| Definition | Oceanobacillus iheyensis HTE831, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004193 |
| Length | 3,630,528 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is ktrD [H]
Identifier: 23098843
GI number: 23098843
Start: 1433031
End: 1434398
Strand: Direct
Name: ktrD [H]
Synonym: OB1388
Alternate gene names: 23098843
Gene position: 1433031-1434398 (Clockwise)
Preceding gene: 23098842
Following gene: 23098847
Centisome position: 39.47
GC content: 32.89
Gene sequence:
>1368_bases ATGTCAAAGAATAAATATCAACGTAATGTACTGAATCAATTATCGCCAGTACAATTATTATTACTGTTTTATGGGATCGC AGTCGTTTTTTCTACGGTACTTTTATCCCTGCCAGTTGCTCATAAACCGGATGTGAATATACCGTTTATCGATATCATGT TTACGGCGGTTAGTGCAATTAGTGTGACAGGGTTAAGTACAATAACCATAGTAGATAGCTTTAGTACTATCGGAATTGTT TTTTTGGCAATTATCATGCAGCTCGGTGCGGTAGGAATCATGGCAATCGGAACATTGATATGGTTAATTTTAGGGAAAAG AATCGGTTTCAAAGAACGCAGTATGATAATGACAGACCAAAACCAAACTCATTTTGATGGTATGGTCAGGCTAATTAAAG GAATCATTTATGTGTTATTGATTATTGAATTAATCGGTTTTTTAATACTAGGAACATATTATTTGCAATATTTTCCTACT GCTAGAGAAGCATACATACAAGGCTTTTTTGGTACGATTAGTGCTATTTCTAACGGAGGTTTTGATATAACTGGACAATC GTTGGTTCTTTTTAAAGACGATTATTTTGTTCAATTTATCCAAATCTTATTAATAATATTTGGAGCAATTGGTTTCCCAG TACTAATTGAATTAAAAGAGTATTTATTCCGTAAGAGAACGGAGAGAAATTTATTTCACTTTAGTTTATTTACAAAGGTT ACTACAGTTACTTTTTTTGTACTAATTGTAATCGGTGCTCTAGGAATTTATCTTTTAGATATGAACGCATTTTTTAAGGG ATTAACGTGGCATGAGAGTTTATTTTATGCTTTATTCCAATCCGTGACAACTAGAAGTGGTGGATTATCCACAATGGATG TTAGCTTACTTACAGAAACAAATCAATTGTTTATGTCTGGGTTAATGTTTATTGGAGCCTCACCGAGCAGTGCCGGAGGT GGGATACGTACGACGACTTTTGCATTAGCTATTATCTTCGTCTTTACATATATTAGAGGGGGGAATAGTGTACGCATTTT TAATCGAGAAGTATACAACGACGATCTAATAAAAGCAGTTTCTATCACTTTATTTGCGATTACATTGGTTATTTTTTCAA CATTGGTTTTGACTGCGTTAGAGCCATTATTTACATTAGAAGAAATTTTGTTTGAGGTAACATCTGCTTTTGGAACAGTT GGGTTATCGTTGGGTATCACAAGTGAATTATCAAATATAAGTAAAATATTAATCATGTTATTAATGTTTATAGGACGGAT TGGAATTGTTACATTTTTACTTATATTTAAGCGGAAAAAGAAGAAAGCGAAGTATCATTATCCGAAAGAAAGAATTATTA TTGGCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTAACAACATTAGTTAAAGAAGGTTATGAGGGCAATGAGCTTATCCATAAATTCAAAAATAGTTTCTAATAATCATATT GCTTATATAGGAGAAAATAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GTTATAACGCTTTATACTGACGTGGAAAGAAAAATCATTGCCTTTATCTTCAATAAAAACAAAATGGCTTGTGCATTTTG TTCAGCACAAGCCATTCTTT
Product: Na(+)-transporting ATP synthase
Products: Proton [Cytoplasm]; K (I) [Cytoplasm] [C]
Alternate protein names: K(+)-uptake protein ktrD [H]
Number of amino acids: Translated: 455; Mature: 454
Protein sequence:
>455_residues MSKNKYQRNVLNQLSPVQLLLLFYGIAVVFSTVLLSLPVAHKPDVNIPFIDIMFTAVSAISVTGLSTITIVDSFSTIGIV FLAIIMQLGAVGIMAIGTLIWLILGKRIGFKERSMIMTDQNQTHFDGMVRLIKGIIYVLLIIELIGFLILGTYYLQYFPT AREAYIQGFFGTISAISNGGFDITGQSLVLFKDDYFVQFIQILLIIFGAIGFPVLIELKEYLFRKRTERNLFHFSLFTKV TTVTFFVLIVIGALGIYLLDMNAFFKGLTWHESLFYALFQSVTTRSGGLSTMDVSLLTETNQLFMSGLMFIGASPSSAGG GIRTTTFALAIIFVFTYIRGGNSVRIFNREVYNDDLIKAVSITLFAITLVIFSTLVLTALEPLFTLEEILFEVTSAFGTV GLSLGITSELSNISKILIMLLMFIGRIGIVTFLLIFKRKKKKAKYHYPKERIIIG
Sequences:
>Translated_455_residues MSKNKYQRNVLNQLSPVQLLLLFYGIAVVFSTVLLSLPVAHKPDVNIPFIDIMFTAVSAISVTGLSTITIVDSFSTIGIV FLAIIMQLGAVGIMAIGTLIWLILGKRIGFKERSMIMTDQNQTHFDGMVRLIKGIIYVLLIIELIGFLILGTYYLQYFPT AREAYIQGFFGTISAISNGGFDITGQSLVLFKDDYFVQFIQILLIIFGAIGFPVLIELKEYLFRKRTERNLFHFSLFTKV TTVTFFVLIVIGALGIYLLDMNAFFKGLTWHESLFYALFQSVTTRSGGLSTMDVSLLTETNQLFMSGLMFIGASPSSAGG GIRTTTFALAIIFVFTYIRGGNSVRIFNREVYNDDLIKAVSITLFAITLVIFSTLVLTALEPLFTLEEILFEVTSAFGTV GLSLGITSELSNISKILIMLLMFIGRIGIVTFLLIFKRKKKKAKYHYPKERIIIG >Mature_454_residues SKNKYQRNVLNQLSPVQLLLLFYGIAVVFSTVLLSLPVAHKPDVNIPFIDIMFTAVSAISVTGLSTITIVDSFSTIGIVF LAIIMQLGAVGIMAIGTLIWLILGKRIGFKERSMIMTDQNQTHFDGMVRLIKGIIYVLLIIELIGFLILGTYYLQYFPTA REAYIQGFFGTISAISNGGFDITGQSLVLFKDDYFVQFIQILLIIFGAIGFPVLIELKEYLFRKRTERNLFHFSLFTKVT TVTFFVLIVIGALGIYLLDMNAFFKGLTWHESLFYALFQSVTTRSGGLSTMDVSLLTETNQLFMSGLMFIGASPSSAGGG IRTTTFALAIIFVFTYIRGGNSVRIFNREVYNDDLIKAVSITLFAITLVIFSTLVLTALEPLFTLEEILFEVTSAFGTVG LSLGITSELSNISKILIMLLMFIGRIGIVTFLLIFKRKKKKAKYHYPKERIIIG
Specific function: Integral membrane subunit of the KtrCD potassium uptake transporter. The 2 major potassium transporter complexes KtrAB and KtrCD confer resistance to both suddenly imposed and prolonged osmotic stress [H]
COG id: COG0168
COG function: function code P; Trk-type K+ transport systems, membrane components
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the trkH potassium transport family. Ktr (TC 2.A.38.4) subfamily [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003445 [H]
Pfam domain/function: PF02386 TrkH [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 50752; Mature: 50621
Theoretical pI: Translated: 9.90; Mature: 9.90
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.9 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSKNKYQRNVLNQLSPVQLLLLFYGIAVVFSTVLLSLPVAHKPDVNIPFIDIMFTAVSAI CCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH SVTGLSTITIVDSFSTIGIVFLAIIMQLGAVGIMAIGTLIWLILGKRIGFKERSMIMTDQ HHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECC NQTHFDGMVRLIKGIIYVLLIIELIGFLILGTYYLQYFPTAREAYIQGFFGTISAISNGG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC FDITGQSLVLFKDDYFVQFIQILLIIFGAIGFPVLIELKEYLFRKRTERNLFHFSLFTKV CEECCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH TTVTFFVLIVIGALGIYLLDMNAFFKGLTWHESLFYALFQSVTTRSGGLSTMDVSLLTET HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHH NQLFMSGLMFIGASPSSAGGGIRTTTFALAIIFVFTYIRGGNSVRIFNREVYNDDLIKAV HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHCCHHHHHHH SITLFAITLVIFSTLVLTALEPLFTLEEILFEVTSAFGTVGLSLGITSELSNISKILIML HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH LMFIGRIGIVTFLLIFKRKKKKAKYHYPKERIIIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECC >Mature Secondary Structure SKNKYQRNVLNQLSPVQLLLLFYGIAVVFSTVLLSLPVAHKPDVNIPFIDIMFTAVSAI CCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH SVTGLSTITIVDSFSTIGIVFLAIIMQLGAVGIMAIGTLIWLILGKRIGFKERSMIMTDQ HHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECC NQTHFDGMVRLIKGIIYVLLIIELIGFLILGTYYLQYFPTAREAYIQGFFGTISAISNGG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC FDITGQSLVLFKDDYFVQFIQILLIIFGAIGFPVLIELKEYLFRKRTERNLFHFSLFTKV CEECCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH TTVTFFVLIVIGALGIYLLDMNAFFKGLTWHESLFYALFQSVTTRSGGLSTMDVSLLTET HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHH NQLFMSGLMFIGASPSSAGGGIRTTTFALAIIFVFTYIRGGNSVRIFNREVYNDDLIKAV HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHCCHHHHHHH SITLFAITLVIFSTLVLTALEPLFTLEEILFEVTSAFGTVGLSLGITSELSNISKILIML HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH LMFIGRIGIVTFLLIFKRKKKKAKYHYPKERIIIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: Proton [Periplasm]; K (I) [Periplasm] [C]
Specific reaction: Proton [Periplasm] + K (I) [Periplasm] = Proton [Cytoplasm] + K (I) [Cytoplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9384377 [H]