| Definition | Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007880 |
| Length | 1,895,994 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is res [H]
Identifier: 89255935
GI number: 89255935
Start: 508407
End: 511280
Strand: Direct
Name: res [H]
Synonym: FTL_0528
Alternate gene names: 89255935
Gene position: 508407-511280 (Clockwise)
Preceding gene: 89255934
Following gene: 89255936
Centisome position: 26.81
GC content: 29.09
Gene sequence:
>2874_bases ATGCTATTTGAAAAACAACAGTATCAAGAAGATTGTGTAAATAATATCGTAAATATTTTAGATGAGTGCGATGTCTTTAA TAATGACTATTCAAATCTAAAAAATATAATCAAAGAACATTATAAAACTCAAAGATACAGCCAGTTTGAAACATCCAGTA AGAAGCAAATAGATGTTTTAATGGAAACTGGTACAGGTAAAACATTTACCTATATAAAAACTATTTTTGAGATAAACAAG CAATTTGGCAAGACTAAATTTATTATAGTGCTACCTCGTACAGCCATTAAACAAGGTGTTATTCAAAATATCAAACTTAC TGATGAATATTTCTATAATGAGTATGGTAAGCATTTAAAGTTTATAGGCTATACAGGTAAAGATAGTTTATCAGCAGTAC AGCAAAGTTTTATTCGTAATGAATCAGATTTAACAGTTCTTGTGTCTACCAATTCAGCATTTAATAAGGATGCTAATACA ATTAACCAAGCTAAAGAAGATCTTGTTGAGCATAGTAGTGTATGGGAAGCAATAGCAGATAAAAAGCCAATAGTGTTTAT AGATGAGCCACATTTATTAAAAGGTGGTGCCACAGTTGAAGCTTTAGAAAAGTTGGATAGCTTATTTATTCGTTTTGGTG CTACATACCCTACAGAAGAGGAGCATAAGCTTGTAAATGTTGCTTATGCTTTAGATAGTATTAACTCATTTGAAAACTAT TTAGTAAAAAGAATTGCAGTTAAGAATATTCTAACAGGTGCGGAAGAGTCAGATATTAAAATCACAAAGATAAATGCAAA AGGTAAGCAATCCGATAAATCTGTAACATTTAGTTATTCAAAAAATCAACAAATATACTCAACTACTATCAAAATTGGTG ATGATGTAGGCTCTAAAACTGGTTTAGATATTTATCATGGTGTAACGCTTACCAAAATAAATGCAAAAGAAATATTTTTC TCTAATGGAGATACTAAAAAAGTTAGTGAAAGCTATGAGTTAAATGATGATGAGATTGAGCAAATGCTTAGGGTTACAGT TTCTAGTCATTTTGAAAAAGAAGAAAGACTTTTTAATCAATGTATTAAAGAGTTATCACTATTTTTTATTCCTAGTATTG CAGATTTTAGGGGAGATAATCCTAGAGTTAGAAAATTTTTTGAGAAAATATATCGTGAGATTCGTGATGAGTATTATCAC AACACGACTAATCAAGAGTATAATAAATATCTAGATAAAGACTTTAAAGATGGCAAACTACAAGTTTTAGAAGGGTACTT CTCAGGTGATAAGGGTGATAGTGCAAAAGATGATGATCTAAAAAAAGCAGTGGATATTATTCTTAATAAAAAAGAACAAT TATTATCGCTTGATGAACCTTTAAGATTTGTTTTCTCAGTATGGGCTTTGCAAGAGGGTTGGGATAACCCTAACATTTTT AATATTTGTAAACTTGCAACTACGGATAAAGAAACATCTAGAAGACAGCAAGTAGGACGTGGACTTAGATTAGCTGTTAA TCAGGCAGGAAAAAGACAGTCATTTAAAACCTTGGCAGAAAATGAAAATGCTTTTTATGATATTAATACCCTTGATATGG TGGTTTCAGGCTATGAAAAAGACTTTATCGAAGGTATCCAATCAGAAATTCAAAAAGCTAGCTTTGGTATTGTTGGAGAC TTCTTAGAAAATAGCTTATTAGAAGCAAATGGACTAAATTTAAGAGAAATTAGCAAATTAATAAATACCTTAGAAGATAA TCAAATTATTGAATTTGATGAGTCGATTGAGAAGTATAAAATTATTAGCAGCATTTATGATTTTATAGAAAATAATGCTG ATAAATTATCTTTCTTATCTAATGATAGGTTGCAAGAAATAAAACAACTGTTTAAGTCTAGAAAATCTCTTATTGAAGAT AAAAATAAAACAATAGAAAAGTTAAAAATTCGCCAAGAACAAGCTAAGAAATTCAAGGAGCTATGGGAGACTATTAATCG CAAAGCAGAAATAGTTTATAAAGATATAAATGAGCTAGATATTATCAACAAAATAGCAGATGCTTTTGATACAGAAAACT TTTCTCAGATAGATACAAAGGTTATAACAAAAGTTTATGATCCTATAAAAGACAAGGTTGTTACCAAAGAAGAGCAATCT CTAGGTAAAATTGATTTCTTTGCTAAAAATAAACTTAGTGAATTTGTATTTGAGTTCTCTAAAAAAGAAAAACTTCCTCT AGGGTTTGTTACAAAATTATTCAGTAAGCTTGATTTGCAAAAGATAAAAAACAATCCAAGTAAAGCTATTAACTTTATAA AAACACAAATAAAAGAGTCTATTCATACGAGTATTTTACAATGTGTTGATTATGATTTTAGCCAAACAAATATATTTAGT AAAAATATTTTGCAAAATGATGATGGTAGTTTTATCAAAGAAATTGAATACACTAAACTAGGTAGAAATATTGGAGATGA GGCGTCTGATGAGTTTTTATTTGATCGAGTTGTTTATGATTCAGACATAGAAAAACAGGCAATATTGAATGATCCTATTT CAATAGATGGTCAGCAAATAACAGTTTTTGCAAAACTACCAAGTATATCTATACCAACACCATACAAATCATATAATCCA GATTTTGCTTACCTTGTTGATAGAGGCGAAAACCAAAAGCAATTATTTTTAGTGGTTGAAACTAAAAGCTATAAAAATAA TAGTGATATCCCTCAAGCTGAAAAAACAAAAATAGATTATGCTAAAAAGTTCTTTGAAGGTTTGCAGAAGCAATTACCTG ATGTTGAAATTAGATTTAAAACCAGGGTAAATAAACAGGAATTGTCTAATATTTTACAGGAGTACCAAAAATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GAAGTATAAAATAGGTATGTGCAAAAAATACACACACCACACAAATAAAAAGCATTATGCAAAAGTTGCATAATGCAGGT AGCTATAAGAGAGATGTTGA
Downstream 100 bases:
>100_bases CTTGGTCAGATATCTTAGCAGAAGAAAAACAAAAACCTTATTTTAAACAAATACTTGACTTTTTGGCGTGTGAAAGCGCT AAAGGTAAGGTAATTTTCCC
Product: Type III restriction enzyme
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 957; Mature: 957
Protein sequence:
>957_residues MLFEKQQYQEDCVNNIVNILDECDVFNNDYSNLKNIIKEHYKTQRYSQFETSSKKQIDVLMETGTGKTFTYIKTIFEINK QFGKTKFIIVLPRTAIKQGVIQNIKLTDEYFYNEYGKHLKFIGYTGKDSLSAVQQSFIRNESDLTVLVSTNSAFNKDANT INQAKEDLVEHSSVWEAIADKKPIVFIDEPHLLKGGATVEALEKLDSLFIRFGATYPTEEEHKLVNVAYALDSINSFENY LVKRIAVKNILTGAEESDIKITKINAKGKQSDKSVTFSYSKNQQIYSTTIKIGDDVGSKTGLDIYHGVTLTKINAKEIFF SNGDTKKVSESYELNDDEIEQMLRVTVSSHFEKEERLFNQCIKELSLFFIPSIADFRGDNPRVRKFFEKIYREIRDEYYH NTTNQEYNKYLDKDFKDGKLQVLEGYFSGDKGDSAKDDDLKKAVDIILNKKEQLLSLDEPLRFVFSVWALQEGWDNPNIF NICKLATTDKETSRRQQVGRGLRLAVNQAGKRQSFKTLAENENAFYDINTLDMVVSGYEKDFIEGIQSEIQKASFGIVGD FLENSLLEANGLNLREISKLINTLEDNQIIEFDESIEKYKIISSIYDFIENNADKLSFLSNDRLQEIKQLFKSRKSLIED KNKTIEKLKIRQEQAKKFKELWETINRKAEIVYKDINELDIINKIADAFDTENFSQIDTKVITKVYDPIKDKVVTKEEQS LGKIDFFAKNKLSEFVFEFSKKEKLPLGFVTKLFSKLDLQKIKNNPSKAINFIKTQIKESIHTSILQCVDYDFSQTNIFS KNILQNDDGSFIKEIEYTKLGRNIGDEASDEFLFDRVVYDSDIEKQAILNDPISIDGQQITVFAKLPSISIPTPYKSYNP DFAYLVDRGENQKQLFLVVETKSYKNNSDIPQAEKTKIDYAKKFFEGLQKQLPDVEIRFKTRVNKQELSNILQEYQK
Sequences:
>Translated_957_residues MLFEKQQYQEDCVNNIVNILDECDVFNNDYSNLKNIIKEHYKTQRYSQFETSSKKQIDVLMETGTGKTFTYIKTIFEINK QFGKTKFIIVLPRTAIKQGVIQNIKLTDEYFYNEYGKHLKFIGYTGKDSLSAVQQSFIRNESDLTVLVSTNSAFNKDANT INQAKEDLVEHSSVWEAIADKKPIVFIDEPHLLKGGATVEALEKLDSLFIRFGATYPTEEEHKLVNVAYALDSINSFENY LVKRIAVKNILTGAEESDIKITKINAKGKQSDKSVTFSYSKNQQIYSTTIKIGDDVGSKTGLDIYHGVTLTKINAKEIFF SNGDTKKVSESYELNDDEIEQMLRVTVSSHFEKEERLFNQCIKELSLFFIPSIADFRGDNPRVRKFFEKIYREIRDEYYH NTTNQEYNKYLDKDFKDGKLQVLEGYFSGDKGDSAKDDDLKKAVDIILNKKEQLLSLDEPLRFVFSVWALQEGWDNPNIF NICKLATTDKETSRRQQVGRGLRLAVNQAGKRQSFKTLAENENAFYDINTLDMVVSGYEKDFIEGIQSEIQKASFGIVGD FLENSLLEANGLNLREISKLINTLEDNQIIEFDESIEKYKIISSIYDFIENNADKLSFLSNDRLQEIKQLFKSRKSLIED KNKTIEKLKIRQEQAKKFKELWETINRKAEIVYKDINELDIINKIADAFDTENFSQIDTKVITKVYDPIKDKVVTKEEQS LGKIDFFAKNKLSEFVFEFSKKEKLPLGFVTKLFSKLDLQKIKNNPSKAINFIKTQIKESIHTSILQCVDYDFSQTNIFS KNILQNDDGSFIKEIEYTKLGRNIGDEASDEFLFDRVVYDSDIEKQAILNDPISIDGQQITVFAKLPSISIPTPYKSYNP DFAYLVDRGENQKQLFLVVETKSYKNNSDIPQAEKTKIDYAKKFFEGLQKQLPDVEIRFKTRVNKQELSNILQEYQK >Mature_957_residues MLFEKQQYQEDCVNNIVNILDECDVFNNDYSNLKNIIKEHYKTQRYSQFETSSKKQIDVLMETGTGKTFTYIKTIFEINK QFGKTKFIIVLPRTAIKQGVIQNIKLTDEYFYNEYGKHLKFIGYTGKDSLSAVQQSFIRNESDLTVLVSTNSAFNKDANT INQAKEDLVEHSSVWEAIADKKPIVFIDEPHLLKGGATVEALEKLDSLFIRFGATYPTEEEHKLVNVAYALDSINSFENY LVKRIAVKNILTGAEESDIKITKINAKGKQSDKSVTFSYSKNQQIYSTTIKIGDDVGSKTGLDIYHGVTLTKINAKEIFF SNGDTKKVSESYELNDDEIEQMLRVTVSSHFEKEERLFNQCIKELSLFFIPSIADFRGDNPRVRKFFEKIYREIRDEYYH NTTNQEYNKYLDKDFKDGKLQVLEGYFSGDKGDSAKDDDLKKAVDIILNKKEQLLSLDEPLRFVFSVWALQEGWDNPNIF NICKLATTDKETSRRQQVGRGLRLAVNQAGKRQSFKTLAENENAFYDINTLDMVVSGYEKDFIEGIQSEIQKASFGIVGD FLENSLLEANGLNLREISKLINTLEDNQIIEFDESIEKYKIISSIYDFIENNADKLSFLSNDRLQEIKQLFKSRKSLIED KNKTIEKLKIRQEQAKKFKELWETINRKAEIVYKDINELDIINKIADAFDTENFSQIDTKVITKVYDPIKDKVVTKEEQS LGKIDFFAKNKLSEFVFEFSKKEKLPLGFVTKLFSKLDLQKIKNNPSKAINFIKTQIKESIHTSILQCVDYDFSQTNIFS KNILQNDDGSFIKEIEYTKLGRNIGDEASDEFLFDRVVYDSDIEKQAILNDPISIDGQQITVFAKLPSISIPTPYKSYNP DFAYLVDRGENQKQLFLVVETKSYKNNSDIPQAEKTKIDYAKKFFEGLQKQLPDVEIRFKTRVNKQELSNILQEYQK
Specific function: This protein cuts the DNA outside of the recognition site. May also act as a helicase involved in unwinding DNA at the cleavage site. Protein only required for restriction but needs the presence of the modification enzyme [H]
COG id: COG3587
COG function: function code V; Restriction endonuclease
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 VRR-NUC domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR006935 - InterPro: IPR014883 [H]
Pfam domain/function: PF04851 ResIII; PF08774 VRR_NUC [H]
EC number: =3.1.21.5 [H]
Molecular weight: Translated: 110625; Mature: 110625
Theoretical pI: Translated: 5.36; Mature: 5.36
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 0.4 %Met (Translated Protein) 0.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 0.4 %Met (Mature Protein) 0.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLFEKQQYQEDCVNNIVNILDECDVFNNDYSNLKNIIKEHYKTQRYSQFETSSKKQIDVL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEE METGTGKTFTYIKTIFEINKQFGKTKFIIVLPRTAIKQGVIQNIKLTDEYFYNEYGKHLK EECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCEE FIGYTGKDSLSAVQQSFIRNESDLTVLVSTNSAFNKDANTINQAKEDLVEHSSVWEAIAD EEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC KKPIVFIDEPHLLKGGATVEALEKLDSLFIRFGATYPTEEEHKLVNVAYALDSINSFENY CCCEEEECCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVKRIAVKNILTGAEESDIKITKINAKGKQSDKSVTFSYSKNQQIYSTTIKIGDDVGSKT HHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEEEECCCCCCCC GLDIYHGVTLTKINAKEIFFSNGDTKKVSESYELNDDEIEQMLRVTVSSHFEKEERLFNQ CCEEECCEEEEEECHHHEEECCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CIKELSLFFIPSIADFRGDNPRVRKFFEKIYREIRDEYYHNTTNQEYNKYLDKDFKDGKL HHHHHHHHHCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCE QVLEGYFSGDKGDSAKDDDLKKAVDIILNKKEQLLSLDEPLRFVFSVWALQEGWDNPNIF EEEEHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE NICKLATTDKETSRRQQVGRGLRLAVNQAGKRQSFKTLAENENAFYDINTLDMVVSGYEK EEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCEEHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHH DFIEGIQSEIQKASFGIVGDFLENSLLEANGLNLREISKLINTLEDNQIIEFDESIEKYK HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHH IISSIYDFIENNADKLSFLSNDRLQEIKQLFKSRKSLIEDKNKTIEKLKIRQEQAKKFKE HHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LWETINRKAEIVYKDINELDIINKIADAFDTENFSQIDTKVITKVYDPIKDKVVTKEEQS HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH LGKIDFFAKNKLSEFVFEFSKKEKLPLGFVTKLFSKLDLQKIKNNPSKAINFIKTQIKES CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH IHTSILQCVDYDFSQTNIFSKNILQNDDGSFIKEIEYTKLGRNIGDEASDEFLFDRVVYD HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHC SDIEKQAILNDPISIDGQQITVFAKLPSISIPTPYKSYNPDFAYLVDRGENQKQLFLVVE CCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEE TKSYKNNSDIPQAEKTKIDYAKKFFEGLQKQLPDVEIRFKTRVNKQELSNILQEYQK ECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MLFEKQQYQEDCVNNIVNILDECDVFNNDYSNLKNIIKEHYKTQRYSQFETSSKKQIDVL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEE METGTGKTFTYIKTIFEINKQFGKTKFIIVLPRTAIKQGVIQNIKLTDEYFYNEYGKHLK EECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCEE FIGYTGKDSLSAVQQSFIRNESDLTVLVSTNSAFNKDANTINQAKEDLVEHSSVWEAIAD EEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC KKPIVFIDEPHLLKGGATVEALEKLDSLFIRFGATYPTEEEHKLVNVAYALDSINSFENY CCCEEEECCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVKRIAVKNILTGAEESDIKITKINAKGKQSDKSVTFSYSKNQQIYSTTIKIGDDVGSKT HHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEEEECCCCCCCC GLDIYHGVTLTKINAKEIFFSNGDTKKVSESYELNDDEIEQMLRVTVSSHFEKEERLFNQ CCEEECCEEEEEECHHHEEECCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CIKELSLFFIPSIADFRGDNPRVRKFFEKIYREIRDEYYHNTTNQEYNKYLDKDFKDGKL HHHHHHHHHCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCE QVLEGYFSGDKGDSAKDDDLKKAVDIILNKKEQLLSLDEPLRFVFSVWALQEGWDNPNIF EEEEHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE NICKLATTDKETSRRQQVGRGLRLAVNQAGKRQSFKTLAENENAFYDINTLDMVVSGYEK EEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCEEHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHH DFIEGIQSEIQKASFGIVGDFLENSLLEANGLNLREISKLINTLEDNQIIEFDESIEKYK HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHH IISSIYDFIENNADKLSFLSNDRLQEIKQLFKSRKSLIEDKNKTIEKLKIRQEQAKKFKE HHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LWETINRKAEIVYKDINELDIINKIADAFDTENFSQIDTKVITKVYDPIKDKVVTKEEQS HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH LGKIDFFAKNKLSEFVFEFSKKEKLPLGFVTKLFSKLDLQKIKNNPSKAINFIKTQIKES CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH IHTSILQCVDYDFSQTNIFSKNILQNDDGSFIKEIEYTKLGRNIGDEASDEFLFDRVVYD HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHC SDIEKQAILNDPISIDGQQITVFAKLPSISIPTPYKSYNPDFAYLVDRGENQKQLFLVVE CCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEE TKSYKNNSDIPQAEKTKIDYAKKFFEGLQKQLPDVEIRFKTRVNKQELSNILQEYQK ECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 10217496; 1587478 [H]