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The map label for this gene is yoeA [H]

Identifier: 51598728

GI number: 51598728

Start: 494922

End: 496280

Strand: Direct

Name: yoeA [H]

Synonym: BG0485

Alternate gene names: 51598728

Gene position: 494922-496280 (Clockwise)

Preceding gene: 51598727

Following gene: 51598730

Centisome position: 54.73

GC content: 28.62

Gene sequence:

>1359_bases
ATGTCTAAAAATAAGAGCAAGGCTAGGGAATTAATATTAAAAGGCAATCTATATAAGGTTCTTTTTTTAATAAGTTTTCC
CATTGTTATAACCAATATTATTCAAGCTTTTTATGATCTTACTGATATGTTTTATGTTGGTAAGCTTGGAGCCATGCCTT
TGTCAGCGCTTTCACTTGCTGGTCCTGTAAATTTTTTTATTATGGCTATTGCTATGGGTATGGCTACAGGAAGCATTTCT
TTGACTTCAAAATGTATAGGAGAGGGAAATTTTTCTCGTTTTTCAAGGTATGCGGGGCAACTTATTGTTTTAAACTTTGT
TTTATCTTTATTTGTTGCTATTTGCTCTTTTTTTTTTATTGAGCATCTTTTGGATTTGCTAGGTGTAAAAGGCGAGCTTA
AAGAACTTTCAAGAGCTTATTTTTATGTGACAATTTTTGGAATACCTATTATGTTTTTAAGCATTTCAATTACATATATT
TTAAATGCTCAAGGAGAAACTATCATTTCAATGATAATAGTTTTATTTGCTAATATTGTTAATTTTATTCTTGATCCAAT
TTTAATATTTAGTTTTAATATGGGCATTACTGGAGCCGCTTGGGCTACTTTATTTTCAAAATTGTTAACCGTTGCTTTTT
ATTTATTTTTGACCTATGGGCTAAATCGTGGATTAAAAATTTATCCTAAGGACTTAGCGTTAGATATAAGATATATTAAA
GAAATTGTTAATTTAGGATTACCTTCAACTTTTGGGCAAATAATGGTTTCGTTGTCTTTTTTTATTTTTAATTATATCGG
TATTGAGATTAGTCCGAAATTTTTGGCGGCGTATGGACTTACAAACACAATTATTTCTTTTTTATTCCTTCCTGCCATGG
GGATTGGTACTGGAATTATTTCCATTGTTGGTCAAAATCTTGGTGCTAAGAAAATTAATAGGGTGGGAGAAGTTTTGAAA
AAGGGATTTTTTATTTCTTTAGCAATTTTATTAATAATAAATTCAATTGTTATTATTAATAAACATTTTATACTGAGATT
ATTTACAAATGATTTGGAAGTTTTAAATTATGCTAATAATTATTTATTGTTAACAACTATTGGTACTTTTGGATATGGAT
TGCAGCAAGTGTTCTTTGGAGGACTTATTGGATCTGGTAGGACAAAAGTTGCAATGATTATTATTTTTATTAGGTTGTGG
CTTATTCGTCTTCCGGTAGTTTTTATTTTTCAATATTTTGGCATAATTGAAAATTCTTTAGGTTATGCTTTTATAATTTC
CAATTATTTGGCAATTATCATTTTAGTTGGTTTTACTTGTACTCGCTATTGGGCTAAACCCATTTTAATTAAAAAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAATTTTTAAAATTAAAAATTAAATACTTTTTTATTATTGATGAATAAATTTGAGTTTATATTTTTTATAAAAAATCTT
TTAGATAAGGATAAAATTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATAGTAATTAAGATTTATTTATATTTTTGTTTTACCAAAGGAAATGGTTTATTTTTAATAATTTAATGTTTTTGACCT
TTAAAATTGTTTTTAGATTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 452; Mature: 451

Protein sequence:

>452_residues
MSKNKSKARELILKGNLYKVLFLISFPIVITNIIQAFYDLTDMFYVGKLGAMPLSALSLAGPVNFFIMAIAMGMATGSIS
LTSKCIGEGNFSRFSRYAGQLIVLNFVLSLFVAICSFFFIEHLLDLLGVKGELKELSRAYFYVTIFGIPIMFLSISITYI
LNAQGETIISMIIVLFANIVNFILDPILIFSFNMGITGAAWATLFSKLLTVAFYLFLTYGLNRGLKIYPKDLALDIRYIK
EIVNLGLPSTFGQIMVSLSFFIFNYIGIEISPKFLAAYGLTNTIISFLFLPAMGIGTGIISIVGQNLGAKKINRVGEVLK
KGFFISLAILLIINSIVIINKHFILRLFTNDLEVLNYANNYLLLTTIGTFGYGLQQVFFGGLIGSGRTKVAMIIIFIRLW
LIRLPVVFIFQYFGIIENSLGYAFIISNYLAIIILVGFTCTRYWAKPILIKK

Sequences:

>Translated_452_residues
MSKNKSKARELILKGNLYKVLFLISFPIVITNIIQAFYDLTDMFYVGKLGAMPLSALSLAGPVNFFIMAIAMGMATGSIS
LTSKCIGEGNFSRFSRYAGQLIVLNFVLSLFVAICSFFFIEHLLDLLGVKGELKELSRAYFYVTIFGIPIMFLSISITYI
LNAQGETIISMIIVLFANIVNFILDPILIFSFNMGITGAAWATLFSKLLTVAFYLFLTYGLNRGLKIYPKDLALDIRYIK
EIVNLGLPSTFGQIMVSLSFFIFNYIGIEISPKFLAAYGLTNTIISFLFLPAMGIGTGIISIVGQNLGAKKINRVGEVLK
KGFFISLAILLIINSIVIINKHFILRLFTNDLEVLNYANNYLLLTTIGTFGYGLQQVFFGGLIGSGRTKVAMIIIFIRLW
LIRLPVVFIFQYFGIIENSLGYAFIISNYLAIIILVGFTCTRYWAKPILIKK
>Mature_451_residues
SKNKSKARELILKGNLYKVLFLISFPIVITNIIQAFYDLTDMFYVGKLGAMPLSALSLAGPVNFFIMAIAMGMATGSISL
TSKCIGEGNFSRFSRYAGQLIVLNFVLSLFVAICSFFFIEHLLDLLGVKGELKELSRAYFYVTIFGIPIMFLSISITYIL
NAQGETIISMIIVLFANIVNFILDPILIFSFNMGITGAAWATLFSKLLTVAFYLFLTYGLNRGLKIYPKDLALDIRYIKE
IVNLGLPSTFGQIMVSLSFFIFNYIGIEISPKFLAAYGLTNTIISFLFLPAMGIGTGIISIVGQNLGAKKINRVGEVLKK
GFFISLAILLIINSIVIINKHFILRLFTNDLEVLNYANNYLLLTTIGTFGYGLQQVFFGGLIGSGRTKVAMIIIFIRLWL
IRLPVVFIFQYFGIIENSLGYAFIISNYLAIIILVGFTCTRYWAKPILIKK

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI153792564, Length=399, Percent_Identity=21.0526315789474, Blast_Score=67, Evalue=4e-11,
Organism=Escherichia coli, GI226510954, Length=410, Percent_Identity=21.9512195121951, Blast_Score=74, Evalue=2e-14,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50432; Mature: 50300

Theoretical pI: Translated: 10.06; Mature: 10.06

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SKNKSKARELILKGNLYKVLFLISFPIVITNIIQAFYDLTDMFYVGKLGAMPLSALSLA
CCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH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CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]