAGTTTTTTCATTTTCTCC
TTTTATTCTAATTGGATCTAGTTCAGCTTTTAGTGCAACATCAACTATTAACCGTTTTGCAGAAATTCTTAATTTAGAAC
ATCAAAATTATGATTCAAATACAATTGTAGATGTTGAAAAATTCTACCTTAATCAAAAAAAAGACCAATTTTTCCTTATA
CCAAAACAAGTAGATAACCCAAATTTTTCAAAAAGGCAAGTAGAATATATCCAACAGGCTTGAAATGATAGCTCAGCTGC
AGCTCAAGCTTGACAGGCGGCTTCTTATTTATTGATTCCTTATCAGTTAATTAATGTTTTTGAGCCAAATGATCGGGATG
CAATTGAAAATGCAGTCGGAATCCCCGAAAGTTTCCTAAAAAATTATATTTATTCCAATAATTTGGCATCAAAAAAAAAT
AATTACCTTTTATCTACAAGTCCAGAATTAAAAAAATATAAATTATCGACATCACAGGAAGTTTTTTTAGTCCCGGGATC
GCTTAAAAATGATTCCCATTTTGAAAATCTAGAAAACCGCGAAATTATTTATGCAAGTGAAAATGCTGCTAATTTTGCCA
AAATTTTACCCCAAGACGCCCAAACTTTTGGTCTTACTTCTGATCTTGTTGGGAAATTAAAGTGAAATTTAATAAAAGAA
CTTTTATCTTCACCAATTTTTGATAAATTTGCAAATAATTTTTTTGCAAATTTTAGCAATAAAGTACGTCAGAAAGAAAT
TCTTGAAAAAATTTCGGATACAATTTCAGCTAATAAAGAGCTTTTGGAACTAAATGATGAAAATGCTGCGGTTTTAGCAA
AAAAACTTGATATTAAAAAAGTTGAAAATCAAGTCCAAAAAAAAATCTATCTTGCAACCGCGCTAATTTATTGACTTTAT
TTTAATAGACAAAACACGGAAATACTTGATAATTTTTTAAAAAATGAGCAAAATAATTACGATCCGGGTCCAATTTTTAT
CAAAATTGATAAAGAAAACTACCAAATCGGCGGCTTTTCCTCATTTAGTTCTGAACAACGAGTGCTTGAGAATAAAGTAA
TTAAACGTTTTAACTTGTCAAAAAGCAATAATTTTTTATTTCAGCCAGTTTTACAGATGATGGAAATCAAAAGCCACTAT
CAGGTCGTCTCAAAAAAAATTTATCCAGTAATTTGGGCCCTAATTTCTGCAATTTTATTATTTTTTATCTTTATTATTTA
TTCAAGAAAGGACTATAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTAAAAGTGGTTTTCCGCTTTTTAATTTAGTAAAAATTTTAAAATTTTACAAATTATTATCTAATATTATACAACAA
TATTAGATAAGTAGAAGAGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTCTGATTGGATTTTGGAAGTAGAAAATCTAACAAAAATTTATTCAAAATCAGAAGCAGGGGTTAAAAATGTTAGTTTT
AAGGTTAAAAAAAACCAAAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 593; Mature: 592

Protein sequence:

>593_residues
MTLLQVRTNIFRSNQYFRFLFKLSFKKKVIYVFITLSFLMTMMLALIAKFYATEKSFSLFSFIILFINLSLTIIIASYMF
LSIFKDLSTSSVDIITFIKPYSRQYFILTKLLFLTFFGILWSVFISFLLVSFYMINFKYLGQVNSPLLWGFLSSFFSFMI
FGAMTALFGNKFSSKLSLSIAVFSFSPFILIGSSSAFSATSTINRFAEILNLEHQNYDSNTIVDVEKFYLNQKKDQFFLI
PKQVDNPNFSKRQVEYIQQAWNDSSAAAQAWQAASYLLIPYQLINVFEPNDRDAIENAVGIPESFLKNYIYSNNLASKKN
NYLLSTSPELKKYKLSTSQEVFLVPGSLKNDSHFENLENREIIYASENAANFAKILPQDAQTFGLTSDLVGKLKWNLIKE
LLSSPIFDKFANNFFANFSNKVRQKEILEKISDTISANKELLELNDENAAVLAKKLDIKKVENQVQKKIYLATALIYWLY
FNRQNTEILDNFLKNEQNNYDPGPIFIKIDKENYQIGGFSSFSSEQRVLENKVIKRFNLSKSNNFLFQPVLQMMEIKSHY
QVVSKKIYPVIWALISAILLFFIFIIYSRKDYK

Sequences:

>Translated_593_residues
MTLLQVRTNIFRSNQYFRFLFKLSFKKKVIYVFITLSFLMTMMLALIAKFYATEKSFSLFSFIILFINLSLTIIIASYMF
LSIFKDLSTSSVDIITFIKPYSRQYFILTKLLFLTFFGILWSVFISFLLVSFYMINFKYLGQVNSPLL*GFLSSFFSFMI
FGAMTALFGNKFSSKLSLSIAVFSFSPFILIGSSSAFSATSTINRFAEILNLEHQNYDSNTIVDVEKFYLNQKKDQFFLI
PKQVDNPNFSKRQVEYIQQA*NDSSAAAQA*QAASYLLIPYQLINVFEPNDRDAIENAVGIPESFLKNYIYSNNLASKKN
NYLLSTSPELKKYKLSTSQEVFLVPGSLKNDSHFENLENREIIYASENAANFAKILPQDAQTFGLTSDLVGKLK*NLIKE
LLSSPIFDKFANNFFANFSNKVRQKEILEKISDTISANKELLELNDENAAVLAKKLDIKKVENQVQKKIYLATALIY*LY
FNRQNTEILDNFLKNEQNNYDPGPIFIKIDKENYQIGGFSSFSSEQRVLENKVIKRFNLSKSNNFLFQPVLQMMEIKSHY
QVVSKKIYPVIWALISAILLFFIFIIYSRKDYK
>Mature_592_residues
TLLQVRTNIFRSNQYFRFLFKLSFKKKVIYVFITLSFLMTMMLALIAKFYATEKSFSLFSFIILFINLSLTIIIASYMFL
SIFKDLSTSSVDIITFIKPYSRQYFILTKLLFLTFFGILWSVFISFLLVSFYMINFKYLGQVNSPLL*GFLSSFFSFMIF
GAMTALFGNKFSSKLSLSIAVFSFSPFILIGSSSAFSATSTINRFAEILNLEHQNYDSNTIVDVEKFYLNQKKDQFFLIP
KQVDNPNFSKRQVEYIQQA*NDSSAAAQA*QAASYLLIPYQLINVFEPNDRDAIENAVGIPESFLKNYIYSNNLASKKNN
YLLSTSPELKKYKLSTSQEVFLVPGSLKNDSHFENLENREIIYASENAANFAKILPQDAQTFGLTSDLVGKLK*NLIKEL
LSSPIFDKFANNFFANFSNKVRQKEILEKISDTISANKELLELNDENAAVLAKKLDIKKVENQVQKKIYLATALIY*LYF
NRQNTEILDNFLKNEQNNYDPGPIFIKIDKENYQIGGFSSFSSEQRVLENKVIKRFNLSKSNNFLFQPVLQMMEIKSHYQ
VVSKKIYPVIWALISAILLFFIFIIYSRKDYK

Specific function: Unknown

COG id: COG1277

COG function: function code R; ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67811; Mature: 67679

Theoretical pI: Translated: 9.86; Mature: 9.86

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTLLQVRTNIFRSNQYFRFLFKLSFKKKVIYVFITLSFLMTMMLALIAKFYATEKSFSLF
CCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
SFIILFINLSLTIIIASYMFLSIFKDLSTSSVDIITFIKPYSRQYFILTKLLFLTFFGIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
WSVFISFLLVSFYMINFKYLGQVNSPLLGFLSSFFSFMIFGAMTALFGNKFSSKLSLSIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEE
VFSFSPFILIGSSSAFSATSTINRFAEILNLEHQNYDSNTIVDVEKFYLNQKKDQFFLIP
EEECCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEHHHHHHCCCCCCEEEEC
KQVDNPNFSKRQVEYIQQANDSSAAAQAQAASYLLIPYQLINVFEPNDRDAIENAVGIPE
CCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCH
SFLKNYIYSNNLASKKNNYLLSTSPELKKYKLSTSQEVFLVPGSLKNDSHFENLENREII
HHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHEECCCCCEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCEEE
YASENAANFAKILPQDAQTFGLTSDLVGKLKNLIKELLSSPIFDKFANNFFANFSNKVRQ
EECCCCHHHHHHCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEILEKISDTISANKELLELNDENAAVLAKKLDIKKVENQVQKKIYLATALIYLYFNRQN
HHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
TEILDNFLKNEQNNYDPGPIFIKIDKENYQIGGFSSFSSEQRVLENKVIKRFNLSKSNNF
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
LFQPVLQMMEIKSHYQVVSKKIYPVIWALISAILLFFIFIIYSRKDYK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TLLQVRTNIFRSNQYFRFLFKLSFKKKVIYVFITLSFLMTMMLALIAKFYATEKSFSLF
CHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
SFIILFINLSLTIIIASYMFLSIFKDLSTSSVDIITFIKPYSRQYFILTKLLFLTFFGIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
WSVFISFLLVSFYMINFKYLGQVNSPLLGFLSSFFSFMIFGAMTALFGNKFSSKLSLSIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEE
VFSFSPFILIGSSSAFSATSTINRFAEILNLEHQNYDSNTIVDVEKFYLNQKKDQFFLIP
EEECCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEHHHHHHCCCCCCEEEEC
KQVDNPNFSKRQVEYIQQANDSSAAAQAQAASYLLIPYQLINVFEPNDRDAIENAVGIPE
CCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCH
SFLKNYIYSNNLASKKNNYLLSTSPELKKYKLSTSQEVFLVPGSLKNDSHFENLENREII
HHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHEECCCCCEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCEEE
YASENAANFAKILPQDAQTFGLTSDLVGKLKNLIKELLSSPIFDKFANNFFANFSNKVRQ
EECCCCHHHHHHCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEILEKISDTISANKELLELNDENAAVLAKKLDIKKVENQVQKKIYLATALIYLYFNRQN
HHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
TEILDNFLKNEQNNYDPGPIFIKIDKENYQIGGFSSFSSEQRVLENKVIKRFNLSKSNNF
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
LFQPVLQMMEIKSHYQVVSKKIYPVIWALISAILLFFIFIIYSRKDYK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA