| Definition | Staphylococcus aureus subsp. aureus COL chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002951 |
| Length | 2,809,422 |
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The map label for this gene is yebA [C]
Identifier: 57652568
GI number: 57652568
Start: 382423
End: 388623
Strand: Direct
Name: yebA [C]
Synonym: SACOL0379
Alternate gene names: 57652568
Gene position: 382423-388623 (Clockwise)
Preceding gene: 57651305
Following gene: 57652569
Centisome position: 13.61
GC content: 36.37
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TGCAATCTTTTGTAAAAATCATAGATGGTTACAAGGAAGAAGTAATAACAGATTTTAATCAGCTTATATTTTTAGATGCA AGGGCTGAAAGTCCAAACAC
Product: prophage L54a, TP901 family tail tape meausure protein
Products: NA
Alternate protein names: Staphylolytic enzyme ALE-1 [H]
Number of amino acids: Translated: 2066; Mature: 2066
Protein sequence:
>2066_residues MNEKVEGMTLELKLDHLGVQEGMKGLKRQLGVVNSEMKANLSAFDKSEKSMEKYQARIKGLNDRLKVQKKMYSQVEDELK QVNANYQKAKSSVKDVEKAYLKLVEANKKEKLALDKSKEALKSSNTELKKAENQYKRTNQRKQDAYQKLKQLRDAEQKLK NSNQATTAQLKRASDAVQKQSAKHKALVEQYKQEGNQVQKLKVQNDNLSKSNDKIESSYAKTNTKLKQTEKEFNDLNNTI KNHSANVAKAETAVNKEKAALNNLERSIDKASSEMKTFNKEQMIAQSHFGKLASQADVMSKKFSSIGDKMTSLGRTMTMG VSTPITLGLGAALKTSADFEGQMSRVGAIAQASSKDLKSMSNQAVDLGAKTSKSANEVAKGMEELAALGFNAKQTMEAMP GVISAAEASGAEMATTATVMASAINSFGLKASDANHVADLLARSANDSAADIQYMGDALKYAGTPAKALGVSIEDTSAAI EVLSNSGLEGSQAGTALRASFIRLANPSKNTAKEMKKLGIHLSDAKGQFVGMGELIRQFQDNMKGMTREQKLATVATIVG TEAASGFLALIEAGPDKINSYSKSLKNSNGESKKAADLMKDNLKGALEQLGGAFESLAIEVGKDLTPMIRAGAEGLTKLV DGFTHLPGWVRKASVGLALFGAAIGPAVLAGGLLIRTVGSAAKGYASLNRRIAENTILSNTNSKAMKSLGLQTLFLGSTT GKTSKGFKGLAGAMMFNLKPINVLKNSAKLAILPFKLLKNGLGLAAKSLFAVSGGARFAGVALRFLTGPIGATITAITIA YKVFKTAYDRVEWFRNGINGLGETIKFFGGKIIGGAVRKLGEFKNYLGSIGKSFKEKFSKDMKDGYKSLSDDDLLKVGVN KFKGFMQTMGTASKKASDTVKVLGKGVSKETEKALEKYVHYSEENSRIMEKVRLNSGQISEDKAKKLLKIETDLSNNLIA EIEKRNKKELEKTQELIDKYSAFDEQEKQNILTRTKEKNDLRIKKEQELNQKIKELKEKALSDGQISENERKEIEKLENQ RRDITVKELSKTEKEQERILVRMQRNRNAYSIDEASKAIKEAEKARKARKKEVDKQYEDDVIAIKNNVNLSKSEKDKLLA IADQRHKDEVRKAKSKKDAVVDVVKKQNKDIDKEMDLSSGRVYKNTEKWWNGLKSWWSNFREDQKKKSDKYAKEQEETAR RNRENIKKWFGNAWDGVKTKTGEAFSKMGRNANHFGGEMKKMWSGIKGIPSKLSSSWSSAKSSVGYHTKAIANSTGKWFG KAWQSVKSTTGSIYNQTKQKYSDASDKAWAHSKSIWKGTSKWFSNAYKSAKGWLTDMANKSRSKWDNISSTAWSNAKSVW KGTSKWFGNSYKSLKGWTGDMYSRAHDRFDAISSSAWSNAKSVFNGFRKWLSKTYDWIRDIGKDMGRAAADLGKNVANKA IGGLNSMIGGINKISKAITDKNLIKPIPTLSTGTLAGKGVATDNSGALTQPTFAVLNDRGSGNAPGGGVQEVIHRADGTF HAPQGRDVVVPLGVGDSVINANDTLKLQRMGVLPKFHGGTKKKKWMEQVTENLGKKAGDFGSKAKNTAHNIKKGAEEMVE AAGDKIKDGASWLGDKIGDVWDYVQHPGKLVNKVMSGLNINFGGGANATVKIAKGAYSLLKKKLVDKVKSWFEDFGGGGD GSYLFDHPIWQRFGSYTGGLNFNGGRHYGIDFGMPTGTNIYAVKGGIADKVWTDYGGGNSIQIKTGANEWNWYMHLSKQL ARQGQRIKAGQLIGKSGATGNFVRGAHLHFQLMQGSHPGNDTAKDPEKWLKSLKGSGVRSGSGVNKAASAWAGDIRRAAK RMGVNVTSGDVGNIISLIQHESGGNAGITQSSSLRDINVLQGNPAKGLLQYIPQTFRHYAVRGHNNIYSGYDQLLAFFNN RYWRSQFNPRGGWSPSGPRRYANGGLITKHQLAEVGEGDKQEMVIPLTRRKRAIQLTEQVMRIIGMDGKPNNITVNNDTS TVEKLLKQIVMLSDKGNKLTDALIQTVSSQDNNLGSNDAIRGLEKILSKQSGHRANANNYMGGLTN
Sequences:
>Translated_2066_residues MNEKVEGMTLELKLDHLGVQEGMKGLKRQLGVVNSEMKANLSAFDKSEKSMEKYQARIKGLNDRLKVQKKMYSQVEDELK QVNANYQKAKSSVKDVEKAYLKLVEANKKEKLALDKSKEALKSSNTELKKAENQYKRTNQRKQDAYQKLKQLRDAEQKLK NSNQATTAQLKRASDAVQKQSAKHKALVEQYKQEGNQVQKLKVQNDNLSKSNDKIESSYAKTNTKLKQTEKEFNDLNNTI KNHSANVAKAETAVNKEKAALNNLERSIDKASSEMKTFNKEQMIAQSHFGKLASQADVMSKKFSSIGDKMTSLGRTMTMG VSTPITLGLGAALKTSADFEGQMSRVGAIAQASSKDLKSMSNQAVDLGAKTSKSANEVAKGMEELAALGFNAKQTMEAMP GVISAAEASGAEMATTATVMASAINSFGLKASDANHVADLLARSANDSAADIQYMGDALKYAGTPAKALGVSIEDTSAAI EVLSNSGLEGSQAGTALRASFIRLANPSKNTAKEMKKLGIHLSDAKGQFVGMGELIRQFQDNMKGMTREQKLATVATIVG TEAASGFLALIEAGPDKINSYSKSLKNSNGESKKAADLMKDNLKGALEQLGGAFESLAIEVGKDLTPMIRAGAEGLTKLV DGFTHLPGWVRKASVGLALFGAAIGPAVLAGGLLIRTVGSAAKGYASLNRRIAENTILSNTNSKAMKSLGLQTLFLGSTT GKTSKGFKGLAGAMMFNLKPINVLKNSAKLAILPFKLLKNGLGLAAKSLFAVSGGARFAGVALRFLTGPIGATITAITIA YKVFKTAYDRVEWFRNGINGLGETIKFFGGKIIGGAVRKLGEFKNYLGSIGKSFKEKFSKDMKDGYKSLSDDDLLKVGVN KFKGFMQTMGTASKKASDTVKVLGKGVSKETEKALEKYVHYSEENSRIMEKVRLNSGQISEDKAKKLLKIETDLSNNLIA EIEKRNKKELEKTQELIDKYSAFDEQEKQNILTRTKEKNDLRIKKEQELNQKIKELKEKALSDGQISENERKEIEKLENQ RRDITVKELSKTEKEQERILVRMQRNRNAYSIDEASKAIKEAEKARKARKKEVDKQYEDDVIAIKNNVNLSKSEKDKLLA IADQRHKDEVRKAKSKKDAVVDVVKKQNKDIDKEMDLSSGRVYKNTEKWWNGLKSWWSNFREDQKKKSDKYAKEQEETAR RNRENIKKWFGNAWDGVKTKTGEAFSKMGRNANHFGGEMKKMWSGIKGIPSKLSSSWSSAKSSVGYHTKAIANSTGKWFG KAWQSVKSTTGSIYNQTKQKYSDASDKAWAHSKSIWKGTSKWFSNAYKSAKGWLTDMANKSRSKWDNISSTAWSNAKSVW KGTSKWFGNSYKSLKGWTGDMYSRAHDRFDAISSSAWSNAKSVFNGFRKWLSKTYDWIRDIGKDMGRAAADLGKNVANKA IGGLNSMIGGINKISKAITDKNLIKPIPTLSTGTLAGKGVATDNSGALTQPTFAVLNDRGSGNAPGGGVQEVIHRADGTF HAPQGRDVVVPLGVGDSVINANDTLKLQRMGVLPKFHGGTKKKKWMEQVTENLGKKAGDFGSKAKNTAHNIKKGAEEMVE AAGDKIKDGASWLGDKIGDVWDYVQHPGKLVNKVMSGLNINFGGGANATVKIAKGAYSLLKKKLVDKVKSWFEDFGGGGD GSYLFDHPIWQRFGSYTGGLNFNGGRHYGIDFGMPTGTNIYAVKGGIADKVWTDYGGGNSIQIKTGANEWNWYMHLSKQL ARQGQRIKAGQLIGKSGATGNFVRGAHLHFQLMQGSHPGNDTAKDPEKWLKSLKGSGVRSGSGVNKAASAWAGDIRRAAK RMGVNVTSGDVGNIISLIQHESGGNAGITQSSSLRDINVLQGNPAKGLLQYIPQTFRHYAVRGHNNIYSGYDQLLAFFNN RYWRSQFNPRGGWSPSGPRRYANGGLITKHQLAEVGEGDKQEMVIPLTRRKRAIQLTEQVMRIIGMDGKPNNITVNNDTS TVEKLLKQIVMLSDKGNKLTDALIQTVSSQDNNLGSNDAIRGLEKILSKQSGHRANANNYMGGLTN >Mature_2066_residues MNEKVEGMTLELKLDHLGVQEGMKGLKRQLGVVNSEMKANLSAFDKSEKSMEKYQARIKGLNDRLKVQKKMYSQVEDELK QVNANYQKAKSSVKDVEKAYLKLVEANKKEKLALDKSKEALKSSNTELKKAENQYKRTNQRKQDAYQKLKQLRDAEQKLK NSNQATTAQLKRASDAVQKQSAKHKALVEQYKQEGNQVQKLKVQNDNLSKSNDKIESSYAKTNTKLKQTEKEFNDLNNTI KNHSANVAKAETAVNKEKAALNNLERSIDKASSEMKTFNKEQMIAQSHFGKLASQADVMSKKFSSIGDKMTSLGRTMTMG VSTPITLGLGAALKTSADFEGQMSRVGAIAQASSKDLKSMSNQAVDLGAKTSKSANEVAKGMEELAALGFNAKQTMEAMP GVISAAEASGAEMATTATVMASAINSFGLKASDANHVADLLARSANDSAADIQYMGDALKYAGTPAKALGVSIEDTSAAI EVLSNSGLEGSQAGTALRASFIRLANPSKNTAKEMKKLGIHLSDAKGQFVGMGELIRQFQDNMKGMTREQKLATVATIVG TEAASGFLALIEAGPDKINSYSKSLKNSNGESKKAADLMKDNLKGALEQLGGAFESLAIEVGKDLTPMIRAGAEGLTKLV DGFTHLPGWVRKASVGLALFGAAIGPAVLAGGLLIRTVGSAAKGYASLNRRIAENTILSNTNSKAMKSLGLQTLFLGSTT GKTSKGFKGLAGAMMFNLKPINVLKNSAKLAILPFKLLKNGLGLAAKSLFAVSGGARFAGVALRFLTGPIGATITAITIA YKVFKTAYDRVEWFRNGINGLGETIKFFGGKIIGGAVRKLGEFKNYLGSIGKSFKEKFSKDMKDGYKSLSDDDLLKVGVN KFKGFMQTMGTASKKASDTVKVLGKGVSKETEKALEKYVHYSEENSRIMEKVRLNSGQISEDKAKKLLKIETDLSNNLIA EIEKRNKKELEKTQELIDKYSAFDEQEKQNILTRTKEKNDLRIKKEQELNQKIKELKEKALSDGQISENERKEIEKLENQ RRDITVKELSKTEKEQERILVRMQRNRNAYSIDEASKAIKEAEKARKARKKEVDKQYEDDVIAIKNNVNLSKSEKDKLLA IADQRHKDEVRKAKSKKDAVVDVVKKQNKDIDKEMDLSSGRVYKNTEKWWNGLKSWWSNFREDQKKKSDKYAKEQEETAR RNRENIKKWFGNAWDGVKTKTGEAFSKMGRNANHFGGEMKKMWSGIKGIPSKLSSSWSSAKSSVGYHTKAIANSTGKWFG KAWQSVKSTTGSIYNQTKQKYSDASDKAWAHSKSIWKGTSKWFSNAYKSAKGWLTDMANKSRSKWDNISSTAWSNAKSVW KGTSKWFGNSYKSLKGWTGDMYSRAHDRFDAISSSAWSNAKSVFNGFRKWLSKTYDWIRDIGKDMGRAAADLGKNVANKA IGGLNSMIGGINKISKAITDKNLIKPIPTLSTGTLAGKGVATDNSGALTQPTFAVLNDRGSGNAPGGGVQEVIHRADGTF HAPQGRDVVVPLGVGDSVINANDTLKLQRMGVLPKFHGGTKKKKWMEQVTENLGKKAGDFGSKAKNTAHNIKKGAEEMVE AAGDKIKDGASWLGDKIGDVWDYVQHPGKLVNKVMSGLNINFGGGANATVKIAKGAYSLLKKKLVDKVKSWFEDFGGGGD GSYLFDHPIWQRFGSYTGGLNFNGGRHYGIDFGMPTGTNIYAVKGGIADKVWTDYGGGNSIQIKTGANEWNWYMHLSKQL ARQGQRIKAGQLIGKSGATGNFVRGAHLHFQLMQGSHPGNDTAKDPEKWLKSLKGSGVRSGSGVNKAASAWAGDIRRAAK RMGVNVTSGDVGNIISLIQHESGGNAGITQSSSLRDINVLQGNPAKGLLQYIPQTFRHYAVRGHNNIYSGYDQLLAFFNN RYWRSQFNPRGGWSPSGPRRYANGGLITKHQLAEVGEGDKQEMVIPLTRRKRAIQLTEQVMRIIGMDGKPNNITVNNDTS TVEKLLKQIVMLSDKGNKLTDALIQTVSSQDNNLGSNDAIRGLEKILSKQSGHRANANNYMGGLTN
Specific function: Lyses staphylococcal cells by hydrolyzing the polyglycine interpeptide bridges of the peptidoglycan [H]
COG id: COG5283
COG function: function code S; Phage-related tail protein
Gene ontology:
Cell location: Secreted [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the peptidase M23B family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR011055 - InterPro: IPR016047 - InterPro: IPR002886 - InterPro: IPR003646 - InterPro: IPR013667 [H]
Pfam domain/function: PF01551 Peptidase_M23; PF08460 SH3_5 [H]
EC number: =3.4.24.75 [H]
Molecular weight: Translated: 226044; Mature: 226044
Theoretical pI: Translated: 10.50; Mature: 10.50
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNEKVEGMTLELKLDHLGVQEGMKGLKRQLGVVNSEMKANLSAFDKSEKSMEKYQARIKG CCCCCCCCEEEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC LNDRLKVQKKMYSQVEDELKQVNANYQKAKSSVKDVEKAYLKLVEANKKEKLALDKSKEA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH LKSSNTELKKAENQYKRTNQRKQDAYQKLKQLRDAEQKLKNSNQATTAQLKRASDAVQKQ HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SAKHKALVEQYKQEGNQVQKLKVQNDNLSKSNDKIESSYAKTNTKLKQTEKEFNDLNNTI HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNHSANVAKAETAVNKEKAALNNLERSIDKASSEMKTFNKEQMIAQSHFGKLASQADVMS HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKFSSIGDKMTSLGRTMTMGVSTPITLGLGAALKTSADFEGQMSRVGAIAQASSKDLKSM HHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SNQAVDLGAKTSKSANEVAKGMEELAALGFNAKQTMEAMPGVISAAEASGAEMATTATVM HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH ASAINSFGLKASDANHVADLLARSANDSAADIQYMGDALKYAGTPAKALGVSIEDTSAAI 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