| Definition | Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006360 |
| Length | 892,758 |
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The map label for this gene is 54020425
Identifier: 54020425
GI number: 54020425
Start: 291693
End: 293303
Strand: Reverse
Name: 54020425
Synonym: mhp267
Alternate gene names: NA
Gene position: 293303-291693 (Counterclockwise)
Preceding gene: 54020426
Following gene: 54020424
Centisome position: 32.85
GC content: 29.05
Gene sequence:
>1611_bases TTGCTCAAAGGGGGAGATAAGATGGAATCAGCATTAGCAAAAAAGAGCAAGTCACAGAAAATCACCTTTTTTGGCGCTCT TTTAATCGTGCTTGGCGCAAGTATTGGTGCTGGAATTTTCTTTAAATCAAAGTCCGTTTTGGAAAATTCAGGTTATAATT TGGCTCTTGCAATCGGAAACTGAATTATTGCTTGTTTTTCAATTGTTGCAATGGCCATTGCTCTTGTTGAAATTTCATCA GCAACAAAAAAATCTAATTTATCTATTATTATTTGAAATAAAGTCTTTAATTCTCAAGCTTTTTTTCAAATTTCAAAAAA TTTCATTATTTATCTTTATCTACCATTTACTTATTTTGTCCTCCCTGTTTATTTTATGCAAATTTTCCAGGACGCAATTG CAGCTTTTCGCCTTGATTCAAGCGGGCAATGAAATATGAATTCAGACTGAATTATTGTCCTTGCTGTTTCAATTTTGATA ACAATTTATTTTTTTATCATTGGATTAAATACAAAAATTGCAGAATTTCACAATAAATTATTTCTTTTTGCGAAATTTTT ACCAATTTTGGTAACAATAATTGTTGGTTTTGTATTTTTTTTTCAAGGGGGATCAAGTAGATTATCCAATAATTTTGATT TTTTACCGATAGAAAAAATAAAAACAGAAGGAGCATCAATTGCCTCTAGTTTGCCAGGAGTTGGTGTTTTAATTTCGATG TCAGGAATTTTCTTTTCATATGAAGGATTTTTTACTGCTGCTGGTTTACAATCAGAAATGAAGGAACCAAAAAAAACACC AATTGCTATTTTATTAGGTATTGCAATTGCAACGATAATTTACCTTTTTATTGCAGTTGCAACTTCAATTGTTGGGGATG GATCAATTTCATCTTTTATTCAAATTGCAAAAAACGAACTAAATTGGTCAGGTTTAACTATTAAATTAATTTTAGGAACA ACTTTTTTGCTAATTGGAGTCAGTTTACTCGGAATTATTAATGTTTTTACTTTATGAGGTCCACGTGCCCTTGAAGAATT AATTATGAGAGATGAATTTTCCTTACTAAAAAAATGGAAAAACCGTATAAATTTAAATAAACCTAAGGTTTCTACAGTTT TTTTATGTATTTTTTCTGTTATTTGCTTAATTATTTTTACATTGATTGGTGTTTTTGCTTTTGATGATCAAAGTTATGGT AATTATGGTGAAAAATTAAATAATTTATATTCATTTGCAGATATTACTGGAAATTGGGCGGCTTTGATTAGTTTCTTATT AATCGCCGCGGCAATTTATGGTTGCATTCGAAACCGAAAAACGCAAAAAATAGCCGTTCAGAAGCAGCGTTATTTTCTCT TTTTTGGCTATATTTCAGTAATTTTTATTACTATAGTATTAATTTTTGCAATTTTTGCCCCAATTATAGATTTGATTTTA ATTTTTAGCTATAAACCTCCAATTCCCGAATTTAGTCAAATTCTAAAAACGCGAATAACTATCGTTATCGTGCTTTTTTT GTTTATATTTGTCCCGGTTTTGCCGGTTATTTTAAATTGAGGGCAAAAAAAATTAAAAATTTTCAACAAAAGACAAAAAA ATAGTTTATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AACTAATCGAAAAATATTTTATACCTTTGATTTAAATTTAAAAAAAAATACATTAATTTAAAGTGTTTTTTTTAAAATAT GGTATAATTAGTCTTCCAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TATAAGAAAGTTATGCAAATTAACTTAGAAAAATATATTCGAACCGTCGAAGATTTCCCTAAAAAAGGAATTAGTTTTAA GGACATTTCACCATTACTTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 536; Mature: 536
Protein sequence:
>536_residues MLKGGDKMESALAKKSKSQKITFFGALLIVLGASIGAGIFFKSKSVLENSGYNLALAIGNWIIACFSIVAMAIALVEISS ATKKSNLSIIIWNKVFNSQAFFQISKNFIIYLYLPFTYFVLPVYFMQIFQDAIAAFRLDSSGQWNMNSDWIIVLAVSILI TIYFFIIGLNTKIAEFHNKLFLFAKFLPILVTIIVGFVFFFQGGSSRLSNNFDFLPIEKIKTEGASIASSLPGVGVLISM SGIFFSYEGFFTAAGLQSEMKEPKKTPIAILLGIAIATIIYLFIAVATSIVGDGSISSFIQIAKNELNWSGLTIKLILGT TFLLIGVSLLGIINVFTLWGPRALEELIMRDEFSLLKKWKNRINLNKPKVSTVFLCIFSVICLIIFTLIGVFAFDDQSYG NYGEKLNNLYSFADITGNWAALISFLLIAAAIYGCIRNRKTQKIAVQKQRYFLFFGYISVIFITIVLIFAIFAPIIDLIL IFSYKPPIPEFSQILKTRITIVIVLFLFIFVPVLPVILNWGQKKLKIFNKRQKNSL
Sequences:
>Translated_536_residues MLKGGDKMESALAKKSKSQKITFFGALLIVLGASIGAGIFFKSKSVLENSGYNLALAIGN*IIACFSIVAMAIALVEISS ATKKSNLSIII*NKVFNSQAFFQISKNFIIYLYLPFTYFVLPVYFMQIFQDAIAAFRLDSSGQ*NMNSD*IIVLAVSILI TIYFFIIGLNTKIAEFHNKLFLFAKFLPILVTIIVGFVFFFQGGSSRLSNNFDFLPIEKIKTEGASIASSLPGVGVLISM SGIFFSYEGFFTAAGLQSEMKEPKKTPIAILLGIAIATIIYLFIAVATSIVGDGSISSFIQIAKNELNWSGLTIKLILGT TFLLIGVSLLGIINVFTL*GPRALEELIMRDEFSLLKKWKNRINLNKPKVSTVFLCIFSVICLIIFTLIGVFAFDDQSYG NYGEKLNNLYSFADITGNWAALISFLLIAAAIYGCIRNRKTQKIAVQKQRYFLFFGYISVIFITIVLIFAIFAPIIDLIL IFSYKPPIPEFSQILKTRITIVIVLFLFIFVPVLPVILN*GQKKLKIFNKRQKNSL >Mature_536_residues MLKGGDKMESALAKKSKSQKITFFGALLIVLGASIGAGIFFKSKSVLENSGYNLALAIGN*IIACFSIVAMAIALVEISS ATKKSNLSIII*NKVFNSQAFFQISKNFIIYLYLPFTYFVLPVYFMQIFQDAIAAFRLDSSGQ*NMNSD*IIVLAVSILI TIYFFIIGLNTKIAEFHNKLFLFAKFLPILVTIIVGFVFFFQGGSSRLSNNFDFLPIEKIKTEGASIASSLPGVGVLISM SGIFFSYEGFFTAAGLQSEMKEPKKTPIAILLGIAIATIIYLFIAVATSIVGDGSISSFIQIAKNELNWSGLTIKLILGT TFLLIGVSLLGIINVFTL*GPRALEELIMRDEFSLLKKWKNRINLNKPKVSTVFLCIFSVICLIIFTLIGVFAFDDQSYG NYGEKLNNLYSFADITGNWAALISFLLIAAAIYGCIRNRKTQKIAVQKQRYFLFFGYISVIFITIVLIFAIFAPIIDLIL IFSYKPPIPEFSQILKTRITIVIVLFLFIFVPVLPVILN*GQKKLKIFNKRQKNSL
Specific function: Unknown
COG id: COG0531
COG function: function code E; Amino acid transporters
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To M.pneumoniae MPN_095 and MPN_096 [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002293 [H]
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 58681; Mature: 58681
Theoretical pI: Translated: 10.25; Mature: 10.25
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLKGGDKMESALAKKSKSQKITFFGALLIVLGASIGAGIFFKSKSVLENSGYNLALAIGN CCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHCCCCEEEEHHHH IIACFSIVAMAIALVEISSATKKSNLSIIINKVFNSQAFFQISKNFIIYLYLPFTYFVLP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEHHHCCHHHEEECCCEEEEEEHHHHHHHHH VYFMQIFQDAIAAFRLDSSGQNMNSDIIVLAVSILITIYFFIIGLNTKIAEFHNKLFLFA HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH KFLPILVTIIVGFVFFFQGGSSRLSNNFDFLPIEKIKTEGASIASSLPGVGVLISMSGIF HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHCCCCCEEEEECCCCE FSYEGFFTAAGLQSEMKEPKKTPIAILLGIAIATIIYLFIAVATSIVGDGSISSFIQIAK EEECCHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH NELNWSGLTIKLILGTTFLLIGVSLLGIINVFTLGPRALEELIMRDEFSLLKKWKNRINL HCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NKPKVSTVFLCIFSVICLIIFTLIGVFAFDDQSYGNYGEKLNNLYSFADITGNWAALISF CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH LLIAAAIYGCIRNRKTQKIAVQKQRYFLFFGYISVIFITIVLIFAIFAPIIDLILIFSYK HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC PPIPEFSQILKTRITIVIVLFLFIFVPVLPVILNGQKKLKIFNKRQKNSL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MLKGGDKMESALAKKSKSQKITFFGALLIVLGASIGAGIFFKSKSVLENSGYNLALAIGN CCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHCCCCEEEEHHHH IIACFSIVAMAIALVEISSATKKSNLSIIINKVFNSQAFFQISKNFIIYLYLPFTYFVLP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEHHHCCHHHEEECCCEEEEEEHHHHHHHHH VYFMQIFQDAIAAFRLDSSGQNMNSDIIVLAVSILITIYFFIIGLNTKIAEFHNKLFLFA HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH KFLPILVTIIVGFVFFFQGGSSRLSNNFDFLPIEKIKTEGASIASSLPGVGVLISMSGIF HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHCCCCCEEEEECCCCE FSYEGFFTAAGLQSEMKEPKKTPIAILLGIAIATIIYLFIAVATSIVGDGSISSFIQIAK EEECCHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH NELNWSGLTIKLILGTTFLLIGVSLLGIINVFTLGPRALEELIMRDEFSLLKKWKNRINL HCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NKPKVSTVFLCIFSVICLIIFTLIGVFAFDDQSYGNYGEKLNNLYSFADITGNWAALISF CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH LLIAAAIYGCIRNRKTQKIAVQKQRYFLFFGYISVIFITIVLIFAIFAPIIDLILIFSYK HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC PPIPEFSQILKTRITIVIVLFLFIFVPVLPVILNGQKKLKIFNKRQKNSL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8948633; 9098066 [H]