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The map label for this gene is 15897996

Identifier: 15897996

GI number: 15897996

Start: 977985

End: 979136

Strand: Reverse

Name: 15897996

Synonym: SSO1140

Alternate gene names: NA

Gene position: 979136-977985 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15897997

Following gene: 15897984

Centisome position: 32.72

GC content: 36.81

Gene sequence:

>1152_bases
ATGCTTAAAAACAGAAACGAAGTCTTGAAAATCTCCTTTTCAGCCTTTTTCGCTGATCTTGGATACCAGGCTGTAGTAGC
CTCTTTTCCAATAATTTTCGTATTGATCTTTAAAGCTCCAATTCCCCTTTATGGTTTTGCTGAGGCATTAAATTACGGGA
TTGGTACTGTTATGGCTTATGCTGGAGGTTTAGCTGGGGATAGGTTTGGGAGAAAAAGGATTGCTATTCTTGGAAATGTT
CTTATTCTATTTACTTCCCTAATAGGACTATCTAGGGATTACATTCAAGCCCTCATATTCTTCATGATAGGGTGGTGGTT
TAGGAACTTTAGATCACCACCAAGAAGGGCGATGATGGCTGAAGTCACATCACCGGAAGAGAGATCTGAGGCATTTGGAA
TTTTGCATTCTTTAGACATCGCTGGTGCGTTAATAGCAATAATTTATCTAACTGTATTACTTTACCTTCGCGTTTCCATC
TTTTTTGTTCTTTTATTCACCTCAATACCTTTGCTTATGTCAACAATTGTTTTAACCATGGTAAATGCTGGGAAGAAAAG
TGAGAAAGCGAAGAGAAAAGAAGCAGAAAGTAAAATAACCCAAAAAAGGGTCTTCTGGACTCTTATATTATCTACAATGT
TCTTCGGATTTAGTCAGTACAGCTTTGGATTTCCTATTCTAACTACAACAGAGATTACTGGAAAGGAGTATTTGGGAGTA
TTATCTTATGGCATATTTCTTGGCGCTTCCTCTTTATTTGGGTACCTATTTGGTAGAATAAGAATGAAAGAATTTGAAAG
TTTAGCATTTCTAGGATATTTAATTGGAGCACTAGGATCTCTGGGGTTTGCGTATTTATCGAGTTTTGGAGTGTTTTCCC
TTTATCCTCTCTCTTTCTTAATGGGAACTAGTGTCGCCTCAACTGAGACTTTTGAACCTACCATAATATCGAAGATAACT
AAAGAAGAAGCATTTAGTACAAGTATGGGCTACTTATCAGCAGGTAGAAGTATTGGGATATTTCTTGGTAATGTAATAAT
GGGGTTCTTATATCAAATAAGCTATACATATGCGTATCTATTCGCCGCTATAACTTCGTTAATCTCCTTTGCACTAATCT
TAAACTTGATCATGAGACCAAATGCTTCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGTATTATAGCAATAGTTCTGGCAATATTGGCTCTAGTAAGAAGGAGAAGGTAAGATATAATCATTATTTTTATTACTAT
TTTTCCTCCTTATTTTTAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGTAGATTTTAAACAACGCACTACCTATCAATGTGGTAAATATTGACATGAAAACTATACCCTCAAATTCCTCTTGGTTT
AGTGCGTTATATGAAAGGCC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 383; Mature: 383

Protein sequence:

>383_residues
MLKNRNEVLKISFSAFFADLGYQAVVASFPIIFVLIFKAPIPLYGFAEALNYGIGTVMAYAGGLAGDRFGRKRIAILGNV
LILFTSLIGLSRDYIQALIFFMIGWWFRNFRSPPRRAMMAEVTSPEERSEAFGILHSLDIAGALIAIIYLTVLLYLRVSI
FFVLLFTSIPLLMSTIVLTMVNAGKKSEKAKRKEAESKITQKRVFWTLILSTMFFGFSQYSFGFPILTTTEITGKEYLGV
LSYGIFLGASSLFGYLFGRIRMKEFESLAFLGYLIGALGSLGFAYLSSFGVFSLYPLSFLMGTSVASTETFEPTIISKIT
KEEAFSTSMGYLSAGRSIGIFLGNVIMGFLYQISYTYAYLFAAITSLISFALILNLIMRPNAS

Sequences:

>Translated_383_residues
MLKNRNEVLKISFSAFFADLGYQAVVASFPIIFVLIFKAPIPLYGFAEALNYGIGTVMAYAGGLAGDRFGRKRIAILGNV
LILFTSLIGLSRDYIQALIFFMIGWWFRNFRSPPRRAMMAEVTSPEERSEAFGILHSLDIAGALIAIIYLTVLLYLRVSI
FFVLLFTSIPLLMSTIVLTMVNAGKKSEKAKRKEAESKITQKRVFWTLILSTMFFGFSQYSFGFPILTTTEITGKEYLGV
LSYGIFLGASSLFGYLFGRIRMKEFESLAFLGYLIGALGSLGFAYLSSFGVFSLYPLSFLMGTSVASTETFEPTIISKIT
KEEAFSTSMGYLSAGRSIGIFLGNVIMGFLYQISYTYAYLFAAITSLISFALILNLIMRPNAS
>Mature_383_residues
MLKNRNEVLKISFSAFFADLGYQAVVASFPIIFVLIFKAPIPLYGFAEALNYGIGTVMAYAGGLAGDRFGRKRIAILGNV
LILFTSLIGLSRDYIQALIFFMIGWWFRNFRSPPRRAMMAEVTSPEERSEAFGILHSLDIAGALIAIIYLTVLLYLRVSI
FFVLLFTSIPLLMSTIVLTMVNAGKKSEKAKRKEAESKITQKRVFWTLILSTMFFGFSQYSFGFPILTTTEITGKEYLGV
LSYGIFLGASSLFGYLFGRIRMKEFESLAFLGYLIGALGSLGFAYLSSFGVFSLYPLSFLMGTSVASTETFEPTIISKIT
KEEAFSTSMGYLSAGRSIGIFLGNVIMGFLYQISYTYAYLFAAITSLISFALILNLIMRPNAS

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 42513; Mature: 42513

Theoretical pI: Translated: 9.97; Mature: 9.97

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
3.4 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKNRNEVLKISFSAFFADLGYQAVVASFPIIFVLIFKAPIPLYGFAEALNYGIGTVMAY
CCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AGGLAGDRFGRKRIAILGNVLILFTSLIGLSRDYIQALIFFMIGWWFRNFRSPPRRAMMA
HCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
EVTSPEERSEAFGILHSLDIAGALIAIIYLTVLLYLRVSIFFVLLFTSIPLLMSTIVLTM
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VNAGKKSEKAKRKEAESKITQKRVFWTLILSTMFFGFSQYSFGFPILTTTEITGKEYLGV
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHH
LSYGIFLGASSLFGYLFGRIRMKEFESLAFLGYLIGALGSLGFAYLSSFGVFSLYPLSFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
MGTSVASTETFEPTIISKITKEEAFSTSMGYLSAGRSIGIFLGNVIMGFLYQISYTYAYL
HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FAAITSLISFALILNLIMRPNAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLKNRNEVLKISFSAFFADLGYQAVVASFPIIFVLIFKAPIPLYGFAEALNYGIGTVMAY
CCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AGGLAGDRFGRKRIAILGNVLILFTSLIGLSRDYIQALIFFMIGWWFRNFRSPPRRAMMA
HCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
EVTSPEERSEAFGILHSLDIAGALIAIIYLTVLLYLRVSIFFVLLFTSIPLLMSTIVLTM
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VNAGKKSEKAKRKEAESKITQKRVFWTLILSTMFFGFSQYSFGFPILTTTEITGKEYLGV
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHH
LSYGIFLGASSLFGYLFGRIRMKEFESLAFLGYLIGALGSLGFAYLSSFGVFSLYPLSFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
MGTSVASTETFEPTIISKITKEEAFSTSMGYLSAGRSIGIFLGNVIMGFLYQISYTYAYL
HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FAAITSLISFALILNLIMRPNAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]