Definition | Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403, complete genome. |
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Accession | NC_002662 |
Length | 2,365,589 |
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The map label for this gene is yieH
Identifier: 15672817
GI number: 15672817
Start: 848313
End: 850964
Strand: Reverse
Name: yieH
Synonym: L48341
Alternate gene names: NA
Gene position: 850964-848313 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15672818
Following gene: 15672807
Centisome position: 35.97
GC content: 35.07
Gene sequence:
>2652_bases ATGAAATTTATCAAGAAAAATAAATGGGCACTTCTTGCAAGTTTTTTTATTCCATTATTATTAATGGTTATCGTTCTTGC AATGACTGGGATTTATTGGGGGAGTTCACGGTCAATTTTGGCTGGGGATGCATATCATCAGTATGTCGCCATTCATTCTC TCTATCGTAATATTTTACATTCGGGCGGTTCTTCTGGTTTCTTATATACTTTTACCAGTGGTCTCGGCCTCAATCTTTAT GCTTTTTCGGCTTACTACATGGGAAGTTTTCTCATGCCACTTACATTTTTCTTTGATGTAAAATCAATGCCTGATGCTTT ATATTTACTGACCATACTAAAATTTGGCTTGATTGGTCTATCAGCATTTGTCAGTTTCAAAAACATGTATCAAAAGCTTT CTAAATTGATTGTCTTGTCAATAAGTACAGCTTTCGCACTGATGAGTTTTTTGACCTCACAGCTTGAAATTACGATGTGG TTAGATGTTTTCATTCTCTTGCCTCTAATTATTTGGGGACTTCATCGCTTAATGGATGAACGAAAACGCTGGCTTTATTT CGTTAGTTTATTGATTCTATTTATCCAAAATTATTATTTTGGCTTTATGGTGGCTATTTTCTTAGTGCTCTATTTCTTGG CACGGATGACTTACGAAAAATGGTCTTGGACAAAAGTGCTTGATTTTGTGGTTTCTTCTGCTTTAGCTGGTCTGTCCAGC CTAATCATGCTCTTACCCATGTATCTTGATTTGAAGTCTCATAATTCCGATGCTCTTTCAACTTTGTCAGGTGTCTTTAC AGAAAATTCTCATCTTTTTGACCTTTTCGCTAAGAATTTTGTTGGCACTTATGATACTACTCAATTCAATGCCATTCCAA TGATTTATGTTGGAATGATGCCTTTAGCTTTGGCTATTCTCTTCTTTTTCACTAAAAGTATTCGTCTCAGAAGTAAATTT GCCTTTCTAGGAATCATTGCTTTCTTTGTTGCTTCATTTTATCTTCAAGCTTTAGATTTACTATGGCAAGGGATGCATTC ACCAAATATGTTCTTGCACCGCTATGCTTTCTTATTTAGTTTGCTTCTTGTTTTAATGGCTTTGGAAACTCTATCTCGCT GGGAGGAAATAAAGACTTGGCATATTTTGACTATTAGTCTTTTTCTAATTACAGGTTTTCTTGCTACTTTAATTTTTGGA CACTATAAATATGTAATGACTTCTCAAGTTATGTTGACTTTCTTGTTTGGTCTTGCTTATTTAATCTTGTCTATTAATTC TGTTAGGAAATGGATTTCAGCTCATCTATTTGTCATTATCCTCTTTGTTTTCATGACTGTTGAAGCTGGTGTTAATGCCC TTTATCAGGTTCAAGGAATACAAAAAGAGTGGAATTTTGCTAGTCGTGATTACTATAATACCCAAGTGAATTCTATAGAA CCGATTGCCAATAAGGTGAATGAACTTACTGGTTCTGGTTTTGCCAGAATGGATAACACTGTTCCTGATACAGCAAATGA TGGCATGAAGTACAATTTTAATGCACTTTCCCAATTTTCATCTGTTCGTAACAGCAACGCCAGTTCAATCATGCGTCAAT TAGGTTTTCACACTGACAGTACTTATTTGAATTTACGTTATCCTGGGAATACATTACTGATGGATTCGATTTTTGGAATT AAATATAATATAAGCCAAGCTCAACCTCCAAAATTTGGATTTTCACCAGTTTCCAATGCTCTCAGTAATTTGAGCAAAAA CTCAAATGCGATGGGTCTTGGTGTCTTCGTTCCCAATGGATTTGAAGATGCTAAATTCACTGATAAAGCTCAAGCTAGCA GCTTTATTAATAATCAAACAGCTTTAGTTAACGCTTTGACAAAATCGAAAACTACATTCTTTACTCCATTTTACACGACC AGTGAAGAAACTGCTGATAAAATCACGGGTGCTGGCAATTCTGTTACTCTGACTCGGCCAAAAACTTCTACAGCTACTGA TGTTTCAGTCACCTACGGAATTACCGTGGCGGCAAATAGTCAAATTTATTTATCTGTTCCCAATATTACTTATCTAAATA GTAATGCTGAAAATACATTGATTACTATTTCTGATGTTTCCAATCCAAAAATGACACGTTCTCTCAATAGTTATTACGTT GGTACAAATGATACTGGCTCCTTCTTGAATTTAGGAAGTTTCAGTAAGGAAACTAAGCTAAAAGTGACCTTAGCATTTCC GGAAAATTCACAAGTTACTTTTGATACCACTTCATTCTGGCGTCTGGACACTGAAGCTTATCAAAAAGAAATGGCACTTC TACAATCTCGTAGTCCTAAAACAGAAATGATTAAAAACGGGGTTCGCATGACTTATAGAGAAAAAGAAAAGGGCGATATT TTCTTGACAATTCCTTATGATAAAGGCTGGTCAGCAAAAGTTGATGGAAAAAAAGTGGCTGTCAGTAAAGCTCAATCTGG TTTTATGAAAGTTAGCGTTCCTGCTGGCAGTCATCGTCTTGAACTAAAATTCTTCCCTAATGGACTAAAAGAAGGAATCA TTTGCTTTATTTTAGGAATTCTGTTATTTATTGGTTACAACTATTTTACTAATAAACCTAAAAAATCTGGAGGAACAAAA AATGAAAGCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTAGAAATCGTTTAGATAAAAAGTACTGACAGGTTTGTCAGTATTTTTTTAATACACTTAATATAAGTTTGATTTTTGT ATCTTTGGTATAATAGAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATCAATTATCCCCTTTACGCTCGGAATCCTAGTTGCTGTCAGCATCCCTGTTTCCTATTCTTTAAAGACCAAACATTTTG AAGTCAATTTCAAAAAAGGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 883; Mature: 883
Protein sequence:
>883_residues MKFIKKNKWALLASFFIPLLLMVIVLAMTGIYWGSSRSILAGDAYHQYVAIHSLYRNILHSGGSSGFLYTFTSGLGLNLY AFSAYYMGSFLMPLTFFFDVKSMPDALYLLTILKFGLIGLSAFVSFKNMYQKLSKLIVLSISTAFALMSFLTSQLEITMW LDVFILLPLIIWGLHRLMDERKRWLYFVSLLILFIQNYYFGFMVAIFLVLYFLARMTYEKWSWTKVLDFVVSSALAGLSS LIMLLPMYLDLKSHNSDALSTLSGVFTENSHLFDLFAKNFVGTYDTTQFNAIPMIYVGMMPLALAILFFFTKSIRLRSKF AFLGIIAFFVASFYLQALDLLWQGMHSPNMFLHRYAFLFSLLLVLMALETLSRWEEIKTWHILTISLFLITGFLATLIFG HYKYVMTSQVMLTFLFGLAYLILSINSVRKWISAHLFVIILFVFMTVEAGVNALYQVQGIQKEWNFASRDYYNTQVNSIE PIANKVNELTGSGFARMDNTVPDTANDGMKYNFNALSQFSSVRNSNASSIMRQLGFHTDSTYLNLRYPGNTLLMDSIFGI KYNISQAQPPKFGFSPVSNALSNLSKNSNAMGLGVFVPNGFEDAKFTDKAQASSFINNQTALVNALTKSKTTFFTPFYTT SEETADKITGAGNSVTLTRPKTSTATDVSVTYGITVAANSQIYLSVPNITYLNSNAENTLITISDVSNPKMTRSLNSYYV GTNDTGSFLNLGSFSKETKLKVTLAFPENSQVTFDTTSFWRLDTEAYQKEMALLQSRSPKTEMIKNGVRMTYREKEKGDI FLTIPYDKGWSAKVDGKKVAVSKAQSGFMKVSVPAGSHRLELKFFPNGLKEGIICFILGILLFIGYNYFTNKPKKSGGTK NES
Sequences:
>Translated_883_residues MKFIKKNKWALLASFFIPLLLMVIVLAMTGIYWGSSRSILAGDAYHQYVAIHSLYRNILHSGGSSGFLYTFTSGLGLNLY AFSAYYMGSFLMPLTFFFDVKSMPDALYLLTILKFGLIGLSAFVSFKNMYQKLSKLIVLSISTAFALMSFLTSQLEITMW LDVFILLPLIIWGLHRLMDERKRWLYFVSLLILFIQNYYFGFMVAIFLVLYFLARMTYEKWSWTKVLDFVVSSALAGLSS LIMLLPMYLDLKSHNSDALSTLSGVFTENSHLFDLFAKNFVGTYDTTQFNAIPMIYVGMMPLALAILFFFTKSIRLRSKF AFLGIIAFFVASFYLQALDLLWQGMHSPNMFLHRYAFLFSLLLVLMALETLSRWEEIKTWHILTISLFLITGFLATLIFG HYKYVMTSQVMLTFLFGLAYLILSINSVRKWISAHLFVIILFVFMTVEAGVNALYQVQGIQKEWNFASRDYYNTQVNSIE PIANKVNELTGSGFARMDNTVPDTANDGMKYNFNALSQFSSVRNSNASSIMRQLGFHTDSTYLNLRYPGNTLLMDSIFGI KYNISQAQPPKFGFSPVSNALSNLSKNSNAMGLGVFVPNGFEDAKFTDKAQASSFINNQTALVNALTKSKTTFFTPFYTT SEETADKITGAGNSVTLTRPKTSTATDVSVTYGITVAANSQIYLSVPNITYLNSNAENTLITISDVSNPKMTRSLNSYYV GTNDTGSFLNLGSFSKETKLKVTLAFPENSQVTFDTTSFWRLDTEAYQKEMALLQSRSPKTEMIKNGVRMTYREKEKGDI FLTIPYDKGWSAKVDGKKVAVSKAQSGFMKVSVPAGSHRLELKFFPNGLKEGIICFILGILLFIGYNYFTNKPKKSGGTK NES >Mature_883_residues MKFIKKNKWALLASFFIPLLLMVIVLAMTGIYWGSSRSILAGDAYHQYVAIHSLYRNILHSGGSSGFLYTFTSGLGLNLY AFSAYYMGSFLMPLTFFFDVKSMPDALYLLTILKFGLIGLSAFVSFKNMYQKLSKLIVLSISTAFALMSFLTSQLEITMW LDVFILLPLIIWGLHRLMDERKRWLYFVSLLILFIQNYYFGFMVAIFLVLYFLARMTYEKWSWTKVLDFVVSSALAGLSS LIMLLPMYLDLKSHNSDALSTLSGVFTENSHLFDLFAKNFVGTYDTTQFNAIPMIYVGMMPLALAILFFFTKSIRLRSKF AFLGIIAFFVASFYLQALDLLWQGMHSPNMFLHRYAFLFSLLLVLMALETLSRWEEIKTWHILTISLFLITGFLATLIFG HYKYVMTSQVMLTFLFGLAYLILSINSVRKWISAHLFVIILFVFMTVEAGVNALYQVQGIQKEWNFASRDYYNTQVNSIE PIANKVNELTGSGFARMDNTVPDTANDGMKYNFNALSQFSSVRNSNASSIMRQLGFHTDSTYLNLRYPGNTLLMDSIFGI KYNISQAQPPKFGFSPVSNALSNLSKNSNAMGLGVFVPNGFEDAKFTDKAQASSFINNQTALVNALTKSKTTFFTPFYTT SEETADKITGAGNSVTLTRPKTSTATDVSVTYGITVAANSQIYLSVPNITYLNSNAENTLITISDVSNPKMTRSLNSYYV GTNDTGSFLNLGSFSKETKLKVTLAFPENSQVTFDTTSFWRLDTEAYQKEMALLQSRSPKTEMIKNGVRMTYREKEKGDI FLTIPYDKGWSAKVDGKKVAVSKAQSGFMKVSVPAGSHRLELKFFPNGLKEGIICFILGILLFIGYNYFTNKPKKSGGTK NES
Specific function: Unknown
COG id: COG4485
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 99526; Mature: 99526
Theoretical pI: Translated: 9.85; Mature: 9.85
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 3.7 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 3.7 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKFIKKNKWALLASFFIPLLLMVIVLAMTGIYWGSSRSILAGDAYHQYVAIHSLYRNILH CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH SGGSSGFLYTFTSGLGLNLYAFSAYYMGSFLMPLTFFFDVKSMPDALYLLTILKFGLIGL CCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SAFVSFKNMYQKLSKLIVLSISTAFALMSFLTSQLEITMWLDVFILLPLIIWGLHRLMDE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RKRWLYFVSLLILFIQNYYFGFMVAIFLVLYFLARMTYEKWSWTKVLDFVVSSALAGLSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIMLLPMYLDLKSHNSDALSTLSGVFTENSHLFDLFAKNFVGTYDTTQFNAIPMIYVGMM HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH PLALAILFFFTKSIRLRSKFAFLGIIAFFVASFYLQALDLLWQGMHSPNMFLHRYAFLFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH LLLVLMALETLSRWEEIKTWHILTISLFLITGFLATLIFGHYKYVMTSQVMLTFLFGLAY HHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LILSINSVRKWISAHLFVIILFVFMTVEAGVNALYQVQGIQKEWNFASRDYYNTQVNSIE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC PIANKVNELTGSGFARMDNTVPDTANDGMKYNFNALSQFSSVRNSNASSIMRQLGFHTDS HHHHHHHHHCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCEECHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCC TYLNLRYPGNTLLMDSIFGIKYNISQAQPPKFGFSPVSNALSNLSKNSNAMGLGVFVPNG CEEEEEECCCEEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCC FEDAKFTDKAQASSFINNQTALVNALTKSKTTFFTPFYTTSEETADKITGAGNSVTLTRP CCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHCCCCCEEEEECC KTSTATDVSVTYGITVAANSQIYLSVPNITYLNSNAENTLITISDVSNPKMTRSLNSYYV CCCCCCEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCEEEECCCCCCEEEEEECCCCCHHHHCCCCEEE GTNDTGSFLNLGSFSKETKLKVTLAFPENSQVTFDTTSFWRLDTEAYQKEMALLQSRSPK CCCCCCCCEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEECCCEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCH TEMIKNGVRMTYREKEKGDIFLTIPYDKGWSAKVDGKKVAVSKAQSGFMKVSVPAGSHRL HHHHHCCCCEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEE ELKFFPNGLKEGIICFILGILLFIGYNYFTNKPKKSGGTKNES EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKFIKKNKWALLASFFIPLLLMVIVLAMTGIYWGSSRSILAGDAYHQYVAIHSLYRNILH CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH SGGSSGFLYTFTSGLGLNLYAFSAYYMGSFLMPLTFFFDVKSMPDALYLLTILKFGLIGL CCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SAFVSFKNMYQKLSKLIVLSISTAFALMSFLTSQLEITMWLDVFILLPLIIWGLHRLMDE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RKRWLYFVSLLILFIQNYYFGFMVAIFLVLYFLARMTYEKWSWTKVLDFVVSSALAGLSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIMLLPMYLDLKSHNSDALSTLSGVFTENSHLFDLFAKNFVGTYDTTQFNAIPMIYVGMM HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH PLALAILFFFTKSIRLRSKFAFLGIIAFFVASFYLQALDLLWQGMHSPNMFLHRYAFLFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH LLLVLMALETLSRWEEIKTWHILTISLFLITGFLATLIFGHYKYVMTSQVMLTFLFGLAY HHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LILSINSVRKWISAHLFVIILFVFMTVEAGVNALYQVQGIQKEWNFASRDYYNTQVNSIE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC PIANKVNELTGSGFARMDNTVPDTANDGMKYNFNALSQFSSVRNSNASSIMRQLGFHTDS HHHHHHHHHCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCEECHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCC TYLNLRYPGNTLLMDSIFGIKYNISQAQPPKFGFSPVSNALSNLSKNSNAMGLGVFVPNG CEEEEEECCCEEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCC FEDAKFTDKAQASSFINNQTALVNALTKSKTTFFTPFYTTSEETADKITGAGNSVTLTRP CCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHCCCCCEEEEECC KTSTATDVSVTYGITVAANSQIYLSVPNITYLNSNAENTLITISDVSNPKMTRSLNSYYV CCCCCCEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCEEEECCCCCCEEEEEECCCCCHHHHCCCCEEE GTNDTGSFLNLGSFSKETKLKVTLAFPENSQVTFDTTSFWRLDTEAYQKEMALLQSRSPK CCCCCCCCEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEECCCEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCH TEMIKNGVRMTYREKEKGDIFLTIPYDKGWSAKVDGKKVAVSKAQSGFMKVSVPAGSHRL HHHHHCCCCEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEE ELKFFPNGLKEGIICFILGILLFIGYNYFTNKPKKSGGTKNES EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA