Definition | Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome. |
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Accession | NC_006360 |
Length | 892,758 |
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The map label for this gene is ntpJ
Identifier: 54020248
GI number: 54020248
Start: 711340
End: 712818
Strand: Direct
Name: ntpJ
Synonym: mhp564
Alternate gene names: 54020248
Gene position: 711340-712818 (Clockwise)
Preceding gene: 54020247
Following gene: 54020249
Centisome position: 79.68
GC content: 29.68
Gene sequence:
>1479_bases TTGAAAATTAATTTCAAAAGTTTTCTAAAATCACTTTTTCGGCTAAAAAAAATTCATATAATTTTTGCTGTTTATACCAT AGTTATTTTTCTTGGTGCTGGCTTTTTAGTTACGCCTTTTGCACATACAAACGCCGTTGACAAAATTAGTTTTCTCAGCG CACTTTTTACTTCAGTTTCTGCCTTTAGCGATACCGGACTTAGTTTGGTTGATACCGGAACAAGTTTTAATGTTTTTGGC CAGACTATAATTGCAATTCTGATCTCCCTTGGCGGAATTGGAATTTTTGCGGTAAAATTCTATATTTTTAACTTGATTTT TGGAAAAAAAATTAGTATTTTATCTCGTGAAATTCTCAAAATTGAAAGAGGATCAAGTAGGTTAAATGATCTAAAAGGTG TAATTAAAATCTCAATTAACCTCTTTTTAATTCTAGTTTTAATTTCAAGTTTGGCGCTAATGCTTCATTTTTATTATTAT GAAATTAGCCCAAGAAAATTCTCTTTCCAACAAAGTCCATATAAAAATTTAGTTTTATCACTAAGATTTGCAATTTTTCA TAGTATTTCTGCAATCAATAATGCTGGTTTTGATATAATTGGCGCCTATAGTTTCGAGCCTTATTATTATTCTTATTTTT TGCAGATTATTATTATAATTTTAACAATCATTGGCGGGATTGGTTATCCCGTAATTTTTGATTTTTATAGTTATTTTCGG ATAAAACTATCAAAACAAAAAGTGAAAAACTTTCGGTTTTCACTTTTCTCAAAAATTTCACTTTTAAGTTATTTTGTAAT TTCGTTTTTTGGTTTTATTTTATTTATTGCTTTTGAGGCGAGTTCAAAATCCAATCTTACTTTTTGAAATCAGGTCGAAA ATGGTAACTGATTTGATAAGTCCTTTGCACTTTTATTTCATAATTTTATGTCGCGTTCGACTGGTTTTTTAACTTTTGAT CTAAAACAACTTTCACAAGCAAGCACGTTTTTAACAAGTTTATTAATGTTTATCGGCTCTGCGCCGTCTTCAACAGGTGG CGGAATTCGTGTTACAACTTTTTGGATTTTTATCCTTGTAATTATTTCAAGAATTCGTGGATCCCAAGATGTTAATGCTT TTAGAAGAAAAATTACTACAGATAAAGTTGTTTCAGCCTCAATTGTTTTCTTTATTTCACTTGTTTTAGTAATTTTTCTT GTTTTTGTTGCTAGTTTTTCCCTTGATGATTCAATTAATAGAGGCAAAACTATTCCATACCAAATTCATCATTTAATTTT TGAAGTTACTTCTGCTTTTGGAACCTCAGGACTATCAACTGGACTAATTCGCGACTTGTCAACTGTTTCTCAGGTCGGAT TTATGATTATAATGCTGATTGGACAGCTCGGAATTACTTCATTTATTTATGTTTGACAAGGCGATAATATCGGAAAACAG AATAAAACTTATATTACAGAAGATATTTTAATTGGGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAACTTTGAAAAATGGGCTTATTTTAGATTTTTTAGCTTACTGATATATAAAAAACACTAGAAAACAAGGAATAATTTAT CAAAACGGGGAAAAATGAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTATATACTTAAAATTTAAAAAACACTATAAATTACAGTAAGTTAGTATACTGATTTAACCTAAACATTGATTTTTATA TATTTTTGGCTTTCTTATTC
Product: potassium uptake protein
Products: NA
Alternate protein names: K(+)-uptake protein ktrD [H]
Number of amino acids: Translated: 492; Mature: 492
Protein sequence:
>492_residues MKINFKSFLKSLFRLKKIHIIFAVYTIVIFLGAGFLVTPFAHTNAVDKISFLSALFTSVSAFSDTGLSLVDTGTSFNVFG QTIIAILISLGGIGIFAVKFYIFNLIFGKKISILSREILKIERGSSRLNDLKGVIKISINLFLILVLISSLALMLHFYYY EISPRKFSFQQSPYKNLVLSLRFAIFHSISAINNAGFDIIGAYSFEPYYYSYFLQIIIIILTIIGGIGYPVIFDFYSYFR IKLSKQKVKNFRFSLFSKISLLSYFVISFFGFILFIAFEASSKSNLTFWNQVENGNWFDKSFALLFHNFMSRSTGFLTFD LKQLSQASTFLTSLLMFIGSAPSSTGGGIRVTTFWIFILVIISRIRGSQDVNAFRRKITTDKVVSASIVFFISLVLVIFL VFVASFSLDDSINRGKTIPYQIHHLIFEVTSAFGTSGLSTGLIRDLSTVSQVGFMIIMLIGQLGITSFIYVWQGDNIGKQ NKTYITEDILIG
Sequences:
>Translated_492_residues MKINFKSFLKSLFRLKKIHIIFAVYTIVIFLGAGFLVTPFAHTNAVDKISFLSALFTSVSAFSDTGLSLVDTGTSFNVFG QTIIAILISLGGIGIFAVKFYIFNLIFGKKISILSREILKIERGSSRLNDLKGVIKISINLFLILVLISSLALMLHFYYY EISPRKFSFQQSPYKNLVLSLRFAIFHSISAINNAGFDIIGAYSFEPYYYSYFLQIIIIILTIIGGIGYPVIFDFYSYFR IKLSKQKVKNFRFSLFSKISLLSYFVISFFGFILFIAFEASSKSNLTF*NQVENGN*FDKSFALLFHNFMSRSTGFLTFD LKQLSQASTFLTSLLMFIGSAPSSTGGGIRVTTFWIFILVIISRIRGSQDVNAFRRKITTDKVVSASIVFFISLVLVIFL VFVASFSLDDSINRGKTIPYQIHHLIFEVTSAFGTSGLSTGLIRDLSTVSQVGFMIIMLIGQLGITSFIYV*QGDNIGKQ NKTYITEDILIG >Mature_492_residues MKINFKSFLKSLFRLKKIHIIFAVYTIVIFLGAGFLVTPFAHTNAVDKISFLSALFTSVSAFSDTGLSLVDTGTSFNVFG QTIIAILISLGGIGIFAVKFYIFNLIFGKKISILSREILKIERGSSRLNDLKGVIKISINLFLILVLISSLALMLHFYYY EISPRKFSFQQSPYKNLVLSLRFAIFHSISAINNAGFDIIGAYSFEPYYYSYFLQIIIIILTIIGGIGYPVIFDFYSYFR IKLSKQKVKNFRFSLFSKISLLSYFVISFFGFILFIAFEASSKSNLTF*NQVENGN*FDKSFALLFHNFMSRSTGFLTFD LKQLSQASTFLTSLLMFIGSAPSSTGGGIRVTTFWIFILVIISRIRGSQDVNAFRRKITTDKVVSASIVFFISLVLVIFL VFVASFSLDDSINRGKTIPYQIHHLIFEVTSAFGTSGLSTGLIRDLSTVSQVGFMIIMLIGQLGITSFIYV*QGDNIGKQ NKTYITEDILIG
Specific function: Integral membrane subunit of the KtrCD potassium uptake transporter. The 2 major potassium transporter complexes KtrAB and KtrCD confer resistance to both suddenly imposed and prolonged osmotic stress [H]
COG id: COG0168
COG function: function code P; Trk-type K+ transport systems, membrane components
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the trkH potassium transport family. Ktr (TC 2.A.38.4) subfamily [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003445 [H]
Pfam domain/function: PF02386 TrkH [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 54809; Mature: 54809
Theoretical pI: Translated: 10.36; Mature: 10.36
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 1.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.2 %Met (Mature Protein) 1.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKINFKSFLKSLFRLKKIHIIFAVYTIVIFLGAGFLVTPFAHTNAVDKISFLSALFTSVS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH AFSDTGLSLVDTGTSFNVFGQTIIAILISLGGIGIFAVKFYIFNLIFGKKISILSREILK HHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH IERGSSRLNDLKGVIKISINLFLILVLISSLALMLHFYYYEISPRKFSFQQSPYKNLVLS HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCHHHHHHHH LRFAIFHSISAINNAGFDIIGAYSFEPYYYSYFLQIIIIILTIIGGIGYPVIFDFYSYFR HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH IKLSKQKVKNFRFSLFSKISLLSYFVISFFGFILFIAFEASSKSNLTFNQVENGNFDKSF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEEECCCCCCCHHH ALLFHNFMSRSTGFLTFDLKQLSQASTFLTSLLMFIGSAPSSTGGGIRVTTFWIFILVII HHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH SRIRGSQDVNAFRRKITTDKVVSASIVFFISLVLVIFLVFVASFSLDDSINRGKTIPYQI HHHCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHH HHLIFEVTSAFGTSGLSTGLIRDLSTVSQVGFMIIMLIGQLGITSFIYVQGDNIGKQNKT HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCC YITEDILIG EECHHHCCC >Mature Secondary Structure MKINFKSFLKSLFRLKKIHIIFAVYTIVIFLGAGFLVTPFAHTNAVDKISFLSALFTSVS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH AFSDTGLSLVDTGTSFNVFGQTIIAILISLGGIGIFAVKFYIFNLIFGKKISILSREILK HHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH IERGSSRLNDLKGVIKISINLFLILVLISSLALMLHFYYYEISPRKFSFQQSPYKNLVLS HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCHHHHHHHH LRFAIFHSISAINNAGFDIIGAYSFEPYYYSYFLQIIIIILTIIGGIGYPVIFDFYSYFR HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH IKLSKQKVKNFRFSLFSKISLLSYFVISFFGFILFIAFEASSKSNLTFNQVENGNFDKSF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEEECCCCCCCHHH ALLFHNFMSRSTGFLTFDLKQLSQASTFLTSLLMFIGSAPSSTGGGIRVTTFWIFILVII HHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH SRIRGSQDVNAFRRKITTDKVVSASIVFFISLVLVIFLVFVASFSLDDSINRGKTIPYQI HHHCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHH HHLIFEVTSAFGTSGLSTGLIRDLSTVSQVGFMIIMLIGQLGITSFIYVQGDNIGKQNKT HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCC YITEDILIG EECHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9384377 [H]