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Definition Borrelia garinii PBi chromosome chromosome linear, complete sequence.
Accession NC_006156
Length 904,246

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The map label for this gene is 51598820

Identifier: 51598820

GI number: 51598820

Start: 583575

End: 585347

Strand: Direct

Name: 51598820

Synonym: BG0579

Alternate gene names: NA

Gene position: 583575-585347 (Clockwise)

Preceding gene: 51598819

Following gene: 51598821

Centisome position: 64.54

GC content: 24.99

Gene sequence:

>1773_bases
ATGGATAATGACAATAATGACTTTTTTGCTAATGATTATTTGGCAACCTTATTTTATAAACTTGAAGTTTTTGATGAGAG
TGCAAGGCATGTTTATTCAAATTTAAGCAAATCAATTCCTAAATTAATAGAAAAAATTTCTAAAGATTCTAAGGATTTAT
CTTTTAGTATTGACTTGATTTCTAATCTTGATCTTGATAATGATGCTTCTTTGAATAATTTCATAGCTAAGATTATAGGA
GCATTAGATGATTTTGTTGCTTACTTCAATTCTTCAACAACTTCTCTTGAATCTCAATTTAGTGTAATAAGGAGTAAGGT
TAAAGACATAGAAATACTTGAAGATGTGATTGAGAAAATGAAAAAAAGCTCTCTTGATATGGAAATAATGTCTATTAATA
CATTAACAGTTGCCATGAGGGCTGGTAAGGCTGGGGGAGCCTTTTCTTATATTACTAGTGAAATCAAGGTTTTAACCCAA
TCTATGATTAAACAGGCAGATCAACTTACCAGTAAGGGGCGCGAAGTTAAAATTGGTCTAGATAGGGCTAAAAATCAAGT
ATATGAAAGTAATACAGCTGAAAATAAAATTCTTGAAGAATTTAGAGATAATTTAATGAAAAAAATAGATGCCTTTTCAG
ATGGAATAGGAAGTGTTATTGCTCTTTATGATGATATTTTAAAAGTTTTATTAGAATTTAAGTTTAAACTTGTAAATTCT
ATTTCTTATCTTCAGTTCCAAGACAGACTAACTCAATCTTTACAACATTTAAATATTATGTATTCTAATATTGATGTTTT
TAAATTTAGAGATATAAGCGAGATTCAAAAATTAAAAATTTTATCAGTTTTTACTGATACATCAAAAGTTATAGTAAAAG
ATGTTCTTGAAAAGCTTGAAAAAAATTATACTATTTTTGAGAAATTTATTGATGCCTCTCTTAGTTCTATTCAAACTATT
AACGATTTAAGATCTGATAATTCCTTATACATAGATATTCCTAAAATAATAGAACAATTTTCTAACATTTTGTCTGACCT
GCTTAGAAGAATTGATGATGTTGAGAAAAATAATTCTAATTTTTTGAATTTATATTATGAACAGGTTAAGCTTATAAAAT
CATTAGAGCTAATGTTTTCAAATATTGCAGCTATTTCTGCTAGGTTTCAAAATATTAATATAGCGTCAAAGATAGAAGTT
GTCAAAAGATCAGAACTTAAAGCTATGGAGGGTAATATTTCAGAAATGTCGAAAATTATTAAAGAGATTGATTCTAATAT
TACTAAGGGAATAGAATTTCTAGATCAAATAATCTTTTTTCTTGAAAAAGTTGTTAAAGATTATGACAATAGATTTTATC
TTGAAAAAAATTATTTTAATAAATTTAAAAAATTATTTATAGAAATTAAGAATGATATTCTTGATATTAAGAACATAGCC
ATTGATAATATTTTGTCTTATGAAGTTTTTTCAATTGAATTTATGGAAATATTTGAAGAAATGAAATTAGAAGTCTATAA
TGTTAGAAATTTAAAAAATTCTCTTTTAGATATAGAAAACTTTTTAAGTAATATGGAAAGCAAAATAAACTTTAGTCTTA
ATTTAGAATTATCCAAAGTCGGAATTCAATTTGTTGAAATTGAAGATAAAGAATTTGTTAATAGAATTGCTAATCGATTT
ACTTTATTTGTTCATAAAAAATACCTATTATCTTTAATAGAGGAAGCTAAGGATGTTCATTCCTTTGATGAGGGTAGTGT
AATTTTATTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGTTTTTGGTATGCCAATGGAAGCTATAAAAATAGGAGCCGTTTACAAAATTCTTCCTTTGAGTAAAATAGCTGATCAT
GTTCTGAGGAGATCTTAGTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTATATACTTTTTGGGAGGGTTTTAGGAGAAACTTAGATGAAAAAAAGAATTTTGGTTATTGATGATAATAGGGCAA
TAAGGCAAAGCGTTGCTTAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 590; Mature: 590

Protein sequence:

>590_residues
MDNDNNDFFANDYLATLFYKLEVFDESARHVYSNLSKSIPKLIEKISKDSKDLSFSIDLISNLDLDNDASLNNFIAKIIG
ALDDFVAYFNSSTTSLESQFSVIRSKVKDIEILEDVIEKMKKSSLDMEIMSINTLTVAMRAGKAGGAFSYITSEIKVLTQ
SMIKQADQLTSKGREVKIGLDRAKNQVYESNTAENKILEEFRDNLMKKIDAFSDGIGSVIALYDDILKVLLEFKFKLVNS
ISYLQFQDRLTQSLQHLNIMYSNIDVFKFRDISEIQKLKILSVFTDTSKVIVKDVLEKLEKNYTIFEKFIDASLSSIQTI
NDLRSDNSLYIDIPKIIEQFSNILSDLLRRIDDVEKNNSNFLNLYYEQVKLIKSLELMFSNIAAISARFQNINIASKIEV
VKRSELKAMEGNISEMSKIIKEIDSNITKGIEFLDQIIFFLEKVVKDYDNRFYLEKNYFNKFKKLFIEIKNDILDIKNIA
IDNILSYEVFSIEFMEIFEEMKLEVYNVRNLKNSLLDIENFLSNMESKINFSLNLELSKVGIQFVEIEDKEFVNRIANRF
TLFVHKKYLLSLIEEAKDVHSFDEGSVILF

Sequences:

>Translated_590_residues
MDNDNNDFFANDYLATLFYKLEVFDESARHVYSNLSKSIPKLIEKISKDSKDLSFSIDLISNLDLDNDASLNNFIAKIIG
ALDDFVAYFNSSTTSLESQFSVIRSKVKDIEILEDVIEKMKKSSLDMEIMSINTLTVAMRAGKAGGAFSYITSEIKVLTQ
SMIKQADQLTSKGREVKIGLDRAKNQVYESNTAENKILEEFRDNLMKKIDAFSDGIGSVIALYDDILKVLLEFKFKLVNS
ISYLQFQDRLTQSLQHLNIMYSNIDVFKFRDISEIQKLKILSVFTDTSKVIVKDVLEKLEKNYTIFEKFIDASLSSIQTI
NDLRSDNSLYIDIPKIIEQFSNILSDLLRRIDDVEKNNSNFLNLYYEQVKLIKSLELMFSNIAAISARFQNINIASKIEV
VKRSELKAMEGNISEMSKIIKEIDSNITKGIEFLDQIIFFLEKVVKDYDNRFYLEKNYFNKFKKLFIEIKNDILDIKNIA
IDNILSYEVFSIEFMEIFEEMKLEVYNVRNLKNSLLDIENFLSNMESKINFSLNLELSKVGIQFVEIEDKEFVNRIANRF
TLFVHKKYLLSLIEEAKDVHSFDEGSVILF
>Mature_590_residues
MDNDNNDFFANDYLATLFYKLEVFDESARHVYSNLSKSIPKLIEKISKDSKDLSFSIDLISNLDLDNDASLNNFIAKIIG
ALDDFVAYFNSSTTSLESQFSVIRSKVKDIEILEDVIEKMKKSSLDMEIMSINTLTVAMRAGKAGGAFSYITSEIKVLTQ
SMIKQADQLTSKGREVKIGLDRAKNQVYESNTAENKILEEFRDNLMKKIDAFSDGIGSVIALYDDILKVLLEFKFKLVNS
ISYLQFQDRLTQSLQHLNIMYSNIDVFKFRDISEIQKLKILSVFTDTSKVIVKDVLEKLEKNYTIFEKFIDASLSSIQTI
NDLRSDNSLYIDIPKIIEQFSNILSDLLRRIDDVEKNNSNFLNLYYEQVKLIKSLELMFSNIAAISARFQNINIASKIEV
VKRSELKAMEGNISEMSKIIKEIDSNITKGIEFLDQIIFFLEKVVKDYDNRFYLEKNYFNKFKKLFIEIKNDILDIKNIA
IDNILSYEVFSIEFMEIFEEMKLEVYNVRNLKNSLLDIENFLSNMESKINFSLNLELSKVGIQFVEIEDKEFVNRIANRF
TLFVHKKYLLSLIEEAKDVHSFDEGSVILF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 68282; Mature: 68282

Theoretical pI: Translated: 4.76; Mature: 4.76

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDNDNNDFFANDYLATLFYKLEVFDESARHVYSNLSKSIPKLIEKISKDSKDLSFSIDLI
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHH
SNLDLDNDASLNNFIAKIIGALDDFVAYFNSSTTSLESQFSVIRSKVKDIEILEDVIEKM
HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKSSLDMEIMSINTLTVAMRAGKAGGAFSYITSEIKVLTQSMIKQADQLTSKGREVKIGL
HHCCCCEEEEEEHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEH
DRAKNQVYESNTAENKILEEFRDNLMKKIDAFSDGIGSVIALYDDILKVLLEFKFKLVNS
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISYLQFQDRLTQSLQHLNIMYSNIDVFKFRDISEIQKLKILSVFTDTSKVIVKDVLEKLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
KNYTIFEKFIDASLSSIQTINDLRSDNSLYIDIPKIIEQFSNILSDLLRRIDDVEKNNSN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
FLNLYYEQVKLIKSLELMFSNIAAISARFQNINIASKIEVVKRSELKAMEGNISEMSKII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
KEIDSNITKGIEFLDQIIFFLEKVVKDYDNRFYLEKNYFNKFKKLFIEIKNDILDIKNIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDNILSYEVFSIEFMEIFEEMKLEVYNVRNLKNSLLDIENFLSNMESKINFSLNLELSKV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEHHH
GIQFVEIEDKEFVNRIANRFTLFVHKKYLLSLIEEAKDVHSFDEGSVILF
CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEC
>Mature Secondary Structure
MDNDNNDFFANDYLATLFYKLEVFDESARHVYSNLSKSIPKLIEKISKDSKDLSFSIDLI
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHH
SNLDLDNDASLNNFIAKIIGALDDFVAYFNSSTTSLESQFSVIRSKVKDIEILEDVIEKM
HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKSSLDMEIMSINTLTVAMRAGKAGGAFSYITSEIKVLTQSMIKQADQLTSKGREVKIGL
HHCCCCEEEEEEHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEH
DRAKNQVYESNTAENKILEEFRDNLMKKIDAFSDGIGSVIALYDDILKVLLEFKFKLVNS
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISYLQFQDRLTQSLQHLNIMYSNIDVFKFRDISEIQKLKILSVFTDTSKVIVKDVLEKLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
KNYTIFEKFIDASLSSIQTINDLRSDNSLYIDIPKIIEQFSNILSDLLRRIDDVEKNNSN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
FLNLYYEQVKLIKSLELMFSNIAAISARFQNINIASKIEVVKRSELKAMEGNISEMSKII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
KEIDSNITKGIEFLDQIIFFLEKVVKDYDNRFYLEKNYFNKFKKLFIEIKNDILDIKNIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDNILSYEVFSIEFMEIFEEMKLEVYNVRNLKNSLLDIENFLSNMESKINFSLNLELSKV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEHHH
GIQFVEIEDKEFVNRIANRFTLFVHKKYLLSLIEEAKDVHSFDEGSVILF
CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA