Definition | Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome. |
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Accession | NC_005861 |
Length | 2,414,465 |
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The map label for this gene is 46446369
Identifier: 46446369
GI number: 46446369
Start: 897665
End: 900892
Strand: Direct
Name: 46446369
Synonym: pc0735
Alternate gene names: NA
Gene position: 897665-900892 (Clockwise)
Preceding gene: 46446366
Following gene: 46446371
Centisome position: 37.18
GC content: 35.07
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1075; Mature: 1075
Protein sequence:
>1075_residues MIEPTISFIPSIKTPLITFHLNGRVPSHLKYEYRLRIVLKQAITAKAEVKTDKKTEWKMWKVTFQTHSTDWLLANISRQM FQQHPQINLTKQKSVKQLNLEFGQAISKEPVHVMVEIAGKTSRGENYILHLCPSNLKESRATLQDKKGKTKPIALDLGFL ETFTLEDLRYLFLTKFESFVRIQIKQKDGEKSLCLSALNSSSLSLSSLKHTKDLVKYLKQGNSQDPIIAILLKKMVDAFV NMQQPRSEAIEEMIDIFDKLQQNDQMRVFRSVTKHFVENPLTDQNIVKILKKILVYFQKTIYQQQVDAEEDNVFLSSKIL DEFDANDLVKILVILTENLVPQAGSKNIPSIQNRLRALVALLETMIIQEVQGVNKDVYLSAYKAINEIAKSKDLKNNLEM DYLAHYGKNSFLQISDDTTVGDTAKSTLSRTFYLLRGFAKIADSVSIFEPWHIVSLFDSLEDFKKVISYRDYRFKKWFSK KQWFTSLLALRFTLFKKPEKFFSELDKLNTQEASFSKKAMRVFHHPLFLIGFVNLLKEVLHIPTHVPRDLALKKVAIQLL QRIYQDNVSKEKPNSPISFKLESDEQRNQILEIVRGYLLACKTHGDPAVSRVTEEALKELNLQDVIFSPASKPQNELFDQ AVKQIPIFNALKQISKQLEKDDQLKKESVYYISPNVQEDEGFSDSFPLKKALKNFFETENTPVLYLEGDGGAGKTLTMKV LTNELLRNYSSTSYFPFYTYLGSLNNPLEKIIEETFALRGMTPDQVNELKERKVVFICDAVDEINPLKLPSETKNMNMYE ANNFAEKDIAKVIFVSKKGLNDAKRFEPVGKTIQKFILTPFDEQQIFDYLEKFAQERQKEENNLFLTWTAEKYRETFKKL QDSELWKLITNPFRLHVIVEVLPLIVESRSDIKIEEIFRQQTKGEIEQHFFDIFACVQAYRSSLKEKLLPIGPEEFLKYS AQLAAVMQRHEIFSIPLQAIAEQQEDVKDLSNSSISTKEDIALQGIIQKFFKKSHEKFYKECLILKNQGEWAFMHGDYQL YFSQFGNYFGRAKRFDEIYNKYNLTKWIRRDNDRS
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 124928; Mature: 124928
Theoretical pI: Translated: 9.24; Mature: 9.24
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIEPTISFIPSIKTPLITFHLNGRVPSHLKYEYRLRIVLKQAITAKAEVKTDKKTEWKMW CCCCHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEE KVTFQTHSTDWLLANISRQMFQQHPQINLTKQKSVKQLNLEFGQAISKEPVHVMVEIAGK EEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCC TSRGENYILHLCPSNLKESRATLQDKKGKTKPIALDLGFLETFTLEDLRYLFLTKFESFV CCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE RIQIKQKDGEKSLCLSALNSSSLSLSSLKHTKDLVKYLKQGNSQDPIIAILLKKMVDAFV EEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH NMQQPRSEAIEEMIDIFDKLQQNDQMRVFRSVTKHFVENPLTDQNIVKILKKILVYFQKT CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IYQQQVDAEEDNVFLSSKILDEFDANDLVKILVILTENLVPQAGSKNIPSIQNRLRALVA HHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH LLETMIIQEVQGVNKDVYLSAYKAINEIAKSKDLKNNLEMDYLAHYGKNSFLQISDDTTV HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCEEEECCCCCC GDTAKSTLSRTFYLLRGFAKIADSVSIFEPWHIVSLFDSLEDFKKVISYRDYRFKKWFSK CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KQWFTSLLALRFTLFKKPEKFFSELDKLNTQEASFSKKAMRVFHHPLFLIGFVNLLKEVL HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HIPTHVPRDLALKKVAIQLLQRIYQDNVSKEKPNSPISFKLESDEQRNQILEIVRGYLLA HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH CKTHGDPAVSRVTEEALKELNLQDVIFSPASKPQNELFDQAVKQIPIFNALKQISKQLEK HCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH DDQLKKESVYYISPNVQEDEGFSDSFPLKKALKNFFETENTPVLYLEGDGGAGKTLTMKV HHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHH LTNELLRNYSSTSYFPFYTYLGSLNNPLEKIIEETFALRGMTPDQVNELKERKVVFICDA HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECC VDEINPLKLPSETKNMNMYEANNFAEKDIAKVIFVSKKGLNDAKRFEPVGKTIQKFILTP CCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC FDEQQIFDYLEKFAQERQKEENNLFLTWTAEKYRETFKKLQDSELWKLITNPFRLHVIVE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH VLPLIVESRSDIKIEEIFRQQTKGEIEQHFFDIFACVQAYRSSLKEKLLPIGPEEFLKYS HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH AQLAAVMQRHEIFSIPLQAIAEQQEDVKDLSNSSISTKEDIALQGIIQKFFKKSHEKFYK HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ECLILKNQGEWAFMHGDYQLYFSQFGNYFGRAKRFDEIYNKYNLTKWIRRDNDRS HHHEEECCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC >Mature Secondary Structure MIEPTISFIPSIKTPLITFHLNGRVPSHLKYEYRLRIVLKQAITAKAEVKTDKKTEWKMW CCCCHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEE KVTFQTHSTDWLLANISRQMFQQHPQINLTKQKSVKQLNLEFGQAISKEPVHVMVEIAGK EEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCC TSRGENYILHLCPSNLKESRATLQDKKGKTKPIALDLGFLETFTLEDLRYLFLTKFESFV CCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE RIQIKQKDGEKSLCLSALNSSSLSLSSLKHTKDLVKYLKQGNSQDPIIAILLKKMVDAFV EEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH NMQQPRSEAIEEMIDIFDKLQQNDQMRVFRSVTKHFVENPLTDQNIVKILKKILVYFQKT CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IYQQQVDAEEDNVFLSSKILDEFDANDLVKILVILTENLVPQAGSKNIPSIQNRLRALVA HHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH LLETMIIQEVQGVNKDVYLSAYKAINEIAKSKDLKNNLEMDYLAHYGKNSFLQISDDTTV HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCEEEECCCCCC GDTAKSTLSRTFYLLRGFAKIADSVSIFEPWHIVSLFDSLEDFKKVISYRDYRFKKWFSK CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KQWFTSLLALRFTLFKKPEKFFSELDKLNTQEASFSKKAMRVFHHPLFLIGFVNLLKEVL HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HIPTHVPRDLALKKVAIQLLQRIYQDNVSKEKPNSPISFKLESDEQRNQILEIVRGYLLA HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH CKTHGDPAVSRVTEEALKELNLQDVIFSPASKPQNELFDQAVKQIPIFNALKQISKQLEK HCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH DDQLKKESVYYISPNVQEDEGFSDSFPLKKALKNFFETENTPVLYLEGDGGAGKTLTMKV HHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHH LTNELLRNYSSTSYFPFYTYLGSLNNPLEKIIEETFALRGMTPDQVNELKERKVVFICDA HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECC VDEINPLKLPSETKNMNMYEANNFAEKDIAKVIFVSKKGLNDAKRFEPVGKTIQKFILTP CCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC FDEQQIFDYLEKFAQERQKEENNLFLTWTAEKYRETFKKLQDSELWKLITNPFRLHVIVE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH VLPLIVESRSDIKIEEIFRQQTKGEIEQHFFDIFACVQAYRSSLKEKLLPIGPEEFLKYS HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH AQLAAVMQRHEIFSIPLQAIAEQQEDVKDLSNSSISTKEDIALQGIIQKFFKKSHEKFYK HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ECLILKNQGEWAFMHGDYQLYFSQFGNYFGRAKRFDEIYNKYNLTKWIRRDNDRS HHHEEECCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA