Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 88606908

Identifier: 88606908

GI number: 88606908

Start: 215371

End: 215835

Strand: Direct

Name: 88606908

Synonym: APH_0217

Alternate gene names: NA

Gene position: 215371-215835 (Clockwise)

Preceding gene: 88607197

Following gene: 88607690

Centisome position: 14.64

GC content: 41.94

Gene sequence:

>465_bases
ATGCGCGCACTGTGTACCTTACAAGTGCCTAATGCCGAAATTATAAAATTGATTTTAAATCTTGAGTACACTTATGCATG
TGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGC
TATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTAT
GTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTG
CTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCTA
TGTGCTATGTGCTATGTGCTATGTGCCCATTGACACTCCGTAGTTCTCCTCTATACGCGATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAAGCGACATGTCTCCTATTTTCTCGAATTTCTCGGTGCTGCAGACGAGTATCATCTTTTGAGGTAATGGAAGTACGTGT
TCTGCGTGATATTGGGGCCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTCCACGTTCATAAGAAAGCCCATAGCAATATACTACAGGCACGTATGATACTTCCTGGGCTTGATGCCAAAGTTTTAT
CGCTGCATACGTAATAGTAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 154; Mature: 154

Protein sequence:

>154_residues
MRALCTLQVPNAEIIKLILNLEYTYACAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCY
VLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCPLTLRSSPLYAI

Sequences:

>Translated_154_residues
MRALCTLQVPNAEIIKLILNLEYTYACAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCY
VLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCPLTLRSSPLYAI
>Mature_154_residues
MRALCTLQVPNAEIIKLILNLEYTYACAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCY
VLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCPLTLRSSPLYAI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 17260; Mature: 17260

Theoretical pI: Translated: 6.96; Mature: 6.96

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

22.7 %Cys     (Translated Protein)
11.7 %Met     (Translated Protein)
34.4 %Cys+Met (Translated Protein)
22.7 %Cys     (Mature Protein)
11.7 %Met     (Mature Protein)
34.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRALCTLQVPNAEIIKLILNLEYTYACAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYV
CCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCPLTLRSSPLYAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MRALCTLQVPNAEIIKLILNLEYTYACAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYV
CCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCYVLCAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CYVLCAMCYVLCAMCYVLCAMCPLTLRSSPLYAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 10.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA