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The map label for this gene is 17228885

Identifier: 17228885

GI number: 17228885

Start: 1651529

End: 1654321

Strand: Direct

Name: 17228885

Synonym: alr1390

Alternate gene names: NA

Gene position: 1651529-1654321 (Clockwise)

Preceding gene: 17228881

Following gene: 17228887

Centisome position: 25.75

GC content: 39.99

Gene sequence:

>2793_bases
ATGGACGGTAGGAGGAGTAAACCTGTGAAATCGTTTTGGAATGCAAGTTTTGAGGGAATTTTCTGGCTCTGGAACCTGAC
ATTTTTATCATTAGTTTACTTAGGGATATTACCATTTGTCGGTGTGCCATTAGTTCTGGCAACCGCTAGGGGTGATATAC
CAATTGAATTTTCCTTAGCTTTAGTTACTTTAATTGCCGTTCCCACAATTTCCAGTATTATCGGTGGCTGGTGTTTTCTT
CAACAACCTGTAAAACTAATCCGCCTATTTTATGGTGTAGAAGCCCCACTATTTGTCTTGTGTTTATTGCGCTTGTTTTT
GATTCGAGAACTCACCCCTGCTAGTAGCCAAATTTTACTGACGATGGGTGTTTGTATTGCTGCTTTTGCGGGAGAACTAT
TTTGGGGTTATGCTTCTCGGCGCAAAATTGGTTTGCAATGGGTACAAATGTTAGCCCATACATTAATGCTGGTATTCGGC
ATTTATGCAGGCGCAGTGTTGTTATTTTACGCTTTGCCTTTAGCAGTATTTTTGTTGCAGGAATTGGTGAAATTTGAATG
GGTAATTCCATTATGGAATATCTTATATCACACAGCCTTTGTGGGTGGTTTGTTCATAATTTCTATGTGGTTAATTGTTC
TTGCTTTTAGCGCTACATTATTTATTTTAATGCCATCGGCATTAACAGCAATGTATGTACACTCAGGAGCAAAAATTTTA
AAAGCTTTTGCTTCGGAGCATGGAAATAAAAAGGCATTTGCTGGCGCTAGTGCAGTTATTGTGGCGTTTGCTGTTACTTT
TTTATCCTTGCAACAACAGCCCCAAGTAATGGCTTTTTCACTGTTAGCTAATGCGCCGAAAAATGATAGCGATCGCCAAA
CCCTCATAACTAAATCAGAACAAATCCGCACAGGATTACTTAACGCTTATTTATCTTCTTATCGCTACCTCAGTAGCAGG
GAAGAAAATAATCATATCAGCGCTATGTATCGTCATGTCTTAGGTTTGGAGAAGACGGCGGCTGATGGATTGCAAGAAAC
CTATAATTTTTTGATGTCACCATTTTTATATAATGGTTCCGACAAAGATGTTGCTAAGGCAGAAAAACTCTACGCGGAAT
TTTTTGACACACCTCTACAAAAAGCCGAAAAAACAGCCGTTAGTCATGCAGTACAATCTACTTTTAACGAGCAGGAAGTT
AAAGCAGGTTTATTAAATATCAACGAGAAAAAAGTTTTGTTGGCATCACAACAAGTCACAGTGAAAGAACATGGTGATTG
GGCTGATGTGGAATTGTACGAAGTTTATAAAAACCAAACACCAGAAGTTCAGGAAGTTTTCTACTCCTTCTCTTTGCCAG
AAAGTGCTGTAATTACCGGCTTATGGTTGGGAGATACCAATAAATTAGACCAACGCTTTAATTTTGTCGTCTCTCCTCGT
GGTGCTGCCCAAAAAGTTTATAATTCTCAAGTTAGGCGTGAGCGTCCGGTCGATCCAGCTTTATTAGAACAAGTAGGGCC
CAGACATTATCGTTTACGGGCTTTTCCCATTCCTCCCAACAACGTACAACAAATAGAAGGACAACCACCACTCCCTACAG
AAATGAACCTATGGTTAACTTACAAGGTGCTGGGACAAGATAAAGGTTGGGCAATGCCAGATTTAGGGGAAAGACGTAAT
ATATTCTGGACTAATCAAACCAAGCGTATCCGCAACGGTAAAGAAATAGGTTTTAAAGAAAATGCTTGGTTAGAAGAATT
CATCCCCGCCAGCCAGAAAATTCAGCCTGCACTACATGAGGTGAGTTTAGATGAAGGATACAAAATATTAGCTAAACCCT
TATCTAACAAAGATTACACTTTGCCTAAAAATCAGCGCGTCGCCTTAGTTCTCGACACTTCCCGTAGTATGGGAGAACAT
ATCAAAGAATTGACACAAACATTATCTTGGTTGAAACAACACGGTTTTGCAGATAATGATTTGACAAACAACGATGCTGA
TTTATATATCAGTGTTTCTCCAGGCGCTACACCCACACGATTAGATAATCTCCAACAATTCCAACCCGAAAAAGTAGCCT
TCTACGGTACAATTCAACCCCAAGAAATGTTGGCACAGTTTAATAATTTGCGTGGAGATACAGCTTATGATGCTGTTTTA
TTGTTGAGTGATGAAGGTAGTTATGAGTTGTCAAAGAACAATAAAACCGTCCCTGCTACACCTGCACCTTTGTGGATGGT
GCATTTAGGTGGATTGCCTGGAGCCTATAACGATGGCATCATTAAATCATTACAAGATAGCGGTGGTGGAGTTGCTGTTG
ATATTGCCGAGGTGCTGCAACGAATTGCCACCAAATCAATTTTAGGTGATTCTGTTGTTACCGTTGTCAATGGTTATGCT
TGGTATTTGCAGACATTAGACACAGCAGTTACAACTAATAACCAGCAAGATGATTTATTACCATTAGCCGCCAGACAATT
AATTTTAGGCTTGAGTAAACAAATTAAATTAGACAACCTCAAAAGTTTGGATGCAATTCACGCTGTAGCCAAAAAGTATA
AGATTGTCAGCCCTTATTCTTCGATGTTGGTATTAGTCAACGATGAACAAAGACAGTTACTCAAAGAAGCAGAAGCCGCA
AGCGATCGCTTTGATCGTAAAGTTGAAAATGGTAAAGAAAACCTTTCTAAACCCAATAACCCGTTGAAAGTCAGCGTACC
TGAACCATCAGGGGGGTGGCTTTTAGGTGTGAGTGCGATCGCTCTATTCATATTTGCGAAGCGTCGGCGCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCAACATTGAATAATTTATTTTCTGGAAGTTCCTTATTTCACACCACCACAAAAGATAGCCTTGAATTCAGGGAATTATC
AATATAGTGCTGTATCTATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATCATCAAATTCGTGTGAGTAATTGGTAATAACCCATATAGTATTTTCAGGGTGGGCATTGCCCACCAAAAACATATACC
AATTATCAGTTACCAATTAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 930; Mature: 930

Protein sequence:

>930_residues
MDGRRSKPVKSFWNASFEGIFWLWNLTFLSLVYLGILPFVGVPLVLATARGDIPIEFSLALVTLIAVPTISSIIGGWCFL
QQPVKLIRLFYGVEAPLFVLCLLRLFLIRELTPASSQILLTMGVCIAAFAGELFWGYASRRKIGLQWVQMLAHTLMLVFG
IYAGAVLLFYALPLAVFLLQELVKFEWVIPLWNILYHTAFVGGLFIISMWLIVLAFSATLFILMPSALTAMYVHSGAKIL
KAFASEHGNKKAFAGASAVIVAFAVTFLSLQQQPQVMAFSLLANAPKNDSDRQTLITKSEQIRTGLLNAYLSSYRYLSSR
EENNHISAMYRHVLGLEKTAADGLQETYNFLMSPFLYNGSDKDVAKAEKLYAEFFDTPLQKAEKTAVSHAVQSTFNEQEV
KAGLLNINEKKVLLASQQVTVKEHGDWADVELYEVYKNQTPEVQEVFYSFSLPESAVITGLWLGDTNKLDQRFNFVVSPR
GAAQKVYNSQVRRERPVDPALLEQVGPRHYRLRAFPIPPNNVQQIEGQPPLPTEMNLWLTYKVLGQDKGWAMPDLGERRN
IFWTNQTKRIRNGKEIGFKENAWLEEFIPASQKIQPALHEVSLDEGYKILAKPLSNKDYTLPKNQRVALVLDTSRSMGEH
IKELTQTLSWLKQHGFADNDLTNNDADLYISVSPGATPTRLDNLQQFQPEKVAFYGTIQPQEMLAQFNNLRGDTAYDAVL
LLSDEGSYELSKNNKTVPATPAPLWMVHLGGLPGAYNDGIIKSLQDSGGGVAVDIAEVLQRIATKSILGDSVVTVVNGYA
WYLQTLDTAVTTNNQQDDLLPLAARQLILGLSKQIKLDNLKSLDAIHAVAKKYKIVSPYSSMLVLVNDEQRQLLKEAEAA
SDRFDRKVENGKENLSKPNNPLKVSVPEPSGGWLLGVSAIALFIFAKRRR

Sequences:

>Translated_930_residues
MDGRRSKPVKSFWNASFEGIFWLWNLTFLSLVYLGILPFVGVPLVLATARGDIPIEFSLALVTLIAVPTISSIIGGWCFL
QQPVKLIRLFYGVEAPLFVLCLLRLFLIRELTPASSQILLTMGVCIAAFAGELFWGYASRRKIGLQWVQMLAHTLMLVFG
IYAGAVLLFYALPLAVFLLQELVKFEWVIPLWNILYHTAFVGGLFIISMWLIVLAFSATLFILMPSALTAMYVHSGAKIL
KAFASEHGNKKAFAGASAVIVAFAVTFLSLQQQPQVMAFSLLANAPKNDSDRQTLITKSEQIRTGLLNAYLSSYRYLSSR
EENNHISAMYRHVLGLEKTAADGLQETYNFLMSPFLYNGSDKDVAKAEKLYAEFFDTPLQKAEKTAVSHAVQSTFNEQEV
KAGLLNINEKKVLLASQQVTVKEHGDWADVELYEVYKNQTPEVQEVFYSFSLPESAVITGLWLGDTNKLDQRFNFVVSPR
GAAQKVYNSQVRRERPVDPALLEQVGPRHYRLRAFPIPPNNVQQIEGQPPLPTEMNLWLTYKVLGQDKGWAMPDLGERRN
IFWTNQTKRIRNGKEIGFKENAWLEEFIPASQKIQPALHEVSLDEGYKILAKPLSNKDYTLPKNQRVALVLDTSRSMGEH
IKELTQTLSWLKQHGFADNDLTNNDADLYISVSPGATPTRLDNLQQFQPEKVAFYGTIQPQEMLAQFNNLRGDTAYDAVL
LLSDEGSYELSKNNKTVPATPAPLWMVHLGGLPGAYNDGIIKSLQDSGGGVAVDIAEVLQRIATKSILGDSVVTVVNGYA
WYLQTLDTAVTTNNQQDDLLPLAARQLILGLSKQIKLDNLKSLDAIHAVAKKYKIVSPYSSMLVLVNDEQRQLLKEAEAA
SDRFDRKVENGKENLSKPNNPLKVSVPEPSGGWLLGVSAIALFIFAKRRR
>Mature_930_residues
MDGRRSKPVKSFWNASFEGIFWLWNLTFLSLVYLGILPFVGVPLVLATARGDIPIEFSLALVTLIAVPTISSIIGGWCFL
QQPVKLIRLFYGVEAPLFVLCLLRLFLIRELTPASSQILLTMGVCIAAFAGELFWGYASRRKIGLQWVQMLAHTLMLVFG
IYAGAVLLFYALPLAVFLLQELVKFEWVIPLWNILYHTAFVGGLFIISMWLIVLAFSATLFILMPSALTAMYVHSGAKIL
KAFASEHGNKKAFAGASAVIVAFAVTFLSLQQQPQVMAFSLLANAPKNDSDRQTLITKSEQIRTGLLNAYLSSYRYLSSR
EENNHISAMYRHVLGLEKTAADGLQETYNFLMSPFLYNGSDKDVAKAEKLYAEFFDTPLQKAEKTAVSHAVQSTFNEQEV
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GAAQKVYNSQVRRERPVDPALLEQVGPRHYRLRAFPIPPNNVQQIEGQPPLPTEMNLWLTYKVLGQDKGWAMPDLGERRN
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IKELTQTLSWLKQHGFADNDLTNNDADLYISVSPGATPTRLDNLQQFQPEKVAFYGTIQPQEMLAQFNNLRGDTAYDAVL
LLSDEGSYELSKNNKTVPATPAPLWMVHLGGLPGAYNDGIIKSLQDSGGGVAVDIAEVLQRIATKSILGDSVVTVVNGYA
WYLQTLDTAVTTNNQQDDLLPLAARQLILGLSKQIKLDNLKSLDAIHAVAKKYKIVSPYSSMLVLVNDEQRQLLKEAEAA
SDRFDRKVENGKENLSKPNNPLKVSVPEPSGGWLLGVSAIALFIFAKRRR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 103904; Mature: 103904

Theoretical pI: Translated: 8.53; Mature: 8.53

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDGRRSKPVKSFWNASFEGIFWLWNLTFLSLVYLGILPFVGVPLVLATARGDIPIEFSLA
CCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHH
LVTLIAVPTISSIIGGWCFLQQPVKLIRLFYGVEAPLFVLCLLRLFLIRELTPASSQILL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
TMGVCIAAFAGELFWGYASRRKIGLQWVQMLAHTLMLVFGIYAGAVLLFYALPLAVFLLQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELVKFEWVIPLWNILYHTAFVGGLFIISMWLIVLAFSATLFILMPSALTAMYVHSGAKIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KAFASEHGNKKAFAGASAVIVAFAVTFLSLQQQPQVMAFSLLANAPKNDSDRQTLITKSE
HHHHHCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH
QIRTGLLNAYLSSYRYLSSREENNHISAMYRHVLGLEKTAADGLQETYNFLMSPFLYNGS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCC
DKDVAKAEKLYAEFFDTPLQKAEKTAVSHAVQSTFNEQEVKAGLLNINEKKVLLASQQVT
CCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCEE
VKEHGDWADVELYEVYKNQTPEVQEVFYSFSLPESAVITGLWLGDTNKLDQRFNFVVSPR
ECCCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHEEEEEECCCHHHHHHCCEEECCC
GAAQKVYNSQVRRERPVDPALLEQVGPRHYRLRAFPIPPNNVQQIEGQPPLPTEMNLWLT
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHCCCCCCCCCCCCEEEEE
YKVLGQDKGWAMPDLGERRNIFWTNQTKRIRNGKEIGFKENAWLEEFIPASQKIQPALHE
EEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEECCCHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHH
VSLDEGYKILAKPLSNKDYTLPKNQRVALVLDTSRSMGEHIKELTQTLSWLKQHGFADND
CCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
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CCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEE
LLSDEGSYELSKNNKTVPATPAPLWMVHLGGLPGAYNDGIIKSLQDSGGGVAVDIAEVLQ
EEECCCCEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHH
RIATKSILGDSVVTVVNGYAWYLQTLDTAVTTNNQQDDLLPLAARQLILGLSKQIKLDNL
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
KSLDAIHAVAKKYKIVSPYSSMLVLVNDEQRQLLKEAEAASDRFDRKVENGKENLSKPNN
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PLKVSVPEPSGGWLLGVSAIALFIFAKRRR
CEEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
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CCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHH
LVTLIAVPTISSIIGGWCFLQQPVKLIRLFYGVEAPLFVLCLLRLFLIRELTPASSQILL
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KSLDAIHAVAKKYKIVSPYSSMLVLVNDEQRQLLKEAEAASDRFDRKVENGKENLSKPNN
HHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCC
PLKVSVPEPSGGWLLGVSAIALFIFAKRRR
CEEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA