Definition | Yersinia pestis CO92 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_003143 |
Length | 4,653,728 |
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The map label for this gene is 218928805
Identifier: 218928805
GI number: 218928805
Start: 1907134
End: 1910010
Strand: Direct
Name: 218928805
Synonym: YPO1673
Alternate gene names: NA
Gene position: 1907134-1910010 (Clockwise)
Preceding gene: 218928804
Following gene: 218928806
Centisome position: 40.98
GC content: 51.2
Gene sequence:
>2877_bases ATGGAGTATTGGCTGTTAATTTTTTTACTTATCTTCTTGTTTGTCATCTATATGCAAATAAGTGCGTTATCCAACTCGGT AAAATATATACGAGAAGAGATAGGCAGGCTGCGCAATGAGCTTGCTCCACGCTTGCCTGAACCTACCGTGGCTACTGTTG TGGCCACTGTTAAGGAAGAGATCACGCCAACGAATTTGGCAGATGATGTGGCCGCATCCGAGGTATGGACCCCTGATTAC GCAACCTATCAGAATTATCTACTCACCAAACAGCAAAGCCAGATTAAAGAGATGGCTCTAGCCTATGCCGCAAAAAAAGA ACCCGCTCGGCCAATAGAATATAGGATTGCTGACCGTCAGGTGGTGCTTGAGCCACAGGATGGGGCTCCTCAAGAATCGC CGAAAATGGATGCAGGTCCTGCCAGTGGTCATCCACAGAAACCCGATGTGTGGACAAAATTGGAAAATGTCCTGTTTTCT TTAAAATCACCGGAGAGTTTCTGGAAACGCATCGAGCAAGAGTTTGCCGCGCGTTGGATGGTGTGGATCGGCGGTATGAT CATGGCACTGGGTGTGATTTTCCTGCTGAAAGCAGGCAGCGAACAGGGTCTGTTCGGGCCAAACTTGCGGATTGGTACCG CCATTGTGCTGAGTGTGCTGATGGTTGTTGGGGGGGAGTGGCTCAGGCGTTCACGTTTTCAGTTGCCCTTGGTCAATGCC GGTTATATCCCGGCGGCGCTGAGTGGGGCCGGTATTCTCGGTCTATTTGCCTCAATGCTGGCGGCTAAATATCTCTACGA CATGTTCCCGATGCCCGTTCTCATGCTGTTGCTCAGCCTGATTTCTCTGTTGGCGATGGTGCTGGCATTGTGGCAGGGGC CATTTATGGCGGCCTTGGGGCTGCTTGGCGCCTATACCGTCCCGTTATTTGTTTCGACGGGCAGCGGTAATGTCACCGGG CTGTTGGCCTACCTGTTCCTGGTTAGTTTGGCGTCTATCGGCCTGATGAGCCGTGTCTATCGGCACTGGCTATGGCTGGG GGCGATGGTCGGAAACTATCTATGGCTTTTGGTTTCTTTATTCATAGCAACGTCCGAACACCAGTTAGCGCGTTCACTAT TCCTGCTAGCAACCACATACGGCTTCCTGGCCTGGCCACATCTGGGGTGGGCGCTAAAAAGCAAAATACGTTTTCGCCAT AATGACTGGAAAAACTGGCCCCCGGCTTTGCTGGATCCGTTATTAACTGGGTTGATTGCCGGGCTTTCGCTATTAGCCTT AACGTTAAGCGCAAATCATTCGATCCTGGTCTGGAGCACGTTGGTATTCTCCTGTATTAGCCTGTTACTGATTGCCAGAC GCTCACCTTCATTGGATTTATTTGTTCCACTGGCCGCGATATTAGCCATTTCTCCCTTTATTAATGCAGGAACGCTGTTT GAGCCAGAAACCGTCTGGACGAGTTTGCTCGCGCTCAGCACATTAGCGCTATTCTGCGGGATATATGGTAGCTACCAGGT CACCCGGCCGGTTTACCGCAAGCTGTGGTGGGCGTTATTGTCGGTGCTGGTGCCAATGTATCTCGTTGCAAGTACCTATT ATGCCTGTCGCGATAATTTTGAGCTGGCTCCAGTTAAATACACACTGCTGGCGGTTTGTCTGGCTATGTATATCGCGTGG AATGCATTCAGTGATGGGTATCGCCGTGGCTCAGCGCTGTTGCGGACGATCTATCAGGTCGCCGCCCAACTGACGTTGAC CTTTGCATTATTTATGGCTTTCAGCCAGGTTACGCTAACCCTGCTGCTCGCGGGTCAGCTTTTAGTTTTGGTACTCTGGC AACGTTGGCGACAGGTTTCGTTACTGTCTTGGATTTTGAAACTGCATGCGATCATACTGCTGGTTCGTCTGTCAATGAAC CCGTATATCCTTGGATATTCCTCGCCGTTGCACATTGGTTCGGTCGTTATTCCTTGGACGCTATACGGTTTTGGGATTCC GATTCTCTGCCTGTGGCTAAGTTCACGCTGGTTACCTGCGCGTCGCGGTGAGCAGACCGCCAATTGGTTAGCGGCCAATG CTATTTATCTGTTGGCCTTGTGGATCAACGTTGAATTACGTCACCTGCTGCATGGCAGCTATCATCTGTCGCTGGATTTC GCTTCTCTTACCGATTGTGCGTTGCATGGGGTGACCTTCGGGCTGATGGCGCTGGCCTACGGCTATCGTGAACAGTTTGC AGATTCGCTACAACGGATATACCGCCTGGCGGCTAAAACCAGTGCCATTCTGATGCTCACCCTAACGTTGCTCTGCCTGG TTGTCTTTAACCCCATCTGGTCAGCACAACAGGTTGGCGGCCTACCGCTGCTGAATATGGTGACCGTTGCCTATGCGATC CCGATGGTGTTCATGGTGGTAGCACTAAGATACTGGCCAGATCACTGGCTAGATATCCGTCTGAAGCCCTACGTTATCGG TGCGATTGCGCTACTGGGAATGGTGTTCATTACCTTGACGGTCCGCCAGCTCTGGCATGGTGACCGGTTGGATAATGATA TCGTGTACAGCGGCGAACAATACTCTTACTCCTTAGCGTGGATGTTAACTGCCATTGGCATGATGTACAGCGCAATACAC TGGCCTAACTATAAAGTGCGCCGCGCCTCCCTGGGGTTGTTGGCGCTCACGATCGTCAAACTGTTCCTGTGGGATATGTC TGGTCTTGAAGGGCTATATCGTTCGGTCTCATTCCTCGGTCTGGGGCTGTGTCTGGTAGCGATTGGTTGGTTCTACCAGA AGTTTGTCGTTATGAAGGAAGTCATTGAGCAAAACAAGGATCAGCCGACAGCGGACGTGGTACAAAGCGGGCAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGAAAAATACCTGTCAGATACTGTTTCATGCTATCCGATGAATGGATAGGGTTATCTCATAGAGAATTTTTTACTTAATA AACGCTGAGTTGGATACATA
Downstream 100 bases:
>100_bases TCGCCATTTGTCTTACCGGAGCGTGCATCGACTGATGTGGGAAAATCAATATACAGCAAGGAGTCAGTGTGATTAATTTT GTGAAGTTAATGTGTAATGT
Product: putative integral membrane protein
Products: NA
Alternate protein names: MSF Permease
Number of amino acids: Translated: 958; Mature: 958
Protein sequence:
>958_residues MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVVATVKEEITPTNLADDVAASEVWTPDY ATYQNYLLTKQQSQIKEMALAYAAKKEPARPIEYRIADRQVVLEPQDGAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFS LKSPESFWKRIEQEFAARWMVWIGGMIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPNLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNA GYIPAALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTG LLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRH NDWKNWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLF EPETVWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVASTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAW NAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMN PYILGYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDF ASLTDCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGGLPLLNMVTVAYAI PMVFMVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIH WPNYKVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ
Sequences:
>Translated_958_residues MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVVATVKEEITPTNLADDVAASEVWTPDY ATYQNYLLTKQQSQIKEMALAYAAKKEPARPIEYRIADRQVVLEPQDGAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFS LKSPESFWKRIEQEFAARWMVWIGGMIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPNLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNA GYIPAALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTG LLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRH NDWKNWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLF EPETVWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVASTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAW NAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMN PYILGYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDF ASLTDCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGGLPLLNMVTVAYAI PMVFMVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIH WPNYKVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ >Mature_958_residues MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVVATVKEEITPTNLADDVAASEVWTPDY ATYQNYLLTKQQSQIKEMALAYAAKKEPARPIEYRIADRQVVLEPQDGAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFS LKSPESFWKRIEQEFAARWMVWIGGMIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPNLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNA GYIPAALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTG LLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRH NDWKNWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLF EPETVWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVASTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAW NAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMN PYILGYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDF ASLTDCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGGLPLLNMVTVAYAI PMVFMVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIH WPNYKVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ
Specific function: Unknown
COG id: COG5373
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 107457; Mature: 107457
Theoretical pI: Translated: 9.33; Mature: 9.33
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 3.2 %Met (Translated Protein) 4.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 3.2 %Met (Mature Protein) 4.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVVATVKEE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH ITPTNLADDVAASEVWTPDYATYQNYLLTKQQSQIKEMALAYAAKKEPARPIEYRIADRQ CCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCE VVLEPQDGAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSPESFWKRIEQEFAARWM EEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH VWIGGMIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPNLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNA HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCCCC GYIPAALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALG CCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH LLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSL HHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWKNWPPALLDPLLTGLIA HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH GLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLF HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC EPETVWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVASTYYACRDNF CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC ELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYILGYSSPLHIGSVVIPWT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHH LYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDF HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEH ASLTDCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC SAQQVGGLPLLNMVTVAYAIPMVFMVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLT CHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH VRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNYKVRRASLGLLALTIVK HHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH LFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVVATVKEE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH ITPTNLADDVAASEVWTPDYATYQNYLLTKQQSQIKEMALAYAAKKEPARPIEYRIADRQ CCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCE VVLEPQDGAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSPESFWKRIEQEFAARWM EEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH VWIGGMIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPNLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNA HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCCCC GYIPAALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALG CCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH LLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSL HHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWKNWPPALLDPLLTGLIA HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH GLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLF HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC EPETVWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVASTYYACRDNF CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC ELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYILGYSSPLHIGSVVIPWT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHH LYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDF HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEH ASLTDCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC SAQQVGGLPLLNMVTVAYAIPMVFMVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLT CHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH VRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNYKVRRASLGLLALTIVK HHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH LFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA