Definition | Bacillus anthracis str. Sterne chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_005945 |
Length | 5,228,663 |
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The map label for this gene is opuD [H]
Identifier: 49183548
GI number: 49183548
Start: 556611
End: 558161
Strand: Reverse
Name: opuD [H]
Synonym: BAS0522
Alternate gene names: 49183548
Gene position: 558161-556611 (Counterclockwise)
Preceding gene: 49183556
Following gene: 49183535
Centisome position: 10.68
GC content: 36.75
Gene sequence:
>1551_bases ATGATAAAAAAGGAAAACAGTGTATTCTATATCTCCATCTTGCTAACAACATTATTTATCATATGGGGAATTACCCCGGC AAGTTGGATACAAGGCTATGATTTACAAAGCGTTACATCTTCTTTAAACTCATTTATCCTCAATAAATTTGGATGGTTTT ACTCTCTACTTATGACTGCAATGATTATTTTAGCCACGTATTTAGCATTCTCTAAATACGGTTCTATTCGTCTTGGTAAA GATGGAGAAAAACCAAAGTATAGTTATCCATCTTGGCTATCCATGTTGTTTGGAGCAGGAATGGGAATTGGACTCCTCTT TTATGGAATCGCTGAACCGATTTCACATTTTACAGATCCATTAACAGGAAAAGCAGGTACAGAGGAAAGTGCCAAACTCG CTATGCAATATTCATTTTTCCACTGGGGCCTCTTTCCATGGGCACTATACGCAATGGTTGCTTTAACAATTGCATATTTC ACATTCCGCAAACAAAAAGGTAGCACAATTGGCGCTACAGTTACTCCATTATTTAATCGATCGAAGAATTCTCCTATCGG AAAAACAGTTGATATTTTAGCTGTTTTAGCCACAGTATTTGGTATTGTGCCATCTGTTGGGATTGGTGCTCAACAAATCG CCGGAGGATTAAGCTATTTATTCCCTTCTATTCATAACACTTTACTTACACAGCTCGTACTTATCGCCATCTTCGCTGTT TTATATTTAACAAGTGCACAAACAGGCTTAGATCGTGGGATTAAATATTTGAGTAACTTAAATTTCTCTCTTACAGGTAT ATTACTCGTCTCCTTTTTACTTTTAGGACCAACTGTATTTATTATGAAATATTTCACATCTACACTCGGTTCTTATATTG GAGCTTTACCTAGTATGGGATTAAATTTAGGAGCATTTAATGAAAAATCTTCTTCTTGGATAGAAAACTGGACTATTTTC TATTGGGGATGGTGGATCTCCTGGTCTCCATTCGTCGGTACATTCATCGCCCGTATTTCTAAAGGGCGCACAATAAAAGA ATTTATTTTTGGAGTTGTATTAGTCCCAACTCTCATCTGCACATTTTGGTTTGCAGTATTTGGCGGCACCGCTATCCATA TGGAAATGTTCCAATCCCTTGGAGTAGCTGATGAAATCGCAAAAAACGGGACAGAGATTGGATTATTTGCTGTTATTTCA CATCTACCGTTCTCTACATTTTTAACAATTATCGGGTTAATTTTAGTAGCCACATTTTTCGTTACTTCTGCCGACTCGGC AACATTTGTTGTTTCTATGCAAACGAGTAACGGAAGCTTATCACCGAAAAATAGTTTGAAACTTATATGGGGATTAACAA TCGCGATAATCGCAGCTATTTTATTACAAGCTGGAGGGTTAAATGCACTACAAATTGCAGCGATAATCGCAGCACTACCA TTTTCTATCGTAGTCGTTCTTATGGTTACTTCGCTCTTTAAAGAGCTCCGAAAAGAAGATATTAATTCGCAAACGAAAGA AGTTCCGAAAAAAATAAAAAAGGTTATGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTCCTTTTACACATGTTAAAAATCGAATTTTTTGACAATTACCCCTTCAATTGTTATGATTAATATAATTGTTAACTTTA TTAAACAAGGGTGGGATTCT
Downstream 100 bases:
>100_bases CGATTGGCGCCTTAAATTACTTCTAAATCCGTGATGAATGAGGAAAAAAGTAAATGAATAAAACCCATTCATATGAAATA TCATTTTCATATGAATGGGT
Product: glycine betaine transporter
Products: Proton [Cytoplasm]; choline [Cytoplasm] [C]
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 516; Mature: 516
Protein sequence:
>516_residues MIKKENSVFYISILLTTLFIIWGITPASWIQGYDLQSVTSSLNSFILNKFGWFYSLLMTAMIILATYLAFSKYGSIRLGK DGEKPKYSYPSWLSMLFGAGMGIGLLFYGIAEPISHFTDPLTGKAGTEESAKLAMQYSFFHWGLFPWALYAMVALTIAYF TFRKQKGSTIGATVTPLFNRSKNSPIGKTVDILAVLATVFGIVPSVGIGAQQIAGGLSYLFPSIHNTLLTQLVLIAIFAV LYLTSAQTGLDRGIKYLSNLNFSLTGILLVSFLLLGPTVFIMKYFTSTLGSYIGALPSMGLNLGAFNEKSSSWIENWTIF YWGWWISWSPFVGTFIARISKGRTIKEFIFGVVLVPTLICTFWFAVFGGTAIHMEMFQSLGVADEIAKNGTEIGLFAVIS HLPFSTFLTIIGLILVATFFVTSADSATFVVSMQTSNGSLSPKNSLKLIWGLTIAIIAAILLQAGGLNALQIAAIIAALP FSIVVVLMVTSLFKELRKEDINSQTKEVPKKIKKVM
Sequences:
>Translated_516_residues MIKKENSVFYISILLTTLFIIWGITPASWIQGYDLQSVTSSLNSFILNKFGWFYSLLMTAMIILATYLAFSKYGSIRLGK DGEKPKYSYPSWLSMLFGAGMGIGLLFYGIAEPISHFTDPLTGKAGTEESAKLAMQYSFFHWGLFPWALYAMVALTIAYF TFRKQKGSTIGATVTPLFNRSKNSPIGKTVDILAVLATVFGIVPSVGIGAQQIAGGLSYLFPSIHNTLLTQLVLIAIFAV LYLTSAQTGLDRGIKYLSNLNFSLTGILLVSFLLLGPTVFIMKYFTSTLGSYIGALPSMGLNLGAFNEKSSSWIENWTIF YWGWWISWSPFVGTFIARISKGRTIKEFIFGVVLVPTLICTFWFAVFGGTAIHMEMFQSLGVADEIAKNGTEIGLFAVIS HLPFSTFLTIIGLILVATFFVTSADSATFVVSMQTSNGSLSPKNSLKLIWGLTIAIIAAILLQAGGLNALQIAAIIAALP FSIVVVLMVTSLFKELRKEDINSQTKEVPKKIKKVM >Mature_516_residues MIKKENSVFYISILLTTLFIIWGITPASWIQGYDLQSVTSSLNSFILNKFGWFYSLLMTAMIILATYLAFSKYGSIRLGK DGEKPKYSYPSWLSMLFGAGMGIGLLFYGIAEPISHFTDPLTGKAGTEESAKLAMQYSFFHWGLFPWALYAMVALTIAYF TFRKQKGSTIGATVTPLFNRSKNSPIGKTVDILAVLATVFGIVPSVGIGAQQIAGGLSYLFPSIHNTLLTQLVLIAIFAV LYLTSAQTGLDRGIKYLSNLNFSLTGILLVSFLLLGPTVFIMKYFTSTLGSYIGALPSMGLNLGAFNEKSSSWIENWTIF YWGWWISWSPFVGTFIARISKGRTIKEFIFGVVLVPTLICTFWFAVFGGTAIHMEMFQSLGVADEIAKNGTEIGLFAVIS HLPFSTFLTIIGLILVATFFVTSADSATFVVSMQTSNGSLSPKNSLKLIWGLTIAIIAAILLQAGGLNALQIAAIIAALP FSIVVVLMVTSLFKELRKEDINSQTKEVPKKIKKVM
Specific function: High-affinity uptake of glycine betaine [H]
COG id: COG1292
COG function: function code M; Choline-glycine betaine transporter
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the BCCT transporter (TC 2.A.15) family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1786506, Length=507, Percent_Identity=36.4891518737673, Blast_Score=326, Evalue=2e-90, Organism=Escherichia coli, GI1788102, Length=455, Percent_Identity=31.2087912087912, Blast_Score=204, Evalue=9e-54, Organism=Escherichia coli, GI1786224, Length=484, Percent_Identity=27.8925619834711, Blast_Score=187, Evalue=1e-48,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR000060 - InterPro: IPR018093 [H]
Pfam domain/function: PF02028 BCCT [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 56537; Mature: 56537
Theoretical pI: Translated: 9.98; Mature: 9.98
Prosite motif: PS01303 BCCT
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIKKENSVFYISILLTTLFIIWGITPASWIQGYDLQSVTSSLNSFILNKFGWFYSLLMTA CCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MIILATYLAFSKYGSIRLGKDGEKPKYSYPSWLSMLFGAGMGIGLLFYGIAEPISHFTDP HHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC LTGKAGTEESAKLAMQYSFFHWGLFPWALYAMVALTIAYFTFRKQKGSTIGATVTPLFNR CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCC SKNSPIGKTVDILAVLATVFGIVPSVGIGAQQIAGGLSYLFPSIHNTLLTQLVLIAIFAV CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LYLTSAQTGLDRGIKYLSNLNFSLTGILLVSFLLLGPTVFIMKYFTSTLGSYIGALPSMG HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC LNLGAFNEKSSSWIENWTIFYWGWWISWSPFVGTFIARISKGRTIKEFIFGVVLVPTLIC CCCCCCCCCCHHHHHCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH TFWFAVFGGTAIHMEMFQSLGVADEIAKNGTEIGLFAVISHLPFSTFLTIIGLILVATFF HHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VTSADSATFVVSMQTSNGSLSPKNSLKLIWGLTIAIIAAILLQAGGLNALQIAAIIAALP HHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH FSIVVVLMVTSLFKELRKEDINSQTKEVPKKIKKVM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MIKKENSVFYISILLTTLFIIWGITPASWIQGYDLQSVTSSLNSFILNKFGWFYSLLMTA CCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MIILATYLAFSKYGSIRLGKDGEKPKYSYPSWLSMLFGAGMGIGLLFYGIAEPISHFTDP HHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC LTGKAGTEESAKLAMQYSFFHWGLFPWALYAMVALTIAYFTFRKQKGSTIGATVTPLFNR CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCC SKNSPIGKTVDILAVLATVFGIVPSVGIGAQQIAGGLSYLFPSIHNTLLTQLVLIAIFAV CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LYLTSAQTGLDRGIKYLSNLNFSLTGILLVSFLLLGPTVFIMKYFTSTLGSYIGALPSMG HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC LNLGAFNEKSSSWIENWTIFYWGWWISWSPFVGTFIARISKGRTIKEFIFGVVLVPTLIC CCCCCCCCCCHHHHHCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH TFWFAVFGGTAIHMEMFQSLGVADEIAKNGTEIGLFAVISHLPFSTFLTIIGLILVATFF HHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VTSADSATFVVSMQTSNGSLSPKNSLKLIWGLTIAIIAAILLQAGGLNALQIAAIIAALP HHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH FSIVVVLMVTSLFKELRKEDINSQTKEVPKKIKKVM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: Proton [Periplasm]; choline [Periplasm] [C]
Specific reaction: Proton [Periplasm] + choline [Periplasm] = Proton [Cytoplasm] + choline [Cytoplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8752321; 9387221; 9384377 [H]