Definition | Mesoplasma florum L1, complete genome. |
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Accession | NC_006055 |
Length | 793,224 |
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The map label for this gene is 50365277
Identifier: 50365277
GI number: 50365277
Start: 541996
End: 543810
Strand: Reverse
Name: 50365277
Synonym: Mfl460
Alternate gene names: NA
Gene position: 543810-541996 (Counterclockwise)
Preceding gene: 50365278
Following gene: 50365276
Centisome position: 68.56
GC content: 23.2
Gene sequence:
>1815_bases ATGGTAGAAGAAAATTATGAAAAAAAGAAAACAAACCCTTTGCAAAATTTTATAAAGCAAAAGCTTATTAAATATAGAAG AATCCCGTTTGTTAAATTAATGAAATTTAGTTTTAAAAGTTTATTAAAAGAAAAATTATTTTATATTTTAAATTTAGCAA CTATTATTATTTCTATTTTAATGGGAATTATATTAGCTTTTGTAAAATCTGGAAGTTCTCAAGTTGTAATATTCAACTTT TATATATTATTTTTTGTTTGTTGTTTAATGTTTGTATTTATTTTAAGAATGATTCAATTTTTCTTCAGTAAGAATTTTGA AGATAAAACAACATATATTGTTTTAACTAATCAAGTAAGTAGAACAAAGTTTTTTATAGCTCAATATTTATTAATTATTT TAATTTGTGCTGTAAATATTTTAATGAGCTTTATTGTTATTAATATATTCTATGCAGTATTTACATTGTTTCATTATGAT GTATTTATACTTAGAATGACATCAATGTATGTTATATATTGTTTACTTGCAACATTCTTTTTAATTAACTTTATTTCGTT TTTAATTTTTATATTTACGTTACAAACAACTACAATTATATGTACATTATTATTAGCATTATCATTTATAGCAAACATCC CCATGTCGTTTATAAAAGCAAATGAAAAAAGTTATTATGTACAATTTACAAGCGGTGACATTTTTCAGTTAAATGATATA TATGATGCATACAGCTTATATGATCATGTAAACGATGGAAATATTAAATATCCCCATTTATCCAAATACGTTTACAACTA TTTTCTTTCAAAAGAAATGGTCACTGATCAATTTCGTAACACAACAAATATAAATTATAGAACGCAAATGTGAAAAGATT TAGGACTTATAAATCCTAATCCAGTTGTTATAACAGAAACAAATTTAGATTTATTCTCAAAACCCCTTAGAGATACATCT GTTCCAAATACTTGAGCAATCTATGATAAATTTAATATTCAAATAACTTTAAAAGACACTTTTATAACAAACGATCAATT AGATGAACTAATTAATAAAACAGTTGATCAAAATACAAAAAATATTTTAGTTGAATTTAGAAATTTCACAAATGAAATTA ACAAATACTTCAACAATGATCTTCAATTTGAAAAATATGATTTATTTTATGATTTCTTATTTTTAGATTCAGGTATTGAG AAAAGCTATTTAGAAAAACTTAATCCATCTGAAGAAGAAATAGAAGAAAATAAAGTAACTTATGCTTTGAAAAAACAAGA TGTTGTTTCGTTCTATGAATATTCAGTTGCGGGAATCCGTAATGATGGATTCAGATTTACAAATGCAAATGATTTAGTTA GAAATCAATTAAACTTTAATTTAATGTACTCAGCTAGAGTCATTGAAGAATACTTTATTAAATATTCAAGCAATTACATA ATTATGTCTTCAAATGCGGTATCTAAAACTTCAGGAGACTGAAATAGTTATACTAAAGGCAGAAGCATGATGCGTGGCCT ATCCTATTTCAACTTGTATAGTGGGTTGTGAATGGTTTATACCAAAAACTTAGGATTTTACAATAATGATATTTGATTTT CTCCAAATTCTTTTTCAAAGATTTATTTAGAAGATCAAAAGAATTTATTTTTAGGATATCCAGAGTATGATATAAAACTT ACTTCTACTAATATGATTGAAAAAAATACCACATCAAACTATATTAAGCCTTGATATTATTTGGTTATTTTATTTGGAAT AAGCACATTTAGTTTTTCAATAGCTTTATATAAATTTAGAAAGTTTGATTTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAAGCTTTGTAATTAAATCAGAAAAATTTTATTGATTTGAAAGAACACTAATTGAATCTATTTAATTTAGTGAATTACAT TGAAAGGAGGTGAAGGTACT
Downstream 100 bases:
>100_bases AATAAAATTTTAAAAATACACACAATTAAGAAAGAAAAGGAAAAAAATAAAAATGAAAAAATTATTATTAATATTATCAT CATTCGCTGTAGTTGGTACT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 604; Mature: 604
Protein sequence:
>604_residues MVEENYEKKKTNPLQNFIKQKLIKYRRIPFVKLMKFSFKSLLKEKLFYILNLATIIISILMGIILAFVKSGSSQVVIFNF YILFFVCCLMFVFILRMIQFFFSKNFEDKTTYIVLTNQVSRTKFFIAQYLLIILICAVNILMSFIVINIFYAVFTLFHYD VFILRMTSMYVIYCLLATFFLINFISFLIFIFTLQTTTIICTLLLALSFIANIPMSFIKANEKSYYVQFTSGDIFQLNDI YDAYSLYDHVNDGNIKYPHLSKYVYNYFLSKEMVTDQFRNTTNINYRTQMWKDLGLINPNPVVITETNLDLFSKPLRDTS VPNTWAIYDKFNIQITLKDTFITNDQLDELINKTVDQNTKNILVEFRNFTNEINKYFNNDLQFEKYDLFYDFLFLDSGIE KSYLEKLNPSEEEIEENKVTYALKKQDVVSFYEYSVAGIRNDGFRFTNANDLVRNQLNFNLMYSARVIEEYFIKYSSNYI IMSSNAVSKTSGDWNSYTKGRSMMRGLSYFNLYSGLWMVYTKNLGFYNNDIWFSPNSFSKIYLEDQKNLFLGYPEYDIKL TSTNMIEKNTTSNYIKPWYYLVILFGISTFSFSIALYKFRKFDF
Sequences:
>Translated_604_residues MVEENYEKKKTNPLQNFIKQKLIKYRRIPFVKLMKFSFKSLLKEKLFYILNLATIIISILMGIILAFVKSGSSQVVIFNF YILFFVCCLMFVFILRMIQFFFSKNFEDKTTYIVLTNQVSRTKFFIAQYLLIILICAVNILMSFIVINIFYAVFTLFHYD VFILRMTSMYVIYCLLATFFLINFISFLIFIFTLQTTTIICTLLLALSFIANIPMSFIKANEKSYYVQFTSGDIFQLNDI YDAYSLYDHVNDGNIKYPHLSKYVYNYFLSKEMVTDQFRNTTNINYRTQM*KDLGLINPNPVVITETNLDLFSKPLRDTS VPNT*AIYDKFNIQITLKDTFITNDQLDELINKTVDQNTKNILVEFRNFTNEINKYFNNDLQFEKYDLFYDFLFLDSGIE KSYLEKLNPSEEEIEENKVTYALKKQDVVSFYEYSVAGIRNDGFRFTNANDLVRNQLNFNLMYSARVIEEYFIKYSSNYI IMSSNAVSKTSGD*NSYTKGRSMMRGLSYFNLYSGL*MVYTKNLGFYNNDI*FSPNSFSKIYLEDQKNLFLGYPEYDIKL TSTNMIEKNTTSNYIKP*YYLVILFGISTFSFSIALYKFRKFDF >Mature_604_residues MVEENYEKKKTNPLQNFIKQKLIKYRRIPFVKLMKFSFKSLLKEKLFYILNLATIIISILMGIILAFVKSGSSQVVIFNF YILFFVCCLMFVFILRMIQFFFSKNFEDKTTYIVLTNQVSRTKFFIAQYLLIILICAVNILMSFIVINIFYAVFTLFHYD VFILRMTSMYVIYCLLATFFLINFISFLIFIFTLQTTTIICTLLLALSFIANIPMSFIKANEKSYYVQFTSGDIFQLNDI YDAYSLYDHVNDGNIKYPHLSKYVYNYFLSKEMVTDQFRNTTNINYRTQM*KDLGLINPNPVVITETNLDLFSKPLRDTS VPNT*AIYDKFNIQITLKDTFITNDQLDELINKTVDQNTKNILVEFRNFTNEINKYFNNDLQFEKYDLFYDFLFLDSGIE KSYLEKLNPSEEEIEENKVTYALKKQDVVSFYEYSVAGIRNDGFRFTNANDLVRNQLNFNLMYSARVIEEYFIKYSSNYI IMSSNAVSKTSGD*NSYTKGRSMMRGLSYFNLYSGL*MVYTKNLGFYNNDI*FSPNSFSKIYLEDQKNLFLGYPEYDIKL TSTNMIEKNTTSNYIKP*YYLVILFGISTFSFSIALYKFRKFDF
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 70490; Mature: 70490
Theoretical pI: Translated: 8.86; Mature: 8.86
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVEENYEKKKTNPLQNFIKQKLIKYRRIPFVKLMKFSFKSLLKEKLFYILNLATIIISIL CCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MGIILAFVKSGSSQVVIFNFYILFFVCCLMFVFILRMIQFFFSKNFEDKTTYIVLTNQVS HHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCH RTKFFIAQYLLIILICAVNILMSFIVINIFYAVFTLFHYDVFILRMTSMYVIYCLLATFF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LINFISFLIFIFTLQTTTIICTLLLALSFIANIPMSFIKANEKSYYVQFTSGDIFQLNDI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEEHHH YDAYSLYDHVNDGNIKYPHLSKYVYNYFLSKEMVTDQFRNTTNINYRTQMKDLGLINPNP HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHCCCCCCCC VVITETNLDLFSKPLRDTSVPNTAIYDKFNIQITLKDTFITNDQLDELINKTVDQNTKNI EEEEECCHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCHHH LVEFRNFTNEINKYFNNDLQFEKYDLFYDFLFLDSGIEKSYLEKLNPSEEEIEENKVTYA HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHCHHEEE LKKQDVVSFYEYSVAGIRNDGFRFTNANDLVRNQLNFNLMYSARVIEEYFIKYSSNYIIM EHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE SSNAVSKTSGDNSYTKGRSMMRGLSYFNLYSGLMVYTKNLGFYNNDIFSPNSFSKIYLED ECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEC QKNLFLGYPEYDIKLTSTNMIEKNTTSNYIKPYYLVILFGISTFSFSIALYKFRKFDF CCCEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MVEENYEKKKTNPLQNFIKQKLIKYRRIPFVKLMKFSFKSLLKEKLFYILNLATIIISIL CCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MGIILAFVKSGSSQVVIFNFYILFFVCCLMFVFILRMIQFFFSKNFEDKTTYIVLTNQVS HHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCH RTKFFIAQYLLIILICAVNILMSFIVINIFYAVFTLFHYDVFILRMTSMYVIYCLLATFF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LINFISFLIFIFTLQTTTIICTLLLALSFIANIPMSFIKANEKSYYVQFTSGDIFQLNDI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEEHHH YDAYSLYDHVNDGNIKYPHLSKYVYNYFLSKEMVTDQFRNTTNINYRTQMKDLGLINPNP HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHCCCCCCCC VVITETNLDLFSKPLRDTSVPNTAIYDKFNIQITLKDTFITNDQLDELINKTVDQNTKNI EEEEECCHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCHHH LVEFRNFTNEINKYFNNDLQFEKYDLFYDFLFLDSGIEKSYLEKLNPSEEEIEENKVTYA HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHCHHEEE LKKQDVVSFYEYSVAGIRNDGFRFTNANDLVRNQLNFNLMYSARVIEEYFIKYSSNYIIM EHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE SSNAVSKTSGDNSYTKGRSMMRGLSYFNLYSGLMVYTKNLGFYNNDIFSPNSFSKIYLED ECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEC QKNLFLGYPEYDIKLTSTNMIEKNTTSNYIKPYYLVILFGISTFSFSIALYKFRKFDF CCCEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA