Definition Staphylococcus aureus RF122, complete genome.
Accession NC_007622
Length 2,742,531

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The map label for this gene is nhaK [H]

Identifier: 82750333

GI number: 82750333

Start: 643132

End: 645174

Strand: Direct

Name: nhaK [H]

Synonym: SAB0580

Alternate gene names: 82750333

Gene position: 643132-645174 (Clockwise)

Preceding gene: 82750332

Following gene: 82750337

Centisome position: 23.45

GC content: 31.72

Gene sequence:

>2043_bases
TTGGAAATATTTGAAACAATTCTTATATTTATAGTTGTTGTGATACTAAGTTCGTTTGTCCATACTTTCATACCTAAAGT
ACCCCTAGCATTTATACAAATTTTCTTGGGCATGTTACTTTTTATTACCCCAATCCCTGTTCAATTTAATTTTGATTCTG
AATTGTTTATGGTAACAATGATTGCGCCTTTGTTATTTGTAGAAGGTGTTAATGTTTCTAGAGTCCATTTAAGGAAATAT
ATTAAGCCAGTGATGATGATGGCATTAGGATTAGTCATTACTACTGTGATAGGTGTAGGTTTATTTATTCATTGGATTTG
GCCAGATTTACCTATTGGAGCAGCATTTGCAATTGCTGCCATTCTTTGTCCTACTGATGCAGTAGCAGTGCAAGCAATCA
CTAAAGGAAAGGTCTTGCCAAAAGGAGCAATGACAATTCTTGAAGGTGAGTCATTATTGAATGATGCTGCTGGTATTATT
TCATTTAAAATAGCTGTTGGAGTATTAGTTACAGGTGCTTTTTCACTTGTTGATGCTGTTCAGTTGTTTTTAATTGCATC
AATTGGTGGCGCAGTGGTTGGTTTACTTATAGGTATGGCATTAGTAAGGTTCCGATTAACATTGATGCGTCGAGGATATG
AAAACATTAATATGTTTACAATTATTCAATTGTTAACACCATTTGTTACGTATTTAATTGCTGAATTGTTTCACGCATCA
GGAATCATTGCAGCAGTAGTTGCAGGACTTGTACATGGTTTCGAACGTGACAGAATTATGCAAGTACGTACACAACTACA
AATGAGTTACAATCATACATGGAATATACTAGGTTATGTTTTAAATGGCTTTGTTTTTTCAATACTAGGATTTTTAGTAC
CTGAAGTTATTATTAAAATTATTAAAACAGAACCGCACAATTTAATCTTTTTAATAGGCATCACTATAGTTGTTGCTTTA
GCTGTCTATCTATTTAGATTTGTTTGGGTTTATGTCTTATATCCTTATTTTTATTTAGCCATCAGTCCATTCCAAAAAAT
GATGACTAAAAATGATGATGATAATCCAACGACTGAGAAACCACCAAAGCGAAGTTTATACGCTTTAATTATGACGTTAT
GTGGTGTGCATGGAACAATTTCTTTAGCAATCGCATTAACGTTACCGTATTTTTTAGCAGGTCATCATGCTTTTACGTAT
AGAAACGACTTATTATTTATTGCATCTGGTATGGTTATTATTAGTTTGGTAGTTGCACAAGTATTATTGCCATTATTAAC
GAAACCTGCACCTAAAACAGTAATTGGCAATATGTCGTTTAAAGTTGCTAGAATTTATATATTAGAACAAGTTATTGATT
ATCTAAATCAAAAATCTACTTTCGAAACAAGTTTTAAATATGGTAACGTGATTAAGGAATATCATGATAAATTAGCATTT
TTAAAAACTGTAGAGAAAGATGATGAAAACTCTAAAGAATTAGAACGTCTACAAAAAATTGCTTTTAATGTAGAAACAAA
AACATTAGAGTCTTTAGTAGATGAAGGACAAATAACGAATAGTGTACTTGAAAACTATATGCGTTATGCTGAAAGAACAC
AAGTATATAGACAAGCATCATTAATAAGAAGAATGATTGTATTATTACGAGGTGCTTTATTAAAACGAAGAGTACAAACT
AGAGTGAACTCGGCATCTTCACTTAGTGTTACGGATAACTTAATGGAATTAAATAAAATTAATAAATTAGTCCATTATAA
TGTGGTTAGTCGTTTGTCTAAGGAAACAACAAACGATAATACACTTGAAGTTGGAATGGTTTGTGACGGTTATTTAATTC
GAATTGAAAACTTAACACCATCTAATTTCTTCAACTCAGCAAGTGAAGATACGATTACTAAAATTAAATTAAATGCATTG
AGAGAACAACGTCGCATTTTACGTGAGTTGATTGATACAGATGAAGTATCAGAAGGTACAGCGTTAAAACTAAGAGAAGC
CATCAATTATGATGAAATGGTTATTGTAGATAGTATGACGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTTTGTGGTCGCTAACTCAATTTATCCTCTAAAGTATAATTACAACGAGATGTGATACTTAATTTTCAATTAAACAATA
CTTTTTAGAGAGGTGAAAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTCGTAATTATGCTAAAAGGGATTGATGAAAAACTGAATGGCTTTTCATCAATCCCTTTTATTTTAGGAGAATTGAATAG
ATAGTTTTAAACTATACGAA

Product: sodium-hydrogen exhange family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 680; Mature: 680

Protein sequence:

>680_residues
MEIFETILIFIVVVILSSFVHTFIPKVPLAFIQIFLGMLLFITPIPVQFNFDSELFMVTMIAPLLFVEGVNVSRVHLRKY
IKPVMMMALGLVITTVIGVGLFIHWIWPDLPIGAAFAIAAILCPTDAVAVQAITKGKVLPKGAMTILEGESLLNDAAGII
SFKIAVGVLVTGAFSLVDAVQLFLIASIGGAVVGLLIGMALVRFRLTLMRRGYENINMFTIIQLLTPFVTYLIAELFHAS
GIIAAVVAGLVHGFERDRIMQVRTQLQMSYNHTWNILGYVLNGFVFSILGFLVPEVIIKIIKTEPHNLIFLIGITIVVAL
AVYLFRFVWVYVLYPYFYLAISPFQKMMTKNDDDNPTTEKPPKRSLYALIMTLCGVHGTISLAIALTLPYFLAGHHAFTY
RNDLLFIASGMVIISLVVAQVLLPLLTKPAPKTVIGNMSFKVARIYILEQVIDYLNQKSTFETSFKYGNVIKEYHDKLAF
LKTVEKDDENSKELERLQKIAFNVETKTLESLVDEGQITNSVLENYMRYAERTQVYRQASLIRRMIVLLRGALLKRRVQT
RVNSASSLSVTDNLMELNKINKLVHYNVVSRLSKETTNDNTLEVGMVCDGYLIRIENLTPSNFFNSASEDTITKIKLNAL
REQRRILRELIDTDEVSEGTALKLREAINYDEMVIVDSMT

Sequences:

>Translated_680_residues
MEIFETILIFIVVVILSSFVHTFIPKVPLAFIQIFLGMLLFITPIPVQFNFDSELFMVTMIAPLLFVEGVNVSRVHLRKY
IKPVMMMALGLVITTVIGVGLFIHWIWPDLPIGAAFAIAAILCPTDAVAVQAITKGKVLPKGAMTILEGESLLNDAAGII
SFKIAVGVLVTGAFSLVDAVQLFLIASIGGAVVGLLIGMALVRFRLTLMRRGYENINMFTIIQLLTPFVTYLIAELFHAS
GIIAAVVAGLVHGFERDRIMQVRTQLQMSYNHTWNILGYVLNGFVFSILGFLVPEVIIKIIKTEPHNLIFLIGITIVVAL
AVYLFRFVWVYVLYPYFYLAISPFQKMMTKNDDDNPTTEKPPKRSLYALIMTLCGVHGTISLAIALTLPYFLAGHHAFTY
RNDLLFIASGMVIISLVVAQVLLPLLTKPAPKTVIGNMSFKVARIYILEQVIDYLNQKSTFETSFKYGNVIKEYHDKLAF
LKTVEKDDENSKELERLQKIAFNVETKTLESLVDEGQITNSVLENYMRYAERTQVYRQASLIRRMIVLLRGALLKRRVQT
RVNSASSLSVTDNLMELNKINKLVHYNVVSRLSKETTNDNTLEVGMVCDGYLIRIENLTPSNFFNSASEDTITKIKLNAL
REQRRILRELIDTDEVSEGTALKLREAINYDEMVIVDSMT
>Mature_680_residues
MEIFETILIFIVVVILSSFVHTFIPKVPLAFIQIFLGMLLFITPIPVQFNFDSELFMVTMIAPLLFVEGVNVSRVHLRKY
IKPVMMMALGLVITTVIGVGLFIHWIWPDLPIGAAFAIAAILCPTDAVAVQAITKGKVLPKGAMTILEGESLLNDAAGII
SFKIAVGVLVTGAFSLVDAVQLFLIASIGGAVVGLLIGMALVRFRLTLMRRGYENINMFTIIQLLTPFVTYLIAELFHAS
GIIAAVVAGLVHGFERDRIMQVRTQLQMSYNHTWNILGYVLNGFVFSILGFLVPEVIIKIIKTEPHNLIFLIGITIVVAL
AVYLFRFVWVYVLYPYFYLAISPFQKMMTKNDDDNPTTEKPPKRSLYALIMTLCGVHGTISLAIALTLPYFLAGHHAFTY
RNDLLFIASGMVIISLVVAQVLLPLLTKPAPKTVIGNMSFKVARIYILEQVIDYLNQKSTFETSFKYGNVIKEYHDKLAF
LKTVEKDDENSKELERLQKIAFNVETKTLESLVDEGQITNSVLENYMRYAERTQVYRQASLIRRMIVLLRGALLKRRVQT
RVNSASSLSVTDNLMELNKINKLVHYNVVSRLSKETTNDNTLEVGMVCDGYLIRIENLTPSNFFNSASEDTITKIKLNAL
REQRRILRELIDTDEVSEGTALKLREAINYDEMVIVDSMT

Specific function: Transporter involved in the efflux of sodium, potassium, lithium and rubidium [H]

COG id: COG0025

COG function: function code P; NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the monovalent cation:proton antiporter 1 (CPA1) transporter (TC 2.A.36) family. Nhak (TC 2.A.36.3.2) subfamily [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790501, Length=440, Percent_Identity=35.4545454545455, Blast_Score=213, Evalue=4e-56,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6320663, Length=418, Percent_Identity=25.8373205741627, Blast_Score=70, Evalue=7e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006153
- InterPro:   IPR018422
- InterPro:   IPR018417
- InterPro:   IPR004705 [H]

Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 76421; Mature: 76421

Theoretical pI: Translated: 8.81; Mature: 8.81

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHCCCCCEEEEECCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHCCCCCEEEEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]