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The map label for this gene is yabM [H]

Identifier: 57650045

GI number: 57650045

Start: 557548

End: 559074

Strand: Direct

Name: yabM [H]

Synonym: SACOL0548

Alternate gene names: 57650045

Gene position: 557548-559074 (Clockwise)

Preceding gene: 57650044

Following gene: 57650046

Centisome position: 19.85

GC content: 33.01

Gene sequence:

>1527_bases
ATGAAGCATAAAGAAGCATTTAATGGCGTTGTCGTGTTAACTGCTGCATTAATTGTCATTAAAATTCTGAGTGCTGTATA
TCGAATTCCATATCAAAATATATTAGGCGATACAGGTTTGTATGCATATCAACAAGTGTATCCAATTGTAGCATTAGGAA
TGATATTATCGATGAATGCCATTCCTAGTGCAATTACACAAAATATAGGGAAGTATCATAGTGACGAAGCATATGCAAAA
GCAGTCGCTTATATACAATTAGTTGGTATATTATTATTTATTGCTATTTTTGTGTTTGCGAACAATATTGCACATATGAT
GGGTGATGGCCATTTAACACCAATGATTCAAGCTGCAAGTTTAAGCTTTATATTTATAGGTATGCTTGGCGTGTTAAGAG
GTTATTATCAATCTGCAAATAATATGACAGTTCCGGCTATTTCCCAGGTTATAGAACAAGTTATACGAGTAGGTATTATC
ATTGTTACTATTGTTATTTTTGTAGACAGAGGTTGGACGATATATGAAGCGGGAACAATTGCTATTTTAGCATCAACGAT
AGGTTTTTTAGGTTCTTCAATTTATTTAGTAGCGCACCGACCTTTTAAGTTTAAAATGGTAAATAACACTGCAAAGATCG
TTTGGAAACAGTTCGCACTTTCGGTTTTGATTTTCGCTATCAGTCAATTAATCGTAATTTTATGGCAAGTGATTGATAGT
GTTACTATTATTAAGTCACTTCAAGCGATACGCGTGCCATTCGATGTTGCCATAACTGAAAAAGGAGTCTATGACCGTGG
TGCATCATTTATTCAGATGGGATTGATTGTAACTACAACATTTAGTTTTGCGCTCATTCCTCTGTTAAGTGACGCAATCA
AAATGAATAATCAGGTACTTATGAATCGTTATGCAAATGCGTCATTAAAGATTACGATTTTAATAAGTACAGCAGCGGGA
ATAGGATTAATTAATTTATTGCCTTTAATGAACGGTGTGTTTTTTAAGACGAATGATTTAACCTTAACGTTAAGTGTTTA
TATGATTACGGTCATTTGTGTATCGTTAATTATGATGGATATGGCATTATTACAAGCGCAACATGCTGTGAGACCTATTT
TTGTTGGTATGACGGCAGGATTGGTTATTAAATTTATACTTAATATCATTTTGATTCGTTTAAGTGGCATTATTGGTGCG
AGCATTAGTACTGTTGTATCATTAATTATATTCGGTACGATTATCCATATTGCTGTCACGAGAAAATACCACTTATATGC
GATGAGACGATTTTTTATCAATGTTGTTTTAGGTATGGTATTTATGTCGATTGTTGTTCAATGCGTGTTAAACATAGTGA
CAACACACGGTAGAATCACTGGACTCATTGAATTATTATGTGCAGCAGTATTAGGTATCATTGCATTGTTTTTCTATATT
TTTAGATTTAATGTTTTGACATATAAAGAGTTAACTTATTTACCATTTGGTTCAAAGTTGTATCAAATTAAGAAAGGAAG
ACGTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAAAATAATGCAATGACAATTACTTTAACGAAACAAAATCAATGGCTTGATAGTTTGAAGTTTTTAGTTAAGTGCATTGA
AGAAAGTATGAGAATCAGTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGCACATACCATTACGATTGTTGGCTTAGGAAACTATGGCATTGATGATTTGCCGCTAGGGATATATAAATTTTTAAAG
ACACAAGATAAAGTTTATGC

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 508; Mature: 508

Protein sequence:

>508_residues
MKHKEAFNGVVVLTAALIVIKILSAVYRIPYQNILGDTGLYAYQQVYPIVALGMILSMNAIPSAITQNIGKYHSDEAYAK
AVAYIQLVGILLFIAIFVFANNIAHMMGDGHLTPMIQAASLSFIFIGMLGVLRGYYQSANNMTVPAISQVIEQVIRVGII
IVTIVIFVDRGWTIYEAGTIAILASTIGFLGSSIYLVAHRPFKFKMVNNTAKIVWKQFALSVLIFAISQLIVILWQVIDS
VTIIKSLQAIRVPFDVAITEKGVYDRGASFIQMGLIVTTTFSFALIPLLSDAIKMNNQVLMNRYANASLKITILISTAAG
IGLINLLPLMNGVFFKTNDLTLTLSVYMITVICVSLIMMDMALLQAQHAVRPIFVGMTAGLVIKFILNIILIRLSGIIGA
SISTVVSLIIFGTIIHIAVTRKYHLYAMRRFFINVVLGMVFMSIVVQCVLNIVTTHGRITGLIELLCAAVLGIIALFFYI
FRFNVLTYKELTYLPFGSKLYQIKKGRR

Sequences:

>Translated_508_residues
MKHKEAFNGVVVLTAALIVIKILSAVYRIPYQNILGDTGLYAYQQVYPIVALGMILSMNAIPSAITQNIGKYHSDEAYAK
AVAYIQLVGILLFIAIFVFANNIAHMMGDGHLTPMIQAASLSFIFIGMLGVLRGYYQSANNMTVPAISQVIEQVIRVGII
IVTIVIFVDRGWTIYEAGTIAILASTIGFLGSSIYLVAHRPFKFKMVNNTAKIVWKQFALSVLIFAISQLIVILWQVIDS
VTIIKSLQAIRVPFDVAITEKGVYDRGASFIQMGLIVTTTFSFALIPLLSDAIKMNNQVLMNRYANASLKITILISTAAG
IGLINLLPLMNGVFFKTNDLTLTLSVYMITVICVSLIMMDMALLQAQHAVRPIFVGMTAGLVIKFILNIILIRLSGIIGA
SISTVVSLIIFGTIIHIAVTRKYHLYAMRRFFINVVLGMVFMSIVVQCVLNIVTTHGRITGLIELLCAAVLGIIALFFYI
FRFNVLTYKELTYLPFGSKLYQIKKGRR
>Mature_508_residues
MKHKEAFNGVVVLTAALIVIKILSAVYRIPYQNILGDTGLYAYQQVYPIVALGMILSMNAIPSAITQNIGKYHSDEAYAK
AVAYIQLVGILLFIAIFVFANNIAHMMGDGHLTPMIQAASLSFIFIGMLGVLRGYYQSANNMTVPAISQVIEQVIRVGII
IVTIVIFVDRGWTIYEAGTIAILASTIGFLGSSIYLVAHRPFKFKMVNNTAKIVWKQFALSVLIFAISQLIVILWQVIDS
VTIIKSLQAIRVPFDVAITEKGVYDRGASFIQMGLIVTTTFSFALIPLLSDAIKMNNQVLMNRYANASLKITILISTAAG
IGLINLLPLMNGVFFKTNDLTLTLSVYMITVICVSLIMMDMALLQAQHAVRPIFVGMTAGLVIKFILNIILIRLSGIIGA
SISTVVSLIIFGTIIHIAVTRKYHLYAMRRFFINVVLGMVFMSIVVQCVLNIVTTHGRITGLIELLCAAVLGIIALFFYI
FRFNVLTYKELTYLPFGSKLYQIKKGRR

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56091; Mature: 56091

Theoretical pI: Translated: 10.21; Mature: 10.21

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKHKEAFNGVVVLTAALIVIKILSAVYRIPYQNILGDTGLYAYQQVYPIVALGMILSMNA
CCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPSAITQNIGKYHSDEAYAKAVAYIQLVGILLFIAIFVFANNIAHMMGDGHLTPMIQAAS
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
LSFIFIGMLGVLRGYYQSANNMTVPAISQVIEQVIRVGIIIVTIVIFVDRGWTIYEAGTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHH
AILASTIGFLGSSIYLVAHRPFKFKMVNNTAKIVWKQFALSVLIFAISQLIVILWQVIDS
HHHHHHHHHHCCCEEEEEECCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTIIKSLQAIRVPFDVAITEKGVYDRGASFIQMGLIVTTTFSFALIPLLSDAIKMNNQVL
HHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
MNRYANASLKITILISTAAGIGLINLLPLMNGVFFKTNDLTLTLSVYMITVICVSLIMMD
HHHHCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCEEEECCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MALLQAQHAVRPIFVGMTAGLVIKFILNIILIRLSGIIGASISTVVSLIIFGTIIHIAVT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RKYHLYAMRRFFINVVLGMVFMSIVVQCVLNIVTTHGRITGLIELLCAAVLGIIALFFYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FRFNVLTYKELTYLPFGSKLYQIKKGRR
HHHHHHEEHHEEECCCCHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKHKEAFNGVVVLTAALIVIKILSAVYRIPYQNILGDTGLYAYQQVYPIVALGMILSMNA
CCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPSAITQNIGKYHSDEAYAKAVAYIQLVGILLFIAIFVFANNIAHMMGDGHLTPMIQAAS
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
LSFIFIGMLGVLRGYYQSANNMTVPAISQVIEQVIRVGIIIVTIVIFVDRGWTIYEAGTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHH
AILASTIGFLGSSIYLVAHRPFKFKMVNNTAKIVWKQFALSVLIFAISQLIVILWQVIDS
HHHHHHHHHHCCCEEEEEECCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTIIKSLQAIRVPFDVAITEKGVYDRGASFIQMGLIVTTTFSFALIPLLSDAIKMNNQVL
HHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
MNRYANASLKITILISTAAGIGLINLLPLMNGVFFKTNDLTLTLSVYMITVICVSLIMMD
HHHHCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCEEEECCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MALLQAQHAVRPIFVGMTAGLVIKFILNIILIRLSGIIGASISTVVSLIIFGTIIHIAVT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RKYHLYAMRRFFINVVLGMVFMSIVVQCVLNIVTTHGRITGLIELLCAAVLGIIALFFYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FRFNVLTYKELTYLPFGSKLYQIKKGRR
HHHHHHEEHHEEECCCCHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7584024; 9384377 [H]