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The map label for this gene is yjbG [H]

Identifier: 23098671

GI number: 23098671

Start: 1265476

End: 1267284

Strand: Direct

Name: yjbG [H]

Synonym: OB1216

Alternate gene names: 23098671

Gene position: 1265476-1267284 (Clockwise)

Preceding gene: 23098670

Following gene: 23098675

Centisome position: 34.86

GC content: 34.66

Gene sequence:

>1809_bases
ATGAGTAAAGCGACAAAACAATTACCTAAAAGAGATGAAATACCTACAGACCTTACTTGGAAATTGGAGGATATTTTTGC
TAGTGATGACGCTTGGAAAGAAGAACTTAAATCATTAAGAGAAGAATTTCCTAAGATAACTGAATTTAAAGGGAAATTAC
ATGAGTCTGCCGATACCTTGTATTCTTTATTTAAAATGCAAGATGAGCTTTCTCAGCGTCTTGGCATGTTATATACGTAT
GCACATATGCGTTATGATCAAGATACGACAAACTCTTTTTACCAGGGATTAAATGCACAAGCTGAGAACTTAATAACTAT
TGCCTCCAGTAATCTAAGTTATATTGTTCCCGAAATTCTTTCCATTGAAGAAAATAAGTTACAACAGTTTTTAGATGATC
ATGAGGGTTTGCAACAATATAAGAAAGTTCTTGAAGACATTAATAGACAGCGTCCACATGTTTTAAGTGAAAAAGAAGAG
GCGTTACTAGCACAAGCATCTGAGCCAATGTCTACAGGATCACAAACTTTTGGAATGCTTAATAACGCAGATCTAACATT
CCCATCAGTTACAAATGAAGATGGCGAAGAGGTAGAAGTAACGCATGGAAGATATTCTACATTTTTAGAATCAAAAGATA
GAAACGTTAGAAAAAATGCGTTTGAAGCTGTATACCAAACATACGAAAGCTTTAAAAATACATTTGCTTCAACTTTAAGT
GGCACTGTTAAAGCGCACAACTTTAGCGCAAAAGTACGCAATTATGAAAGTGCTAGACAATCTGCTTTGGATGATAATAA
TATTCCGGAAGAAGTGTACGATAATTTAGTAGAAGCAGTAAATGAACGATTACCATTACTTCATCGTTATACTAAGTTGC
GAAAAAAAGTATTGGAATTAGATGAGTTGCATATGTATGATCTTTATACGCCACTAGTAAAAGATGTAAAAATGAAAGTA
TCATATGACCAAGCGCAAGATTTTGTATTAAAAGGTTTAGAGCCACTTGGTGATGATTATAAAAAAGTATTAAAATCAGC
CTTCGAAAATCGCTGGATAGATGTTGAAGAAAATAAAGGGAAGAGAAGTGGTGCTTATTCTTCCGGTGCTTATGGGACAA
ATCCTTATATCTTGATGAATTGGCAGGATGATATTAATAATACATTCACACTCGCTCATGAATTGGGTCATTCTGTGCAT
AGTTATTACTCAAGAAAGCATCAACCATTTCGTTATGGTAATTATTCGATCTTCGTGGCAGAAGTTGCTTCTACAACAAA
CGAAGCGTTGTTAAATGATTATTTATTAAATCATTTAGAAGACGAAAAAGAAAAGCTATATATCCTTAACCATTTCTTAG
AAGGATTCAGAGGTACCGTGTTCCGTCAAACAATGTTTGCTGAATTTGAACATGAGATTCATAAACTGGATCAAGAAGGC
GAAGCGTTAACGGCTGAAAAGTTCACTCAGATCTATTATGAGTTAAATAAGAAATATTTTGGTGAAGATGTAGTCTCCGA
TGAATATATCGGATTAGAGTGGGCTAGAATCCCTCACTTCTATTACAATTATTATGTGTATCAGTATGCGACAGGTTACT
CTGCTGCTACTGCTCTAGCACACAATATATTAGAAGGAAAAGAAGGGGCAGTTGATCGTTACCTGCAATTCTTACAATCA
GGTAGTAGTGAAGATCCGATTGATGTACTGAAAAAAGCTGGTGTTGATATGACGTCTAAACAACCAATATTAGATGCTTT
AGATGTCTTTGAAGAGAAACTAGCTGAGATGGAACAATTATTAGGCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTATTTTTGGAAAAAAAGGGCAAAATGTGAGCATGATTGTACATTATTTCGTTATACTAAGTAATATACTATGTTGAGA
GAAGATAAGGAGGAGTACAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAAAAAAGTTCGAGTGTATAGACTCGAACTTTTTTATGTTTCTGTCAGTTACATGTGTGATATAGCAAAAGATATCCCT
TTGTGTTCTCAGATCTCCTG

Product: thimet oligopeptidase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 602; Mature: 601

Protein sequence:

>602_residues
MSKATKQLPKRDEIPTDLTWKLEDIFASDDAWKEELKSLREEFPKITEFKGKLHESADTLYSLFKMQDELSQRLGMLYTY
AHMRYDQDTTNSFYQGLNAQAENLITIASSNLSYIVPEILSIEENKLQQFLDDHEGLQQYKKVLEDINRQRPHVLSEKEE
ALLAQASEPMSTGSQTFGMLNNADLTFPSVTNEDGEEVEVTHGRYSTFLESKDRNVRKNAFEAVYQTYESFKNTFASTLS
GTVKAHNFSAKVRNYESARQSALDDNNIPEEVYDNLVEAVNERLPLLHRYTKLRKKVLELDELHMYDLYTPLVKDVKMKV
SYDQAQDFVLKGLEPLGDDYKKVLKSAFENRWIDVEENKGKRSGAYSSGAYGTNPYILMNWQDDINNTFTLAHELGHSVH
SYYSRKHQPFRYGNYSIFVAEVASTTNEALLNDYLLNHLEDEKEKLYILNHFLEGFRGTVFRQTMFAEFEHEIHKLDQEG
EALTAEKFTQIYYELNKKYFGEDVVSDEYIGLEWARIPHFYYNYYVYQYATGYSAATALAHNILEGKEGAVDRYLQFLQS
GSSEDPIDVLKKAGVDMTSKQPILDALDVFEEKLAEMEQLLG

Sequences:

>Translated_602_residues
MSKATKQLPKRDEIPTDLTWKLEDIFASDDAWKEELKSLREEFPKITEFKGKLHESADTLYSLFKMQDELSQRLGMLYTY
AHMRYDQDTTNSFYQGLNAQAENLITIASSNLSYIVPEILSIEENKLQQFLDDHEGLQQYKKVLEDINRQRPHVLSEKEE
ALLAQASEPMSTGSQTFGMLNNADLTFPSVTNEDGEEVEVTHGRYSTFLESKDRNVRKNAFEAVYQTYESFKNTFASTLS
GTVKAHNFSAKVRNYESARQSALDDNNIPEEVYDNLVEAVNERLPLLHRYTKLRKKVLELDELHMYDLYTPLVKDVKMKV
SYDQAQDFVLKGLEPLGDDYKKVLKSAFENRWIDVEENKGKRSGAYSSGAYGTNPYILMNWQDDINNTFTLAHELGHSVH
SYYSRKHQPFRYGNYSIFVAEVASTTNEALLNDYLLNHLEDEKEKLYILNHFLEGFRGTVFRQTMFAEFEHEIHKLDQEG
EALTAEKFTQIYYELNKKYFGEDVVSDEYIGLEWARIPHFYYNYYVYQYATGYSAATALAHNILEGKEGAVDRYLQFLQS
GSSEDPIDVLKKAGVDMTSKQPILDALDVFEEKLAEMEQLLG
>Mature_601_residues
SKATKQLPKRDEIPTDLTWKLEDIFASDDAWKEELKSLREEFPKITEFKGKLHESADTLYSLFKMQDELSQRLGMLYTYA
HMRYDQDTTNSFYQGLNAQAENLITIASSNLSYIVPEILSIEENKLQQFLDDHEGLQQYKKVLEDINRQRPHVLSEKEEA
LLAQASEPMSTGSQTFGMLNNADLTFPSVTNEDGEEVEVTHGRYSTFLESKDRNVRKNAFEAVYQTYESFKNTFASTLSG
TVKAHNFSAKVRNYESARQSALDDNNIPEEVYDNLVEAVNERLPLLHRYTKLRKKVLELDELHMYDLYTPLVKDVKMKVS
YDQAQDFVLKGLEPLGDDYKKVLKSAFENRWIDVEENKGKRSGAYSSGAYGTNPYILMNWQDDINNTFTLAHELGHSVHS
YYSRKHQPFRYGNYSIFVAEVASTTNEALLNDYLLNHLEDEKEKLYILNHFLEGFRGTVFRQTMFAEFEHEIHKLDQEGE
ALTAEKFTQIYYELNKKYFGEDVVSDEYIGLEWARIPHFYYNYYVYQYATGYSAATALAHNILEGKEGAVDRYLQFLQSG
SSEDPIDVLKKAGVDMTSKQPILDALDVFEEKLAEMEQLLG

Specific function: Unknown

COG id: COG1164

COG function: function code E; Oligoendopeptidase F

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M3B family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001567
- InterPro:   IPR004438
- InterPro:   IPR013647 [H]

Pfam domain/function: PF01432 Peptidase_M3; PF08439 Peptidase_M3_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69653; Mature: 69522

Theoretical pI: Translated: 4.71; Mature: 4.71

Prosite motif: PS00142 ZINC_PROTEASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSKATKQLPKRDEIPTDLTWKLEDIFASDDAWKEELKSLREEFPKITEFKGKLHESADTL
CCCHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
YSLFKMQDELSQRLGMLYTYAHMRYDQDTTNSFYQGLNAQAENLITIASSNLSYIVPEIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHH
SIEENKLQQFLDDHEGLQQYKKVLEDINRQRPHVLSEKEEALLAQASEPMSTGSQTFGML
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCC
NNADLTFPSVTNEDGEEVEVTHGRYSTFLESKDRNVRKNAFEAVYQTYESFKNTFASTLS
CCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GTVKAHNFSAKVRNYESARQSALDDNNIPEEVYDNLVEAVNERLPLLHRYTKLRKKVLEL
CCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DELHMYDLYTPLVKDVKMKVSYDQAQDFVLKGLEPLGDDYKKVLKSAFENRWIDVEENKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
KRSGAYSSGAYGTNPYILMNWQDDINNTFTLAHELGHSVHSYYSRKHQPFRYGNYSIFVA
CCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCEEEEEE
EVASTTNEALLNDYLLNHLEDEKEKLYILNHFLEGFRGTVFRQTMFAEFEHEIHKLDQEG
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
EALTAEKFTQIYYELNKKYFGEDVVSDEYIGLEWARIPHFYYNYYVYQYATGYSAATALA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCHHHCCHHHHHEEEEEEECCHHHHHHHH
HNILEGKEGAVDRYLQFLQSGSSEDPIDVLKKAGVDMTSKQPILDALDVFEEKLAEMEQL
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LG
CC
>Mature Secondary Structure 
SKATKQLPKRDEIPTDLTWKLEDIFASDDAWKEELKSLREEFPKITEFKGKLHESADTL
CCHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
YSLFKMQDELSQRLGMLYTYAHMRYDQDTTNSFYQGLNAQAENLITIASSNLSYIVPEIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHH
SIEENKLQQFLDDHEGLQQYKKVLEDINRQRPHVLSEKEEALLAQASEPMSTGSQTFGML
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCC
NNADLTFPSVTNEDGEEVEVTHGRYSTFLESKDRNVRKNAFEAVYQTYESFKNTFASTLS
CCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GTVKAHNFSAKVRNYESARQSALDDNNIPEEVYDNLVEAVNERLPLLHRYTKLRKKVLEL
CCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DELHMYDLYTPLVKDVKMKVSYDQAQDFVLKGLEPLGDDYKKVLKSAFENRWIDVEENKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
KRSGAYSSGAYGTNPYILMNWQDDINNTFTLAHELGHSVHSYYSRKHQPFRYGNYSIFVA
CCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCEEEEEE
EVASTTNEALLNDYLLNHLEDEKEKLYILNHFLEGFRGTVFRQTMFAEFEHEIHKLDQEG
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
EALTAEKFTQIYYELNKKYFGEDVVSDEYIGLEWARIPHFYYNYYVYQYATGYSAATALA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCHHHCCHHHHHEEEEEEECCHHHHHHHH
HNILEGKEGAVDRYLQFLQSGSSEDPIDVLKKAGVDMTSKQPILDALDVFEEKLAEMEQL
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LG
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]