Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yihN [C]

Identifier: 54020139

GI number: 54020139

Start: 361272

End: 362720

Strand: Direct

Name: yihN [C]

Synonym: mhp316

Alternate gene names: 54020139

Gene position: 361272-362720 (Clockwise)

Preceding gene: 54020138

Following gene: 54020140

Centisome position: 40.47

GC content: 30.16

Gene sequence:

>1449_bases
TTGAAAGGAACAGTTTTGGTTAAAACAAGATTTTTTAGTAAATTTAAAGATTTTACTTGATCACAAATTTTTGCTTTAAT
AATATTAGCAGCTGCTGATGTTTTTGTTATTGCTGCCCCTTATTATTTAAAAAATATTGTGCCTAACTTGCACACATATT
TAAGAATTCGTGAAGACCAAGTAGCTTCTTTGACAGCCATTATTGGTTGAGTTACACTTGCAACTCAACTACCGGGTGGA
TTTTTATCTAATAGGATTAATTCGCGTCGACTCTTATTTATTGCTGTCTTATCAACAGGAATTATTACATTTTGATTTGG
TATAACCATCAAAAATGCTCAAAACTTAGGTGAAGAAAGCGCTTTGACTCAATATAAAATTATTTGAGGTCTTTGAGGAA
TCACATCAACTTTAATCTTTTGAACCCCACTTTGAAAGCTAGTTTCACAGCAAACCGACCAAAAAAACCAAGGTCTTGCT
TATGGGATTCAAGGTAGTGCAAATGGTATAGTTGGATTTTTCCTAGTTTTTGTTATTGGTTTAATTATTACTTCAATTTA
TTATCCAGACAATCAAAATACTAATGAAATCAATAGCACACCTTTTGCTGCTTATACTTTTATAATTGGTAGTTTTTTAG
TAATTACTTCATTTTTGGTTCTCTTTTTTGTCAAAGAGAAAAAAATTGAACGTTATACTAACAAAATTAGTTTAGAATCG
ATCAAGAAAAATATTAGCCAAATTTATGTCTCACTTAAAAATTGAAAACTATGAATGCTTTCAATTTTTGTAATGGGAAT
GTATACTTTCCAATCAGTTTTTGCCTATTACTTAGTTCAAGTGTTAAATAATGTCTTTTTAGCACCGACAATTTTAGTTA
CAATTCTTGGTGGAATTAGAACTTATGGACTTCGAGGTTTAATTAGCTCTTATGTTGGCTACTATGCTGACAAATTTAGA
AGCTACATTCTCATTTTAGTTTTAACAGCACTGACAGGAATTTTTGTTATTTTAACTATTTTACTTCTTACCTTAGCTGG
AATTCAAGAGCCTGGAACCCCACTATTTATCTTCTTTATAATATTGGCTACAATTTTATTCTTAATTGCAGGTTCTCTAT
CATGAGTAATGGTAACTCTTAGATTTACTCAAGTTGCTGAAATTGAAATTGGTAAAAATAACTATGCAAGTTCAGTTGGA
ATTCTTTCATTTATTGCGTTTTCACCAGATGCTTGATTCTATGAATTATCAGGATATATTGGAAAAATCTATACAATTGA
AGGTCAAACAAATACTTCGCCTTTAGGTTATCAGTTAATTTTAACAATCGCATTAGGTGTTGCCTTATTTGGGACAATTT
GTGGATTAATAGTGTTTTTATACAATCGAGCTGAACTTAAAAAACTAGGTAAAACAAATTATCGTTGAAGGGAATTAGAT
AATGCCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGCTAAGTTAGTAGAAAAAATTCAGACAATTAGTTTATATACTAACTTAACTTTCTTGAAAAATTTATTATATAATAATT
AATATAGTAAATTTAATTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAACAATTATTAATAGCACATCGTGGTTATTCAGGAATCGCACCTGAAAATACCAAACTAGCTTTTGATTTAGCATATG
AATTTAATTTTGATGGAATC

Product: putative permease, putative mpn421

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 482; Mature: 482

Protein sequence:

>482_residues
MKGTVLVKTRFFSKFKDFTWSQIFALIILAAADVFVIAAPYYLKNIVPNLHTYLRIREDQVASLTAIIGWVTLATQLPGG
FLSNRINSRRLLFIAVLSTGIITFWFGITIKNAQNLGEESALTQYKIIWGLWGITSTLIFWTPLWKLVSQQTDQKNQGLA
YGIQGSANGIVGFFLVFVIGLIITSIYYPDNQNTNEINSTPFAAYTFIIGSFLVITSFLVLFFVKEKKIERYTNKISLES
IKKNISQIYVSLKNWKLWMLSIFVMGMYTFQSVFAYYLVQVLNNVFLAPTILVTILGGIRTYGLRGLISSYVGYYADKFR
SYILILVLTALTGIFVILTILLLTLAGIQEPGTPLFIFFIILATILFLIAGSLSWVMVTLRFTQVAEIEIGKNNYASSVG
ILSFIAFSPDAWFYELSGYIGKIYTIEGQTNTSPLGYQLILTIALGVALFGTICGLIVFLYNRAELKKLGKTNYRWRELD
NA

