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The map label for this gene is 28377465

Identifier: 28377465

GI number: 28377465

Start: 556941

End: 558182

Strand: Direct

Name: 28377465

Synonym: lp_0584

Alternate gene names: NA

Gene position: 556941-558182 (Clockwise)

Preceding gene: 28377464

Following gene: 28377466

Centisome position: 16.83

GC content: 35.67

Gene sequence:

>1242_bases
ATGCAAGAATATATGTGTAACCGTGGTTATCAGACATTAATTAATGTTGCTGTTTTAAGTGGGATAGGAGACGGACTATA
TAATATTGTTTTTGTTATATATGCAGGCTCATTATCATTTAGTACGTTAGCTGTATCATTGGCATCTATGGCAACATTGG
TACCATCATTACTATCTATGCTTACAGGGTACTTTGCTGATCAGTCTAGACATAAAGTCAGAGCGATACTCGTTACGAGA
AACTTACAATTTGTTCTGTTCTTAATTTTGGCTTTTTTAATTACTTTACCGAGAAATATTTGGCTGTTTTTTTTGCTATT
ATCAATTAATATTGTTTCAGACACGCTTGGAACATATGGTAATGGCCTAGCGCTGCCGTTATTACGTCATCTTTTGCCTG
AAAACAAGCTTAAGCAGTCAATGGGATTTATGGTGGCAATGACATTAATGGCACAAGTCGTTTTCCAAGGGATTGGGTCT
GTAATAATTGTTATGTTGCATCATAATTATATGGTTGTCGGATTGATTAATGCACTAACCTTCCTGTTATCCGCATTACT
TGTTAAGTATCGTTTTGGAGTACTGTGTGTGGCAGAACCGCAAATGGTAGAGCGGAAGCAGGTTTCTATGATAAGGAGTC
TAGGACTGACCTTACGGTATCTGTATCGTAATAATTTTTTGTTCAGTGTGATCATTTTGACTTTTTTCATTAATGTATTT
GGAGCTTCAATGTCTGGATTAATTAATGTAACCTTATTATCGGTTAAAACAATGTGGCTGGTTAATTACGGAATCAGTGT
TGCTATTATGAATATGATGATTTCAATTGGGATGATAACTGGCTCTCTTGTTACAAACGGAATAGTTAGGAAACTTCCGT
TGATGTATTTATTTGCGATAAGCTTATCATTTTCAGGGTTGTGTGGCATCAGTTTTATTTGGCACGAATCGGCGTATTTA
AGTATTGTATTACTTTTCGTAATGGGATACTTCATCGGTAAAATAAATCCTCGAATCAGTGCGATAGTGTTGCAATCAAT
TCCTGAGAAAAGATTGGCCGCTGTTGATGGACTATTGAATATGGTCAGTATGCTCGGAGCACCGGTGGGACAACTTCTTT
TTTTAGGAATTGCAAATGTAGTTGGCATTGCATATAGTTGGTTTGCCTTTTCAATAGGTTGCTTTTTCTTGATTGTCATA
ATTGTACTTAAATTCATTAAAATGGATGAACCAATGTTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGGCAGGTACTTTTCTAGCTCTTTATGTTTTGAGATGCTGATATGTCAATGATTTTAGGGAAAACTGTCTAAACTAGATG
GTAAAGAAGATGAATTAGTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAAAACTGAATATGGATTTAATACACTATGTGATAAAATATAGAGTATTAAAGTGTATTAATACAGTTGTTTGTCAGAA
AAAGGAGTGGCGAAGTTGAC

Product: transport protein (putative)

Products: NA

Alternate protein names: Lantibiotic Efflux Protein; Facilitator Superfamily Protein; Permease; Facilitator Permease; Integral Membrane Protein; Efflux Protein; Facilitator Superfamily Transporter Permease; Transportation Permease UpsA; Facilitator Superfamily Transporter

Number of amino acids: Translated: 413; Mature: 413

Protein sequence:

>413_residues
MQEYMCNRGYQTLINVAVLSGIGDGLYNIVFVIYAGSLSFSTLAVSLASMATLVPSLLSMLTGYFADQSRHKVRAILVTR
NLQFVLFLILAFLITLPRNIWLFFLLLSINIVSDTLGTYGNGLALPLLRHLLPENKLKQSMGFMVAMTLMAQVVFQGIGS
VIIVMLHHNYMVVGLINALTFLLSALLVKYRFGVLCVAEPQMVERKQVSMIRSLGLTLRYLYRNNFLFSVIILTFFINVF
GASMSGLINVTLLSVKTMWLVNYGISVAIMNMMISIGMITGSLVTNGIVRKLPLMYLFAISLSFSGLCGISFIWHESAYL
SIVLLFVMGYFIGKINPRISAIVLQSIPEKRLAAVDGLLNMVSMLGAPVGQLLFLGIANVVGIAYSWFAFSIGCFFLIVI
IVLKFIKMDEPMF

Sequences:

>Translated_413_residues
MQEYMCNRGYQTLINVAVLSGIGDGLYNIVFVIYAGSLSFSTLAVSLASMATLVPSLLSMLTGYFADQSRHKVRAILVTR
NLQFVLFLILAFLITLPRNIWLFFLLLSINIVSDTLGTYGNGLALPLLRHLLPENKLKQSMGFMVAMTLMAQVVFQGIGS
VIIVMLHHNYMVVGLINALTFLLSALLVKYRFGVLCVAEPQMVERKQVSMIRSLGLTLRYLYRNNFLFSVIILTFFINVF
GASMSGLINVTLLSVKTMWLVNYGISVAIMNMMISIGMITGSLVTNGIVRKLPLMYLFAISLSFSGLCGISFIWHESAYL
SIVLLFVMGYFIGKINPRISAIVLQSIPEKRLAAVDGLLNMVSMLGAPVGQLLFLGIANVVGIAYSWFAFSIGCFFLIVI
IVLKFIKMDEPMF
>Mature_413_residues
MQEYMCNRGYQTLINVAVLSGIGDGLYNIVFVIYAGSLSFSTLAVSLASMATLVPSLLSMLTGYFADQSRHKVRAILVTR
NLQFVLFLILAFLITLPRNIWLFFLLLSINIVSDTLGTYGNGLALPLLRHLLPENKLKQSMGFMVAMTLMAQVVFQGIGS
VIIVMLHHNYMVVGLINALTFLLSALLVKYRFGVLCVAEPQMVERKQVSMIRSLGLTLRYLYRNNFLFSVIILTFFINVF
GASMSGLINVTLLSVKTMWLVNYGISVAIMNMMISIGMITGSLVTNGIVRKLPLMYLFAISLSFSGLCGISFIWHESAYL
SIVLLFVMGYFIGKINPRISAIVLQSIPEKRLAAVDGLLNMVSMLGAPVGQLLFLGIANVVGIAYSWFAFSIGCFFLIVI
IVLKFIKMDEPMF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45775; Mature: 45775

Theoretical pI: Translated: 10.00; Mature: 10.00

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
5.8 %Met     (Translated Protein)
6.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
5.8 %Met     (Mature Protein)
6.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQEYMCNRGYQTLINVAVLSGIGDGLYNIVFVIYAGSLSFSTLAVSLASMATLVPSLLSM
CCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTGYFADQSRHKVRAILVTRNLQFVLFLILAFLITLPRNIWLFFLLLSINIVSDTLGTYG
HHHHHCCCCCHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NGLALPLLRHLLPENKLKQSMGFMVAMTLMAQVVFQGIGSVIIVMLHHNYMVVGLINALT
CCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
FLLSALLVKYRFGVLCVAEPQMVERKQVSMIRSLGLTLRYLYRNNFLFSVIILTFFINVF
HHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
GASMSGLINVTLLSVKTMWLVNYGISVAIMNMMISIGMITGSLVTNGIVRKLPLMYLFAI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLSFSGLCGISFIWHESAYLSIVLLFVMGYFIGKINPRISAIVLQSIPEKRLAAVDGLLN
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
MVSMLGAPVGQLLFLGIANVVGIAYSWFAFSIGCFFLIVIIVLKFIKMDEPMF
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MQEYMCNRGYQTLINVAVLSGIGDGLYNIVFVIYAGSLSFSTLAVSLASMATLVPSLLSM
CCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTGYFADQSRHKVRAILVTRNLQFVLFLILAFLITLPRNIWLFFLLLSINIVSDTLGTYG
HHHHHCCCCCHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NGLALPLLRHLLPENKLKQSMGFMVAMTLMAQVVFQGIGSVIIVMLHHNYMVVGLINALT
CCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
FLLSALLVKYRFGVLCVAEPQMVERKQVSMIRSLGLTLRYLYRNNFLFSVIILTFFINVF
HHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
GASMSGLINVTLLSVKTMWLVNYGISVAIMNMMISIGMITGSLVTNGIVRKLPLMYLFAI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLSFSGLCGISFIWHESAYLSIVLLFVMGYFIGKINPRISAIVLQSIPEKRLAAVDGLLN
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
MVSMLGAPVGQLLFLGIANVVGIAYSWFAFSIGCFFLIVIIVLKFIKMDEPMF
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA