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The map label for this gene is 52842716

Identifier: 52842716

GI number: 52842716

Start: 2827446

End: 2829869

Strand: Reverse

Name: 52842716

Synonym: lpg2508

Alternate gene names: NA

Gene position: 2829869-2827446 (Counterclockwise)

Preceding gene: 52842717

Following gene: 52842715

Centisome position: 83.29

GC content: 38.16

Gene sequence:

>2424_bases
ATGTTTAGTTATCTGGATAAATTATTAGATGGAATATTTGGATACCAAAAGTCAGATACTAGTCAGTTAAGCACCTCAAC
GCCACCTACTCTAACTACTGTTCCTTTGAAACAAGAATATTTTGTAAAAATTGGGGAAAGTGAAACACAGGATCTAGGCT
TACTGCCAGTGGTTAGCAAGCGACATAATCAATCAGTTCCCTTGGAGGAAATTCCTTTTGAGGATACCAGACTTGAGTTG
ATTGAGCTTTATATTGCATTGTTAAAACAATGTGTTTTAGATGAAAAACTGAAGAGTATCCCTGCGCAGTATCTTATATC
TCATTATCTTTTTATAAAAACCTTAGCCGCAAACGAGGGAAATAAAGGTCGAAAAGATCTGTATCTTAATTTATCTCAAA
AAGTGGCTGATTATCTTGAAAAAAATGAATCTAAAATATGGAGTATGGCTGTTGAATGCGCTAAAACCAGTGAGTATCCC
ATAGTTGACTGGATAAAAAAGCACCATCTTCATTTTAATTTTATAAGAGCTTTTATACTGGATTACAATAAAAAATCATT
GACTCATAATCAACGTGCGTTTATGCAGCAGTTTAGGGATTCTGCTGCTTTTTTCTTTCCTGATCAGGTTTACCTTGCTT
GGCTTACCCAATCCTATGAACCAGGCTCTATCTTGAATCCTATGTACAGGGAGAGCAGATCAACGCATTATTATCACGCG
AACATTACTGATAATCTCTTGTTAAGAACACGCCCCAAACAGGTCAATTTTGGTCCTCAACATTTTTTCCAAAAAGGAAA
AGGCCCCGTCAAGAATACTTATCGTTTCAATATCAATGACGGAAAATTAATGCGCATACAGGGAAGAACATTACTTTTTA
GCACGAATAAAGGCAATGAAGTGATTGCTGTAAAGGTGCAAAAAAAAGGGGAACCGCAATCTGCTTTAAGTAATGAATTT
CAAATGGCAGATTATTTGTTGAAACATCAACGCCGTTTGAATTTGCAAAGTCAATTACCTACCCCTCTCAGCCAATATTC
AATTAATCGAACAGAGATTCTCGAAAAATGCAGTAAATCACCTGATTTTGAGAAGTTCAAGAATTTGATAAGTGATGCAA
AAAGCCTTGAAATTTATGTTTATAAAGCAACACCTTCTTATTTTACTTATCTGCATGATAAGCAGCAGAGCTTTAGTCAA
CTCACTTCATCAGTGCAGAAAAATGTACATGATCTTTTCGTGCTCCTGAGAGAGGGCATAGTCTTTCCTTATCTGGCAGA
TATGTTTCACACCCATATTGATGAGAGTAAAAGGAGCGATAAGGGTCGATATCAGACGTTAGTTGAGCTTTTAAGTGCTT
TGCAATCACAAATGGGCCGTCTTGATAAATGGCAAAAAGCAGTCGAATTTGTTAACTTACGAGCCAGCGGTATCGCTGAT
TTGGGTGACAATCTTCCGTTGACCAGCTTCTTAACTGTTTCTGACTGGACGAAGCATTATCATGCGGAATTGCTAACGGG
CGTTTACCATCCATCCTTTCTATTCCTCGATAAATCCAGTGGCTCGGTTCGCTCCTTGTTTAACAGCCGGCGCAAAATAT
TCGGCAATTATTTGTATCTGAATATCATCGCTGAGTATCTATTAGTTATTCAATTGGTAATTGGCTGTTATGGCGATAAA
GTGACCCGTAAAATGAATAGTAAAAGCAAAGCTAAGGTTTGGGAGCATTTAGCCGAATTGATGTTTTCCAGTTGTGCTGA
AGCGGTTAATTTGATAACTGGTATGCCCAAATCCAGGGCACTTGCTTTTTTAAAGCAAAGAGCCAATGTAAGAAAACATA
CTCAACAAACGTCGTTTTGGATGACTCCTGATTATTCGAATCTGGATAGGCTGAGTGTGCAGTCTCAACAATCCACTTTG
TACCCCGGCGAATCAGATTATGAAATAAACAGTGATTTAATTTCGGGGGTCGGTCTGAGTCTTGATGGCATCAATCAGGA
TTTGGGTGATTATAACCAGGCAAGCCCTTTAAGGGAGCTAGAGAAATTATTGTATGCTACAGTGACCTTAATAGAGGGAA
CCCAGCAACTGGATAAGCAATTTTTTCAACAGTTGGATGAAACTGAGAAAATGATTTTGAGTGCTGCTGGAGTTGATAAA
TGCTATCAAGCTGTCGCAAAACTCCTGGATCTTGCTCGGCCTGGTTGTCAAATGCAGCGAAGATTGGCTTTTACTTATTA
TGAAATGATCAAAAGAATATATCCCTGCTCAAATCCCGCAGATGTGAGATTTGAACTTGTTGCAAAAGAAGAGGCGATTA
TAAAAATTCAGCGTTTTTGGCGAGAGCATAAAAAAGAAAACCAATCGCTTGAAAAAGGGTTTGATTTTGACAGGAACACT
AGTTCATCGCAGTCGCCTTTATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCAACAACGGAGAAGACTAATAAACCTTAGCCTGTTTTATTTAAAGTAATAGAGAAACGGATTCACTTAGGGAATTAAAA
CGCAATGAGGTGTTGTAACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGGGTCATTTCAATTGTAAGAGATCATCCCCAAGATCGTTAGAGGATATTTCAACATCAGGGCACTGACCTGTTACTTT
TAATTTTGGAAAATTAAAAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 807; Mature: 807

Protein sequence:

>807_residues
MFSYLDKLLDGIFGYQKSDTSQLSTSTPPTLTTVPLKQEYFVKIGESETQDLGLLPVVSKRHNQSVPLEEIPFEDTRLEL
IELYIALLKQCVLDEKLKSIPAQYLISHYLFIKTLAANEGNKGRKDLYLNLSQKVADYLEKNESKIWSMAVECAKTSEYP
IVDWIKKHHLHFNFIRAFILDYNKKSLTHNQRAFMQQFRDSAAFFFPDQVYLAWLTQSYEPGSILNPMYRESRSTHYYHA
NITDNLLLRTRPKQVNFGPQHFFQKGKGPVKNTYRFNINDGKLMRIQGRTLLFSTNKGNEVIAVKVQKKGEPQSALSNEF
QMADYLLKHQRRLNLQSQLPTPLSQYSINRTEILEKCSKSPDFEKFKNLISDAKSLEIYVYKATPSYFTYLHDKQQSFSQ
LTSSVQKNVHDLFVLLREGIVFPYLADMFHTHIDESKRSDKGRYQTLVELLSALQSQMGRLDKWQKAVEFVNLRASGIAD
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VTRKMNSKSKAKVWEHLAELMFSSCAEAVNLITGMPKSRALAFLKQRANVRKHTQQTSFWMTPDYSNLDRLSVQSQQSTL
YPGESDYEINSDLISGVGLSLDGINQDLGDYNQASPLRELEKLLYATVTLIEGTQQLDKQFFQQLDETEKMILSAAGVDK
CYQAVAKLLDLARPGCQMQRRLAFTYYEMIKRIYPCSNPADVRFELVAKEEAIIKIQRFWREHKKENQSLEKGFDFDRNT
SSSQSPL

Sequences:

>Translated_807_residues
MFSYLDKLLDGIFGYQKSDTSQLSTSTPPTLTTVPLKQEYFVKIGESETQDLGLLPVVSKRHNQSVPLEEIPFEDTRLEL
IELYIALLKQCVLDEKLKSIPAQYLISHYLFIKTLAANEGNKGRKDLYLNLSQKVADYLEKNESKIWSMAVECAKTSEYP
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NITDNLLLRTRPKQVNFGPQHFFQKGKGPVKNTYRFNINDGKLMRIQGRTLLFSTNKGNEVIAVKVQKKGEPQSALSNEF
QMADYLLKHQRRLNLQSQLPTPLSQYSINRTEILEKCSKSPDFEKFKNLISDAKSLEIYVYKATPSYFTYLHDKQQSFSQ
LTSSVQKNVHDLFVLLREGIVFPYLADMFHTHIDESKRSDKGRYQTLVELLSALQSQMGRLDKWQKAVEFVNLRASGIAD
LGDNLPLTSFLTVSDWTKHYHAELLTGVYHPSFLFLDKSSGSVRSLFNSRRKIFGNYLYLNIIAEYLLVIQLVIGCYGDK
VTRKMNSKSKAKVWEHLAELMFSSCAEAVNLITGMPKSRALAFLKQRANVRKHTQQTSFWMTPDYSNLDRLSVQSQQSTL
YPGESDYEINSDLISGVGLSLDGINQDLGDYNQASPLRELEKLLYATVTLIEGTQQLDKQFFQQLDETEKMILSAAGVDK
CYQAVAKLLDLARPGCQMQRRLAFTYYEMIKRIYPCSNPADVRFELVAKEEAIIKIQRFWREHKKENQSLEKGFDFDRNT
SSSQSPL
>Mature_807_residues
MFSYLDKLLDGIFGYQKSDTSQLSTSTPPTLTTVPLKQEYFVKIGESETQDLGLLPVVSKRHNQSVPLEEIPFEDTRLEL
IELYIALLKQCVLDEKLKSIPAQYLISHYLFIKTLAANEGNKGRKDLYLNLSQKVADYLEKNESKIWSMAVECAKTSEYP
IVDWIKKHHLHFNFIRAFILDYNKKSLTHNQRAFMQQFRDSAAFFFPDQVYLAWLTQSYEPGSILNPMYRESRSTHYYHA
NITDNLLLRTRPKQVNFGPQHFFQKGKGPVKNTYRFNINDGKLMRIQGRTLLFSTNKGNEVIAVKVQKKGEPQSALSNEF
QMADYLLKHQRRLNLQSQLPTPLSQYSINRTEILEKCSKSPDFEKFKNLISDAKSLEIYVYKATPSYFTYLHDKQQSFSQ
LTSSVQKNVHDLFVLLREGIVFPYLADMFHTHIDESKRSDKGRYQTLVELLSALQSQMGRLDKWQKAVEFVNLRASGIAD
LGDNLPLTSFLTVSDWTKHYHAELLTGVYHPSFLFLDKSSGSVRSLFNSRRKIFGNYLYLNIIAEYLLVIQLVIGCYGDK
VTRKMNSKSKAKVWEHLAELMFSSCAEAVNLITGMPKSRALAFLKQRANVRKHTQQTSFWMTPDYSNLDRLSVQSQQSTL
YPGESDYEINSDLISGVGLSLDGINQDLGDYNQASPLRELEKLLYATVTLIEGTQQLDKQFFQQLDETEKMILSAAGVDK
CYQAVAKLLDLARPGCQMQRRLAFTYYEMIKRIYPCSNPADVRFELVAKEEAIIKIQRFWREHKKENQSLEKGFDFDRNT
SSSQSPL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 93117; Mature: 93117

Theoretical pI: Translated: 9.18; Mature: 9.18

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFSYLDKLLDGIFGYQKSDTSQLSTSTPPTLTTVPLKQEYFVKIGESETQDLGLLPVVSK
CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHEEECCCCCCCCCCCHHHHC
RHNQSVPLEEIPFEDTRLELIELYIALLKQCVLDEKLKSIPAQYLISHYLFIKTLAANEG
CCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
NKGRKDLYLNLSQKVADYLEKNESKIWSMAVECAKTSEYPIVDWIKKHHLHFNFIRAFIL
CCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
DYNKKSLTHNQRAFMQQFRDSAAFFFPDQVYLAWLTQSYEPGSILNPMYRESRSTHYYHA
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCCEEEEC
NITDNLLLRTRPKQVNFGPQHFFQKGKGPVKNTYRFNINDGKLMRIQGRTLLFSTNKGNE
CCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCEEEEEECCEEEEECCCCCE
VIAVKVQKKGEPQSALSNEFQMADYLLKHQRRLNLQSQLPTPLSQYSINRTEILEKCSKS
EEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHCC
PDFEKFKNLISDAKSLEIYVYKATPSYFTYLHDKQQSFSQLTSSVQKNVHDLFVLLREGI
CCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VFPYLADMFHTHIDESKRSDKGRYQTLVELLSALQSQMGRLDKWQKAVEFVNLRASGIAD
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
LGDNLPLTSFLTVSDWTKHYHAELLTGVYHPSFLFLDKSSGSVRSLFNSRRKIFGNYLYL
CCCCCCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIIAEYLLVIQLVIGCYGDKVTRKMNSKSKAKVWEHLAELMFSSCAEAVNLITGMPKSRA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
LAFLKQRANVRKHTQQTSFWMTPDYSNLDRLSVQSQQSTLYPGESDYEINSDLISGVGLS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCC
LDGINQDLGDYNQASPLRELEKLLYATVTLIEGTQQLDKQFFQQLDETEKMILSAAGVDK
CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
CYQAVAKLLDLARPGCQMQRRLAFTYYEMIKRIYPCSNPADVRFELVAKEEAIIKIQRFW
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHH
REHKKENQSLEKGFDFDRNTSSSQSPL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFSYLDKLLDGIFGYQKSDTSQLSTSTPPTLTTVPLKQEYFVKIGESETQDLGLLPVVSK
CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHEEECCCCCCCCCCCHHHHC
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NKGRKDLYLNLSQKVADYLEKNESKIWSMAVECAKTSEYPIVDWIKKHHLHFNFIRAFIL
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DYNKKSLTHNQRAFMQQFRDSAAFFFPDQVYLAWLTQSYEPGSILNPMYRESRSTHYYHA
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PDFEKFKNLISDAKSLEIYVYKATPSYFTYLHDKQQSFSQLTSSVQKNVHDLFVLLREGI
CCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VFPYLADMFHTHIDESKRSDKGRYQTLVELLSALQSQMGRLDKWQKAVEFVNLRASGIAD
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NIIAEYLLVIQLVIGCYGDKVTRKMNSKSKAKVWEHLAELMFSSCAEAVNLITGMPKSRA
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CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
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HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHH
REHKKENQSLEKGFDFDRNTSSSQSPL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA