Definition | Mesoplasma florum L1, complete genome. |
---|---|
Accession | NC_006055 |
Length | 793,224 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 50365063
Identifier: 50365063
GI number: 50365063
Start: 275257
End: 278112
Strand: Reverse
Name: 50365063
Synonym: Mfl247
Alternate gene names: NA
Gene position: 278112-275257 (Counterclockwise)
Preceding gene: 50365123
Following gene: 50365062
Centisome position: 35.06
GC content: 26.93
Gene sequence:
>2856_bases ATGAAAAAACTACTATCACTAATTGGTGCTTTTGCTTTAACAGCTAGTGCAACAAGTGTTTTAATTTCATGTTCTAATGA TAAAGACGATGATAAATATGGAAATGTATTTATTAATGATGATGGAGATTTTAAAATCACTACTGAAGACTTATTAAATT GATACAATGAAACTTATGGACGTTTAGGTAAAGATTCTCAAAAATTTTTAGTACAATTCTATAATATTTTTGCAGTTGCC ATTTATGAAGAAGCAAGTAAAGAAAATAACATTTTTCAAGGTATAAGTGCTGAAAAAAATCCTTATATGAATGAAGATGG AAAAGCATTTGCTGAAAGCTTAAAAACACAATATGGTAAGGAATCAAAAGCTTCAAATACAATATATGGTCGTGCTAATA CTGAAATGGAAAGAGCAAGAAAAGAATATCTTGACAATAAAAAACAAGGTACAAAAGCTTGAGTTAAATATTTAAAAGGA CAATTTCCTTGAGTTACTGGTGATCAAACAGCACTAGAAAATGCTTGAATATCAAACTATATCTTAACTGATTCAACTAA CTCTGCTTATGCTAACCTTTCAAAAGCACTAGGTTTTGGAGCAACTGAATCAACTTGAGCAAAAGGTTATTCAACAATCG AAGTAAATAGAACAACTATTTCAAATCTACTGTCAGTATTTTTAACTCAAAATGGAAATGTTTTAATTAATAATGAAACT TTAGATAAAACAATTAAAGAACAAGCAACAACTGAAGCTCAACAAATTTCTATTATAAATTTAGTAAACGCTTTAGGTGG AAAGAATGCATTTAAATCAAGCAATTCTTCTAACTACAATGAAACAATAAACACAGAAAACAATGGTACAACTTTTAAAA TCGAGTTTATTGAAAATACAAACGATGTTTTCTTGAATGCTTTAACTTGAAGAACGTTTTTATCAGGAATTAGTAGTATT TTTGCTAATAGTCCAAATTCAATAAATGGAACTATTTCTCAAATTAGTAGTAGTAATAATAATATTTTTAAATATTCTGA TGTCGAAAGTATAAGACTTGCTGATAATAATATATATAAAGATTTCTATAACTATAATGCTAGATCTTCTAGAGAACTTA ATAAAACACAAATCGTTTCTGTGGCACCTGTCTTAAATTCATCTAAAGATAATCAAAAAAATAATATACTTTCAAATTCA CAAAAATTCTTAGTAGATAATTATTTTGAAACTAAAAAACCTGTTGCAACCTCTGAAATTGTTTTAGAATTTTCAAAAAT TAATAGTACTGCAACACCAGATATTAATAAAGAAATAAGTCCTGCTCAATTTGTTAACAATGCCAATACTCAAACTGAAT TAATTAATTACTTTGAAGGTTTTTATCAATTTTATAATGCTTATGTTTCAAGTGAGAGTGCATCATCATATGCAAATGCT GAAACAAGTAGTTCAACTGGATTAACAGATTTTGAAACATTTTATAGAGGTTCAAATAAAAATAATTTATGAAAATTAGG TCAAAACCAAACTGATACAGGGATTATTAATTTCTTAACAGCTAAAAATAATGAAAAATTATTAACTTTAGACTATGATA CAACAACTGGAACATATTCAAACATAGCTAAATATTCTGTTTATGATTTCTTATCTTCAAATCCTAAAGAAGATGTAATT TCTACAAAGAATGATTGAGATGCAGATTCAACTAATATGATAGGTCAATGAGCAAGTTTTGATCAAAAAATGACAAATGT ATCTACTGATGCTACAAATGGAAAGAACTTATTGTTTAACCTTGTAAATGATTTAGGACGACATGCTGAAACTGAAGCAA ACAGCACAAAAGAAGGCGAAACAGCAAAACCTTATAAAGTATTAAATGCTAAAGATGGAATTATTGCATTCATTGATAGT GATGGATTACACTTCATGAAAATTGATGGATATAGTTTATTAAATAGCTCTAACGCTGAAAAAAGTGAAACAAGTGTTGA TAAAGATAAACAACAATCAATAGCTTATGATCTTCTTTCAAAAACAAATAAAGAATTAATTCCTTACTTATTAAATCCAA AATTAAGTTCAAGTACTGAAGCAGGCAATGCTGGTGAAGGTTCAGGAAAAATAAATAAAATTGACGAATCAACAGCAATT AAGCCTGGAATTAATAATGATATTTATAGACAAAACATTATTGACAATATGGGTACTGAATTTGGTAATGATTATAGTAA AATAATTAATTACTCAATTACCAATGATTATGAAAGATTCTTAGTTAACAATACTGTAGCTAATGGATTTTTATCAACCG ATGAAGAAAAAACAAACTTATTTTATAATTTTGATATTCTAGCTGATGCAAAAGCAACTACTTCAACAACTGAAAATTTC GGATTGTTAAGTCAATGATTATGAACTTACTTAGATGAGATATTAGGTACAAATGGGGACTATGCTGAATTATTTGGAAA ATTCTTTGAAATCGAAGGAGAAGATGTAGATACAAAAGCAGTTTATGAATTAATTAAGGTTATTACAACAGAACAAGAAA CTCTTAGTGCTGCTCCTTTAACAAGTTTTACATTAGAAAATAACAATTGAAATCAAAGCGTTGAAGATAATTATGAAAAA CAACATGAAGATTTAAAAACTGAAACAGCAAGATCATTTATTCCTAAAAATGGCTTGGAAATAAGTTATTCTTCAATTGT ACAAAGTCAGCACTGAAAAACTGACTTGTCAACAAAATCAAAATTTAATAAATTAAATTACATTATTTCTGATAAATGAT TTAATGATGAAGTTATTATTAATGTTTTAAATAAACATGAAGGAGGAGTTAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTGGTAATTTTATAGGGTTTTGAGTTATAATATTATCAATGCTTATATTTATATAAAAATAAGTGTTAACAGAAACGAT TTTCGCAGGAGGAAAACAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TGAAAAAATTATTAGCTATATTAGCAGCAGTTGGACTAACTGCAACAACTTCTTCAGTTGTAATTTCATGTACAACAACA GTTGATAGATTTGGCAAATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 951; Mature: 951
Protein sequence:
>951_residues MKKLLSLIGAFALTASATSVLISCSNDKDDDKYGNVFINDDGDFKITTEDLLNWYNETYGRLGKDSQKFLVQFYNIFAVA IYEEASKENNIFQGISAEKNPYMNEDGKAFAESLKTQYGKESKASNTIYGRANTEMERARKEYLDNKKQGTKAWVKYLKG QFPWVTGDQTALENAWISNYILTDSTNSAYANLSKALGFGATESTWAKGYSTIEVNRTTISNLLSVFLTQNGNVLINNET LDKTIKEQATTEAQQISIINLVNALGGKNAFKSSNSSNYNETINTENNGTTFKIEFIENTNDVFLNALTWRTFLSGISSI FANSPNSINGTISQISSSNNNIFKYSDVESIRLADNNIYKDFYNYNARSSRELNKTQIVSVAPVLNSSKDNQKNNILSNS QKFLVDNYFETKKPVATSEIVLEFSKINSTATPDINKEISPAQFVNNANTQTELINYFEGFYQFYNAYVSSESASSYANA ETSSSTGLTDFETFYRGSNKNNLWKLGQNQTDTGIINFLTAKNNEKLLTLDYDTTTGTYSNIAKYSVYDFLSSNPKEDVI STKNDWDADSTNMIGQWASFDQKMTNVSTDATNGKNLLFNLVNDLGRHAETEANSTKEGETAKPYKVLNAKDGIIAFIDS DGLHFMKIDGYSLLNSSNAEKSETSVDKDKQQSIAYDLLSKTNKELIPYLLNPKLSSSTEAGNAGEGSGKINKIDESTAI KPGINNDIYRQNIIDNMGTEFGNDYSKIINYSITNDYERFLVNNTVANGFLSTDEEKTNLFYNFDILADAKATTSTTENF GLLSQWLWTYLDEILGTNGDYAELFGKFFEIEGEDVDTKAVYELIKVITTEQETLSAAPLTSFTLENNNWNQSVEDNYEK QHEDLKTETARSFIPKNGLEISYSSIVQSQHWKTDLSTKSKFNKLNYIISDKWFNDEVIINVLNKHEGGVK
Sequences:
>Translated_951_residues MKKLLSLIGAFALTASATSVLISCSNDKDDDKYGNVFINDDGDFKITTEDLLN*YNETYGRLGKDSQKFLVQFYNIFAVA IYEEASKENNIFQGISAEKNPYMNEDGKAFAESLKTQYGKESKASNTIYGRANTEMERARKEYLDNKKQGTKA*VKYLKG QFP*VTGDQTALENA*ISNYILTDSTNSAYANLSKALGFGATEST*AKGYSTIEVNRTTISNLLSVFLTQNGNVLINNET LDKTIKEQATTEAQQISIINLVNALGGKNAFKSSNSSNYNETINTENNGTTFKIEFIENTNDVFLNALT*RTFLSGISSI FANSPNSINGTISQISSSNNNIFKYSDVESIRLADNNIYKDFYNYNARSSRELNKTQIVSVAPVLNSSKDNQKNNILSNS QKFLVDNYFETKKPVATSEIVLEFSKINSTATPDINKEISPAQFVNNANTQTELINYFEGFYQFYNAYVSSESASSYANA ETSSSTGLTDFETFYRGSNKNNL*KLGQNQTDTGIINFLTAKNNEKLLTLDYDTTTGTYSNIAKYSVYDFLSSNPKEDVI STKND*DADSTNMIGQ*ASFDQKMTNVSTDATNGKNLLFNLVNDLGRHAETEANSTKEGETAKPYKVLNAKDGIIAFIDS DGLHFMKIDGYSLLNSSNAEKSETSVDKDKQQSIAYDLLSKTNKELIPYLLNPKLSSSTEAGNAGEGSGKINKIDESTAI KPGINNDIYRQNIIDNMGTEFGNDYSKIINYSITNDYERFLVNNTVANGFLSTDEEKTNLFYNFDILADAKATTSTTENF GLLSQ*L*TYLDEILGTNGDYAELFGKFFEIEGEDVDTKAVYELIKVITTEQETLSAAPLTSFTLENNN*NQSVEDNYEK QHEDLKTETARSFIPKNGLEISYSSIVQSQH*KTDLSTKSKFNKLNYIISDK*FNDEVIINVLNKHEGGVK >Mature_951_residues MKKLLSLIGAFALTASATSVLISCSNDKDDDKYGNVFINDDGDFKITTEDLLN*YNETYGRLGKDSQKFLVQFYNIFAVA IYEEASKENNIFQGISAEKNPYMNEDGKAFAESLKTQYGKESKASNTIYGRANTEMERARKEYLDNKKQGTKA*VKYLKG QFP*VTGDQTALENA*ISNYILTDSTNSAYANLSKALGFGATEST*AKGYSTIEVNRTTISNLLSVFLTQNGNVLINNET LDKTIKEQATTEAQQISIINLVNALGGKNAFKSSNSSNYNETINTENNGTTFKIEFIENTNDVFLNALT*RTFLSGISSI FANSPNSINGTISQISSSNNNIFKYSDVESIRLADNNIYKDFYNYNARSSRELNKTQIVSVAPVLNSSKDNQKNNILSNS QKFLVDNYFETKKPVATSEIVLEFSKINSTATPDINKEISPAQFVNNANTQTELINYFEGFYQFYNAYVSSESASSYANA ETSSSTGLTDFETFYRGSNKNNL*KLGQNQTDTGIINFLTAKNNEKLLTLDYDTTTGTYSNIAKYSVYDFLSSNPKEDVI STKND*DADSTNMIGQ*ASFDQKMTNVSTDATNGKNLLFNLVNDLGRHAETEANSTKEGETAKPYKVLNAKDGIIAFIDS DGLHFMKIDGYSLLNSSNAEKSETSVDKDKQQSIAYDLLSKTNKELIPYLLNPKLSSSTEAGNAGEGSGKINKIDESTAI KPGINNDIYRQNIIDNMGTEFGNDYSKIINYSITNDYERFLVNNTVANGFLSTDEEKTNLFYNFDILADAKATTSTTENF GLLSQ*L*TYLDEILGTNGDYAELFGKFFEIEGEDVDTKAVYELIKVITTEQETLSAAPLTSFTLENNN*NQSVEDNYEK QHEDLKTETARSFIPKNGLEISYSSIVQSQH*KTDLSTKSKFNKLNYIISDK*FNDEVIINVLNKHEGGVK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 103721; Mature: 103721
Theoretical pI: Translated: 4.53; Mature: 4.53
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 0.7 %Met (Translated Protein) 0.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 0.7 %Met (Mature Protein) 0.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKLLSLIGAFALTASATSVLISCSNDKDDDKYGNVFINDDGDFKITTEDLLNYNETYGR CHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCCEEECCCCCEEEEHHHHHCCCHHHHH LGKDSQKFLVQFYNIFAVAIYEEASKENNIFQGISAEKNPYMNEDGKAFAESLKTQYGKE CCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC SKASNTIYGRANTEMERARKEYLDNKKQGTKAVKYLKGQFPVTGDQTALENAISNYILTD CCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCEEEEC STNSAYANLSKALGFGATESTAKGYSTIEVNRTTISNLLSVFLTQNGNVLINNETLDKTI CCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHH KEQATTEAQQISIINLVNALGGKNAFKSSNSSNYNETINTENNGTTFKIEFIENTNDVFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHH NALTRTFLSGISSIFANSPNSINGTISQISSSNNNIFKYSDVESIRLADNNIYKDFYNYN HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCEEEECCCCEEEECCCCHHHHHHCCC ARSSRELNKTQIVSVAPVLNSSKDNQKNNILSNSQKFLVDNYFETKKPVATSEIVLEFSK CCCCCCCCHHEEEEEEHHHCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH INSTATPDINKEISPAQFVNNANTQTELINYFEGFYQFYNAYVSSESASSYANAETSSST CCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCCC GLTDFETFYRGSNKNNLKLGQNQTDTGIINFLTAKNNEKLLTLDYDTTTGTYSNIAKYSV CCCHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHH YDFLSSNPKEDVISTKNDDADSTNMIGQASFDQKMTNVSTDATNGKNLLFNLVNDLGRHA HHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC ETEANSTKEGETAKPYKVLNAKDGIIAFIDSDGLHFMKIDGYSLLNSSNAEKSETSVDKD CCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCEECCCCCCHHHHHCCHH KQQSIAYDLLSKTNKELIPYLLNPKLSSSTEAGNAGEGSGKINKIDESTAIKPGINNDIY HHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCHHH RQNIIDNMGTEFGNDYSKIINYSITNDYERFLVNNTVANGFLSTDEEKTNLFYNFDILAD HHHHHHHHCHHHCCCHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEC AKATTSTTENFGLLSQLTYLDEILGTNGDYAELFGKFFEIEGEDVDTKAVYELIKVITTE CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC QETLSAAPLTSFTLENNNNQSVEDNYEKQHEDLKTETARSFIPKNGLEISYSSIVQSQHK HHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHH TDLSTKSKFNKLNYIISDKFNDEVIINVLNKHEGGVK CCCHHHHHHHHHEEEECCCCCCCEEEEEHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKKLLSLIGAFALTASATSVLISCSNDKDDDKYGNVFINDDGDFKITTEDLLNYNETYGR CHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCCEEECCCCCEEEEHHHHHCCCHHHHH LGKDSQKFLVQFYNIFAVAIYEEASKENNIFQGISAEKNPYMNEDGKAFAESLKTQYGKE CCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC SKASNTIYGRANTEMERARKEYLDNKKQGTKAVKYLKGQFPVTGDQTALENAISNYILTD CCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCEEEEC STNSAYANLSKALGFGATESTAKGYSTIEVNRTTISNLLSVFLTQNGNVLINNETLDKTI CCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHH KEQATTEAQQISIINLVNALGGKNAFKSSNSSNYNETINTENNGTTFKIEFIENTNDVFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHH NALTRTFLSGISSIFANSPNSINGTISQISSSNNNIFKYSDVESIRLADNNIYKDFYNYN HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCEEEECCCCEEEECCCCHHHHHHCCC ARSSRELNKTQIVSVAPVLNSSKDNQKNNILSNSQKFLVDNYFETKKPVATSEIVLEFSK CCCCCCCCHHEEEEEEHHHCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH INSTATPDINKEISPAQFVNNANTQTELINYFEGFYQFYNAYVSSESASSYANAETSSST CCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCCC GLTDFETFYRGSNKNNLKLGQNQTDTGIINFLTAKNNEKLLTLDYDTTTGTYSNIAKYSV CCCHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHH YDFLSSNPKEDVISTKNDDADSTNMIGQASFDQKMTNVSTDATNGKNLLFNLVNDLGRHA HHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC ETEANSTKEGETAKPYKVLNAKDGIIAFIDSDGLHFMKIDGYSLLNSSNAEKSETSVDKD CCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCEECCCCCCHHHHHCCHH KQQSIAYDLLSKTNKELIPYLLNPKLSSSTEAGNAGEGSGKINKIDESTAIKPGINNDIY HHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCHHH RQNIIDNMGTEFGNDYSKIINYSITNDYERFLVNNTVANGFLSTDEEKTNLFYNFDILAD HHHHHHHHCHHHCCCHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEC AKATTSTTENFGLLSQLTYLDEILGTNGDYAELFGKFFEIEGEDVDTKAVYELIKVITTE CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC QETLSAAPLTSFTLENNNNQSVEDNYEKQHEDLKTETARSFIPKNGLEISYSSIVQSQHK HHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHH TDLSTKSKFNKLNYIISDKFNDEVIINVLNKHEGGVK CCCHHHHHHHHHEEEECCCCCCCEEEEEHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA