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Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome.
Accession NC_002162
Length 751,719

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The map label for this gene is pheT

Identifier: 13358020

GI number: 13358020

Start: 520153

End: 522471

Strand: Reverse

Name: pheT

Synonym: UU457

Alternate gene names: 13358020

Gene position: 522471-520153 (Counterclockwise)

Preceding gene: 13358021

Following gene: 13358017

Centisome position: 69.5

GC content: 23.93

Gene sequence:

>2319_bases
ATGATTTTAAGTTTAAATTTATTACATAAGATTAGTCCAAAACTAAAAAAGATTCCTTTAAATGAATTATGCGCAGCTTT
AATGGATTTAGGTTGTGAAGTTGAAACAATTAATAGCATTAAACCATCTACTAATTTAGTTTTTGCTAAAGTATTAGAAA
AAACTAGACATCCTAATGCTAATCATTTAAATTTAGTTAAAGTTAAAGCAAACCAAAAAGTTTATGAGATCGTTTGTGGT
GCAAATAATTTTAGTGTTCATAATTGAGTTGTTTTAGCAAAATTAAATGCCGAACTAGCAAATGGTTTAAAAATTACGCC
ACGTGAATTAAGAGGATATGTTTCAAATGGAATGTTATGTGCTTACAGTGAAATTAATCCACAAGCTACTAGTTTTTTAA
CATCAACAGATTTAGATGGAATTTTAGTTTTAGATGACAATTATGACCATTATAAAACCCCAAATCAAATTTTTAATTTA
GATGATGTTATTTTAGATTTATCAATTCCATCAAATCGGAATGATTTAAATGGTTATTTTTGAATAGCTAAGGAATTATG
TGCTTATTTTGATTTCGAATATGTTGTTGATGCAACGATTAATCATCGCCCACATAAAGAAATTATTGACGTGCGGATTT
TATCTGATGATGTTAATTCGTATGGAATAATCGAGGTTAAAAATATTCAAAATTATATTTTAAAATGGAATACTAAAAGT
ATATTGATTAATAATCAAATTAAAGTTCTTAATAATTTCGCTGATAATATGAATTTTTTAACATTATTAACTGCTAATCC
ACTTCATGCATTTGATGCACGAAAAATTAGTGGTCAAATTGTTGTTAAAAATGCTGAAGAAGATGCAATTTTATTGGGTT
TAGATCAAAAAGAATATTTAATTAAAAAAGGGGATCTAATTATCGTTGATGATCAAAAAATTTTAGCACTTGCTGGAATT
ATTGGTTCTAATGATTCTAAAATTGATGCAACAAGCACAACTGCTTATATTGAATGTGCAAATTTTAATCCTATGTTGAT
TGCAAATACAGCGCGTCGTTTAAAAATCAATACCGCAGCGGCTATGCGTTTTAGCAAACCCTTAACTAATTATGTTACAA
AAGTAACATTAAAAAAATTGTTAGCTAATTTTAAATCAGATGCAAAATTAATTTATTATTTTAAACATTCAGTTCATAAT
GTCATTAAAAATAAAATTAATCAAGTAAGTGATTTTGTGGGTGCAGAAATTGATTTAGACACTGCTCAAACATTTTTAAA
ACGCTTAGGTTATAAAATTAATAAGTCTAATTTAATTACTCCAAGTCATCGATATGATGTATTAAATGAGTTTGATGTTT
ATGAAGATATTATGAAAAAAATTAGTATTCAAGAAATCAAACCACAACCAATCAGTTTTGATATTTTAAATTTTGAAAAT
AATCTAGCTTATGATTTTGAAAAAAAAGTTAGTGATTTTTTAGTTGATCAAGGTTTGTTTGAGTGTAAAACTTATAATTT
AAAAAATCAAACACAAGCACATGAGTTTAATTTTTTTAATTTTAAACAAGCTTATGAAATTAATAATCCAACTTCAAATA
TGCGTTCGCATTTAAAATTAAATAACCTTAACTCCTTACTTGAAGTATTAGAATATAACCAAAACCAAAAAAATGAATTA
GAAAATATCTTTGAGATTTCAAAGATTAATCCAGTTGATTCAAGTCAACAAACAGTTTTATCAATCATTTTATGTAAACC
ATTAATTAATTCAAAAATTAATGATTCATTAATAGTTAATAATTTTGTGACAACAAAAGCTTTACTACATGCTTTATTAA
CAAAATTAAATATTGATTATGCATATGATAAAAATCATGTTGTTAATGAATTATATGATAATAACCAATTAGCTTTAATT
AATGCAAACAAACAAGTATTTGGTTTTATTGGTCAACTAAAAAATCAAGTCAAAAAAACATATGGTTTAAGTAATGATAT
TTTTATTATTAATTTAAATTTAACTAGTTATTTAAATCAAAAACAAGTAATCACTAAAGTTATTAAGCCAAGTATGTATC
ATGATGTCATACGTGATATTAGTGTTAAATTAGCTTCTGACGTTGACTTAAATAATATAATTGCTAATATTAAAAAAATT
AAAAATATTAGAAAAGTTGAAATCAGCGATCTTTATATAAAAGATGATGGAATTATTTATACTTTTAAATATTATATTAA
TGATCATTTATCTAATTTAAGTAGTGAACAAATTATAATCATTGAACAAGAAGTAAATAATTATTTGAAACAATTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATATGAAATTGATGATATTCGTTATTTATATTCAAATAATTTTAAATTTAATGCCCAAATTAAATAAATTCCTAAATT
TAATGAAAGAGTAAAAAAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTGTAAATTCTTTAAATAATAAAAAACACCTGCAGTGGTGTTTTTTTATTAATTAGTACATTTCAATTACTATAAGAA
ATGGTTTTTAAATAAAATAG

Product: phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta

Products: NA

Alternate protein names: Phenylalanine--tRNA ligase beta chain; PheRS [H]

Number of amino acids: Translated: 772; Mature: 772

Protein sequence:

>772_residues
MILSLNLLHKISPKLKKIPLNELCAALMDLGCEVETINSIKPSTNLVFAKVLEKTRHPNANHLNLVKVKANQKVYEIVCG
ANNFSVHNWVVLAKLNAELANGLKITPRELRGYVSNGMLCAYSEINPQATSFLTSTDLDGILVLDDNYDHYKTPNQIFNL
DDVILDLSIPSNRNDLNGYFWIAKELCAYFDFEYVVDATINHRPHKEIIDVRILSDDVNSYGIIEVKNIQNYILKWNTKS
ILINNQIKVLNNFADNMNFLTLLTANPLHAFDARKISGQIVVKNAEEDAILLGLDQKEYLIKKGDLIIVDDQKILALAGI
IGSNDSKIDATSTTAYIECANFNPMLIANTARRLKINTAAAMRFSKPLTNYVTKVTLKKLLANFKSDAKLIYYFKHSVHN
VIKNKINQVSDFVGAEIDLDTAQTFLKRLGYKINKSNLITPSHRYDVLNEFDVYEDIMKKISIQEIKPQPISFDILNFEN
NLAYDFEKKVSDFLVDQGLFECKTYNLKNQTQAHEFNFFNFKQAYEINNPTSNMRSHLKLNNLNSLLEVLEYNQNQKNEL
ENIFEISKINPVDSSQQTVLSIILCKPLINSKINDSLIVNNFVTTKALLHALLTKLNIDYAYDKNHVVNELYDNNQLALI
NANKQVFGFIGQLKNQVKKTYGLSNDIFIINLNLTSYLNQKQVITKVIKPSMYHDVIRDISVKLASDVDLNNIIANIKKI
KNIRKVEISDLYIKDDGIIYTFKYYINDHLSNLSSEQIIIIEQEVNNYLKQF

Sequences:

>Translated_772_residues
MILSLNLLHKISPKLKKIPLNELCAALMDLGCEVETINSIKPSTNLVFAKVLEKTRHPNANHLNLVKVKANQKVYEIVCG
ANNFSVHN*VVLAKLNAELANGLKITPRELRGYVSNGMLCAYSEINPQATSFLTSTDLDGILVLDDNYDHYKTPNQIFNL
DDVILDLSIPSNRNDLNGYF*IAKELCAYFDFEYVVDATINHRPHKEIIDVRILSDDVNSYGIIEVKNIQNYILKWNTKS
ILINNQIKVLNNFADNMNFLTLLTANPLHAFDARKISGQIVVKNAEEDAILLGLDQKEYLIKKGDLIIVDDQKILALAGI
IGSNDSKIDATSTTAYIECANFNPMLIANTARRLKINTAAAMRFSKPLTNYVTKVTLKKLLANFKSDAKLIYYFKHSVHN
VIKNKINQVSDFVGAEIDLDTAQTFLKRLGYKINKSNLITPSHRYDVLNEFDVYEDIMKKISIQEIKPQPISFDILNFEN
NLAYDFEKKVSDFLVDQGLFECKTYNLKNQTQAHEFNFFNFKQAYEINNPTSNMRSHLKLNNLNSLLEVLEYNQNQKNEL
ENIFEISKINPVDSSQQTVLSIILCKPLINSKINDSLIVNNFVTTKALLHALLTKLNIDYAYDKNHVVNELYDNNQLALI
NANKQVFGFIGQLKNQVKKTYGLSNDIFIINLNLTSYLNQKQVITKVIKPSMYHDVIRDISVKLASDVDLNNIIANIKKI
KNIRKVEISDLYIKDDGIIYTFKYYINDHLSNLSSEQIIIIEQEVNNYLKQF
>Mature_772_residues
MILSLNLLHKISPKLKKIPLNELCAALMDLGCEVETINSIKPSTNLVFAKVLEKTRHPNANHLNLVKVKANQKVYEIVCG
ANNFSVHN*VVLAKLNAELANGLKITPRELRGYVSNGMLCAYSEINPQATSFLTSTDLDGILVLDDNYDHYKTPNQIFNL
DDVILDLSIPSNRNDLNGYF*IAKELCAYFDFEYVVDATINHRPHKEIIDVRILSDDVNSYGIIEVKNIQNYILKWNTKS
ILINNQIKVLNNFADNMNFLTLLTANPLHAFDARKISGQIVVKNAEEDAILLGLDQKEYLIKKGDLIIVDDQKILALAGI
IGSNDSKIDATSTTAYIECANFNPMLIANTARRLKINTAAAMRFSKPLTNYVTKVTLKKLLANFKSDAKLIYYFKHSVHN
VIKNKINQVSDFVGAEIDLDTAQTFLKRLGYKINKSNLITPSHRYDVLNEFDVYEDIMKKISIQEIKPQPISFDILNFEN
NLAYDFEKKVSDFLVDQGLFECKTYNLKNQTQAHEFNFFNFKQAYEINNPTSNMRSHLKLNNLNSLLEVLEYNQNQKNEL
ENIFEISKINPVDSSQQTVLSIILCKPLINSKINDSLIVNNFVTTKALLHALLTKLNIDYAYDKNHVVNELYDNNQLALI
NANKQVFGFIGQLKNQVKKTYGLSNDIFIINLNLTSYLNQKQVITKVIKPSMYHDVIRDISVKLASDVDLNNIIANIKKI
KNIRKVEISDLYIKDDGIIYTFKYYINDHLSNLSSEQIIIIEQEVNNYLKQF

Specific function: Unknown

COG id: COG0072

COG function: function code J; Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [H]

Metaboloic importance: Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 tRNA-binding domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788006, Length=706, Percent_Identity=24.7875354107649, Blast_Score=178, Evalue=1e-45,

Paralogues:

None

Copy number: 1,800 Molecules/Cell In: Glucose minimal media [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR005146
- InterPro:   IPR005147
- InterPro:   IPR009061
- InterPro:   IPR012340
- InterPro:   IPR016027
- InterPro:   IPR004532
- InterPro:   IPR020825
- InterPro:   IPR005121
- InterPro:   IPR002547 [H]

Pfam domain/function: PF03483 B3_4; PF03484 B5; PF01588 tRNA_bind [H]

EC number: =6.1.1.20 [H]

Molecular weight: Translated: 87784; Mature: 87784

Theoretical pI: Translated: 7.82; Mature: 7.82

Prosite motif: PS50886 TRBD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MILSLNLLHKISPKLKKIPLNELCAALMDLGCEVETINSIKPSTNLVFAKVLEKTRHPNA
CEEEEEHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
NHLNLVKVKANQKVYEIVCGANNFSVHNVVLAKLNAELANGLKITPRELRGYVSNGMLCA
CCEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCEEHHEEEEECCHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEE
YSEINPQATSFLTSTDLDGILVLDDNYDHYKTPNQIFNLDDVILDLSIPSNRNDLNGYFI
EECCCCHHHHEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHH
AKELCAYFDFEYVVDATINHRPHKEIIDVRILSDDVNSYGIIEVKNIQNYILKWNTKSIL
HHHHHHHCCHHEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCEEE
INNQIKVLNNFADNMNFLTLLTANPLHAFDARKISGQIVVKNAEEDAILLGLDQKEYLIK
EECHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEECCCHHHHEE
KGDLIIVDDQKILALAGIIGSNDSKIDATSTTAYIECANFNPMLIANTARRLKINTAAAM
CCCEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCEEECCCEEEEEECCCCCEEEECCCCEEEEEHHHHH
RFSKPLTNYVTKVTLKKLLANFKSDAKLIYYFKHSVHNVIKNKINQVSDFVGAEIDLDTA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEHHHH
QTFLKRLGYKINKSNLITPSHRYDVLNEFDVYEDIMKKISIQEIKPQPISFDILNFENNL
HHHHHHCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCEEEEEECCCCC
AYDFEKKVSDFLVDQGLFECKTYNLKNQTQAHEFNFFNFKQAYEINNPTSNMRSHLKLNN
CCCHHHHHHHHHHHCCCHHEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHEECCC
LNSLLEVLEYNQNQKNELENIFEISKINPVDSSQQTVLSIILCKPLINSKINDSLIVNNF
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHH
VTTKALLHALLTKLNIDYAYDKNHVVNELYDNNQLALINANKQVFGFIGQLKNQVKKTYG
HHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
LSNDIFIINLNLTSYLNQKQVITKVIKPSMYHDVIRDISVKLASDVDLNNIIANIKKIKN
CCCCEEEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHCC
IRKVEISDLYIKDDGIIYTFKYYINDHLSNLSSEQIIIIEQEVNNYLKQF
CEEEEEEEEEEECCCEEEEEEEEHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MILSLNLLHKISPKLKKIPLNELCAALMDLGCEVETINSIKPSTNLVFAKVLEKTRHPNA
CEEEEEHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
NHLNLVKVKANQKVYEIVCGANNFSVHNVVLAKLNAELANGLKITPRELRGYVSNGMLCA
CCEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCEEHHEEEEECCHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEE
YSEINPQATSFLTSTDLDGILVLDDNYDHYKTPNQIFNLDDVILDLSIPSNRNDLNGYFI
EECCCCHHHHEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHH
AKELCAYFDFEYVVDATINHRPHKEIIDVRILSDDVNSYGIIEVKNIQNYILKWNTKSIL
HHHHHHHCCHHEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCEEE
INNQIKVLNNFADNMNFLTLLTANPLHAFDARKISGQIVVKNAEEDAILLGLDQKEYLIK
EECHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEECCCHHHHEE
KGDLIIVDDQKILALAGIIGSNDSKIDATSTTAYIECANFNPMLIANTARRLKINTAAAM
CCCEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCEEECCCEEEEEECCCCCEEEECCCCEEEEEHHHHH
RFSKPLTNYVTKVTLKKLLANFKSDAKLIYYFKHSVHNVIKNKINQVSDFVGAEIDLDTA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEHHHH
QTFLKRLGYKINKSNLITPSHRYDVLNEFDVYEDIMKKISIQEIKPQPISFDILNFENNL
HHHHHHCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCEEEEEECCCCC
AYDFEKKVSDFLVDQGLFECKTYNLKNQTQAHEFNFFNFKQAYEINNPTSNMRSHLKLNN
CCCHHHHHHHHHHHCCCHHEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHEECCC
LNSLLEVLEYNQNQKNELENIFEISKINPVDSSQQTVLSIILCKPLINSKINDSLIVNNF
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHH
VTTKALLHALLTKLNIDYAYDKNHVVNELYDNNQLALINANKQVFGFIGQLKNQVKKTYG
HHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
LSNDIFIINLNLTSYLNQKQVITKVIKPSMYHDVIRDISVKLASDVDLNNIIANIKKIKN
CCCCEEEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHCC
IRKVEISDLYIKDDGIIYTFKYYINDHLSNLSSEQIIIIEQEVNNYLKQF
CEEEEEEEEEEECCCEEEEEEEEHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11048724 [H]