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Definition Nostoc sp. PCC 7120, complete genome.
Accession NC_003272
Length 6,413,771

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The map label for this gene is 17228466

Identifier: 17228466

GI number: 17228466

Start: 1132502

End: 1134214

Strand: Direct

Name: 17228466

Synonym: alr0971

Alternate gene names: NA

Gene position: 1132502-1134214 (Clockwise)

Preceding gene: 17228465

Following gene: 17228467

Centisome position: 17.66

GC content: 36.66

Gene sequence:

>1713_bases
ATGCCTATTTTTGGAGTTCTTCCAATGATGCAAAATTTTATGTACAAACTAAGCGAATGGAATCCTCAACTGTTACGAGA
AGTTAAAGGACGTTGGCAACTTCGTAATATTTTATTGGCCGTTGCCGTATCTTTGCTAGGCCAATTCATACTCTTTATCT
ATTGCCAAACTCAACTACCACCAAACTATATCAATTCCTCCTATGAATATACCCATAAATATTGTACAGGAGCTACTCAG
AACTTTAATTTACCACCATGTTTGTTAGATAAATATGATCGTGTCATTATTAACTGGCAACTATGGAGTCAAGATGTCTT
TATGTTGCTAAGTTTCACTGCTATCTTGGCTCTCTTGGTAGGAGGAGCTTACTTACTTATCAGCGATTTAGCAACAGAAG
AACGGCGAGCTACACTCAATTTTATTCGACTAAGCCCCCAATCGCCTGAAAGCATTCTCTATGGCAAGATGTTAGGAGTT
CCCATTCTCTTGTATTTTGGGTTATTACTAGCAGTTCCGTTTCATTTATCCTTAGGGATAAACGCGCAAATTCCCTTAAT
TCAGATTTTTTTCTTCTATGGAATTTTGATAGTATCTAGCATTTTCTATTATAGTGGAGCCTTATTATTTGGTTTAGTAG
GTACTTGGTTAAGCGGCTTTCAATCTTGGTTAGGTAGTGGGTTAATTTTAGGGTTTCTCTTACTTGCTAAAGCAGCCTTG
CGAGATGGCAGAACAGGTAATTATCCATTTACCATCTTTCAGTTATTTAGCCCTAATTATTTTCTAACCGATTATACTGG
TGAATTTGAATTTACTAGGCTTCATTGGTTCGCTATACCCTTGGGAAGAAGTTTTCCTATTATGGTATGCTTCAATATCT
TGGTTTATTTAATTGGAATTTACTTTTTTTGGCAATCTCTAAACCGTTGCTATAGAGATAAAAATGCCACTATGTTGAGT
AAAAAGCAAAGTTATTTATTAACCTCATGCTTTGTTATTTTTACTTTGGGACTCGCCAATTGGCAAACACAATTCCTAGA
TAAATCTCACTCTTATTTAGGATTAAAGGAAAATTTAGCTACCTTAATGTTTTTAGATTTGTGGCTATTTTTGTATCTGA
TTGCAGCACTTACTCCCAACCGCCAAACCCTACAAGATTGGTCACGTTATCGACATATGTATATGTCCCAGCAGCTAGGC
AAAAGCAAATTAATCAGCGATTTAATTTGGGGTGAAAAAAGTCCGGGCATCTTAGCGATCGCCATCAATGCCATAATTGC
TATTAGCTGTTTAATTTTCTTTACTTTAGTCGTACCAGGATCTACATCTGATAAGCTTATTGTCCTTCTATCTGTAGTTT
TTGCAGGTAGTTTAGCCATCATTTATGCAGCCTTGGCTCAACTACTCCTCTTGATGAAAAATGAACAGAGGCTCTTTTGG
GCTAATGGGATGGTAGGCACTGTTATTATTTTGCCACCAATCGTTTTAGCAATGTTGTTTTCTAACCCTAACTATCAAAC
TTTTCTGTGGTTATTGTCTGTGGCTGCACCAATAATTATTTTGTACCCATCAACTGGCTATATAACACCAATGACTGCTT
TTTTAGCACTGTTGGGACATGGTGGAATTTTGGGTTTATTAATGTTTCAAATCACGCGTCAGTTGAAAAAGTCTGGAGAA
TCAGCAACAAAAGCACTGTTAGCCGGGAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGTATTCCCATAACTAACTTTCATTGTACACAAGAAGATTTAGAAAGTATCTTCTTAAAATTAGGACACAAACAAGCATC
TTAATTAGTCAATATTACCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCAAATGATTTAGTGTGACAAGTAAAACCCTGGTTTATAAGGGAAACCAGGGTTTTTAGTTTGCCGGAATGATTTTAAGT
AAAGAGACAAAATTATTTGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 570; Mature: 569

Protein sequence:

>570_residues
MPIFGVLPMMQNFMYKLSEWNPQLLREVKGRWQLRNILLAVAVSLLGQFILFIYCQTQLPPNYINSSYEYTHKYCTGATQ
NFNLPPCLLDKYDRVIINWQLWSQDVFMLLSFTAILALLVGGAYLLISDLATEERRATLNFIRLSPQSPESILYGKMLGV
PILLYFGLLLAVPFHLSLGINAQIPLIQIFFFYGILIVSSIFYYSGALLFGLVGTWLSGFQSWLGSGLILGFLLLAKAAL
RDGRTGNYPFTIFQLFSPNYFLTDYTGEFEFTRLHWFAIPLGRSFPIMVCFNILVYLIGIYFFWQSLNRCYRDKNATMLS
KKQSYLLTSCFVIFTLGLANWQTQFLDKSHSYLGLKENLATLMFLDLWLFLYLIAALTPNRQTLQDWSRYRHMYMSQQLG
KSKLISDLIWGEKSPGILAIAINAIIAISCLIFFTLVVPGSTSDKLIVLLSVVFAGSLAIIYAALAQLLLLMKNEQRLFW
ANGMVGTVIILPPIVLAMLFSNPNYQTFLWLLSVAAPIIILYPSTGYITPMTAFLALLGHGGILGLLMFQITRQLKKSGE
SATKALLAGN

Sequences:

>Translated_570_residues
MPIFGVLPMMQNFMYKLSEWNPQLLREVKGRWQLRNILLAVAVSLLGQFILFIYCQTQLPPNYINSSYEYTHKYCTGATQ
NFNLPPCLLDKYDRVIINWQLWSQDVFMLLSFTAILALLVGGAYLLISDLATEERRATLNFIRLSPQSPESILYGKMLGV
PILLYFGLLLAVPFHLSLGINAQIPLIQIFFFYGILIVSSIFYYSGALLFGLVGTWLSGFQSWLGSGLILGFLLLAKAAL
RDGRTGNYPFTIFQLFSPNYFLTDYTGEFEFTRLHWFAIPLGRSFPIMVCFNILVYLIGIYFFWQSLNRCYRDKNATMLS
KKQSYLLTSCFVIFTLGLANWQTQFLDKSHSYLGLKENLATLMFLDLWLFLYLIAALTPNRQTLQDWSRYRHMYMSQQLG
KSKLISDLIWGEKSPGILAIAINAIIAISCLIFFTLVVPGSTSDKLIVLLSVVFAGSLAIIYAALAQLLLLMKNEQRLFW
ANGMVGTVIILPPIVLAMLFSNPNYQTFLWLLSVAAPIIILYPSTGYITPMTAFLALLGHGGILGLLMFQITRQLKKSGE
SATKALLAGN
>Mature_569_residues
PIFGVLPMMQNFMYKLSEWNPQLLREVKGRWQLRNILLAVAVSLLGQFILFIYCQTQLPPNYINSSYEYTHKYCTGATQN
FNLPPCLLDKYDRVIINWQLWSQDVFMLLSFTAILALLVGGAYLLISDLATEERRATLNFIRLSPQSPESILYGKMLGVP
ILLYFGLLLAVPFHLSLGINAQIPLIQIFFFYGILIVSSIFYYSGALLFGLVGTWLSGFQSWLGSGLILGFLLLAKAALR
DGRTGNYPFTIFQLFSPNYFLTDYTGEFEFTRLHWFAIPLGRSFPIMVCFNILVYLIGIYFFWQSLNRCYRDKNATMLSK
KQSYLLTSCFVIFTLGLANWQTQFLDKSHSYLGLKENLATLMFLDLWLFLYLIAALTPNRQTLQDWSRYRHMYMSQQLGK
SKLISDLIWGEKSPGILAIAINAIIAISCLIFFTLVVPGSTSDKLIVLLSVVFAGSLAIIYAALAQLLLLMKNEQRLFWA
NGMVGTVIILPPIVLAMLFSNPNYQTFLWLLSVAAPIIILYPSTGYITPMTAFLALLGHGGILGLLMFQITRQLKKSGES
ATKALLAGN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 64498; Mature: 64366

Theoretical pI: Translated: 9.44; Mature: 9.44

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPIFGVLPMMQNFMYKLSEWNPQLLREVKGRWQLRNILLAVAVSLLGQFILFIYCQTQLP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PNYINSSYEYTHKYCTGATQNFNLPPCLLDKYDRVIINWQLWSQDVFMLLSFTAILALLV
HHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GGAYLLISDLATEERRATLNFIRLSPQSPESILYGKMLGVPILLYFGLLLAVPFHLSLGI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
NAQIPLIQIFFFYGILIVSSIFYYSGALLFGLVGTWLSGFQSWLGSGLILGFLLLAKAAL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RDGRTGNYPFTIFQLFSPNYFLTDYTGEFEFTRLHWFAIPLGRSFPIMVCFNILVYLIGI
HCCCCCCCCEEEEEEECCCEEEECCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
YFFWQSLNRCYRDKNATMLSKKQSYLLTSCFVIFTLGLANWQTQFLDKSHSYLGLKENLA
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
TLMFLDLWLFLYLIAALTPNRQTLQDWSRYRHMYMSQQLGKSKLISDLIWGEKSPGILAI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHH
AINAIIAISCLIFFTLVVPGSTSDKLIVLLSVVFAGSLAIIYAALAQLLLLMKNEQRLFW
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
ANGMVGTVIILPPIVLAMLFSNPNYQTFLWLLSVAAPIIILYPSTGYITPMTAFLALLGH
ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHC
GGILGLLMFQITRQLKKSGESATKALLAGN
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
PIFGVLPMMQNFMYKLSEWNPQLLREVKGRWQLRNILLAVAVSLLGQFILFIYCQTQLP
CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PNYINSSYEYTHKYCTGATQNFNLPPCLLDKYDRVIINWQLWSQDVFMLLSFTAILALLV
HHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GGAYLLISDLATEERRATLNFIRLSPQSPESILYGKMLGVPILLYFGLLLAVPFHLSLGI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
NAQIPLIQIFFFYGILIVSSIFYYSGALLFGLVGTWLSGFQSWLGSGLILGFLLLAKAAL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RDGRTGNYPFTIFQLFSPNYFLTDYTGEFEFTRLHWFAIPLGRSFPIMVCFNILVYLIGI
HCCCCCCCCEEEEEEECCCEEEECCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
YFFWQSLNRCYRDKNATMLSKKQSYLLTSCFVIFTLGLANWQTQFLDKSHSYLGLKENLA
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
TLMFLDLWLFLYLIAALTPNRQTLQDWSRYRHMYMSQQLGKSKLISDLIWGEKSPGILAI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHH
AINAIIAISCLIFFTLVVPGSTSDKLIVLLSVVFAGSLAIIYAALAQLLLLMKNEQRLFW
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
ANGMVGTVIILPPIVLAMLFSNPNYQTFLWLLSVAAPIIILYPSTGYITPMTAFLALLGH
ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHC
GGILGLLMFQITRQLKKSGESATKALLAGN
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA