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Definition Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome.
Accession NC_006360
Length 892,758

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The map label for this gene is 54020425

Identifier: 54020425

GI number: 54020425

Start: 291693

End: 293303

Strand: Reverse

Name: 54020425

Synonym: mhp267

Alternate gene names: NA

Gene position: 293303-291693 (Counterclockwise)

Preceding gene: 54020426

Following gene: 54020424

Centisome position: 32.85

GC content: 29.05

Gene sequence:

>1611_bases
TTGCTCAAAGGGGGAGATAAGATGGAATCAGCATTAGCAAAAAAGAGCAAGTCACAGAAAATCACCTTTTTTGGCGCTCT
TTTAATCGTGCTTGGCGCAAGTATTGGTGCTGGAATTTTCTTTAAATCAAAGTCCGTTTTGGAAAATTCAGGTTATAATT
TGGCTCTTGCAATCGGAAACTGAATTATTGCTTGTTTTTCAATTGTTGCAATGGCCATTGCTCTTGTTGAAATTTCATCA
GCAACAAAAAAATCTAATTTATCTATTATTATTTGAAATAAAGTCTTTAATTCTCAAGCTTTTTTTCAAATTTCAAAAAA
TTTCATTATTTATCTTTATCTACCATTTACTTATTTTGTCCTCCCTGTTTATTTTATGCAAATTTTCCAGGACGCAATTG
CAGCTTTTCGCCTTGATTCAAGCGGGCAATGAAATATGAATTCAGACTGAATTATTGTCCTTGCTGTTTCAATTTTGATA
ACAATTTATTTTTTTATCATTGGATTAAATACAAAAATTGCAGAATTTCACAATAAATTATTTCTTTTTGCGAAATTTTT
ACCAATTTTGGTAACAATAATTGTTGGTTTTGTATTTTTTTTTCAAGGGGGATCAAGTAGATTATCCAATAATTTTGATT
TTTTACCGATAGAAAAAATAAAAACAGAAGGAGCATCAATTGCCTCTAGTTTGCCAGGAGTTGGTGTTTTAATTTCGATG
TCAGGAATTTTCTTTTCATATGAAGGATTTTTTACTGCTGCTGGTTTACAATCAGAAATGAAGGAACCAAAAAAAACACC
AATTGCTATTTTATTAGGTATTGCAATTGCAACGATAATTTACCTTTTTATTGCAGTTGCAACTTCAATTGTTGGGGATG
GATCAATTTCATCTTTTATTCAAATTGCAAAAAACGAACTAAATTGGTCAGGTTTAACTATTAAATTAATTTTAGGAACA
ACTTTTTTGCTAATTGGAGTCAGTTTACTCGGAATTATTAATGTTTTTACTTTATGAGGTCCACGTGCCCTTGAAGAATT
AATTATGAGAGATGAATTTTCCTTACTAAAAAAATGGAAAAACCGTATAAATTTAAATAAACCTAAGGTTTCTACAGTTT
TTTTATGTATTTTTTCTGTTATTTGCTTAATTATTTTTACATTGATTGGTGTTTTTGCTTTTGATGATCAAAGTTATGGT
AATTATGGTGAAAAATTAAATAATTTATATTCATTTGCAGATATTACTGGAAATTGGGCGGCTTTGATTAGTTTCTTATT
AATCGCCGCGGCAATTTATGGTTGCATTCGAAACCGAAAAACGCAAAAAATAGCCGTTCAGAAGCAGCGTTATTTTCTCT
TTTTTGGCTATATTTCAGTAATTTTTATTACTATAGTATTAATTTTTGCAATTTTTGCCCCAATTATAGATTTGATTTTA
ATTTTTAGCTATAAACCTCCAATTCCCGAATTTAGTCAAATTCTAAAAACGCGAATAACTATCGTTATCGTGCTTTTTTT
GTTTATATTTGTCCCGGTTTTGCCGGTTATTTTAAATTGAGGGCAAAAAAAATTAAAAATTTTCAACAAAAGACAAAAAA
ATAGTTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AACTAATCGAAAAATATTTTATACCTTTGATTTAAATTTAAAAAAAAATACATTAATTTAAAGTGTTTTTTTTAAAATAT
GGTATAATTAGTCTTCCAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATAAGAAAGTTATGCAAATTAACTTAGAAAAATATATTCGAACCGTCGAAGATTTCCCTAAAAAAGGAATTAGTTTTAA
GGACATTTCACCATTACTTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 536; Mature: 536

Protein sequence:

>536_residues
MLKGGDKMESALAKKSKSQKITFFGALLIVLGASIGAGIFFKSKSVLENSGYNLALAIGNWIIACFSIVAMAIALVEISS
ATKKSNLSIIIWNKVFNSQAFFQISKNFIIYLYLPFTYFVLPVYFMQIFQDAIAAFRLDSSGQWNMNSDWIIVLAVSILI
TIYFFIIGLNTKIAEFHNKLFLFAKFLPILVTIIVGFVFFFQGGSSRLSNNFDFLPIEKIKTEGASIASSLPGVGVLISM
SGIFFSYEGFFTAAGLQSEMKEPKKTPIAILLGIAIATIIYLFIAVATSIVGDGSISSFIQIAKNELNWSGLTIKLILGT
TFLLIGVSLLGIINVFTLWGPRALEELIMRDEFSLLKKWKNRINLNKPKVSTVFLCIFSVICLIIFTLIGVFAFDDQSYG
NYGEKLNNLYSFADITGNWAALISFLLIAAAIYGCIRNRKTQKIAVQKQRYFLFFGYISVIFITIVLIFAIFAPIIDLIL
IFSYKPPIPEFSQILKTRITIVIVLFLFIFVPVLPVILNWGQKKLKIFNKRQKNSL

Sequences:

>Translated_536_residues
MLKGGDKMESALAKKSKSQKITFFGALLIVLGASIGAGIFFKSKSVLENSGYNLALAIGN*IIACFSIVAMAIALVEISS
ATKKSNLSIII*NKVFNSQAFFQISKNFIIYLYLPFTYFVLPVYFMQIFQDAIAAFRLDSSGQ*NMNSD*IIVLAVSILI
TIYFFIIGLNTKIAEFHNKLFLFAKFLPILVTIIVGFVFFFQGGSSRLSNNFDFLPIEKIKTEGASIASSLPGVGVLISM
SGIFFSYEGFFTAAGLQSEMKEPKKTPIAILLGIAIATIIYLFIAVATSIVGDGSISSFIQIAKNELNWSGLTIKLILGT
TFLLIGVSLLGIINVFTL*GPRALEELIMRDEFSLLKKWKNRINLNKPKVSTVFLCIFSVICLIIFTLIGVFAFDDQSYG
NYGEKLNNLYSFADITGNWAALISFLLIAAAIYGCIRNRKTQKIAVQKQRYFLFFGYISVIFITIVLIFAIFAPIIDLIL
IFSYKPPIPEFSQILKTRITIVIVLFLFIFVPVLPVILN*GQKKLKIFNKRQKNSL
>Mature_536_residues
MLKGGDKMESALAKKSKSQKITFFGALLIVLGASIGAGIFFKSKSVLENSGYNLALAIGN*IIACFSIVAMAIALVEISS
ATKKSNLSIII*NKVFNSQAFFQISKNFIIYLYLPFTYFVLPVYFMQIFQDAIAAFRLDSSGQ*NMNSD*IIVLAVSILI
TIYFFIIGLNTKIAEFHNKLFLFAKFLPILVTIIVGFVFFFQGGSSRLSNNFDFLPIEKIKTEGASIASSLPGVGVLISM
SGIFFSYEGFFTAAGLQSEMKEPKKTPIAILLGIAIATIIYLFIAVATSIVGDGSISSFIQIAKNELNWSGLTIKLILGT
TFLLIGVSLLGIINVFTL*GPRALEELIMRDEFSLLKKWKNRINLNKPKVSTVFLCIFSVICLIIFTLIGVFAFDDQSYG
NYGEKLNNLYSFADITGNWAALISFLLIAAAIYGCIRNRKTQKIAVQKQRYFLFFGYISVIFITIVLIFAIFAPIIDLIL
IFSYKPPIPEFSQILKTRITIVIVLFLFIFVPVLPVILN*GQKKLKIFNKRQKNSL

Specific function: Unknown

COG id: COG0531

COG function: function code E; Amino acid transporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To M.pneumoniae MPN_095 and MPN_096 [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002293 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58681; Mature: 58681

Theoretical pI: Translated: 10.25; Mature: 10.25

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKGGDKMESALAKKSKSQKITFFGALLIVLGASIGAGIFFKSKSVLENSGYNLALAIGN
CCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHCCCCEEEEHHHH
IIACFSIVAMAIALVEISSATKKSNLSIIINKVFNSQAFFQISKNFIIYLYLPFTYFVLP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEHHHCCHHHEEECCCEEEEEEHHHHHHHHH
VYFMQIFQDAIAAFRLDSSGQNMNSDIIVLAVSILITIYFFIIGLNTKIAEFHNKLFLFA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
KFLPILVTIIVGFVFFFQGGSSRLSNNFDFLPIEKIKTEGASIASSLPGVGVLISMSGIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHCCCCCEEEEECCCCE
FSYEGFFTAAGLQSEMKEPKKTPIAILLGIAIATIIYLFIAVATSIVGDGSISSFIQIAK
EEECCHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
NELNWSGLTIKLILGTTFLLIGVSLLGIINVFTLGPRALEELIMRDEFSLLKKWKNRINL
HCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NKPKVSTVFLCIFSVICLIIFTLIGVFAFDDQSYGNYGEKLNNLYSFADITGNWAALISF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
LLIAAAIYGCIRNRKTQKIAVQKQRYFLFFGYISVIFITIVLIFAIFAPIIDLILIFSYK
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PPIPEFSQILKTRITIVIVLFLFIFVPVLPVILNGQKKLKIFNKRQKNSL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLKGGDKMESALAKKSKSQKITFFGALLIVLGASIGAGIFFKSKSVLENSGYNLALAIGN
CCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHCCCCEEEEHHHH
IIACFSIVAMAIALVEISSATKKSNLSIIINKVFNSQAFFQISKNFIIYLYLPFTYFVLP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEHHHCCHHHEEECCCEEEEEEHHHHHHHHH
VYFMQIFQDAIAAFRLDSSGQNMNSDIIVLAVSILITIYFFIIGLNTKIAEFHNKLFLFA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
KFLPILVTIIVGFVFFFQGGSSRLSNNFDFLPIEKIKTEGASIASSLPGVGVLISMSGIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHCCCCCEEEEECCCCE
FSYEGFFTAAGLQSEMKEPKKTPIAILLGIAIATIIYLFIAVATSIVGDGSISSFIQIAK
EEECCHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
NELNWSGLTIKLILGTTFLLIGVSLLGIINVFTLGPRALEELIMRDEFSLLKKWKNRINL
HCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NKPKVSTVFLCIFSVICLIIFTLIGVFAFDDQSYGNYGEKLNNLYSFADITGNWAALISF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
LLIAAAIYGCIRNRKTQKIAVQKQRYFLFFGYISVIFITIVLIFAIFAPIIDLILIFSYK
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PPIPEFSQILKTRITIVIVLFLFIFVPVLPVILNGQKKLKIFNKRQKNSL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8948633; 9098066 [H]