| Definition | Nostoc sp. PCC 7120, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003272 |
| Length | 6,413,771 |
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The map label for this gene is 17228466
Identifier: 17228466
GI number: 17228466
Start: 1132502
End: 1134214
Strand: Direct
Name: 17228466
Synonym: alr0971
Alternate gene names: NA
Gene position: 1132502-1134214 (Clockwise)
Preceding gene: 17228465
Following gene: 17228467
Centisome position: 17.66
GC content: 36.66
Gene sequence:
>1713_bases ATGCCTATTTTTGGAGTTCTTCCAATGATGCAAAATTTTATGTACAAACTAAGCGAATGGAATCCTCAACTGTTACGAGA AGTTAAAGGACGTTGGCAACTTCGTAATATTTTATTGGCCGTTGCCGTATCTTTGCTAGGCCAATTCATACTCTTTATCT ATTGCCAAACTCAACTACCACCAAACTATATCAATTCCTCCTATGAATATACCCATAAATATTGTACAGGAGCTACTCAG AACTTTAATTTACCACCATGTTTGTTAGATAAATATGATCGTGTCATTATTAACTGGCAACTATGGAGTCAAGATGTCTT TATGTTGCTAAGTTTCACTGCTATCTTGGCTCTCTTGGTAGGAGGAGCTTACTTACTTATCAGCGATTTAGCAACAGAAG AACGGCGAGCTACACTCAATTTTATTCGACTAAGCCCCCAATCGCCTGAAAGCATTCTCTATGGCAAGATGTTAGGAGTT CCCATTCTCTTGTATTTTGGGTTATTACTAGCAGTTCCGTTTCATTTATCCTTAGGGATAAACGCGCAAATTCCCTTAAT TCAGATTTTTTTCTTCTATGGAATTTTGATAGTATCTAGCATTTTCTATTATAGTGGAGCCTTATTATTTGGTTTAGTAG GTACTTGGTTAAGCGGCTTTCAATCTTGGTTAGGTAGTGGGTTAATTTTAGGGTTTCTCTTACTTGCTAAAGCAGCCTTG CGAGATGGCAGAACAGGTAATTATCCATTTACCATCTTTCAGTTATTTAGCCCTAATTATTTTCTAACCGATTATACTGG TGAATTTGAATTTACTAGGCTTCATTGGTTCGCTATACCCTTGGGAAGAAGTTTTCCTATTATGGTATGCTTCAATATCT TGGTTTATTTAATTGGAATTTACTTTTTTTGGCAATCTCTAAACCGTTGCTATAGAGATAAAAATGCCACTATGTTGAGT AAAAAGCAAAGTTATTTATTAACCTCATGCTTTGTTATTTTTACTTTGGGACTCGCCAATTGGCAAACACAATTCCTAGA TAAATCTCACTCTTATTTAGGATTAAAGGAAAATTTAGCTACCTTAATGTTTTTAGATTTGTGGCTATTTTTGTATCTGA TTGCAGCACTTACTCCCAACCGCCAAACCCTACAAGATTGGTCACGTTATCGACATATGTATATGTCCCAGCAGCTAGGC AAAAGCAAATTAATCAGCGATTTAATTTGGGGTGAAAAAAGTCCGGGCATCTTAGCGATCGCCATCAATGCCATAATTGC TATTAGCTGTTTAATTTTCTTTACTTTAGTCGTACCAGGATCTACATCTGATAAGCTTATTGTCCTTCTATCTGTAGTTT TTGCAGGTAGTTTAGCCATCATTTATGCAGCCTTGGCTCAACTACTCCTCTTGATGAAAAATGAACAGAGGCTCTTTTGG GCTAATGGGATGGTAGGCACTGTTATTATTTTGCCACCAATCGTTTTAGCAATGTTGTTTTCTAACCCTAACTATCAAAC TTTTCTGTGGTTATTGTCTGTGGCTGCACCAATAATTATTTTGTACCCATCAACTGGCTATATAACACCAATGACTGCTT TTTTAGCACTGTTGGGACATGGTGGAATTTTGGGTTTATTAATGTTTCAAATCACGCGTCAGTTGAAAAAGTCTGGAGAA TCAGCAACAAAAGCACTGTTAGCCGGGAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GGTATTCCCATAACTAACTTTCATTGTACACAAGAAGATTTAGAAAGTATCTTCTTAAAATTAGGACACAAACAAGCATC TTAATTAGTCAATATTACCA
Downstream 100 bases:
>100_bases CCAAATGATTTAGTGTGACAAGTAAAACCCTGGTTTATAAGGGAAACCAGGGTTTTTAGTTTGCCGGAATGATTTTAAGT AAAGAGACAAAATTATTTGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 570; Mature: 569
Protein sequence:
>570_residues MPIFGVLPMMQNFMYKLSEWNPQLLREVKGRWQLRNILLAVAVSLLGQFILFIYCQTQLPPNYINSSYEYTHKYCTGATQ NFNLPPCLLDKYDRVIINWQLWSQDVFMLLSFTAILALLVGGAYLLISDLATEERRATLNFIRLSPQSPESILYGKMLGV PILLYFGLLLAVPFHLSLGINAQIPLIQIFFFYGILIVSSIFYYSGALLFGLVGTWLSGFQSWLGSGLILGFLLLAKAAL RDGRTGNYPFTIFQLFSPNYFLTDYTGEFEFTRLHWFAIPLGRSFPIMVCFNILVYLIGIYFFWQSLNRCYRDKNATMLS KKQSYLLTSCFVIFTLGLANWQTQFLDKSHSYLGLKENLATLMFLDLWLFLYLIAALTPNRQTLQDWSRYRHMYMSQQLG KSKLISDLIWGEKSPGILAIAINAIIAISCLIFFTLVVPGSTSDKLIVLLSVVFAGSLAIIYAALAQLLLLMKNEQRLFW ANGMVGTVIILPPIVLAMLFSNPNYQTFLWLLSVAAPIIILYPSTGYITPMTAFLALLGHGGILGLLMFQITRQLKKSGE SATKALLAGN
Sequences:
>Translated_570_residues MPIFGVLPMMQNFMYKLSEWNPQLLREVKGRWQLRNILLAVAVSLLGQFILFIYCQTQLPPNYINSSYEYTHKYCTGATQ NFNLPPCLLDKYDRVIINWQLWSQDVFMLLSFTAILALLVGGAYLLISDLATEERRATLNFIRLSPQSPESILYGKMLGV PILLYFGLLLAVPFHLSLGINAQIPLIQIFFFYGILIVSSIFYYSGALLFGLVGTWLSGFQSWLGSGLILGFLLLAKAAL RDGRTGNYPFTIFQLFSPNYFLTDYTGEFEFTRLHWFAIPLGRSFPIMVCFNILVYLIGIYFFWQSLNRCYRDKNATMLS KKQSYLLTSCFVIFTLGLANWQTQFLDKSHSYLGLKENLATLMFLDLWLFLYLIAALTPNRQTLQDWSRYRHMYMSQQLG KSKLISDLIWGEKSPGILAIAINAIIAISCLIFFTLVVPGSTSDKLIVLLSVVFAGSLAIIYAALAQLLLLMKNEQRLFW ANGMVGTVIILPPIVLAMLFSNPNYQTFLWLLSVAAPIIILYPSTGYITPMTAFLALLGHGGILGLLMFQITRQLKKSGE SATKALLAGN >Mature_569_residues PIFGVLPMMQNFMYKLSEWNPQLLREVKGRWQLRNILLAVAVSLLGQFILFIYCQTQLPPNYINSSYEYTHKYCTGATQN FNLPPCLLDKYDRVIINWQLWSQDVFMLLSFTAILALLVGGAYLLISDLATEERRATLNFIRLSPQSPESILYGKMLGVP ILLYFGLLLAVPFHLSLGINAQIPLIQIFFFYGILIVSSIFYYSGALLFGLVGTWLSGFQSWLGSGLILGFLLLAKAALR DGRTGNYPFTIFQLFSPNYFLTDYTGEFEFTRLHWFAIPLGRSFPIMVCFNILVYLIGIYFFWQSLNRCYRDKNATMLSK KQSYLLTSCFVIFTLGLANWQTQFLDKSHSYLGLKENLATLMFLDLWLFLYLIAALTPNRQTLQDWSRYRHMYMSQQLGK SKLISDLIWGEKSPGILAIAINAIIAISCLIFFTLVVPGSTSDKLIVLLSVVFAGSLAIIYAALAQLLLLMKNEQRLFWA NGMVGTVIILPPIVLAMLFSNPNYQTFLWLLSVAAPIIILYPSTGYITPMTAFLALLGHGGILGLLMFQITRQLKKSGES ATKALLAGN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 64498; Mature: 64366
Theoretical pI: Translated: 9.44; Mature: 9.44
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 4.0 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPIFGVLPMMQNFMYKLSEWNPQLLREVKGRWQLRNILLAVAVSLLGQFILFIYCQTQLP CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC PNYINSSYEYTHKYCTGATQNFNLPPCLLDKYDRVIINWQLWSQDVFMLLSFTAILALLV HHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GGAYLLISDLATEERRATLNFIRLSPQSPESILYGKMLGVPILLYFGLLLAVPFHLSLGI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NAQIPLIQIFFFYGILIVSSIFYYSGALLFGLVGTWLSGFQSWLGSGLILGFLLLAKAAL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RDGRTGNYPFTIFQLFSPNYFLTDYTGEFEFTRLHWFAIPLGRSFPIMVCFNILVYLIGI HCCCCCCCCEEEEEEECCCEEEECCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH YFFWQSLNRCYRDKNATMLSKKQSYLLTSCFVIFTLGLANWQTQFLDKSHSYLGLKENLA HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH TLMFLDLWLFLYLIAALTPNRQTLQDWSRYRHMYMSQQLGKSKLISDLIWGEKSPGILAI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHH AINAIIAISCLIFFTLVVPGSTSDKLIVLLSVVFAGSLAIIYAALAQLLLLMKNEQRLFW HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE ANGMVGTVIILPPIVLAMLFSNPNYQTFLWLLSVAAPIIILYPSTGYITPMTAFLALLGH ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHC GGILGLLMFQITRQLKKSGESATKALLAGN CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure PIFGVLPMMQNFMYKLSEWNPQLLREVKGRWQLRNILLAVAVSLLGQFILFIYCQTQLP CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC PNYINSSYEYTHKYCTGATQNFNLPPCLLDKYDRVIINWQLWSQDVFMLLSFTAILALLV HHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GGAYLLISDLATEERRATLNFIRLSPQSPESILYGKMLGVPILLYFGLLLAVPFHLSLGI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NAQIPLIQIFFFYGILIVSSIFYYSGALLFGLVGTWLSGFQSWLGSGLILGFLLLAKAAL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RDGRTGNYPFTIFQLFSPNYFLTDYTGEFEFTRLHWFAIPLGRSFPIMVCFNILVYLIGI HCCCCCCCCEEEEEEECCCEEEECCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH YFFWQSLNRCYRDKNATMLSKKQSYLLTSCFVIFTLGLANWQTQFLDKSHSYLGLKENLA HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH TLMFLDLWLFLYLIAALTPNRQTLQDWSRYRHMYMSQQLGKSKLISDLIWGEKSPGILAI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHH AINAIIAISCLIFFTLVVPGSTSDKLIVLLSVVFAGSLAIIYAALAQLLLLMKNEQRLFW HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE ANGMVGTVIILPPIVLAMLFSNPNYQTFLWLLSVAAPIIILYPSTGYITPMTAFLALLGH ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHC GGILGLLMFQITRQLKKSGESATKALLAGN CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA