Definition Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 chromosome, complete genome.
Accession NC_007681
Length 1,767,403

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 84489182

Identifier: 84489182

GI number: 84489182

Start: 433673

End: 436249

Strand: Direct

Name: 84489182

Synonym: Msp_0368

Alternate gene names: NA

Gene position: 433673-436249 (Clockwise)

Preceding gene: 84489180

Following gene: 84489183

Centisome position: 24.54

GC content: 32.09

Gene sequence:

>2577_bases
ATGGACAATAAAAATTTAGCAATCAAAATAGCGCCTTTCATAATCGCGATATTACTAGTATTAGCAGTTTTTGCAGTTAG
AGCAGAAACAATTAATCTTGGAGGAATCACCAATTCCAGTCAAAAAGCACTATATCAAGATGATAGTGGAATGCCGTATT
TTACTGAGATAGACTCATATTATAATTATCGTTTAACTGAGAATTATTTAAAAAATGGACAACTTGGTGATACGGTTGTT
AATGGAACGTCATGGGATTCGTTGTCAACGTCTCCTAATGGTCGTGAAGTTAATTATCAACCAGTAATAGTTATATTAGC
AGCTTTAGTATATAAATTCGTTAATATGTTTGGATCTGTGTCTTTAACACAGGTAGCATTCTGGCTAGGTCCAATTATAG
GATCACTGGCTGTATTACCAGCATTTTATATTGTTAGAAGAGCTACTGGAAATACTTGGGGAGCAATAGTAGCAGGTGTA
ATTGCAGGAGCAGCACCAGCATACTTCTCACACACATATGGTGGATTTTTTGATACAGATATGTTCAATGTTCTATTGCC
GTTAATGATAGTAGTATTCCTAACTGAAAGTGTTTATGCATCAAAACCATTATTTAAGGGTTTATATGCTGGAATAGCAT
CGTTATTCCTAGGTTTATTTGCTCTGTCATGGAGTGGATATACATACATGGTATTATTAACATTTGGTACATTGATTTTA
TTCATACCTATTAGCTATATTATGGATAAAAAAGATGGAAAGGATTTATCAAATAAAAAGCAATGGCTTAAAAACAATCC
TGCAACATTACCACTTGTAGTATTTATTATACTATCAATAATTATTCTTGCATTAACAGTAGGTTCTTCAATGTTTGAAT
CAATTACAACTGTTCTTGGTTCAGCAACAAGCTTACAAAGTGCAACTGCAGGTACAGCATATCCTAACGTATATGTATCT
GTAGGGGAACTTCAAATTCCACAAGTTATTGATGTAGCAAATCAAAGTGGTGGATTATTCTCATTATTATATGCAGTTGC
TGCATTATTCTTAATGGGATATGTATTAAGAAAAAAACCAGTAAACAAAGATAAAAAAGACGAAACTGAAGAAAAAACAG
AAACAATTGAGGATAAAAAGCCTAGAAATAGGAGATACACTCCTAAAACTAAAAAAGCTGAAGAAGTTATGCATCATGAA
GATGTATTTAAACCAGGAAGATATGAATTAACATCAAAAGAAAAATATAATAACTTATTCCTATATGTTCTTACATTACT
TTGGATTCTTGGTATAGCAATAATGTTAACACAAGGTACAAGGTTTATAGAACAATTTGCAGTACCAGTAGCACTGTTAT
CTGGTCTGTTTGTAGGAATCATGGTTAAATATATCGATTTAAAAACTGAAAATTATTCATATGTAGCATTAATTGCAGCA
ATACTTGTATTGTTAGCAGTGGTAAGTCCATTATATGCAGATCATTTAGCTTCTTCCCAAGCTGTGGGAAGTACAAACGA
TGATATGTACAATACATTAACATGGATTAAAGCAAATACATCACAAGACACTGTACTTGCATCTTGGTGGGACTTTGGTC
ACCTATTCACAGCAGTTGCTGACCGTCAAGTAGTATTTGATGGGGGTTCACAGAATAACATGAGAGCCTATTGGATAGGT
AATGCCCTAACATCAACAGATGAGGCAAAATCTGCAGGTATTTTAAGAATGCTTGCAAACAGTGGAGAAGATGCATCTAA
TACATTAGATTTATATACAAATAATACAGAAAAAACTGTAGAAATATTAAATGCAATTTTACCAATGGATAGAACAGAAG
CAAATTCAGCATTAACTGGTACTTATGGCTTATCACAACAAGAAGCTAACTCAGTACTTGATTTAACACATCCTGCAAAA
GTAAAACCTGTAAACTTAATATTAAGTTCGGATATGCTTTCAAAAGCAGCATGGTGGTCATACTTTGGTTCATGGGACTT
TAAAAACCAAAATTCAACACATTACTCATATTATCCATCTCAAAGTAATATTGAAAACATTAATGGAAGAGAATTTACAT
TAGGTATGGATAATGGTGTTATAGGAGTAAGTTCACCAACCAATGAAACAAATGGTAGTACAATGACATTTGCATATGTG
GATCAATCAAAACTAAATAAAAGTTTAAATATGTCCACACTAGAAGATAAACAACGCATGTCTAAAGAATTATCAGATGG
TACTGGAAATACATTACTAAAACCACATAAATTAATTGTTGTAGAAAACAATCAATTAACAGAAAAAATAGTTAACAATA
ACAGTAACATGTCTATTATGGCTATACATCAAAACGATGGTTCATATTTCACAGTATTATTTGATTCACATTTAGAAGAA
TCATTATTCACAAAACTATACCTTAAAAGTGGATTAAATGTGACAAGATTCAACATGACACATTCAGAACCAGGAATAAG
TGTATGGGATGTATCTGAATATGCAAATACAACTGCCAACAGTACAACAAATTCAAGTACTAATGGTACAAATGTTCAAA
CAAATACTTCAACTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAGATACAGTTTATAATCTGAATTAAAGAAATTTATCAAAATTGACAAATAGTATCCTATTATTCTATCTATATTGGAGG
TAAAAAAGGAGAATTAACAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACCCCTCTTTTTTTTTATTTTTATGATTCAAAGACTAGAATAATGTATTGATATATTAATTTTTTAATGAAATTTTGAGC
TTGTAAAAAGTAGATACTCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 858; Mature: 858

Protein sequence:

>858_residues
MDNKNLAIKIAPFIIAILLVLAVFAVRAETINLGGITNSSQKALYQDDSGMPYFTEIDSYYNYRLTENYLKNGQLGDTVV
NGTSWDSLSTSPNGREVNYQPVIVILAALVYKFVNMFGSVSLTQVAFWLGPIIGSLAVLPAFYIVRRATGNTWGAIVAGV
IAGAAPAYFSHTYGGFFDTDMFNVLLPLMIVVFLTESVYASKPLFKGLYAGIASLFLGLFALSWSGYTYMVLLTFGTLIL
FIPISYIMDKKDGKDLSNKKQWLKNNPATLPLVVFIILSIIILALTVGSSMFESITTVLGSATSLQSATAGTAYPNVYVS
VGELQIPQVIDVANQSGGLFSLLYAVAALFLMGYVLRKKPVNKDKKDETEEKTETIEDKKPRNRRYTPKTKKAEEVMHHE
DVFKPGRYELTSKEKYNNLFLYVLTLLWILGIAIMLTQGTRFIEQFAVPVALLSGLFVGIMVKYIDLKTENYSYVALIAA
ILVLLAVVSPLYADHLASSQAVGSTNDDMYNTLTWIKANTSQDTVLASWWDFGHLFTAVADRQVVFDGGSQNNMRAYWIG
NALTSTDEAKSAGILRMLANSGEDASNTLDLYTNNTEKTVEILNAILPMDRTEANSALTGTYGLSQQEANSVLDLTHPAK
VKPVNLILSSDMLSKAAWWSYFGSWDFKNQNSTHYSYYPSQSNIENINGREFTLGMDNGVIGVSSPTNETNGSTMTFAYV
DQSKLNKSLNMSTLEDKQRMSKELSDGTGNTLLKPHKLIVVENNQLTEKIVNNNSNMSIMAIHQNDGSYFTVLFDSHLEE
SLFTKLYLKSGLNVTRFNMTHSEPGISVWDVSEYANTTANSTTNSSTNGTNVQTNTST

Sequences:

>Translated_858_residues
MDNKNLAIKIAPFIIAILLVLAVFAVRAETINLGGITNSSQKALYQDDSGMPYFTEIDSYYNYRLTENYLKNGQLGDTVV
NGTSWDSLSTSPNGREVNYQPVIVILAALVYKFVNMFGSVSLTQVAFWLGPIIGSLAVLPAFYIVRRATGNTWGAIVAGV
IAGAAPAYFSHTYGGFFDTDMFNVLLPLMIVVFLTESVYASKPLFKGLYAGIASLFLGLFALSWSGYTYMVLLTFGTLIL
FIPISYIMDKKDGKDLSNKKQWLKNNPATLPLVVFIILSIIILALTVGSSMFESITTVLGSATSLQSATAGTAYPNVYVS
VGELQIPQVIDVANQSGGLFSLLYAVAALFLMGYVLRKKPVNKDKKDETEEKTETIEDKKPRNRRYTPKTKKAEEVMHHE
DVFKPGRYELTSKEKYNNLFLYVLTLLWILGIAIMLTQGTRFIEQFAVPVALLSGLFVGIMVKYIDLKTENYSYVALIAA
ILVLLAVVSPLYADHLASSQAVGSTNDDMYNTLTWIKANTSQDTVLASWWDFGHLFTAVADRQVVFDGGSQNNMRAYWIG
NALTSTDEAKSAGILRMLANSGEDASNTLDLYTNNTEKTVEILNAILPMDRTEANSALTGTYGLSQQEANSVLDLTHPAK
VKPVNLILSSDMLSKAAWWSYFGSWDFKNQNSTHYSYYPSQSNIENINGREFTLGMDNGVIGVSSPTNETNGSTMTFAYV
DQSKLNKSLNMSTLEDKQRMSKELSDGTGNTLLKPHKLIVVENNQLTEKIVNNNSNMSIMAIHQNDGSYFTVLFDSHLEE
SLFTKLYLKSGLNVTRFNMTHSEPGISVWDVSEYANTTANSTTNSSTNGTNVQTNTST
>Mature_858_residues
MDNKNLAIKIAPFIIAILLVLAVFAVRAETINLGGITNSSQKALYQDDSGMPYFTEIDSYYNYRLTENYLKNGQLGDTVV
NGTSWDSLSTSPNGREVNYQPVIVILAALVYKFVNMFGSVSLTQVAFWLGPIIGSLAVLPAFYIVRRATGNTWGAIVAGV
IAGAAPAYFSHTYGGFFDTDMFNVLLPLMIVVFLTESVYASKPLFKGLYAGIASLFLGLFALSWSGYTYMVLLTFGTLIL
FIPISYIMDKKDGKDLSNKKQWLKNNPATLPLVVFIILSIIILALTVGSSMFESITTVLGSATSLQSATAGTAYPNVYVS
VGELQIPQVIDVANQSGGLFSLLYAVAALFLMGYVLRKKPVNKDKKDETEEKTETIEDKKPRNRRYTPKTKKAEEVMHHE
DVFKPGRYELTSKEKYNNLFLYVLTLLWILGIAIMLTQGTRFIEQFAVPVALLSGLFVGIMVKYIDLKTENYSYVALIAA
ILVLLAVVSPLYADHLASSQAVGSTNDDMYNTLTWIKANTSQDTVLASWWDFGHLFTAVADRQVVFDGGSQNNMRAYWIG
NALTSTDEAKSAGILRMLANSGEDASNTLDLYTNNTEKTVEILNAILPMDRTEANSALTGTYGLSQQEANSVLDLTHPAK
VKPVNLILSSDMLSKAAWWSYFGSWDFKNQNSTHYSYYPSQSNIENINGREFTLGMDNGVIGVSSPTNETNGSTMTFAYV
DQSKLNKSLNMSTLEDKQRMSKELSDGTGNTLLKPHKLIVVENNQLTEKIVNNNSNMSIMAIHQNDGSYFTVLFDSHLEE
SLFTKLYLKSGLNVTRFNMTHSEPGISVWDVSEYANTTANSTTNSSTNGTNVQTNTST

Specific function: Unknown

COG id: COG1287

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, required for N-linked glycosylation

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the STT3 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003674 [H]

Pfam domain/function: PF02516 STT3 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 94618; Mature: 94618

Theoretical pI: Translated: 5.70; Mature: 5.70

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDNKNLAIKIAPFIIAILLVLAVFAVRAETINLGGITNSSQKALYQDDSGMPYFTEIDSY
CCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCHHEECCCCCCCCEEHHHH
YNYRLTENYLKNGQLGDTVVNGTSWDSLSTSPNGREVNYQPVIVILAALVYKFVNMFGSV
HCCEEEHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SLTQVAFWLGPIIGSLAVLPAFYIVRRATGNTWGAIVAGVIAGAAPAYFSHTYGGFFDTD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCHHH
MFNVLLPLMIVVFLTESVYASKPLFKGLYAGIASLFLGLFALSWSGYTYMVLLTFGTLIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
FIPISYIMDKKDGKDLSNKKQWLKNNPATLPLVVFIILSIIILALTVGSSMFESITTVLG
HHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHC
SATSLQSATAGTAYPNVYVSVGELQIPQVIDVANQSGGLFSLLYAVAALFLMGYVLRKKP
CCHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCEECCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
VNKDKKDETEEKTETIEDKKPRNRRYTPKTKKAEEVMHHEDVFKPGRYELTSKEKYNNLF
CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCHHHHHHH
LYVLTLLWILGIAIMLTQGTRFIEQFAVPVALLSGLFVGIMVKYIDLKTENYSYVALIAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHH
ILVLLAVVSPLYADHLASSQAVGSTNDDMYNTLTWIKANTSQDTVLASWWDFGHLFTAVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHEEEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH
DRQVVFDGGSQNNMRAYWIGNALTSTDEAKSAGILRMLANSGEDASNTLDLYTNNTEKTV
CCEEEEECCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCHHHHH
EILNAILPMDRTEANSALTGTYGLSQQEANSVLDLTHPAKVKPVNLILSSDMLSKAAWWS
HHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHCCEEECCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHH
YFGSWDFKNQNSTHYSYYPSQSNIENINGREFTLGMDNGVIGVSSPTNETNGSTMTFAYV
HHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEECCCCCCCCCCCEEEEEEE
DQSKLNKSLNMSTLEDKQRMSKELSDGTGNTLLKPHKLIVVENNQLTEKIVNNNSNMSIM
CHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHCCCCCEEEE
AIHQNDGSYFTVLFDSHLEESLFTKLYLKSGLNVTRFNMTHSEPGISVWDVSEYANTTAN
EEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCEEEECHHHHCCCCC
STTNSSTNGTNVQTNTST
CCCCCCCCCCCCEECCCC
>Mature Secondary Structure
MDNKNLAIKIAPFIIAILLVLAVFAVRAETINLGGITNSSQKALYQDDSGMPYFTEIDSY
CCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCHHEECCCCCCCCEEHHHH
YNYRLTENYLKNGQLGDTVVNGTSWDSLSTSPNGREVNYQPVIVILAALVYKFVNMFGSV
HCCEEEHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SLTQVAFWLGPIIGSLAVLPAFYIVRRATGNTWGAIVAGVIAGAAPAYFSHTYGGFFDTD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCHHH
MFNVLLPLMIVVFLTESVYASKPLFKGLYAGIASLFLGLFALSWSGYTYMVLLTFGTLIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
FIPISYIMDKKDGKDLSNKKQWLKNNPATLPLVVFIILSIIILALTVGSSMFESITTVLG
HHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHC
SATSLQSATAGTAYPNVYVSVGELQIPQVIDVANQSGGLFSLLYAVAALFLMGYVLRKKP
CCHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCEECCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
VNKDKKDETEEKTETIEDKKPRNRRYTPKTKKAEEVMHHEDVFKPGRYELTSKEKYNNLF
CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCHHHHHHH
LYVLTLLWILGIAIMLTQGTRFIEQFAVPVALLSGLFVGIMVKYIDLKTENYSYVALIAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHH
ILVLLAVVSPLYADHLASSQAVGSTNDDMYNTLTWIKANTSQDTVLASWWDFGHLFTAVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHEEEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH
DRQVVFDGGSQNNMRAYWIGNALTSTDEAKSAGILRMLANSGEDASNTLDLYTNNTEKTV
CCEEEEECCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCHHHHH
EILNAILPMDRTEANSALTGTYGLSQQEANSVLDLTHPAKVKPVNLILSSDMLSKAAWWS
HHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHCCEEECCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHH
YFGSWDFKNQNSTHYSYYPSQSNIENINGREFTLGMDNGVIGVSSPTNETNGSTMTFAYV
HHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEECCCCCCCCCCCEEEEEEE
DQSKLNKSLNMSTLEDKQRMSKELSDGTGNTLLKPHKLIVVENNQLTEKIVNNNSNMSIM
CHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHCCCCCEEEE
AIHQNDGSYFTVLFDSHLEESLFTKLYLKSGLNVTRFNMTHSEPGISVWDVSEYANTTAN
EEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCEEEECHHHHCCCCC
STTNSSTNGTNVQTNTST
CCCCCCCCCCCCEECCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]