Definition | Borrelia garinii PBi chromosome chromosome linear, complete sequence. |
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Accession | NC_006156 |
Length | 904,246 |
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The map label for this gene is 51598820
Identifier: 51598820
GI number: 51598820
Start: 583575
End: 585347
Strand: Direct
Name: 51598820
Synonym: BG0579
Alternate gene names: NA
Gene position: 583575-585347 (Clockwise)
Preceding gene: 51598819
Following gene: 51598821
Centisome position: 64.54
GC content: 24.99
Gene sequence:
>1773_bases ATGGATAATGACAATAATGACTTTTTTGCTAATGATTATTTGGCAACCTTATTTTATAAACTTGAAGTTTTTGATGAGAG TGCAAGGCATGTTTATTCAAATTTAAGCAAATCAATTCCTAAATTAATAGAAAAAATTTCTAAAGATTCTAAGGATTTAT CTTTTAGTATTGACTTGATTTCTAATCTTGATCTTGATAATGATGCTTCTTTGAATAATTTCATAGCTAAGATTATAGGA GCATTAGATGATTTTGTTGCTTACTTCAATTCTTCAACAACTTCTCTTGAATCTCAATTTAGTGTAATAAGGAGTAAGGT TAAAGACATAGAAATACTTGAAGATGTGATTGAGAAAATGAAAAAAAGCTCTCTTGATATGGAAATAATGTCTATTAATA CATTAACAGTTGCCATGAGGGCTGGTAAGGCTGGGGGAGCCTTTTCTTATATTACTAGTGAAATCAAGGTTTTAACCCAA TCTATGATTAAACAGGCAGATCAACTTACCAGTAAGGGGCGCGAAGTTAAAATTGGTCTAGATAGGGCTAAAAATCAAGT ATATGAAAGTAATACAGCTGAAAATAAAATTCTTGAAGAATTTAGAGATAATTTAATGAAAAAAATAGATGCCTTTTCAG ATGGAATAGGAAGTGTTATTGCTCTTTATGATGATATTTTAAAAGTTTTATTAGAATTTAAGTTTAAACTTGTAAATTCT ATTTCTTATCTTCAGTTCCAAGACAGACTAACTCAATCTTTACAACATTTAAATATTATGTATTCTAATATTGATGTTTT TAAATTTAGAGATATAAGCGAGATTCAAAAATTAAAAATTTTATCAGTTTTTACTGATACATCAAAAGTTATAGTAAAAG ATGTTCTTGAAAAGCTTGAAAAAAATTATACTATTTTTGAGAAATTTATTGATGCCTCTCTTAGTTCTATTCAAACTATT AACGATTTAAGATCTGATAATTCCTTATACATAGATATTCCTAAAATAATAGAACAATTTTCTAACATTTTGTCTGACCT GCTTAGAAGAATTGATGATGTTGAGAAAAATAATTCTAATTTTTTGAATTTATATTATGAACAGGTTAAGCTTATAAAAT CATTAGAGCTAATGTTTTCAAATATTGCAGCTATTTCTGCTAGGTTTCAAAATATTAATATAGCGTCAAAGATAGAAGTT GTCAAAAGATCAGAACTTAAAGCTATGGAGGGTAATATTTCAGAAATGTCGAAAATTATTAAAGAGATTGATTCTAATAT TACTAAGGGAATAGAATTTCTAGATCAAATAATCTTTTTTCTTGAAAAAGTTGTTAAAGATTATGACAATAGATTTTATC TTGAAAAAAATTATTTTAATAAATTTAAAAAATTATTTATAGAAATTAAGAATGATATTCTTGATATTAAGAACATAGCC ATTGATAATATTTTGTCTTATGAAGTTTTTTCAATTGAATTTATGGAAATATTTGAAGAAATGAAATTAGAAGTCTATAA TGTTAGAAATTTAAAAAATTCTCTTTTAGATATAGAAAACTTTTTAAGTAATATGGAAAGCAAAATAAACTTTAGTCTTA ATTTAGAATTATCCAAAGTCGGAATTCAATTTGTTGAAATTGAAGATAAAGAATTTGTTAATAGAATTGCTAATCGATTT ACTTTATTTGTTCATAAAAAATACCTATTATCTTTAATAGAGGAAGCTAAGGATGTTCATTCCTTTGATGAGGGTAGTGT AATTTTATTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTGTTTTTGGTATGCCAATGGAAGCTATAAAAATAGGAGCCGTTTACAAAATTCTTCCTTTGAGTAAAATAGCTGATCAT GTTCTGAGGAGATCTTAGTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTTATATACTTTTTGGGAGGGTTTTAGGAGAAACTTAGATGAAAAAAAGAATTTTGGTTATTGATGATAATAGGGCAA TAAGGCAAAGCGTTGCTTAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 590; Mature: 590
Protein sequence:
>590_residues MDNDNNDFFANDYLATLFYKLEVFDESARHVYSNLSKSIPKLIEKISKDSKDLSFSIDLISNLDLDNDASLNNFIAKIIG ALDDFVAYFNSSTTSLESQFSVIRSKVKDIEILEDVIEKMKKSSLDMEIMSINTLTVAMRAGKAGGAFSYITSEIKVLTQ SMIKQADQLTSKGREVKIGLDRAKNQVYESNTAENKILEEFRDNLMKKIDAFSDGIGSVIALYDDILKVLLEFKFKLVNS ISYLQFQDRLTQSLQHLNIMYSNIDVFKFRDISEIQKLKILSVFTDTSKVIVKDVLEKLEKNYTIFEKFIDASLSSIQTI NDLRSDNSLYIDIPKIIEQFSNILSDLLRRIDDVEKNNSNFLNLYYEQVKLIKSLELMFSNIAAISARFQNINIASKIEV VKRSELKAMEGNISEMSKIIKEIDSNITKGIEFLDQIIFFLEKVVKDYDNRFYLEKNYFNKFKKLFIEIKNDILDIKNIA IDNILSYEVFSIEFMEIFEEMKLEVYNVRNLKNSLLDIENFLSNMESKINFSLNLELSKVGIQFVEIEDKEFVNRIANRF TLFVHKKYLLSLIEEAKDVHSFDEGSVILF
Sequences:
>Translated_590_residues MDNDNNDFFANDYLATLFYKLEVFDESARHVYSNLSKSIPKLIEKISKDSKDLSFSIDLISNLDLDNDASLNNFIAKIIG ALDDFVAYFNSSTTSLESQFSVIRSKVKDIEILEDVIEKMKKSSLDMEIMSINTLTVAMRAGKAGGAFSYITSEIKVLTQ SMIKQADQLTSKGREVKIGLDRAKNQVYESNTAENKILEEFRDNLMKKIDAFSDGIGSVIALYDDILKVLLEFKFKLVNS ISYLQFQDRLTQSLQHLNIMYSNIDVFKFRDISEIQKLKILSVFTDTSKVIVKDVLEKLEKNYTIFEKFIDASLSSIQTI NDLRSDNSLYIDIPKIIEQFSNILSDLLRRIDDVEKNNSNFLNLYYEQVKLIKSLELMFSNIAAISARFQNINIASKIEV VKRSELKAMEGNISEMSKIIKEIDSNITKGIEFLDQIIFFLEKVVKDYDNRFYLEKNYFNKFKKLFIEIKNDILDIKNIA IDNILSYEVFSIEFMEIFEEMKLEVYNVRNLKNSLLDIENFLSNMESKINFSLNLELSKVGIQFVEIEDKEFVNRIANRF TLFVHKKYLLSLIEEAKDVHSFDEGSVILF >Mature_590_residues MDNDNNDFFANDYLATLFYKLEVFDESARHVYSNLSKSIPKLIEKISKDSKDLSFSIDLISNLDLDNDASLNNFIAKIIG ALDDFVAYFNSSTTSLESQFSVIRSKVKDIEILEDVIEKMKKSSLDMEIMSINTLTVAMRAGKAGGAFSYITSEIKVLTQ SMIKQADQLTSKGREVKIGLDRAKNQVYESNTAENKILEEFRDNLMKKIDAFSDGIGSVIALYDDILKVLLEFKFKLVNS ISYLQFQDRLTQSLQHLNIMYSNIDVFKFRDISEIQKLKILSVFTDTSKVIVKDVLEKLEKNYTIFEKFIDASLSSIQTI NDLRSDNSLYIDIPKIIEQFSNILSDLLRRIDDVEKNNSNFLNLYYEQVKLIKSLELMFSNIAAISARFQNINIASKIEV VKRSELKAMEGNISEMSKIIKEIDSNITKGIEFLDQIIFFLEKVVKDYDNRFYLEKNYFNKFKKLFIEIKNDILDIKNIA IDNILSYEVFSIEFMEIFEEMKLEVYNVRNLKNSLLDIENFLSNMESKINFSLNLELSKVGIQFVEIEDKEFVNRIANRF TLFVHKKYLLSLIEEAKDVHSFDEGSVILF
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 68282; Mature: 68282
Theoretical pI: Translated: 4.76; Mature: 4.76
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDNDNNDFFANDYLATLFYKLEVFDESARHVYSNLSKSIPKLIEKISKDSKDLSFSIDLI CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHH SNLDLDNDASLNNFIAKIIGALDDFVAYFNSSTTSLESQFSVIRSKVKDIEILEDVIEKM HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKSSLDMEIMSINTLTVAMRAGKAGGAFSYITSEIKVLTQSMIKQADQLTSKGREVKIGL HHCCCCEEEEEEHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEH DRAKNQVYESNTAENKILEEFRDNLMKKIDAFSDGIGSVIALYDDILKVLLEFKFKLVNS HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISYLQFQDRLTQSLQHLNIMYSNIDVFKFRDISEIQKLKILSVFTDTSKVIVKDVLEKLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH KNYTIFEKFIDASLSSIQTINDLRSDNSLYIDIPKIIEQFSNILSDLLRRIDDVEKNNSN CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC FLNLYYEQVKLIKSLELMFSNIAAISARFQNINIASKIEVVKRSELKAMEGNISEMSKII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH KEIDSNITKGIEFLDQIIFFLEKVVKDYDNRFYLEKNYFNKFKKLFIEIKNDILDIKNIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDNILSYEVFSIEFMEIFEEMKLEVYNVRNLKNSLLDIENFLSNMESKINFSLNLELSKV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEHHH GIQFVEIEDKEFVNRIANRFTLFVHKKYLLSLIEEAKDVHSFDEGSVILF CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEC >Mature Secondary Structure MDNDNNDFFANDYLATLFYKLEVFDESARHVYSNLSKSIPKLIEKISKDSKDLSFSIDLI CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHH SNLDLDNDASLNNFIAKIIGALDDFVAYFNSSTTSLESQFSVIRSKVKDIEILEDVIEKM HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKSSLDMEIMSINTLTVAMRAGKAGGAFSYITSEIKVLTQSMIKQADQLTSKGREVKIGL HHCCCCEEEEEEHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEH DRAKNQVYESNTAENKILEEFRDNLMKKIDAFSDGIGSVIALYDDILKVLLEFKFKLVNS HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISYLQFQDRLTQSLQHLNIMYSNIDVFKFRDISEIQKLKILSVFTDTSKVIVKDVLEKLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH KNYTIFEKFIDASLSSIQTINDLRSDNSLYIDIPKIIEQFSNILSDLLRRIDDVEKNNSN CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC FLNLYYEQVKLIKSLELMFSNIAAISARFQNINIASKIEVVKRSELKAMEGNISEMSKII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH KEIDSNITKGIEFLDQIIFFLEKVVKDYDNRFYLEKNYFNKFKKLFIEIKNDILDIKNIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDNILSYEVFSIEFMEIFEEMKLEVYNVRNLKNSLLDIENFLSNMESKINFSLNLELSKV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEHHH GIQFVEIEDKEFVNRIANRFTLFVHKKYLLSLIEEAKDVHSFDEGSVILF CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA