Definition | Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_007880 |
Length | 1,895,994 |
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The map label for this gene is 89256836
Identifier: 89256836
GI number: 89256836
Start: 1482574
End: 1484487
Strand: Reverse
Name: 89256836
Synonym: FTL_1552
Alternate gene names: NA
Gene position: 1484487-1482574 (Counterclockwise)
Preceding gene: 89256841
Following gene: 89256834
Centisome position: 78.3
GC content: 31.5
Gene sequence:
>1914_bases ATGTTTGATTATATATTTAATAAAATTAAGGCGACGGTTTTCTCCAAAATTACCCCGGCTCAATTGCTTCTTACAGCTAT TTTAGCTTTTGTATTTGGGTTTGTTCCAGGTATTGCTTATTCACCATTACTTTTTATAGGAGTACTATTTCTAGTTATAA TCCTAAGGATAAATATCGGTGTATTTGTTTTTATTGCAATTATTGCTAAAGCGCTCTCTTATATTTTACAAGGAATTAGC TTTGCAGTGGGGACATTTTTACTTGATGGTTTCACGCAGCCATTATTTAAAACTTTAGTAAATACTCCTGTAGTTGCATA TGCAGGTTTTGATTATTACCTTGTAACAGGTGCATTTGTTGTTGCTATAGTTTTAGGGGTGATATTTGGGGTTATTATCG CAAAGTTTTATAAAAAAATAGTTGCAAAAATGGCAGCAATCCAGTTTGGTACAGAGCTTTATAACAAAATTACAAAAAAC TTTTTTGTTAAAATTGCTGGTTGGATTTTCTTAGGCAAGAATATTGCTAAAGTTAACTGGGTTGAGATGCAAAATCGCAA GTTTAGGCAGCCTTTTAGACTAACAGGTGTTATACTCGTGGCTTTAATTATTGCAGTTTTAATATACTCACCAAAGCTTT TAGAAATGTCGTTAGTATCAAATATCATCAAACAGCAGCTAACTAAAGCTAATGGAACAACTGTTGATTATCAATCTCTA AATCTAGATTTAACTGATGCTAAACTAGAGATAACAGGTTTGGGAGCAGCAGATCCTAATGATCTTAATAAAGACAGATT CTACGCACAATCTGTCAGTACTAGTATAAATATATCAAACTTGCTAACGCGACAAATTACTCTAAAAAATGTTGTTGTAA CGGGAGTGGCTTTAGATAAGCAAAGAACTACCAAAGCCAAACTATACATTGATACAAAACCTTTAACTTCAGAACAATCT AAGATTAGTTCAGAAGCTATAAAACAACAGGCTATTGAAACTGTTGGTAAGCTTGGCGAAAAATTACAACAAGTTGACCT TCAAAAGCTTAAAGAAAATAGTCAACAAGCTAAAGATATTGCTAATGGTATTAAACAAGTAGCAGAATTTTTATCTAATT TTAGGTCTAGTGATACTGAATCAGGACAGGTGAGTCAAGAGATTACTCCAAAAGCTGAGGCTAAGGTATATGGCTATGCA AACGTCAAGAATGAAGATTTGCGTGATAAATATCCAAGTTTTGTGATTCAAAATATTGATATTAAGGACTATAAGGATGC AGGAACTATATATAATGCAAATATAACTAATATATCAACAAATCCTGCTTTATTAGGATTGCCGACTACGATAACTATTA AATCAACTAACAATAATGATTTTGATGCTAATATTGTTATTTCTAACAAGCAAAATGTTGATAATACAGTTAAGTTTAAC TTACAAAATATTACTGGTAATAATGTTAAGGGGCTAACTATTCAGGATGTTGGTTTAGATGCTGAGAGTTTAGCTGTATC AGGTCAAGGAACATGGCAGTTTAGTGGCATAAGAAACATAACGTTTAATATCCCACTTCAACTGAAGTTTAATAACGTAG CAGTTAGTTTCAAACAGTTAATACAAAATGTTTCTGATCTAACCTTAGGTGGAGTTATATCGGGAGATTTAAATAAACCT AACCTTAGTGTTGATGCATCTTCTTTAAAGAACTTACTAAATGTTGATACTGTTAAAAACGTTGCAAATCAAGTAGCTAA GCAGACTGGGATAGATAAAAAGGCACAACAGGTAATCAATAGTGCTAAGATAAATGGTAAATCTATTAAAGATTTAAATG CTAATGATTTAAAGAATATTAATAAAAAAGATGTTCAAAATCTTGCTTCTCAATTTGGAATTACAATTAACTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TATGTTATTTTTTCTAATAAAAATACTTATTTTAATGTTTGAATTGCCTATAATATGGTAATGTTAATTTGGTAAAATTA CAAAACAAAGGTAGTTAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TAAATATTTATCTAAACCCCCTTGCGTCAGAGCGTCTATTTGAGGGTATTTCTTTATAGTATTTAATTTTTACTTCAGTT GTTTCGCCACATCTTACGAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 637; Mature: 637
Protein sequence:
>637_residues MFDYIFNKIKATVFSKITPAQLLLTAILAFVFGFVPGIAYSPLLFIGVLFLVIILRINIGVFVFIAIIAKALSYILQGIS FAVGTFLLDGFTQPLFKTLVNTPVVAYAGFDYYLVTGAFVVAIVLGVIFGVIIAKFYKKIVAKMAAIQFGTELYNKITKN FFVKIAGWIFLGKNIAKVNWVEMQNRKFRQPFRLTGVILVALIIAVLIYSPKLLEMSLVSNIIKQQLTKANGTTVDYQSL NLDLTDAKLEITGLGAADPNDLNKDRFYAQSVSTSINISNLLTRQITLKNVVVTGVALDKQRTTKAKLYIDTKPLTSEQS KISSEAIKQQAIETVGKLGEKLQQVDLQKLKENSQQAKDIANGIKQVAEFLSNFRSSDTESGQVSQEITPKAEAKVYGYA NVKNEDLRDKYPSFVIQNIDIKDYKDAGTIYNANITNISTNPALLGLPTTITIKSTNNNDFDANIVISNKQNVDNTVKFN LQNITGNNVKGLTIQDVGLDAESLAVSGQGTWQFSGIRNITFNIPLQLKFNNVAVSFKQLIQNVSDLTLGGVISGDLNKP NLSVDASSLKNLLNVDTVKNVANQVAKQTGIDKKAQQVINSAKINGKSIKDLNANDLKNINKKDVQNLASQFGITIN
Sequences:
>Translated_637_residues MFDYIFNKIKATVFSKITPAQLLLTAILAFVFGFVPGIAYSPLLFIGVLFLVIILRINIGVFVFIAIIAKALSYILQGIS FAVGTFLLDGFTQPLFKTLVNTPVVAYAGFDYYLVTGAFVVAIVLGVIFGVIIAKFYKKIVAKMAAIQFGTELYNKITKN FFVKIAGWIFLGKNIAKVNWVEMQNRKFRQPFRLTGVILVALIIAVLIYSPKLLEMSLVSNIIKQQLTKANGTTVDYQSL NLDLTDAKLEITGLGAADPNDLNKDRFYAQSVSTSINISNLLTRQITLKNVVVTGVALDKQRTTKAKLYIDTKPLTSEQS KISSEAIKQQAIETVGKLGEKLQQVDLQKLKENSQQAKDIANGIKQVAEFLSNFRSSDTESGQVSQEITPKAEAKVYGYA NVKNEDLRDKYPSFVIQNIDIKDYKDAGTIYNANITNISTNPALLGLPTTITIKSTNNNDFDANIVISNKQNVDNTVKFN LQNITGNNVKGLTIQDVGLDAESLAVSGQGTWQFSGIRNITFNIPLQLKFNNVAVSFKQLIQNVSDLTLGGVISGDLNKP NLSVDASSLKNLLNVDTVKNVANQVAKQTGIDKKAQQVINSAKINGKSIKDLNANDLKNINKKDVQNLASQFGITIN >Mature_637_residues MFDYIFNKIKATVFSKITPAQLLLTAILAFVFGFVPGIAYSPLLFIGVLFLVIILRINIGVFVFIAIIAKALSYILQGIS FAVGTFLLDGFTQPLFKTLVNTPVVAYAGFDYYLVTGAFVVAIVLGVIFGVIIAKFYKKIVAKMAAIQFGTELYNKITKN FFVKIAGWIFLGKNIAKVNWVEMQNRKFRQPFRLTGVILVALIIAVLIYSPKLLEMSLVSNIIKQQLTKANGTTVDYQSL NLDLTDAKLEITGLGAADPNDLNKDRFYAQSVSTSINISNLLTRQITLKNVVVTGVALDKQRTTKAKLYIDTKPLTSEQS KISSEAIKQQAIETVGKLGEKLQQVDLQKLKENSQQAKDIANGIKQVAEFLSNFRSSDTESGQVSQEITPKAEAKVYGYA NVKNEDLRDKYPSFVIQNIDIKDYKDAGTIYNANITNISTNPALLGLPTTITIKSTNNNDFDANIVISNKQNVDNTVKFN LQNITGNNVKGLTIQDVGLDAESLAVSGQGTWQFSGIRNITFNIPLQLKFNNVAVSFKQLIQNVSDLTLGGVISGDLNKP NLSVDASSLKNLLNVDTVKNVANQVAKQTGIDKKAQQVINSAKINGKSIKDLNANDLKNINKKDVQNLASQFGITIN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 69885; Mature: 69885
Theoretical pI: Translated: 10.14; Mature: 10.14
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 0.6 %Met (Translated Protein) 0.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 0.6 %Met (Mature Protein) 0.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFDYIFNKIKATVFSKITPAQLLLTAILAFVFGFVPGIAYSPLLFIGVLFLVIILRINIG CHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFVFIAIIAKALSYILQGISFAVGTFLLDGFTQPLFKTLVNTPVVAYAGFDYYLVTGAFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHH VAIVLGVIFGVIIAKFYKKIVAKMAAIQFGTELYNKITKNFFVKIAGWIFLGKNIAKVNW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEE VEMQNRKFRQPFRLTGVILVALIIAVLIYSPKLLEMSLVSNIIKQQLTKANGTTVDYQSL EECCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEC NLDLTDAKLEITGLGAADPNDLNKDRFYAQSVSTSINISNLLTRQITLKNVVVTGVALDK CEEEECCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECC QRTTKAKLYIDTKPLTSEQSKISSEAIKQQAIETVGKLGEKLQQVDLQKLKENSQQAKDI CCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ANGIKQVAEFLSNFRSSDTESGQVSQEITPKAEAKVYGYANVKNEDLRDKYPSFVIQNID HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHCCHHEEECCC IKDYKDAGTIYNANITNISTNPALLGLPTTITIKSTNNNDFDANIVISNKQNVDNTVKFN CCCCCCCCCEEECEECCCCCCCEEEECCEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEE LQNITGNNVKGLTIQDVGLDAESLAVSGQGTWQFSGIRNITFNIPLQLKFNNVAVSFKQL EEECCCCCCCCEEEEECCCCHHHEEECCCCCEEECCCCEEEEEEEEEEEECHHHHHHHHH IQNVSDLTLGGVISGDLNKPNLSVDASSLKNLLNVDTVKNVANQVAKQTGIDKKAQQVIN HHHHHHCEECCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH SAKINGKSIKDLNANDLKNINKKDVQNLASQFGITIN HHCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC >Mature Secondary Structure MFDYIFNKIKATVFSKITPAQLLLTAILAFVFGFVPGIAYSPLLFIGVLFLVIILRINIG CHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFVFIAIIAKALSYILQGISFAVGTFLLDGFTQPLFKTLVNTPVVAYAGFDYYLVTGAFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHH VAIVLGVIFGVIIAKFYKKIVAKMAAIQFGTELYNKITKNFFVKIAGWIFLGKNIAKVNW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEE VEMQNRKFRQPFRLTGVILVALIIAVLIYSPKLLEMSLVSNIIKQQLTKANGTTVDYQSL EECCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEC NLDLTDAKLEITGLGAADPNDLNKDRFYAQSVSTSINISNLLTRQITLKNVVVTGVALDK CEEEECCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECC QRTTKAKLYIDTKPLTSEQSKISSEAIKQQAIETVGKLGEKLQQVDLQKLKENSQQAKDI CCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ANGIKQVAEFLSNFRSSDTESGQVSQEITPKAEAKVYGYANVKNEDLRDKYPSFVIQNID HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHCCHHEEECCC IKDYKDAGTIYNANITNISTNPALLGLPTTITIKSTNNNDFDANIVISNKQNVDNTVKFN CCCCCCCCCEEECEECCCCCCCEEEECCEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEE LQNITGNNVKGLTIQDVGLDAESLAVSGQGTWQFSGIRNITFNIPLQLKFNNVAVSFKQL EEECCCCCCCCEEEEECCCCHHHEEECCCCCEEECCCCEEEEEEEEEEEECHHHHHHHHH IQNVSDLTLGGVISGDLNKPNLSVDASSLKNLLNVDTVKNVANQVAKQTGIDKKAQQVIN HHHHHHCEECCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH SAKINGKSIKDLNANDLKNINKKDVQNLASQFGITIN HHCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA