| Definition | Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006360 |
| Length | 892,758 |
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The map label for this gene is 54020495
Identifier: 54020495
GI number: 54020495
Start: 500902
End: 502794
Strand: Reverse
Name: 54020495
Synonym: mhp423
Alternate gene names: NA
Gene position: 502794-500902 (Counterclockwise)
Preceding gene: 54020496
Following gene: 54020494
Centisome position: 56.32
GC content: 26.15
Gene sequence:
>1893_bases ATGAAAAAAATTAATTTTTCCCACTATTTTCGTTTACATACAAGACAAAAGTATTTCATCTGAAACAATTTAGATTCTAA TTTTCCCGAAAATCCTGATTTTGATGAGGAAAATTTTGAGAATACAGTTTGAAATTTTGAAGCTTTAAGTGAAAATCCTA CCGATTTTTCTGAATTACACATTAATATTTTTAAAAATTTTACAACGGAATTTCATACTTTTATTAAAAAAAAATATCCT GAGAAGAAAATTTGCATTGTCTATCCGGCAGAAGTTGAAAAAAAAATTGCCCAAACAATTAGTTTTTATAAAAGTGGAAA TTGTGATATTATATTTAACCCATGTTTCGAATATAAAGATGCCGTAGCTCATTCTTCTGTATTTTTTGTATTTAATAAAA AAATAAGCATCCTAAAATTATCAACTTCAACAAAAATTAAAGACTATTTAGCCGCAAATTGAAATTTTTGAATTACAACT TATGCGCTTCGTGGATTTGGAAATGATCTTAATCCAATTGAAGAAGTTTCTTATTTTTTAATTGATACAGTTGAGAATCC AAGAAAAAATCAAACTGAATTTTGTGAAACATTATGAGTTTCAACTAACAAGGGTGTCAAGTCAGTTTCAAAAGTAGATC GTGAAGGTCCTTATTATTTTTTTGCAAAAAAAATCGCTAAACAAAACGGCCTTACACTTTTAGAGTTTAATAATCCTTAT TTTCTTGAACAAAATCGTCTTGTTAAAAATCTTCTTAGAAACACAGTTAGTAGAAATTCACCAAAGCAGCCTAAAAAAAC CAGAAAAATTATCAAAATGATTCCAATAATTGATGCTTTATCCGAAATCAAAGAGGCTAAAAACATAAAAACTTTTAGTC CACCACAGATTTCTGATAATGGGAATTTTGAAAAAAATCCTGATTTTAATATGCTAATGACAAAATTTTATCCTCAACTT GCAAATATTAGTGGTACCCTTTTAAAAGCAAAAGATGCTTTATCACTAATCGAAGACGAAGAAAAATTACTAACGCTTGA AAAAAATTCTTTTTGATTTAATTTTTTTCAAGAAAATAATAGCATTATTATTAATCAAATTGAGGAATTAAAAAAATTTT TACTAAATTTATATGCGAAAAAAATTGTCTGGTATGATTTTGAAGCTTTTTCCCTTCCATTTCCGCCAATTGATTATGTC CAACCCTTTCAGCAAATTGTTTCCCAGGTTTCGATAGTTTTAACTAATAGAGGCCAAATTTTGAATCAAAATTTTTCAGA TAGAAATCTTGTTTTTGATCCAAAAAATTATACTTGAGAAAATTTTTTCCTTATAATTGATAAAATTTATCATAAACATG CCGATTTTTATGTGGTTTTTAATAAATCTTATGAACTCACTAGACTAAAAGAAATGCTTGAGATAATTTTCAAAAATTAT CTTGAAAGACTTCCATATCATAAAGCAAAACAAAAATTAGAAGAATATGAGTTAAAAGTAGCTGAAATTATTAAAAAAAC GATTGATTTAAAAGACCCTTTTGCGAAATATTGACTAGTAATCTCGGATCTTAAGGGCTGTTATTCAATTAAAAAAATTG AAAATTTTATCACAAAATATAAATATAACCTTAAAAGATTAATAATCCCTTATAAACAATTAGCAATAAAAAACGGACTT GAGGCGATGATCGAATCAATTGATCGTTATTTTAATTTTATTGGTGATAATCAGTGGGAAATAACAAGGAAAAATTTGCA AATTTATTGCCAAAATGATGTAATTGCAATGATTATGGTCTGAGATTTTCTCAAATTTATTTATAAAAATGCAAATAATG CGTCTAATATTAAGGTAATCAAACCCCAAAAAGTTACACTTTTTGAGAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATGTAGTCGATTCACCAAATATTTTAAAAATTAAGCATTCGGTTTTAGAAAAAAAATTAGAAATTGATACATAATTTTTT AAAATATTTGGTAGATCTAG
Downstream 100 bases:
>100_bases AGCTAAAAAAGTAACTTAATTAGTTTTTAGTTCGAGTAAATAATCCCTACCTTTTTTAGTAATCCTCCGACCACGCGAGG TTTTCTCGATTAATTCCTTC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 630; Mature: 630
Protein sequence:
>630_residues MKKINFSHYFRLHTRQKYFIWNNLDSNFPENPDFDEENFENTVWNFEALSENPTDFSELHINIFKNFTTEFHTFIKKKYP EKKICIVYPAEVEKKIAQTISFYKSGNCDIIFNPCFEYKDAVAHSSVFFVFNKKISILKLSTSTKIKDYLAANWNFWITT YALRGFGNDLNPIEEVSYFLIDTVENPRKNQTEFCETLWVSTNKGVKSVSKVDREGPYYFFAKKIAKQNGLTLLEFNNPY FLEQNRLVKNLLRNTVSRNSPKQPKKTRKIIKMIPIIDALSEIKEAKNIKTFSPPQISDNGNFEKNPDFNMLMTKFYPQL ANISGTLLKAKDALSLIEDEEKLLTLEKNSFWFNFFQENNSIIINQIEELKKFLLNLYAKKIVWYDFEAFSLPFPPIDYV QPFQQIVSQVSIVLTNRGQILNQNFSDRNLVFDPKNYTWENFFLIIDKIYHKHADFYVVFNKSYELTRLKEMLEIIFKNY LERLPYHKAKQKLEEYELKVAEIIKKTIDLKDPFAKYWLVISDLKGCYSIKKIENFITKYKYNLKRLIIPYKQLAIKNGL EAMIESIDRYFNFIGDNQWEITRKNLQIYCQNDVIAMIMVWDFLKFIYKNANNASNIKVIKPQKVTLFEN
Sequences:
>Translated_630_residues MKKINFSHYFRLHTRQKYFI*NNLDSNFPENPDFDEENFENTV*NFEALSENPTDFSELHINIFKNFTTEFHTFIKKKYP EKKICIVYPAEVEKKIAQTISFYKSGNCDIIFNPCFEYKDAVAHSSVFFVFNKKISILKLSTSTKIKDYLAAN*NF*ITT YALRGFGNDLNPIEEVSYFLIDTVENPRKNQTEFCETL*VSTNKGVKSVSKVDREGPYYFFAKKIAKQNGLTLLEFNNPY FLEQNRLVKNLLRNTVSRNSPKQPKKTRKIIKMIPIIDALSEIKEAKNIKTFSPPQISDNGNFEKNPDFNMLMTKFYPQL ANISGTLLKAKDALSLIEDEEKLLTLEKNSF*FNFFQENNSIIINQIEELKKFLLNLYAKKIVWYDFEAFSLPFPPIDYV QPFQQIVSQVSIVLTNRGQILNQNFSDRNLVFDPKNYT*ENFFLIIDKIYHKHADFYVVFNKSYELTRLKEMLEIIFKNY LERLPYHKAKQKLEEYELKVAEIIKKTIDLKDPFAKY*LVISDLKGCYSIKKIENFITKYKYNLKRLIIPYKQLAIKNGL EAMIESIDRYFNFIGDNQWEITRKNLQIYCQNDVIAMIMV*DFLKFIYKNANNASNIKVIKPQKVTLFEN >Mature_630_residues MKKINFSHYFRLHTRQKYFI*NNLDSNFPENPDFDEENFENTV*NFEALSENPTDFSELHINIFKNFTTEFHTFIKKKYP EKKICIVYPAEVEKKIAQTISFYKSGNCDIIFNPCFEYKDAVAHSSVFFVFNKKISILKLSTSTKIKDYLAAN*NF*ITT YALRGFGNDLNPIEEVSYFLIDTVENPRKNQTEFCETL*VSTNKGVKSVSKVDREGPYYFFAKKIAKQNGLTLLEFNNPY FLEQNRLVKNLLRNTVSRNSPKQPKKTRKIIKMIPIIDALSEIKEAKNIKTFSPPQISDNGNFEKNPDFNMLMTKFYPQL ANISGTLLKAKDALSLIEDEEKLLTLEKNSF*FNFFQENNSIIINQIEELKKFLLNLYAKKIVWYDFEAFSLPFPPIDYV QPFQQIVSQVSIVLTNRGQILNQNFSDRNLVFDPKNYT*ENFFLIIDKIYHKHADFYVVFNKSYELTRLKEMLEIIFKNY LERLPYHKAKQKLEEYELKVAEIIKKTIDLKDPFAKY*LVISDLKGCYSIKKIENFITKYKYNLKRLIIPYKQLAIKNGL EAMIESIDRYFNFIGDNQWEITRKNLQIYCQNDVIAMIMV*DFLKFIYKNANNASNIKVIKPQKVTLFEN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To M.genitalium MG366 and M.pneumoniae MPN544 [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR021301 [H]
Pfam domain/function: PF11074 DUF2779 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 73044; Mature: 73044
Theoretical pI: Translated: 9.45; Mature: 9.45
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKINFSHYFRLHTRQKYFINNLDSNFPENPDFDEENFENTVNFEALSENPTDFSELHIN CCCCCCHHEEEEECCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHH IFKNFTTEFHTFIKKKYPEKKICIVYPAEVEKKIAQTISFYKSGNCDIIFNPCFEYKDAV HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHH AHSSVFFVFNKKISILKLSTSTKIKDYLAANNFITTYALRGFGNDLNPIEEVSYFLIDTV HCCCEEEEEECCEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCC ENPRKNQTEFCETLVSTNKGVKSVSKVDREGPYYFFAKKIAKQNGLTLLEFNNPYFLEQN CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHCCCCEEEEECCCEEECHH RLVKNLLRNTVSRNSPKQPKKTRKIIKMIPIIDALSEIKEAKNIKTFSPPQISDNGNFEK HHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC NPDFNMLMTKFYPQLANISGTLLKAKDALSLIEDEEKLLTLEKNSFFNFFQENNSIIINQ CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHCCCCEEEHH IEELKKFLLNLYAKKIVWYDFEAFSLPFPPIDYVQPFQQIVSQVSIVLTNRGQILNQNFS HHHHHHHHHHHHHHHHEEEECHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHCCCCCC DRNLVFDPKNYTENFFLIIDKIYHKHADFYVVFNKSYELTRLKEMLEIIFKNYLERLPYH CCCEEECCCCCCCCCEEEHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH KAKQKLEEYELKVAEIIKKTIDLKDPFAKYLVISDLKGCYSIKKIENFITKYKYNLKRLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IPYKQLAIKNGLEAMIESIDRYFNFIGDNQWEITRKNLQIYCQNDVIAMIMVDFLKFIYK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH NANNASNIKVIKPQKVTLFEN CCCCCCCEEEECCCEEEEECC >Mature Secondary Structure MKKINFSHYFRLHTRQKYFINNLDSNFPENPDFDEENFENTVNFEALSENPTDFSELHIN CCCCCCHHEEEEECCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHH IFKNFTTEFHTFIKKKYPEKKICIVYPAEVEKKIAQTISFYKSGNCDIIFNPCFEYKDAV HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHH AHSSVFFVFNKKISILKLSTSTKIKDYLAANNFITTYALRGFGNDLNPIEEVSYFLIDTV HCCCEEEEEECCEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCC ENPRKNQTEFCETLVSTNKGVKSVSKVDREGPYYFFAKKIAKQNGLTLLEFNNPYFLEQN CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHCCCCEEEEECCCEEECHH RLVKNLLRNTVSRNSPKQPKKTRKIIKMIPIIDALSEIKEAKNIKTFSPPQISDNGNFEK HHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC NPDFNMLMTKFYPQLANISGTLLKAKDALSLIEDEEKLLTLEKNSFFNFFQENNSIIINQ CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHCCCCEEEHH IEELKKFLLNLYAKKIVWYDFEAFSLPFPPIDYVQPFQQIVSQVSIVLTNRGQILNQNFS HHHHHHHHHHHHHHHHEEEECHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHCCCCCC DRNLVFDPKNYTENFFLIIDKIYHKHADFYVVFNKSYELTRLKEMLEIIFKNYLERLPYH CCCEEECCCCCCCCCEEEHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH KAKQKLEEYELKVAEIIKKTIDLKDPFAKYLVISDLKGCYSIKKIENFITKYKYNLKRLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IPYKQLAIKNGLEAMIESIDRYFNFIGDNQWEITRKNLQIYCQNDVIAMIMVDFLKFIYK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH NANNASNIKVIKPQKVTLFEN CCCCCCCEEEECCCEEEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11048724 [H]