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The map label for this gene is yxdM [H]

Identifier: 52142890

GI number: 52142890

Start: 2482468

End: 2484399

Strand: Direct

Name: yxdM [H]

Synonym: BCZK2350

Alternate gene names: 52142890

Gene position: 2482468-2484399 (Clockwise)

Preceding gene: 52142891

Following gene: 52142889

Centisome position: 46.83

GC content: 29.97

Gene sequence:

>1932_bases
ATGACTTTTCGTCAGTTCGCATTTAATAATATTTTTCGTAATAAGCGTACATACGTTGCCCATTTTTTAAGTAGTACATT
TTCTATTATGGTTTTCTTTACATATGCTCTTTTATTATTTCATCCTGATTTACAAGGTGAATTGAAATCAACAAGTGCAA
CAATGAGTGCATATGGTACGATGGGATTTACAATTTCGCAAGGTTTGATTTTTGTATTTTCATTTTTCTTTATTCTATAT
TCAGTTAGTTCATTTTTAAAAACTCGTAAGAAAGAATTTGGCATATTAATGATGCAAGGTATGTCAATGAGACAGTTTAA
GAAATTATTATTAATTGAAAATATGTTGATTGGACTTGGTTCAATTTGTATAGGGATTTTCATTGGACTCATATTTTCTA
AACTAGTCTTATTGATAAGCGCAAGTGTATTAATGATTAATAATGGTTTGCCTTTTTATACACCAGTGAAGGCTGTATTA
TTAACAGTAATCACTTTTCTTTTCTTATTTTTCATTGTTTCACTATTTACATTTAAAATGGTAAAAATAACGGAACTTGT
GGAACTTATTCGAGCAGAGGAAAAACCAAAACCTGAACCGAAATCTTCAATTTTATTATCATTGCTTTCTTTAATTAGTA
TAGGATATGGATATTTCTCAGTATTTCGCTTTATTTCAAGTTCCAGTTTTACTACGCTCGGAATGGGTGTCCTACTAGTA
ATTATAGGAACGTACTTTTTATATACACAGTGTAGCGTTTATATATTACATCTTGCTAAAAGGAGAGAATCTTTCTTTTT
AAAAAGAACAAATATATTAACGTTTTCTGAATTAATTTACCGTATGAAAGATAATGCAACGATGTTTTTTATTGTATCTA
TTATTTCAGCAGTTGCATTTACAGCTATTGGTACAACAGCTGCTATTGGTAATAGAAATTTAGTGTGGATGACAAACCCA
TATACATTTCTGTATGAAAGCTCTGAAAACAACAAATTGGTAGATAAACATCTCTCTATTATAAAAAAACATCTCTTGGA
TGCAAATATTCCGTATCGAATGGCTTCATCTTCAAGTAAATTTACAGAAAGTAACGTAAATGTATTGAAATTAAGTGAAT
ATAACGAACTTACGAGAGCACTCGGGTACCAACATGAAACGATTGAAAAAGAAGATGAAATTTTACTAATCCCTGGGAGG
GTGTCACAAAAGCAAGAATTTAAAAATGGTGACTATAAAAAAAATATTGAAGTCATTCAAGGAGATTGGACAAAGACATT
TCGTGTGAAGAAAACTGTAGAGAATTTAGTTTTACCACATGATTCTAGTAGTATTTATATTGCTGTTCAAGATCATGTGT
ATAATGAAATTCCTCTGACGAGTAATCCAGAGGATAAAGATATTCAATATCGTACTTACGGATTTGTTGTAGATGATTGG
ATAAGAACGAAAGAGATTTCAAATCAATTAAAGAGTATATTCGATAAAGATCTTAGGGACAGTGATTTCTACTTTGTAGC
TTTAACATTAAACTTGTTGGAGGCAAAGCAAAAGAATGGTTTATTACTTATGGCAAGTGTTTTAGTCGGAATCGTTTTCT
TTACATTTGCTGCTAGTTTTATTTATTTCCGATTATACACTGATTTGGACCGTGATCAACAACAATATAAAATGATTTCG
AAAATGGGATTAAGTAAACAAGAGTTAAAAAAAGTTGTAACGAGACAGTTATTATTAATGTTCTTCTTACCGATTGCTGT
TGCGGTGATTCATACTGTAGTAGCGTATACGGCACTGCAACAATTAGTTAGTTTTTCTATTTTAAATAGCTCGATTGTTA
TTTTAATTTCATTTATATGTATACAAGTTTTATATTTCTTTATTACTCGTTGGCGTTACCTACAAAAGCTTTATAAGACT
ATGGAGCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAGATGGTCAACTATATAACGAAATTTATTGTGGTGAAAGCAGACAAGCCTTTTATCAAAAGATTATGGATGTTCTTTC
TTTGTTAGGAGGGAAAAGGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGGATATCAACTAATAAAATTACAGAAAAGCATGTAAAAAATGATATGAATTATGAAAGGAACCGTGATGAAAAGAACTT
TAACTATTTTTATGTTAACT

Product: ABC transporter, permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 643; Mature: 642

Protein sequence:

>643_residues
MTFRQFAFNNIFRNKRTYVAHFLSSTFSIMVFFTYALLLFHPDLQGELKSTSATMSAYGTMGFTISQGLIFVFSFFFILY
SVSSFLKTRKKEFGILMMQGMSMRQFKKLLLIENMLIGLGSICIGIFIGLIFSKLVLLISASVLMINNGLPFYTPVKAVL
LTVITFLFLFFIVSLFTFKMVKITELVELIRAEEKPKPEPKSSILLSLLSLISIGYGYFSVFRFISSSSFTTLGMGVLLV
IIGTYFLYTQCSVYILHLAKRRESFFLKRTNILTFSELIYRMKDNATMFFIVSIISAVAFTAIGTTAAIGNRNLVWMTNP
YTFLYESSENNKLVDKHLSIIKKHLLDANIPYRMASSSSKFTESNVNVLKLSEYNELTRALGYQHETIEKEDEILLIPGR
VSQKQEFKNGDYKKNIEVIQGDWTKTFRVKKTVENLVLPHDSSSIYIAVQDHVYNEIPLTSNPEDKDIQYRTYGFVVDDW
IRTKEISNQLKSIFDKDLRDSDFYFVALTLNLLEAKQKNGLLLMASVLVGIVFFTFAASFIYFRLYTDLDRDQQQYKMIS
KMGLSKQELKKVVTRQLLLMFFLPIAVAVIHTVVAYTALQQLVSFSILNSSIVILISFICIQVLYFFITRWRYLQKLYKT
MEQ

Sequences:

>Translated_643_residues
MTFRQFAFNNIFRNKRTYVAHFLSSTFSIMVFFTYALLLFHPDLQGELKSTSATMSAYGTMGFTISQGLIFVFSFFFILY
SVSSFLKTRKKEFGILMMQGMSMRQFKKLLLIENMLIGLGSICIGIFIGLIFSKLVLLISASVLMINNGLPFYTPVKAVL
LTVITFLFLFFIVSLFTFKMVKITELVELIRAEEKPKPEPKSSILLSLLSLISIGYGYFSVFRFISSSSFTTLGMGVLLV
IIGTYFLYTQCSVYILHLAKRRESFFLKRTNILTFSELIYRMKDNATMFFIVSIISAVAFTAIGTTAAIGNRNLVWMTNP
YTFLYESSENNKLVDKHLSIIKKHLLDANIPYRMASSSSKFTESNVNVLKLSEYNELTRALGYQHETIEKEDEILLIPGR
VSQKQEFKNGDYKKNIEVIQGDWTKTFRVKKTVENLVLPHDSSSIYIAVQDHVYNEIPLTSNPEDKDIQYRTYGFVVDDW
IRTKEISNQLKSIFDKDLRDSDFYFVALTLNLLEAKQKNGLLLMASVLVGIVFFTFAASFIYFRLYTDLDRDQQQYKMIS
KMGLSKQELKKVVTRQLLLMFFLPIAVAVIHTVVAYTALQQLVSFSILNSSIVILISFICIQVLYFFITRWRYLQKLYKT
MEQ
>Mature_642_residues
TFRQFAFNNIFRNKRTYVAHFLSSTFSIMVFFTYALLLFHPDLQGELKSTSATMSAYGTMGFTISQGLIFVFSFFFILYS
VSSFLKTRKKEFGILMMQGMSMRQFKKLLLIENMLIGLGSICIGIFIGLIFSKLVLLISASVLMINNGLPFYTPVKAVLL
TVITFLFLFFIVSLFTFKMVKITELVELIRAEEKPKPEPKSSILLSLLSLISIGYGYFSVFRFISSSSFTTLGMGVLLVI
IGTYFLYTQCSVYILHLAKRRESFFLKRTNILTFSELIYRMKDNATMFFIVSIISAVAFTAIGTTAAIGNRNLVWMTNPY
TFLYESSENNKLVDKHLSIIKKHLLDANIPYRMASSSSKFTESNVNVLKLSEYNELTRALGYQHETIEKEDEILLIPGRV
SQKQEFKNGDYKKNIEVIQGDWTKTFRVKKTVENLVLPHDSSSIYIAVQDHVYNEIPLTSNPEDKDIQYRTYGFVVDDWI
RTKEISNQLKSIFDKDLRDSDFYFVALTLNLLEAKQKNGLLLMASVLVGIVFFTFAASFIYFRLYTDLDRDQQQYKMISK
MGLSKQELKKVVTRQLLLMFFLPIAVAVIHTVVAYTALQQLVSFSILNSSIVILISFICIQVLYFFITRWRYLQKLYKTM
EQ

Specific function: Part of the ABC transporter complex yxdLM which could be involved in peptide resistance [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74095; Mature: 73964

Theoretical pI: Translated: 9.90; Mature: 9.90

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTFRQFAFNNIFRNKRTYVAHFLSSTFSIMVFFTYALLLFHPDLQGELKSTSATMSAYGT
CCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCC
MGFTISQGLIFVFSFFFILYSVSSFLKTRKKEFGILMMQGMSMRQFKKLLLIENMLIGLG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SICIGIFIGLIFSKLVLLISASVLMINNGLPFYTPVKAVLLTVITFLFLFFIVSLFTFKM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VKITELVELIRAEEKPKPEPKSSILLSLLSLISIGYGYFSVFRFISSSSFTTLGMGVLLV
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
IIGTYFLYTQCSVYILHLAKRRESFFLKRTNILTFSELIYRMKDNATMFFIVSIISAVAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
TAIGTTAAIGNRNLVWMTNPYTFLYESSENNKLVDKHLSIIKKHLLDANIPYRMASSSSK
HHHHHHHCCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
FTESNVNVLKLSEYNELTRALGYQHETIEKEDEILLIPGRVSQKQEFKNGDYKKNIEVIQ
CCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEE
GDWTKTFRVKKTVENLVLPHDSSSIYIAVQDHVYNEIPLTSNPEDKDIQYRTYGFVVDDW
CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECEEHHHH
IRTKEISNQLKSIFDKDLRDSDFYFVALTLNLLEAKQKNGLLLMASVLVGIVFFTFAASF
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYFRLYTDLDRDQQQYKMISKMGLSKQELKKVVTRQLLLMFFLPIAVAVIHTVVAYTALQ
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLVSFSILNSSIVILISFICIQVLYFFITRWRYLQKLYKTMEQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
TFRQFAFNNIFRNKRTYVAHFLSSTFSIMVFFTYALLLFHPDLQGELKSTSATMSAYGT
CHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCC
MGFTISQGLIFVFSFFFILYSVSSFLKTRKKEFGILMMQGMSMRQFKKLLLIENMLIGLG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SICIGIFIGLIFSKLVLLISASVLMINNGLPFYTPVKAVLLTVITFLFLFFIVSLFTFKM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VKITELVELIRAEEKPKPEPKSSILLSLLSLISIGYGYFSVFRFISSSSFTTLGMGVLLV
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
IIGTYFLYTQCSVYILHLAKRRESFFLKRTNILTFSELIYRMKDNATMFFIVSIISAVAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
TAIGTTAAIGNRNLVWMTNPYTFLYESSENNKLVDKHLSIIKKHLLDANIPYRMASSSSK
HHHHHHHCCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
FTESNVNVLKLSEYNELTRALGYQHETIEKEDEILLIPGRVSQKQEFKNGDYKKNIEVIQ
CCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEE
GDWTKTFRVKKTVENLVLPHDSSSIYIAVQDHVYNEIPLTSNPEDKDIQYRTYGFVVDDW
CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECEEHHHH
IRTKEISNQLKSIFDKDLRDSDFYFVALTLNLLEAKQKNGLLLMASVLVGIVFFTFAASF
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYFRLYTDLDRDQQQYKMISKMGLSKQELKKVVTRQLLLMFFLPIAVAVIHTVVAYTALQ
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLVSFSILNSSIVILISFICIQVLYFFITRWRYLQKLYKTMEQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8867804; 9384377; 7952181 [H]