Sequences:

>Translated_482_residues
MKGTVLVKTRFFSKFKDFT*SQIFALIILAAADVFVIAAPYYLKNIVPNLHTYLRIREDQVASLTAIIG*VTLATQLPGG
FLSNRINSRRLLFIAVLSTGIITF*FGITIKNAQNLGEESALTQYKII*GL*GITSTLIF*TPL*KLVSQQTDQKNQGLA
YGIQGSANGIVGFFLVFVIGLIITSIYYPDNQNTNEINSTPFAAYTFIIGSFLVITSFLVLFFVKEKKIERYTNKISLES
IKKNISQIYVSLKN*KL*MLSIFVMGMYTFQSVFAYYLVQVLNNVFLAPTILVTILGGIRTYGLRGLISSYVGYYADKFR
SYILILVLTALTGIFVILTILLLTLAGIQEPGTPLFIFFIILATILFLIAGSLS*VMVTLRFTQVAEIEIGKNNYASSVG
ILSFIAFSPDA*FYELSGYIGKIYTIEGQTNTSPLGYQLILTIALGVALFGTICGLIVFLYNRAELKKLGKTNYR*RELD
NA
>Mature_482_residues
MKGTVLVKTRFFSKFKDFT*SQIFALIILAAADVFVIAAPYYLKNIVPNLHTYLRIREDQVASLTAIIG*VTLATQLPGG
FLSNRINSRRLLFIAVLSTGIITF*FGITIKNAQNLGEESALTQYKII*GL*GITSTLIF*TPL*KLVSQQTDQKNQGLA
YGIQGSANGIVGFFLVFVIGLIITSIYYPDNQNTNEINSTPFAAYTFIIGSFLVITSFLVLFFVKEKKIERYTNKISLES
IKKNISQIYVSLKN*KL*MLSIFVMGMYTFQSVFAYYLVQVLNNVFLAPTILVTILGGIRTYGLRGLISSYVGYYADKFR
SYILILVLTALTGIFVILTILLLTLAGIQEPGTPLFIFFIILATILFLIAGSLS*VMVTLRFTQVAEIEIGKNNYASSVG
ILSFIAFSPDA*FYELSGYIGKIYTIEGQTNTSPLGYQLILTIALGVALFGTICGLIVFLYNRAELKKLGKTNYR*RELD
NA

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Integral Membrane Protein [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To E.coli yihN [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51830; Mature: 51830

Theoretical pI: Translated: 9.94; Mature: 9.94

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.0 %Met     (Translated Protein)
1.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.0 %Met     (Mature Protein)
1.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKGTVLVKTRFFSKFKDFTSQIFALIILAAADVFVIAAPYYLKNIVPNLHTYLRIREDQV
CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHH
ASLTAIIGVTLATQLPGGFLSNRINSRRLLFIAVLSTGIITFFGITIKNAQNLGEESALT
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCCHHHHH
QYKIIGLGITSTLIFTPLKLVSQQTDQKNQGLAYGIQGSANGIVGFFLVFVIGLIITSIY
HEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
YPDNQNTNEINSTPFAAYTFIIGSFLVITSFLVLFFVKEKKIERYTNKISLESIKKNISQ
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYVSLKNKLMLSIFVMGMYTFQSVFAYYLVQVLNNVFLAPTILVTILGGIRTYGLRGLIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYVGYYADKFRSYILILVLTALTGIFVILTILLLTLAGIQEPGTPLFIFFIILATILFLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
AGSLSVMVTLRFTQVAEIEIGKNNYASSVGILSFIAFSPDAFYELSGYIGKIYTIEGQTN
HCCHHEEEEEEEHEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCEEEEEEEECCCC
TSPLGYQLILTIALGVALFGTICGLIVFLYNRAELKKLGKTNYRRELDNA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKGTVLVKTRFFSKFKDFTSQIFALIILAAADVFVIAAPYYLKNIVPNLHTYLRIREDQV
CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHH
ASLTAIIGVTLATQLPGGFLSNRINSRRLLFIAVLSTGIITFFGITIKNAQNLGEESALT
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCCHHHHH
QYKIIGLGITSTLIFTPLKLVSQQTDQKNQGLAYGIQGSANGIVGFFLVFVIGLIITSIY
HEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
YPDNQNTNEINSTPFAAYTFIIGSFLVITSFLVLFFVKEKKIERYTNKISLESIKKNISQ
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYVSLKNKLMLSIFVMGMYTFQSVFAYYLVQVLNNVFLAPTILVTILGGIRTYGLRGLIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYVGYYADKFRSYILILVLTALTGIFVILTILLLTLAGIQEPGTPLFIFFIILATILFLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
AGSLSVMVTLRFTQVAEIEIGKNNYASSVGILSFIAFSPDAFYELSGYIGKIYTIEGQTN
HCCHHEEEEEEEHEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCEEEEEEEECCCC
TSPLGYQLILTIALGVALFGTICGLIVFLYNRAELKKLGKTNYRRELDNA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8948633 [H]