Definition Psychrobacter cryohalolentis K5 chromosome, complete genome.
Accession NC_007969
Length 3,059,876

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The map label for this gene is yjcG [C]

Identifier: 93007078

GI number: 93007078

Start: 2765765

End: 2767633

Strand: Direct

Name: yjcG [C]

Synonym: Pcryo_2254

Alternate gene names: 93007078

Gene position: 2765765-2767633 (Clockwise)

Preceding gene: 93007077

Following gene: 93007079

Centisome position: 90.39

GC content: 45.59

Gene sequence:

>1869_bases
ATGAGTCAATTTACGATTAATATCATTTTTGTAGGTCTGTCCTTCGCTTTATACTTCGGTATCGCTTGGTGGGCACGTGC
AGGTTCGACCAGTGAGTTCTATGTTGCTGGCGGCGGTGTACATCCTGTTGTTAACGGTATGGCAACTGCCGCTGACTGGA
TGAGTGCGGCGTCATTTATCTCAATGGCTGGTATTATCGCCACTGGCGGTTATGCTGCATCAACTTATTTAATGGGTTGG
ACGGGTGGTTATGTTCTACTCGCCATGCTCTTAGCACCTTACCTACGTAAATTCGGTAAGTTCACAGTTCCTGATTTTAT
CGGTGACCGCTTTTATTCTAAAACCGCTGCTATGATTGCCGTTGTTTGTTTGATTATCGCATCAACCACTTATGTTATCG
GTCAGATGACTGGTGCTGGTGTGGCATTCTCACGCTTCTTAGAAGTTGACAGTACCACTGGTCTGATTATTGCGGCTGTT
GTTGTATTCTTCTACGCCGTACTTGGTGGTATGAAAGGGATTACCTACACGCAGGTTGCGCAATATGTTGTTCTTATGAT
TGCCTATACGATTCCTGCCGTCTTTATCTCACTTGAGTTGACGGGTAACCCAATTCCAGGTCTTGGTTTATTCTCAAACC
ATGTTGAATCAGGCATTCCTATCCTAACCAAGCTTGACCAAATCGTCGTCGACTTAGGCTTTACCGCTTATACCGCTGAC
GTACCGAACAAGCTGAATATGGTGCTATTTACTTTATCACTGATGATTGGTACCGCGGGTCTACCTCACGTTATTATTCG
CTTTTTCACGGTTCCTAAAGTTGCAGATGCGCGTTGGACAGCTGGTTGGACGTTGGTATTTATCGCGCTCCTATACTTCA
CTGCCCCAGCAGTAGGTGCAATGGCGCGTCTAAATCTAATCAATACTGTTTATCCACAAGGTGTTGACGCTCCTGCTATC
GAATATGATCAACGTCCAGATTGGATGAGAACATGGGAAGAAACTGGTCTTATTAAATATAACGATCTCAATAACGACGG
TCGTATCCAGTTGTATAGTGATAGTGGACTTGGTGCAGCAGAGCTAGCATTGGCTGCCGCTACTACTGATGGCGGCGATG
TTGCTGCTGCAACGACTACCGTTGAAAAAGCAAAAGCTGAACATGCTTTAGAGCGTGATGGTGTGTTTGTTGATAGAGGT
TGGGCAGGTAATGAGCTTGATGTCAACGCTGACATCTTAGTATTGGCTAACCCAGAAATCGCACAGCTACCAGGTTGGGT
TATTGGTCTTATCGCCGCAGGTGGTTTGGCAGCAGCGCTATCTACAGCAGCTGGTCTACTCCTCGCCATCTCATCAGCGA
TCAGTCATGATTTGATTAAACGTAACCTTAATCCAAATATCACTGATGCAGGCGAGCTAAAAGTCGCACGTATCACGATG
GCTGTTGCGCTTGTGGTTGCTACCTACTTAGGTATTAATCCACCAGGATTTGCTGCACAGGTCGTTGCATTGGCCTTTGG
TATTGCTGGTGCCTCACTGTTCCCTGCATTGATGATGGGTATTTTCTCTAAACGTATTAACAACCTTGGCGCCATCGCTG
GTATGCTCACAGGTCTAATTAGTATCTTAGTTTATATCTTCATCTTTAAAGGCTGGTTCTTCGTTACAGGTACAGCAAAC
TTCCCTGATACTGAAGAGTACTGGTTGTTTGGTATCTCACCATTATCATTTGGTGTGATTGGTGCCTTGCTTAACTTTAT
CGTAGCATTCGCAGTGTCTTATGCGACTGCGCCACCACCAGCACACATTCAAGAATTGGTTGAAAGTGTACGTTCTCCAC
GTGGCGCTGGTGCTGCAGTAGATCACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAACAAGGTGCTCTCATCGTATTTATCGCCCTCATCTTTTTCTATGCATGGCGCATGAATAAACTAGATAAACAATATGG
TGTAGACGAGGAATAGCCCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCTTCGATACAAGCTAGCAAATGAAGTGCAAATGACGTATGGTTTTTTACGATAATATATCACTCACAGGCAGCAGCTGC
TCGTGAGTGATTTTTTTATC

Product: Na+/solute symporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 622; Mature: 621

Protein sequence:

>622_residues
MSQFTINIIFVGLSFALYFGIAWWARAGSTSEFYVAGGGVHPVVNGMATAADWMSAASFISMAGIIATGGYAASTYLMGW
TGGYVLLAMLLAPYLRKFGKFTVPDFIGDRFYSKTAAMIAVVCLIIASTTYVIGQMTGAGVAFSRFLEVDSTTGLIIAAV
VVFFYAVLGGMKGITYTQVAQYVVLMIAYTIPAVFISLELTGNPIPGLGLFSNHVESGIPILTKLDQIVVDLGFTAYTAD
VPNKLNMVLFTLSLMIGTAGLPHVIIRFFTVPKVADARWTAGWTLVFIALLYFTAPAVGAMARLNLINTVYPQGVDAPAI
EYDQRPDWMRTWEETGLIKYNDLNNDGRIQLYSDSGLGAAELALAAATTDGGDVAAATTTVEKAKAEHALERDGVFVDRG
WAGNELDVNADILVLANPEIAQLPGWVIGLIAAGGLAAALSTAAGLLLAISSAISHDLIKRNLNPNITDAGELKVARITM
AVALVVATYLGINPPGFAAQVVALAFGIAGASLFPALMMGIFSKRINNLGAIAGMLTGLISILVYIFIFKGWFFVTGTAN
FPDTEEYWLFGISPLSFGVIGALLNFIVAFAVSYATAPPPAHIQELVESVRSPRGAGAAVDH

Sequences:

>Translated_622_residues
MSQFTINIIFVGLSFALYFGIAWWARAGSTSEFYVAGGGVHPVVNGMATAADWMSAASFISMAGIIATGGYAASTYLMGW
TGGYVLLAMLLAPYLRKFGKFTVPDFIGDRFYSKTAAMIAVVCLIIASTTYVIGQMTGAGVAFSRFLEVDSTTGLIIAAV
VVFFYAVLGGMKGITYTQVAQYVVLMIAYTIPAVFISLELTGNPIPGLGLFSNHVESGIPILTKLDQIVVDLGFTAYTAD
VPNKLNMVLFTLSLMIGTAGLPHVIIRFFTVPKVADARWTAGWTLVFIALLYFTAPAVGAMARLNLINTVYPQGVDAPAI
EYDQRPDWMRTWEETGLIKYNDLNNDGRIQLYSDSGLGAAELALAAATTDGGDVAAATTTVEKAKAEHALERDGVFVDRG
WAGNELDVNADILVLANPEIAQLPGWVIGLIAAGGLAAALSTAAGLLLAISSAISHDLIKRNLNPNITDAGELKVARITM
AVALVVATYLGINPPGFAAQVVALAFGIAGASLFPALMMGIFSKRINNLGAIAGMLTGLISILVYIFIFKGWFFVTGTAN
FPDTEEYWLFGISPLSFGVIGALLNFIVAFAVSYATAPPPAHIQELVESVRSPRGAGAAVDH
>Mature_621_residues
SQFTINIIFVGLSFALYFGIAWWARAGSTSEFYVAGGGVHPVVNGMATAADWMSAASFISMAGIIATGGYAASTYLMGWT
GGYVLLAMLLAPYLRKFGKFTVPDFIGDRFYSKTAAMIAVVCLIIASTTYVIGQMTGAGVAFSRFLEVDSTTGLIIAAVV
VFFYAVLGGMKGITYTQVAQYVVLMIAYTIPAVFISLELTGNPIPGLGLFSNHVESGIPILTKLDQIVVDLGFTAYTADV
PNKLNMVLFTLSLMIGTAGLPHVIIRFFTVPKVADARWTAGWTLVFIALLYFTAPAVGAMARLNLINTVYPQGVDAPAIE
YDQRPDWMRTWEETGLIKYNDLNNDGRIQLYSDSGLGAAELALAAATTDGGDVAAATTTVEKAKAEHALERDGVFVDRGW
AGNELDVNADILVLANPEIAQLPGWVIGLIAAGGLAAALSTAAGLLLAISSAISHDLIKRNLNPNITDAGELKVARITMA
VALVVATYLGINPPGFAAQVVALAFGIAGASLFPALMMGIFSKRINNLGAIAGMLTGLISILVYIFIFKGWFFVTGTANF
PDTEEYWLFGISPLSFGVIGALLNFIVAFAVSYATAPPPAHIQELVESVRSPRGAGAAVDH

Specific function: Unknown

COG id: COG4147

COG function: function code R; Predicted symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the sodium:solute symporter (SSF) (TC 2.A.21) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790503, Length=282, Percent_Identity=28.7234042553192, Blast_Score=120, Evalue=2e-28,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001734
- InterPro:   IPR019899 [H]

Pfam domain/function: PF00474 SSF [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 65821; Mature: 65690

Theoretical pI: Translated: 4.95; Mature: 4.95

Prosite motif: PS00457 NA_SOLUT_SYMP_2 ; PS50283 NA_SOLUT_SYMP_3

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSQFTINIIFVGLSFALYFGIAWWARAGSTSEFYVAGGGVHPVVNGMATAADWMSAASFI
CCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SMAGIIATGGYAASTYLMGWTGGYVLLAMLLAPYLRKFGKFTVPDFIGDRFYSKTAAMIA
HHHHHHHCCCHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VVCLIIASTTYVIGQMTGAGVAFSRFLEVDSTTGLIIAAVVVFFYAVLGGMKGITYTQVA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
QYVVLMIAYTIPAVFISLELTGNPIPGLGLFSNHVESGIPILTKLDQIVVDLGFTAYTAD
HHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEECC
VPNKLNMVLFTLSLMIGTAGLPHVIIRFFTVPKVADARWTAGWTLVFIALLYFTAPAVGA
CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MARLNLINTVYPQGVDAPAIEYDQRPDWMRTWEETGLIKYNDLNNDGRIQLYSDSGLGAA
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCHH
ELALAAATTDGGDVAAATTTVEKAKAEHALERDGVFVDRGWAGNELDVNADILVLANPEI
HHHEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCEECCCCCEEEEECCCH
AQLPGWVIGLIAAGGLAAALSTAAGLLLAISSAISHDLIKRNLNPNITDAGELKVARITM
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHH
AVALVVATYLGINPPGFAAQVVALAFGIAGASLFPALMMGIFSKRINNLGAIAGMLTGLI
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SILVYIFIFKGWFFVTGTANFPDTEEYWLFGISPLSFGVIGALLNFIVAFAVSYATAPPP
HHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
AHIQELVESVRSPRGAGAAVDH
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SQFTINIIFVGLSFALYFGIAWWARAGSTSEFYVAGGGVHPVVNGMATAADWMSAASFI
CCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SMAGIIATGGYAASTYLMGWTGGYVLLAMLLAPYLRKFGKFTVPDFIGDRFYSKTAAMIA
HHHHHHHCCCHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VVCLIIASTTYVIGQMTGAGVAFSRFLEVDSTTGLIIAAVVVFFYAVLGGMKGITYTQVA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
QYVVLMIAYTIPAVFISLELTGNPIPGLGLFSNHVESGIPILTKLDQIVVDLGFTAYTAD
HHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEECC
VPNKLNMVLFTLSLMIGTAGLPHVIIRFFTVPKVADARWTAGWTLVFIALLYFTAPAVGA
CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MARLNLINTVYPQGVDAPAIEYDQRPDWMRTWEETGLIKYNDLNNDGRIQLYSDSGLGAA
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCHH
ELALAAATTDGGDVAAATTTVEKAKAEHALERDGVFVDRGWAGNELDVNADILVLANPEI
HHHEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCEECCCCCEEEEECCCH
AQLPGWVIGLIAAGGLAAALSTAAGLLLAISSAISHDLIKRNLNPNITDAGELKVARITM
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHH
AVALVVATYLGINPPGFAAQVVALAFGIAGASLFPALMMGIFSKRINNLGAIAGMLTGLI
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SILVYIFIFKGWFFVTGTANFPDTEEYWLFGISPLSFGVIGALLNFIVAFAVSYATAPPP
HHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
AHIQELVESVRSPRGAGAAVDH
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 1356967 [H]