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The map label for this gene is 78779691

Identifier: 78779691

GI number: 78779691

Start: 1216418

End: 1217737

Strand: Reverse

Name: 78779691

Synonym: PMT9312_1308

Alternate gene names: NA

Gene position: 1217737-1216418 (Counterclockwise)

Preceding gene: 78779696

Following gene: 78779690

Centisome position: 71.25

GC content: 22.65

Gene sequence:

>1320_bases
ATGAAAGAAAATCTTAGAAATAATAATTTTATATTTAATTCTTATTTTAATAAGACGCTAATAAGTAGATCCCTATTAAT
AATTGAAAAAATTATAAGTTTTTTAATGACAGCATTAATGGCAAGCATTCTCTCTTATAAAGATATTGGCTTTTGGTCTC
AGGTAATGTTTTCGGTATCTCTTTTTACCTCTTTAGTAGGCTTCAATATACCTAATGGAATCATAGCTATAGTTCCAAGA
ATAAATAATTCAGAGGAAAAATATGAATTTATTTTTAAGTCAGCTTTATTTATATTATTAACTGGACTAATTATTTCTAT
ATTTTTACTTTTTTTTAAGGACTTCGTATCAAATATTTTATTCAATAATGTTTTGAATTTAAATATTTTTATATTGATTC
TAATTATAGGATTCTCGGAATTATTATTAGAATTTGTTCTTTATACATATAGAAGTATAAAGAATTTTAGTTTTGCAAAC
TATATTTTAATTCTAAGAATCTTGCCACGTATTTTTGCATTTGTAGGCATTATAAAAAATGATATTAATCTAATAATAAA
TTTATATTCGATAACATTTATCATTTCATGTATAACTATCATTTTATTTTTATATAGATATTATAGTTTTAAAATTATTT
TCTTAATAAGAAAAAATTTAAATTTAAGTTTATTTTTTAGTCCCAAGCCTTATTTGCAGAGTCTGTTTTCACTTTCAAGA
AAGTCTGTTTTCGCAACCTTAACAGCTTCATTATTCTTTTTCCTTCTTAGAAGTATTACACTTTCAAATATGGGATTAGA
TGGAGTAGGGCAGCTTTCTTTAGCTATTTCAGCAGGAGCAACTCTATTATCTTTAACAGCATTTGTTGGATTTACTTTCT
ATCCATATATAAGTAATAAGGCAATAAATGAAAAAAAAATAGCTTATCAAAAAACTAGAAAATTATCTTTAAATCTTATC
TATTTATCAATACTAATCCCTTTTATTTTAATATTATTAAAATTAGTATTTAAAAATAATTTGAATTTTTATCCATTCAC
AATTAGCTCTATTGATCTTTTTATGGCTTTTTTAGCTTACGGATTTTTAGGTGCTTATCAATTATCACAACCATTTGCTT
TTGCTTTAACTGATAATATTAATATTGTTAAAATTGAAATACTCTCATCAATTCTTTCTTTAGGCTTACTTTTTATAATT
TTTTTAGTTGATAATTTTTCTATTCATTTTGCAATTCTATCATTTTGTATTTATGCATTTTGCAATTATTTGCAAGCCAA
TCAAAGAAACTTTAAAATATTTAAAGAGAATATTGGCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATTCTTTTTATAGATTTTAAGATAATCTCAGATAAGATTAAAGTAAATGCAATTTCTATATTTACAAATAAATAAAAA
TAAATAGTCAAATTTATCTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGATGCCATTACAAATAAGTTTTAATGAAGATTCTATATTTAGCACCAGGGAATTCAATTCATAGTAAAAAATGGATTG
AAAAAATTAAATCTCTTTAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 439; Mature: 439

Protein sequence:

>439_residues
MKENLRNNNFIFNSYFNKTLISRSLLIIEKIISFLMTALMASILSYKDIGFWSQVMFSVSLFTSLVGFNIPNGIIAIVPR
INNSEEKYEFIFKSALFILLTGLIISIFLLFFKDFVSNILFNNVLNLNIFILILIIGFSELLLEFVLYTYRSIKNFSFAN
YILILRILPRIFAFVGIIKNDINLIINLYSITFIISCITIILFLYRYYSFKIIFLIRKNLNLSLFFSPKPYLQSLFSLSR
KSVFATLTASLFFFLLRSITLSNMGLDGVGQLSLAISAGATLLSLTAFVGFTFYPYISNKAINEKKIAYQKTRKLSLNLI
YLSILIPFILILLKLVFKNNLNFYPFTISSIDLFMAFLAYGFLGAYQLSQPFAFALTDNINIVKIEILSSILSLGLLFII
FLVDNFSIHFAILSFCIYAFCNYLQANQRNFKIFKENIG

Sequences:

>Translated_439_residues
MKENLRNNNFIFNSYFNKTLISRSLLIIEKIISFLMTALMASILSYKDIGFWSQVMFSVSLFTSLVGFNIPNGIIAIVPR
INNSEEKYEFIFKSALFILLTGLIISIFLLFFKDFVSNILFNNVLNLNIFILILIIGFSELLLEFVLYTYRSIKNFSFAN
YILILRILPRIFAFVGIIKNDINLIINLYSITFIISCITIILFLYRYYSFKIIFLIRKNLNLSLFFSPKPYLQSLFSLSR
KSVFATLTASLFFFLLRSITLSNMGLDGVGQLSLAISAGATLLSLTAFVGFTFYPYISNKAINEKKIAYQKTRKLSLNLI
YLSILIPFILILLKLVFKNNLNFYPFTISSIDLFMAFLAYGFLGAYQLSQPFAFALTDNINIVKIEILSSILSLGLLFII
FLVDNFSIHFAILSFCIYAFCNYLQANQRNFKIFKENIG
>Mature_439_residues
MKENLRNNNFIFNSYFNKTLISRSLLIIEKIISFLMTALMASILSYKDIGFWSQVMFSVSLFTSLVGFNIPNGIIAIVPR
INNSEEKYEFIFKSALFILLTGLIISIFLLFFKDFVSNILFNNVLNLNIFILILIIGFSELLLEFVLYTYRSIKNFSFAN
YILILRILPRIFAFVGIIKNDINLIINLYSITFIISCITIILFLYRYYSFKIIFLIRKNLNLSLFFSPKPYLQSLFSLSR
KSVFATLTASLFFFLLRSITLSNMGLDGVGQLSLAISAGATLLSLTAFVGFTFYPYISNKAINEKKIAYQKTRKLSLNLI
YLSILIPFILILLKLVFKNNLNFYPFTISSIDLFMAFLAYGFLGAYQLSQPFAFALTDNINIVKIEILSSILSLGLLFII
FLVDNFSIHFAILSFCIYAFCNYLQANQRNFKIFKENIG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50474; Mature: 50474

Theoretical pI: Translated: 10.11; Mature: 10.11

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKENLRNNNFIFNSYFNKTLISRSLLIIEKIISFLMTALMASILSYKDIGFWSQVMFSVS
CCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
LFTSLVGFNIPNGIIAIVPRINNSEEKYEFIFKSALFILLTGLIISIFLLFFKDFVSNIL
HHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FNNVLNLNIFILILIIGFSELLLEFVLYTYRSIKNFSFANYILILRILPRIFAFVGIIKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DINLIINLYSITFIISCITIILFLYRYYSFKIIFLIRKNLNLSLFFSPKPYLQSLFSLSR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHH
KSVFATLTASLFFFLLRSITLSNMGLDGVGQLSLAISAGATLLSLTAFVGFTFYPYISNK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
AINEKKIAYQKTRKLSLNLIYLSILIPFILILLKLVFKNNLNFYPFTISSIDLFMAFLAY
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHH
GFLGAYQLSQPFAFALTDNINIVKIEILSSILSLGLLFIIFLVDNFSIHFAILSFCIYAF
HHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
CNYLQANQRNFKIFKENIG
HHHHHCCCCCHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKENLRNNNFIFNSYFNKTLISRSLLIIEKIISFLMTALMASILSYKDIGFWSQVMFSVS
CCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
LFTSLVGFNIPNGIIAIVPRINNSEEKYEFIFKSALFILLTGLIISIFLLFFKDFVSNIL
HHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FNNVLNLNIFILILIIGFSELLLEFVLYTYRSIKNFSFANYILILRILPRIFAFVGIIKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DINLIINLYSITFIISCITIILFLYRYYSFKIIFLIRKNLNLSLFFSPKPYLQSLFSLSR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHH
KSVFATLTASLFFFLLRSITLSNMGLDGVGQLSLAISAGATLLSLTAFVGFTFYPYISNK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
AINEKKIAYQKTRKLSLNLIYLSILIPFILILLKLVFKNNLNFYPFTISSIDLFMAFLAY
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHH
GFLGAYQLSQPFAFALTDNINIVKIEILSSILSLGLLFIIFLVDNFSIHFAILSFCIYAF
HHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
CNYLQANQRNFKIFKENIG
HHHHHCCCCCHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA