Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 23097802

Identifier: 23097802

GI number: 23097802

Start: 365843

End: 367906

Strand: Direct

Name: 23097802

Synonym: OB0347

Alternate gene names: NA

Gene position: 365843-367906 (Clockwise)

Preceding gene: 23097800

Following gene: 23097803

Centisome position: 10.08

GC content: 36.53

Gene sequence:

>2064_bases
TTGTCAAATATAATTATTCGATTTAAGAAATCTGTGGTCATTCTATTCTTCGTATTAATGATTATCTCGGCATTTGCTTT
CTTATTCGTAGATGTAAATTATAATATGCAAGATTATTTACCGGAGGATGCTGAATCAACAGTCGGGTTAGATGTAATGG
ATGAAGAGTTTTCCAGCGGAGTATCCAATACGAATGTAATGATCGAGGATGTCACGATTCAAGAAGCGATGGAGTATAAG
CAAGAGATAGAGTCAATGGACGGTGTCACCGAGGTGTTATGGCTAGATGATGCTATAGACCTTCGTGAGCCAATAGAGGT
GGCTGATACTGATACAGTAGAGAATTATTATAAGGATAATAAAGCACTTTTGTCGGTTACGATAGAAAGTGGTGAAGAAG
TAGCAGCTACTGATCAAATTTACGAACTAATCGGTGAAGAGAATGCCATTTCTGGTGAAGCAGCTAATACAGCGACCCAA
CAGAAAATGGCTGGTAGTGAAACAATGTATGCTGCAGCTTTACTAATTCCGATTATTATAATCATACTTGTTCTATCGAC
GAATTCATGGTTAGAACCGGTATTTTTCCTGACGGCGATTGGTGTATCTGTATTAATAAATCTAGGTACAAATATCTTTG
TAGGTGAGGTTTCCTTTATCACCCAATCGGTAGCACCAATCTTACAACTAGCAGTTTCGCTGGATTATGCCATATTCCTA
TTACATAGTTTCCAGGATTATCGTAATAGGGGGAATAAACCAGAAGAAGCTATGAAACTGGCAATGAAAGAATCATTCCC
GGTTGTTAGTGCTAGTGCCTTAACTACATTCTTTGGATTTACAGCACTTATGTTTATGGACTTTGGAATCGGTGCTGACT
TAGGATTAAGCCTTGTTAAAGGGATTTTATTGAGTTTCATTAGTGTTATGATATTCCTGCCAGCATTAACATTATTACTT
TATCCTTGGATTGACAAAACACAGCACAAGTCACTTATTCCAAGTTTTAAAGGTGTAGGAAAGAAATTAATCAAGTTACG
AATTCCAGTTCTTATTCTTATAGCACTGGTAATTGTTCCGAGTTTTCTTGCGCAAAGCAGTACGGAGTTCACTTACGGTA
TGGGCGATCAGCCAGAAAATACTCGTTTAGGTTCCGATATAAATCAGATTCAAGAGACTTTTGGAGAATCAACCTCTGTT
GTGTTATTAGTGCCTAATAACGATATCGGAAAAGAACAAGAAATGATTCAAGATATAGATACAATCGATCATGTAACTTC
CGTTGTAGGTTACGCTAATATGGTTGGAAGTACAATCCCGCAAGATTATTTAGAAGAAAATGTCACCGAACAATTTCTTT
CGGAAAACTACAGCAGAATTATTATTAATACGGATGTTGGTGCAGAAGGAGATGTACCATTTAAGTTAGTAGAAGAAGTT
CGCAGTGTGGCTACTTCTTATTATGGAAATGAAGCATTAACGCTTGGAGAAAGTGTTGCGCTTTATGATATGAAAGAAAC
TGTCACCGCGGATAATAAATTAGTAAACATCCTTACTATTGTAACTATAGCTATCGTATTGTTATTCACATTCCGATCGA
TATCTATACCGGTTGTATTATTGGTGACGATACAATCAGCTGTATGGATTAACTTATCCGTACCATATTTCACAGATACA
TCCCTTGTATTTGTAGGGTATTTAATTGTGAGTACAGTACAATTAGCTGCAACGGTAGATTATGCAATTCTTTTAACCGA
GACGTATAAACAAAATCGCAAAGATATGGCCGCCTTACCTGCCATTAAAAAGACGATTGATGATAAATTGTTCTCGATAG
CAGTATCTGCATCGATACTATCTAGTGTTGGATTTATATTATGGCTAACATCTTCAAATCCGATTGTAGGATCGATTGGT
CTATTATTAGGTAGAGGGGCGTTATTAGCCTTTATTCTAGTAATTACGTTATTGCCAGCATTGCTTGTTATTGGTGATAA
ATTGATTTGGAAGACTACTCTCGGTACGAAAGTTTATAAGGAGGAAAAGCATGAAGATAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGTAACATAAATTATACAACTGTTTGTTGTGTAACTAACATGATGTATTTATAATGTTAATGTAAAATCATTAAATCAT
CAAGATGTGGGGAAATTACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGGTTATGGCTTACTCTAGCAATCTTTTTCTTTCCTGTATTAATTACAAATGCAGAAGCGAATACTTCTGATTCTAATG
ATATCGATAGTGAAAATACA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: RND Family Transporter; Antibiotic ABC Transporter Permease Protein; Exporter Of RND Superfamily Protein-Like Protein; Antibiotic ABC Transporter Permease; MMPL Domain Protein; RND Superfamily Drug Efflux Protein; Antibiotic Export Protein; Mmpl Family; MMPL Domain-Containing Protein

Number of amino acids: Translated: 687; Mature: 686

Protein sequence:

>687_residues
MSNIIIRFKKSVVILFFVLMIISAFAFLFVDVNYNMQDYLPEDAESTVGLDVMDEEFSSGVSNTNVMIEDVTIQEAMEYK
QEIESMDGVTEVLWLDDAIDLREPIEVADTDTVENYYKDNKALLSVTIESGEEVAATDQIYELIGEENAISGEAANTATQ
QKMAGSETMYAAALLIPIIIIILVLSTNSWLEPVFFLTAIGVSVLINLGTNIFVGEVSFITQSVAPILQLAVSLDYAIFL
LHSFQDYRNRGNKPEEAMKLAMKESFPVVSASALTTFFGFTALMFMDFGIGADLGLSLVKGILLSFISVMIFLPALTLLL
YPWIDKTQHKSLIPSFKGVGKKLIKLRIPVLILIALVIVPSFLAQSSTEFTYGMGDQPENTRLGSDINQIQETFGESTSV
VLLVPNNDIGKEQEMIQDIDTIDHVTSVVGYANMVGSTIPQDYLEENVTEQFLSENYSRIIINTDVGAEGDVPFKLVEEV
RSVATSYYGNEALTLGESVALYDMKETVTADNKLVNILTIVTIAIVLLFTFRSISIPVVLLVTIQSAVWINLSVPYFTDT
SLVFVGYLIVSTVQLAATVDYAILLTETYKQNRKDMAALPAIKKTIDDKLFSIAVSASILSSVGFILWLTSSNPIVGSIG
LLLGRGALLAFILVITLLPALLVIGDKLIWKTTLGTKVYKEEKHEDN

Sequences:

>Translated_687_residues
MSNIIIRFKKSVVILFFVLMIISAFAFLFVDVNYNMQDYLPEDAESTVGLDVMDEEFSSGVSNTNVMIEDVTIQEAMEYK
QEIESMDGVTEVLWLDDAIDLREPIEVADTDTVENYYKDNKALLSVTIESGEEVAATDQIYELIGEENAISGEAANTATQ
QKMAGSETMYAAALLIPIIIIILVLSTNSWLEPVFFLTAIGVSVLINLGTNIFVGEVSFITQSVAPILQLAVSLDYAIFL
LHSFQDYRNRGNKPEEAMKLAMKESFPVVSASALTTFFGFTALMFMDFGIGADLGLSLVKGILLSFISVMIFLPALTLLL
YPWIDKTQHKSLIPSFKGVGKKLIKLRIPVLILIALVIVPSFLAQSSTEFTYGMGDQPENTRLGSDINQIQETFGESTSV
VLLVPNNDIGKEQEMIQDIDTIDHVTSVVGYANMVGSTIPQDYLEENVTEQFLSENYSRIIINTDVGAEGDVPFKLVEEV
RSVATSYYGNEALTLGESVALYDMKETVTADNKLVNILTIVTIAIVLLFTFRSISIPVVLLVTIQSAVWINLSVPYFTDT
SLVFVGYLIVSTVQLAATVDYAILLTETYKQNRKDMAALPAIKKTIDDKLFSIAVSASILSSVGFILWLTSSNPIVGSIG
LLLGRGALLAFILVITLLPALLVIGDKLIWKTTLGTKVYKEEKHEDN
>Mature_686_residues
SNIIIRFKKSVVILFFVLMIISAFAFLFVDVNYNMQDYLPEDAESTVGLDVMDEEFSSGVSNTNVMIEDVTIQEAMEYKQ
EIESMDGVTEVLWLDDAIDLREPIEVADTDTVENYYKDNKALLSVTIESGEEVAATDQIYELIGEENAISGEAANTATQQ
KMAGSETMYAAALLIPIIIIILVLSTNSWLEPVFFLTAIGVSVLINLGTNIFVGEVSFITQSVAPILQLAVSLDYAIFLL
HSFQDYRNRGNKPEEAMKLAMKESFPVVSASALTTFFGFTALMFMDFGIGADLGLSLVKGILLSFISVMIFLPALTLLLY
PWIDKTQHKSLIPSFKGVGKKLIKLRIPVLILIALVIVPSFLAQSSTEFTYGMGDQPENTRLGSDINQIQETFGESTSVV
LLVPNNDIGKEQEMIQDIDTIDHVTSVVGYANMVGSTIPQDYLEENVTEQFLSENYSRIIINTDVGAEGDVPFKLVEEVR
SVATSYYGNEALTLGESVALYDMKETVTADNKLVNILTIVTIAIVLLFTFRSISIPVVLLVTIQSAVWINLSVPYFTDTS
LVFVGYLIVSTVQLAATVDYAILLTETYKQNRKDMAALPAIKKTIDDKLFSIAVSASILSSVGFILWLTSSNPIVGSIGL
LLGRGALLAFILVITLLPALLVIGDKLIWKTTLGTKVYKEEKHEDN

Specific function: Unknown

COG id: COG1033

COG function: function code R; Predicted exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 75552; Mature: 75421

Theoretical pI: Translated: 4.09; Mature: 4.09

Prosite motif: PS50156 SSD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSNIIIRFKKSVVILFFVLMIISAFAFLFVDVNYNMQDYLPEDAESTVGLDVMDEEFSSG
CCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCC
VSNTNVMIEDVTIQEAMEYKQEIESMDGVTEVLWLDDAIDLREPIEVADTDTVENYYKDN
CCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCC
KALLSVTIESGEEVAATDQIYELIGEENAISGEAANTATQQKMAGSETMYAAALLIPIII
CEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
IILVLSTNSWLEPVFFLTAIGVSVLINLGTNIFVGEVSFITQSVAPILQLAVSLDYAIFL
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LHSFQDYRNRGNKPEEAMKLAMKESFPVVSASALTTFFGFTALMFMDFGIGADLGLSLVK
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
GILLSFISVMIFLPALTLLLYPWIDKTQHKSLIPSFKGVGKKLIKLRIPVLILIALVIVP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFLAQSSTEFTYGMGDQPENTRLGSDINQIQETFGESTSVVLLVPNNDIGKEQEMIQDID
HHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHH
TIDHVTSVVGYANMVGSTIPQDYLEENVTEQFLSENYSRIIINTDVGAEGDVPFKLVEEV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHH
RSVATSYYGNEALTLGESVALYDMKETVTADNKLVNILTIVTIAIVLLFTFRSISIPVVL
HHHHHHHCCCCCEECCCCEEEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
LVTIQSAVWINLSVPYFTDTSLVFVGYLIVSTVQLAATVDYAILLTETYKQNRKDMAALP
EEECCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHCCHHHHHHH
AIKKTIDDKLFSIAVSASILSSVGFILWLTSSNPIVGSIGLLLGRGALLAFILVITLLPA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLVIGDKLIWKTTLGTKVYKEEKHEDN
HHHHCCHHHEEEHHCCHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SNIIIRFKKSVVILFFVLMIISAFAFLFVDVNYNMQDYLPEDAESTVGLDVMDEEFSSG
CCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCC
VSNTNVMIEDVTIQEAMEYKQEIESMDGVTEVLWLDDAIDLREPIEVADTDTVENYYKDN
CCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCC
KALLSVTIESGEEVAATDQIYELIGEENAISGEAANTATQQKMAGSETMYAAALLIPIII
CEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
IILVLSTNSWLEPVFFLTAIGVSVLINLGTNIFVGEVSFITQSVAPILQLAVSLDYAIFL
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LHSFQDYRNRGNKPEEAMKLAMKESFPVVSASALTTFFGFTALMFMDFGIGADLGLSLVK
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
GILLSFISVMIFLPALTLLLYPWIDKTQHKSLIPSFKGVGKKLIKLRIPVLILIALVIVP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFLAQSSTEFTYGMGDQPENTRLGSDINQIQETFGESTSVVLLVPNNDIGKEQEMIQDID
HHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHH
TIDHVTSVVGYANMVGSTIPQDYLEENVTEQFLSENYSRIIINTDVGAEGDVPFKLVEEV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHH
RSVATSYYGNEALTLGESVALYDMKETVTADNKLVNILTIVTIAIVLLFTFRSISIPVVL
HHHHHHHCCCCCEECCCCEEEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
LVTIQSAVWINLSVPYFTDTSLVFVGYLIVSTVQLAATVDYAILLTETYKQNRKDMAALP
EEECCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHCCHHHHHHH
AIKKTIDDKLFSIAVSASILSSVGFILWLTSSNPIVGSIGLLLGRGALLAFILVITLLPA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLVIGDKLIWKTTLGTKVYKEEKHEDN
HHHHCCHHHEEEHHCCHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA