Definition | Mesoplasma florum L1, complete genome. |
---|---|
Accession | NC_006055 |
Length | 793,224 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 50365140
Identifier: 50365140
GI number: 50365140
Start: 380169
End: 382187
Strand: Reverse
Name: 50365140
Synonym: Mfl324
Alternate gene names: NA
Gene position: 382187-380169 (Counterclockwise)
Preceding gene: 50365141
Following gene: 50365135
Centisome position: 48.18
GC content: 25.11
Gene sequence:
>2019_bases ATGAGAAAATTAATTTCTTTATTGGCTGCTGTAACTTTAACAGCTTCAGCCTCAGCTTCTGTTATTGCTTGTGGTCAAAT ACAACCTAAAGCAAAAGAACCTGCTGTTTATAATTCTCAAGACATTAATATTTTGCTTAAACAAGTAGCTAAAGCATATT ATTTAAATTCAAATAAATCTACAAATTATGATTTTAATTATGTATATGAAAATATGATTAAAAATAAATGAATAAAACAA TTAGATGCAACCGCTGAAACATCAAATACTAATGGAATAAATAATAATTCTCGCTTTACTGACATTCAATCTACATATTT TGGTAATGAATTAATAAGTAGTAAATTAAAAGATAAGAGTAACATTCAAATTATTTCTGGAGCAGCACCAAAAGATCCTA ATATAATTATGAATATTTCAAATATTTATCCTACATTAATTTCATTTATGAGTAACGGACAAATAATTGAAATGATTTTA TTTTTAGTTGATTTAGGAATTACTTTAATGCCACAAATCATTTCTGATCAAGGATTATTAGAATATGCAGCAGCATTATT ACCAGATGCCAATATTAAAAAATTAGCTGATGCTTTAAGTCCTTCAACTGCAAAATATCAAAATTATACAATGGAGGAAG TTTTAAACTCATCTATTGTTGATTTTGGTAATGCTTTAAATGTTTTTGCAGGTAAAGAAGCAAGATACAAAAATTCAACA GCAAAAGAAGCCAATGAATGAAGAGCAGCAGCGTTAAATGGTTCTGTTTTAGCAATGCAAGATTTATCAAAACAATCTAA TGTTAATCTAAATATTGTAGATAATTGAGATTCATTATGTTCAATCGTTAACTTTGCTAGAGTATTAGTTATCTATCTAA ATAACTTTGCTACTCAAAGATTAGAAATTATAGAAAAATCAGAATCAAATATTGAAACACTTTCATGAAGTAATTTACAA AGTATTAGAAATACAAAATATTCTCAAGTTAAAAATGAATTAGATATCAAAAAATTAATCAGATATTTAGATAAAACTTT TAATGATGAAAGTGGTAAAGAAATACAAAATTTATTACAATTTTTATTTAGAGGGCATGAAAAATATAAACCAGCAGCTA ATGGGCTAATTCCTGATATAGATGGTTTCATGTATAACTTTACGAATACAGTATATGATGATGCTGGTTTAAGTGGAGTT TTTAAAGCGTTATTAAATGGTACTTCAACGCCTAATAAACCAATAGGAAGTATGCTTGTTGGAGGATTAGGATTAGTAAG TTCTAATAATAATATAGTTGGTAAAATAAGTGAATCTATTCTTAGACCTTTAATTACAACTGCTTTAAAAGCAGCTGCTG CGCTAGGAACAATTGATGAAAAAACTGCTAACTTATTAATTGATTTAATTAATGACGGAATTTTATCAAAACCATGAGAT GTTACTTGAAATAAATTTTTAATACCTTTTACAAATAAAAAATTAAATAAGAATGGGAAAGTTAATATCTTAGGTTTCCC GATTAGTGGTGATTACACAATTAAAACTTTACTAACTCGTTTAACTGATTTAACAACAACTGAAAATGATCAACCATTAA AAATAGATTTTAATAATGTTTCTAATTTAATAAATCAATTACAAGGTGTTGTTAAAGTTGCACAAGAAAATCCAAAAGAT TTATTAAGTAAATTAGGATATATTAGACCTTCTATTGGTGATGATAAAGAATTTATAAAATCAGGATCATTTTTTGACTA TTTAGGTAAAATATTAAACGATACAAAAGGAAGCAATGGATTATTTACTGCTTTAAATAATAAAACAAAAGAATTTAAAG AATCACAAGAAAAATTAAAACAAGAAATGCAAGAAAAATTTGATTCAATTAAAGTTTCAAATGAAAAACAAATTGATGAT AATAATTTTGAATATGTTATAGACAATAAAACTATTACAATAACAATTAAAGTAGTTAAAAACAAATACTCAATATCAGC AATGAGTATTAAAAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGAGTAAATTTTTCTTTACTGATTTTGTTCACCCAACAAAACAAGTTCATGAATTGGTTTCTGAAATTCTTTTAGACCAT GCAAAGGAGTTGAGTAAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTAAAAAAGACATTAATCTTTAAAAGGATTAGTGTCTTTTTCTTTTTTCTTTTTAACAATATCAGCTTTCAATAATGTT TCAGCTTCTTTTGTTCTTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 672; Mature: 672
Protein sequence:
>672_residues MRKLISLLAAVTLTASASASVIACGQIQPKAKEPAVYNSQDINILLKQVAKAYYLNSNKSTNYDFNYVYENMIKNKWIKQ LDATAETSNTNGINNNSRFTDIQSTYFGNELISSKLKDKSNIQIISGAAPKDPNIIMNISNIYPTLISFMSNGQIIEMIL FLVDLGITLMPQIISDQGLLEYAAALLPDANIKKLADALSPSTAKYQNYTMEEVLNSSIVDFGNALNVFAGKEARYKNST AKEANEWRAAALNGSVLAMQDLSKQSNVNLNIVDNWDSLCSIVNFARVLVIYLNNFATQRLEIIEKSESNIETLSWSNLQ SIRNTKYSQVKNELDIKKLIRYLDKTFNDESGKEIQNLLQFLFRGHEKYKPAANGLIPDIDGFMYNFTNTVYDDAGLSGV FKALLNGTSTPNKPIGSMLVGGLGLVSSNNNIVGKISESILRPLITTALKAAAALGTIDEKTANLLIDLINDGILSKPWD VTWNKFLIPFTNKKLNKNGKVNILGFPISGDYTIKTLLTRLTDLTTTENDQPLKIDFNNVSNLINQLQGVVKVAQENPKD LLSKLGYIRPSIGDDKEFIKSGSFFDYLGKILNDTKGSNGLFTALNNKTKEFKESQEKLKQEMQEKFDSIKVSNEKQIDD NNFEYVIDNKTITITIKVVKNKYSISAMSIKN
Sequences:
>Translated_672_residues MRKLISLLAAVTLTASASASVIACGQIQPKAKEPAVYNSQDINILLKQVAKAYYLNSNKSTNYDFNYVYENMIKNK*IKQ LDATAETSNTNGINNNSRFTDIQSTYFGNELISSKLKDKSNIQIISGAAPKDPNIIMNISNIYPTLISFMSNGQIIEMIL FLVDLGITLMPQIISDQGLLEYAAALLPDANIKKLADALSPSTAKYQNYTMEEVLNSSIVDFGNALNVFAGKEARYKNST AKEANE*RAAALNGSVLAMQDLSKQSNVNLNIVDN*DSLCSIVNFARVLVIYLNNFATQRLEIIEKSESNIETLS*SNLQ SIRNTKYSQVKNELDIKKLIRYLDKTFNDESGKEIQNLLQFLFRGHEKYKPAANGLIPDIDGFMYNFTNTVYDDAGLSGV FKALLNGTSTPNKPIGSMLVGGLGLVSSNNNIVGKISESILRPLITTALKAAAALGTIDEKTANLLIDLINDGILSKP*D VT*NKFLIPFTNKKLNKNGKVNILGFPISGDYTIKTLLTRLTDLTTTENDQPLKIDFNNVSNLINQLQGVVKVAQENPKD LLSKLGYIRPSIGDDKEFIKSGSFFDYLGKILNDTKGSNGLFTALNNKTKEFKESQEKLKQEMQEKFDSIKVSNEKQIDD NNFEYVIDNKTITITIKVVKNKYSISAMSIKN >Mature_672_residues MRKLISLLAAVTLTASASASVIACGQIQPKAKEPAVYNSQDINILLKQVAKAYYLNSNKSTNYDFNYVYENMIKNK*IKQ LDATAETSNTNGINNNSRFTDIQSTYFGNELISSKLKDKSNIQIISGAAPKDPNIIMNISNIYPTLISFMSNGQIIEMIL FLVDLGITLMPQIISDQGLLEYAAALLPDANIKKLADALSPSTAKYQNYTMEEVLNSSIVDFGNALNVFAGKEARYKNST AKEANE*RAAALNGSVLAMQDLSKQSNVNLNIVDN*DSLCSIVNFARVLVIYLNNFATQRLEIIEKSESNIETLS*SNLQ SIRNTKYSQVKNELDIKKLIRYLDKTFNDESGKEIQNLLQFLFRGHEKYKPAANGLIPDIDGFMYNFTNTVYDDAGLSGV FKALLNGTSTPNKPIGSMLVGGLGLVSSNNNIVGKISESILRPLITTALKAAAALGTIDEKTANLLIDLINDGILSKP*D VT*NKFLIPFTNKKLNKNGKVNILGFPISGDYTIKTLLTRLTDLTTTENDQPLKIDFNNVSNLINQLQGVVKVAQENPKD LLSKLGYIRPSIGDDKEFIKSGSFFDYLGKILNDTKGSNGLFTALNNKTKEFKESQEKLKQEMQEKFDSIKVSNEKQIDD NNFEYVIDNKTITITIKVVKNKYSISAMSIKN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 73518; Mature: 73518
Theoretical pI: Translated: 9.01; Mature: 9.01
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRKLISLLAAVTLTASASASVIACGQIQPKAKEPAVYNSQDINILLKQVAKAYYLNSNKS CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCC TNYDFNYVYENMIKNKIKQLDATAETSNTNGINNNSRFTDIQSTYFGNELISSKLKDKSN CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC IQIISGAAPKDPNIIMNISNIYPTLISFMSNGQIIEMILFLVDLGITLMPQIISDQGLLE EEEEECCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH YAAALLPDANIKKLADALSPSTAKYQNYTMEEVLNSSIVDFGNALNVFAGKEARYKNSTA HHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCHH KEANERAAALNGSVLAMQDLSKQSNVNLNIVDNDSLCSIVNFARVLVIYLNNFATQRLEI HHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IEKSESNIETLSSNLQSIRNTKYSQVKNELDIKKLIRYLDKTFNDESGKEIQNLLQFLFR HHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHC GHEKYKPAANGLIPDIDGFMYNFTNTVYDDAGLSGVFKALLNGTSTPNKPIGSMLVGGLG CCHHCCCHHCCCCCCCCHHHHHHCHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHCCCE LVSSNNNIVGKISESILRPLITTALKAAAALGTIDEKTANLLIDLINDGILSKPDVTNKF EEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEE LIPFTNKKLNKNGKVNILGFPISGDYTIKTLLTRLTDLTTTENDQPLKIDFNNVSNLINQ EEEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHH LQGVVKVAQENPKDLLSKLGYIRPSIGDDKEFIKSGSFFDYLGKILNDTKGSNGLFTALN HHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECC NKTKEFKESQEKLKQEMQEKFDSIKVSNEKQIDDNNFEYVIDNKTITITIKVVKNKYSIS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCEEEEECCEEEEEEEEEECCEEEE AMSIKN EEEECC >Mature Secondary Structure MRKLISLLAAVTLTASASASVIACGQIQPKAKEPAVYNSQDINILLKQVAKAYYLNSNKS CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCC TNYDFNYVYENMIKNKIKQLDATAETSNTNGINNNSRFTDIQSTYFGNELISSKLKDKSN CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC IQIISGAAPKDPNIIMNISNIYPTLISFMSNGQIIEMILFLVDLGITLMPQIISDQGLLE EEEEECCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH YAAALLPDANIKKLADALSPSTAKYQNYTMEEVLNSSIVDFGNALNVFAGKEARYKNSTA HHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCHH KEANERAAALNGSVLAMQDLSKQSNVNLNIVDNDSLCSIVNFARVLVIYLNNFATQRLEI HHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IEKSESNIETLSSNLQSIRNTKYSQVKNELDIKKLIRYLDKTFNDESGKEIQNLLQFLFR HHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHC GHEKYKPAANGLIPDIDGFMYNFTNTVYDDAGLSGVFKALLNGTSTPNKPIGSMLVGGLG CCHHCCCHHCCCCCCCCHHHHHHCHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHCCCE LVSSNNNIVGKISESILRPLITTALKAAAALGTIDEKTANLLIDLINDGILSKPDVTNKF EEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEE LIPFTNKKLNKNGKVNILGFPISGDYTIKTLLTRLTDLTTTENDQPLKIDFNNVSNLINQ EEEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHH LQGVVKVAQENPKDLLSKLGYIRPSIGDDKEFIKSGSFFDYLGKILNDTKGSNGLFTALN HHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECC NKTKEFKESQEKLKQEMQEKFDSIKVSNEKQIDDNNFEYVIDNKTITITIKVVKNKYSIS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCEEEEECCEEEEEEEEEECCEEEE AMSIKN EEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA