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The map label for this gene is kefC [H]

Identifier: 93006835

GI number: 93006835

Start: 2472835

End: 2474721

Strand: Direct

Name: kefC [H]

Synonym: Pcryo_2011

Alternate gene names: 93006835

Gene position: 2472835-2474721 (Clockwise)

Preceding gene: 93006834

Following gene: 93006837

Centisome position: 80.81

GC content: 44.46

Gene sequence:

>1887_bases
ATGTTCGCTGCCGCCGCCAGCTCACCAAATTTAATGTTACAAGCGACAATTTTCTTGGGAGCAGCCCTGCTCTTTGTACC
CCTTGGTAAACGTTTTGGTATTGCGACGGTTTTAGGTTATCTGATCACAGGATTGATATTAGGTCCAAGTGTACTGGACG
TCGCAGGTGACGCTGAGAGCTTATTGCATTTCTCTGAGTTTGGCGTGGTGATGCTGCTGTTCATCATTGGGCTTGAGCTG
CAGCCATCAAGGCTCTGGGCACTCAGGCGCTCAATATTCGTCCTTGGCGGTTTGCAAGTTGGTTTGACTGGTGTCTTATT
GATGGGGCTGTTACATCAGATTTTTGGCTTGCAGCTCGATACTGCTTTTATCGTTGGCTTCGGGCTTGCGCTCTCATCTA
CCGCCTTTGTCCTACAAATTCTGACTGAAAAACAGCAGCTATCGAGCACTCATGGCCGTGAAGCCTTTACAATTTTATTA
TTCCAAGACATTGCGGTTATCCCTTTATTAGCGGTCATTCCTTTCTTATCAGGGGTGCGTGAACAAAGCTATGATTTGAT
TTATTTTGGTAAAGTTTTTGCGGTTTTTGCTGGACTTATTTTTGCCAGTCGCTACGTCGTTCGTCCATTTTTTAAATTTG
TCGCCTCAAGTGGTGCGTCAGAATTACTAACGGCAGTCGCGCTATTTATCGTAATGGGTGTGTCAATTTTGATGGGTCAA
ATCGGGCTCTCAATGGCGTTGGGCGCATTTTTAACTGGTGTACTGTTGGCGGATTCTGAATACCGCCATGAGCTTGAAGC
CAGTATCGAGCCTTTTAAAGGATTGTTATTAGGTCTGTTCTTTATGTCAGTCGGTATGTTGACCGATGTGAAATTGATAT
TAGCAAAACCCATTTTTATCATCGGCTGTGCGATGGCATTGATGTTTATCAAGTTCGGGGTGATTACAGCGATTGCAAAA
ATTTCAGGTAATCGCTGGCCAACCAGCATTCGACTGGGGGTTACACTGGCTCAAGGTGGTGAATTTGCTTTTGTCTTGTT
CAGTGTTGCGAGTGCCCAAAACGTCTTACAACCTGAACTTGCCAATACGTTAAACCTGATCGTAACCATCTCTATGGCAC
TCACTCCTTTGGCATTCTTGTTATTAGAAAAAGTCGGCGAGCCATTATTTGCCAAAAGCAAACCAAGCCGCGAATACGAC
ACGATTCCAGATCATGAGCATCAGGTGATTATTGCTGGCTTTGGGCGAGTCGGTCAGATTATCGGTCGTGTGCTACGTAT
GCACAATATTGAATTTACCGCGATTGAACGCTCGGCAAACCGCGTCGATTTTGTCCGTAAATTCGGTAACCAAGTCTATT
ATGGTGATCCAAAAAACCCTGAAATCCTACGTGCAGCAGGTATCAAAAAAGCACGTGTCTTTATCCTTGCCATCGATGAT
TTAGAGCGTTCTATCACCACCGCCCAATATTTACGTAAAAACTATCCAGATTTAATTATCTTAGCACGGGCACGTGACCG
CCAGCATTACTACCGATTACGTGAGGTTGGGGTTCGTCATATCTGGCGTGAGACATATTTGTCCTCGCTAGATATGTCGC
GTGAGTCGTTACAACTGCTTGGCATCTCACCAGAAAAAGCGCGTGAGACAGTGCAAACTTTCCGTGATTACGATGATGAT
CTGATTGAACGTCAACAAGCTATTTATGATGATGAGGCCAGTATGATTGAGTCGGCTCAATCATCGATGGCGGAGCTTGA
AAGCTTATTTGATGAAGATATTGGCAAAGCCCGTAAGATGGACTTGAGCGATTTTTATGAAGCGCTAAAAAGCCAAGCCA
TATCAGTCGATGATAAAGATAATAATACGACTGAATCTAAGCATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATGGAAGATTTATCGTAAAAAATAATCGTTATAAAGTTGCTTTTTATTTTTAATACTGCTGTTGTACTGCCCATTTATC
GTCATTGCTAAGGATTCCAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTTCAACTATAGAAATTGTTGTCAAAAATAATTCTCAGTCTTTGTAGCCACCTAATCAGGGCTACAATTTTCCGGCG
CTTGTTTCTTATTCAATGAG

Product: potassium efflux system protein

Products: Proton [Cytoplasm]; K (I) [Periplasm] [C]

Alternate protein names: K(+)/H(+) antiporter [H]

Number of amino acids: Translated: 628; Mature: 628

Protein sequence:

>628_residues
MFAAAASSPNLMLQATIFLGAALLFVPLGKRFGIATVLGYLITGLILGPSVLDVAGDAESLLHFSEFGVVMLLFIIGLEL
QPSRLWALRRSIFVLGGLQVGLTGVLLMGLLHQIFGLQLDTAFIVGFGLALSSTAFVLQILTEKQQLSSTHGREAFTILL
FQDIAVIPLLAVIPFLSGVREQSYDLIYFGKVFAVFAGLIFASRYVVRPFFKFVASSGASELLTAVALFIVMGVSILMGQ
IGLSMALGAFLTGVLLADSEYRHELEASIEPFKGLLLGLFFMSVGMLTDVKLILAKPIFIIGCAMALMFIKFGVITAIAK
ISGNRWPTSIRLGVTLAQGGEFAFVLFSVASAQNVLQPELANTLNLIVTISMALTPLAFLLLEKVGEPLFAKSKPSREYD
TIPDHEHQVIIAGFGRVGQIIGRVLRMHNIEFTAIERSANRVDFVRKFGNQVYYGDPKNPEILRAAGIKKARVFILAIDD
LERSITTAQYLRKNYPDLIILARARDRQHYYRLREVGVRHIWRETYLSSLDMSRESLQLLGISPEKARETVQTFRDYDDD
LIERQQAIYDDEASMIESAQSSMAELESLFDEDIGKARKMDLSDFYEALKSQAISVDDKDNNTTESKH

Sequences:

>Translated_628_residues
MFAAAASSPNLMLQATIFLGAALLFVPLGKRFGIATVLGYLITGLILGPSVLDVAGDAESLLHFSEFGVVMLLFIIGLEL
QPSRLWALRRSIFVLGGLQVGLTGVLLMGLLHQIFGLQLDTAFIVGFGLALSSTAFVLQILTEKQQLSSTHGREAFTILL
FQDIAVIPLLAVIPFLSGVREQSYDLIYFGKVFAVFAGLIFASRYVVRPFFKFVASSGASELLTAVALFIVMGVSILMGQ
IGLSMALGAFLTGVLLADSEYRHELEASIEPFKGLLLGLFFMSVGMLTDVKLILAKPIFIIGCAMALMFIKFGVITAIAK
ISGNRWPTSIRLGVTLAQGGEFAFVLFSVASAQNVLQPELANTLNLIVTISMALTPLAFLLLEKVGEPLFAKSKPSREYD
TIPDHEHQVIIAGFGRVGQIIGRVLRMHNIEFTAIERSANRVDFVRKFGNQVYYGDPKNPEILRAAGIKKARVFILAIDD
LERSITTAQYLRKNYPDLIILARARDRQHYYRLREVGVRHIWRETYLSSLDMSRESLQLLGISPEKARETVQTFRDYDDD
LIERQQAIYDDEASMIESAQSSMAELESLFDEDIGKARKMDLSDFYEALKSQAISVDDKDNNTTESKH
>Mature_628_residues
MFAAAASSPNLMLQATIFLGAALLFVPLGKRFGIATVLGYLITGLILGPSVLDVAGDAESLLHFSEFGVVMLLFIIGLEL
QPSRLWALRRSIFVLGGLQVGLTGVLLMGLLHQIFGLQLDTAFIVGFGLALSSTAFVLQILTEKQQLSSTHGREAFTILL
FQDIAVIPLLAVIPFLSGVREQSYDLIYFGKVFAVFAGLIFASRYVVRPFFKFVASSGASELLTAVALFIVMGVSILMGQ
IGLSMALGAFLTGVLLADSEYRHELEASIEPFKGLLLGLFFMSVGMLTDVKLILAKPIFIIGCAMALMFIKFGVITAIAK
ISGNRWPTSIRLGVTLAQGGEFAFVLFSVASAQNVLQPELANTLNLIVTISMALTPLAFLLLEKVGEPLFAKSKPSREYD
TIPDHEHQVIIAGFGRVGQIIGRVLRMHNIEFTAIERSANRVDFVRKFGNQVYYGDPKNPEILRAAGIKKARVFILAIDD
LERSITTAQYLRKNYPDLIILARARDRQHYYRLREVGVRHIWRETYLSSLDMSRESLQLLGISPEKARETVQTFRDYDDD
LIERQQAIYDDEASMIESAQSSMAELESLFDEDIGKARKMDLSDFYEALKSQAISVDDKDNNTTESKH

Specific function: Transport system that facilitates potassium-efflux, possibly by potassium-proton antiport [H]

COG id: COG0475

COG function: function code P; Kef-type K+ transport systems, membrane components

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 RCK N-terminal domain [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI157388921, Length=375, Percent_Identity=27.2, Blast_Score=90, Evalue=6e-18,
Organism=Escherichia coli, GI1786232, Length=591, Percent_Identity=43.1472081218274, Blast_Score=465, Evalue=1e-132,
Organism=Escherichia coli, GI1789749, Length=600, Percent_Identity=41.3333333333333, Blast_Score=427, Evalue=1e-120,
Organism=Escherichia coli, GI1786685, Length=557, Percent_Identity=29.443447037702, Blast_Score=183, Evalue=3e-47,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006153
- InterPro:   IPR004771
- InterPro:   IPR006036
- InterPro:   IPR016040
- InterPro:   IPR003148 [H]

Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger; PF02254 TrkA_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69367; Mature: 69367

Theoretical pI: Translated: 6.37; Mature: 6.37

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFAAAASSPNLMLQATIFLGAALLFVPLGKRFGIATVLGYLITGLILGPSVLDVAGDAES
CCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHH
LLHFSEFGVVMLLFIIGLELQPSRLWALRRSIFVLGGLQVGLTGVLLMGLLHQIFGLQLD
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
TAFIVGFGLALSSTAFVLQILTEKQQLSSTHGREAFTILLFQDIAVIPLLAVIPFLSGVR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EQSYDLIYFGKVFAVFAGLIFASRYVVRPFFKFVASSGASELLTAVALFIVMGVSILMGQ
HCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGLSMALGAFLTGVLLADSEYRHELEASIEPFKGLLLGLFFMSVGMLTDVKLILAKPIFI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGCAMALMFIKFGVITAIAKISGNRWPTSIRLGVTLAQGGEFAFVLFSVASAQNVLQPEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHCHHH
ANTLNLIVTISMALTPLAFLLLEKVGEPLFAKSKPSREYDTIPDHEHQVIIAGFGRVGQI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHH
IGRVLRMHNIEFTAIERSANRVDFVRKFGNQVYYGDPKNPEILRAAGIKKARVFILAIDD
HHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCHHHHCCCCEEEEEEEEECH
LERSITTAQYLRKNYPDLIILARARDRQHYYRLREVGVRHIWRETYLSSLDMSRESLQLL
HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHC
GISPEKARETVQTFRDYDDDLIERQQAIYDDEASMIESAQSSMAELESLFDEDIGKARKM
CCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
DLSDFYEALKSQAISVDDKDNNTTESKH
CHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFAAAASSPNLMLQATIFLGAALLFVPLGKRFGIATVLGYLITGLILGPSVLDVAGDAES
CCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHH
LLHFSEFGVVMLLFIIGLELQPSRLWALRRSIFVLGGLQVGLTGVLLMGLLHQIFGLQLD
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
TAFIVGFGLALSSTAFVLQILTEKQQLSSTHGREAFTILLFQDIAVIPLLAVIPFLSGVR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EQSYDLIYFGKVFAVFAGLIFASRYVVRPFFKFVASSGASELLTAVALFIVMGVSILMGQ
HCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGLSMALGAFLTGVLLADSEYRHELEASIEPFKGLLLGLFFMSVGMLTDVKLILAKPIFI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGCAMALMFIKFGVITAIAKISGNRWPTSIRLGVTLAQGGEFAFVLFSVASAQNVLQPEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHCHHH
ANTLNLIVTISMALTPLAFLLLEKVGEPLFAKSKPSREYDTIPDHEHQVIIAGFGRVGQI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHH
IGRVLRMHNIEFTAIERSANRVDFVRKFGNQVYYGDPKNPEILRAAGIKKARVFILAIDD
HHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCHHHHCCCCEEEEEEEEECH
LERSITTAQYLRKNYPDLIILARARDRQHYYRLREVGVRHIWRETYLSSLDMSRESLQLL
HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHC
GISPEKARETVQTFRDYDDDLIERQQAIYDDEASMIESAQSSMAELESLFDEDIGKARKM
CCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
DLSDFYEALKSQAISVDDKDNNTTESKH
CHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; K (I) [Cytoplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + K (I) [Cytoplasm] = Proton [Cytoplasm] + K (I) [Periplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA