| Definition | Pseudomonas fluorescens Pf0-1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007492 |
| Length | 6,438,405 |
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The map label for this gene is 77458653
Identifier: 77458653
GI number: 77458653
Start: 2780846
End: 2783395
Strand: Direct
Name: 77458653
Synonym: Pfl01_2428
Alternate gene names: NA
Gene position: 2780846-2783395 (Clockwise)
Preceding gene: 77458649
Following gene: 77458654
Centisome position: 43.19
GC content: 45.88
Gene sequence:
>2550_bases ATGGCCGCGCATAGTGATGCAACAGGTTACCTTTTAGCTCACAGAGATTCAGTCAACGAAGCGTGGTTTCACGCGGTGTG CGAAGCAGCAATAAACTCACTTGGAGGAAACCTCTCTCCAAACGAACTTGAGCGTCTCTGGAGGCTTTTTTGCGGACTAG AAACCTTTGCACCAGTGGCAACTACTCCCCCTGCGCTGAAGACAAATGCACGTAATGCGATCCAACCGTTTCATCTGGAG ACTCTGTCGGATTTCTCCGGATTCAAGAAGTTGAGTGGCACGCTGAGGCTGGATTTATCGAAACGTATTACACTGGTTTT TGGTCGAAATGGGGCAGGGAAATCGAGCTTATGTCAGGCTCTTAAAATTTTGGCAAATCCAGAGAAGCCGAAAGAACCTC TGAATAATGTTCGCTCTTCTAGCAAAAATATTCCTTCCTTTAGTTATAAGCTACGGGGTGGCTCAGTAGAAAATTGGACT GAGTTGGACGGGTTTGGTGGGCAGTCTCAGGCACTAAAATATTTTGATTCGGCTGTCGCTCATAAACATATAAATAGTTC AATTTCACCAGAAGCGGTAGTGGAGTTAAGTGCGTTTCGACTAGAGTGTTTCGACTATGCTCGGGAGTATTTGAAACAGT TTCAGGCTTACGGTGTGTCTAAGGTTTTGGAGTGCCGGCAAGATACCGATAAGAAAATTTCTGAAATTAAGCTGAGCGTT CATGCAGTTATAGATACAAATACTGGAGTTTTTAAGGATTGGAGTGCAATTAATTGCCAGCCTATGCTTTCTTGGATAGG AACGGTGAGCTTTGGTGAGGAGAGGCGCCTTCAAAAGACAGAAAAGCAGGCAAGGTTGGAACAACTTAGGGGGGCGACGA GCGCTGAGGGTCAGCAAGCCCTCAGTCTGAAAAAAAGTTTGCTAGGCCAAATAAAACAATCGTTATCAAATTTTGTTCAG CAATGTATAGGTTTTTCATATCCTGCCTATAGCCAGATACTTTTTTCAATCCAGCAAAAACAGGCTGCAAGCGTTGAGTT GGCAGGTGTTGTGTTCTCCAAAGAATTGGATGTGACGGGGCAACAGAGGCTTCTATTTGCAGCTGCTGCATTACGGCCAT TTGTTCCCGCTGAGACCTGTCCGTTATGTCGCCAAAAACTAGAGGGTCAAGCTAATGCGCTCTTCCACGCCTTCCATAAT CACTTGACTTCAACTATGCAAACGGAGCTTTCCGTACTAAATGTTCAGCAGAAGGATGAGCAATCCAAGAAAGAAATGAT CGAGAGCTTCGCAGAGATAAATTATTCACAGTATTCGAGTGTTTTGGATATTGATTTCCTGCGTGCTGTTTCAGATCTTA TCAAATTGGTCAAGGCTTCATTGCAAGTGCCTGTAATTGATCAGGCTGCGCTCGGCAATTATTCTCGGTATATCGAGCTG AACTCTTTCGTTGAGACTATAAATGCAGAACACAACAAGGTAGCCTCAGCTTTGACGTTGGCGTCGAATGGATTGCAAGC TCTAAACGAGGAAATTTCAAAGCTCACAACTGAAATTGGTGCGCTCAGCATAGACGAAGTCGCATATTCCGTGCGTCCTC AAATCGAGGCGATATGCCAAAACGCAATCCACTTTGCAAGCGCCGCCAATAGTGTGGAGTCTTATAACTTCACTTCGCGC CTGTCAGCGTTGACCGCACGAAAGAAGGATGCGCATACAGCGCTGGTGCTAAGTTCATTTGTACCGTATTTGGACGCCGA GTATCGGAGACTTTGTGGTGCCTCGCTTGAGCAAATCGGTGTGCGCCTTGCTAACCAAGGGGCTGATGCGATAGTGCTCC CGAAGATTGGTGATGAGCTGGTGCATCGCGTGCTGAGTGAAGGTGAACTCAAGATTCACGCGCTTGCCCTGTTCATGTGT GAGGCAACGGTCGCACCGCATCAGGTTCTGGTTCTAGATGATCCAGTGACCAGCTTTGACTACAACTATATTTCTAATTT TTGTGAGCGTCTGCGTGACTACGCTAAAGACAATACACAATCACAACTCATCGTACTGACACACAATTGGGACTTCTTTG CGAACCTCCAGGCTACTTTAAATGGCTCGGGCCTGAGTGGATCCTTCTCAGTGCAAGTGCTGGAAGACTGTTCGACGGTG TCCGAATACGTAGAGAAGTGGGAGGAGTTGTGTTTGCAGATTGATGGCTACATTGACCCGCAGATAGAGATCAGCCCTGA TGAAAAATCCAAGCTTTCTGCTCTGCTAAGGCGTTTGGTGGAGAGACTTACGAATGCATATGTGTTCAATGAACAACGCC ACCAGTACAAAATCAGAGCGTTGCAGGTCTCCAACTTTAAGGAGTTTGTGAAACTGGTGCCATTGCTTCCGGCAGAGGCG GACAGACTTAAAGATTTGTATGCCAATCTGAGCCCGCTTGAACATGATGATATACGAAACTATTATTCCACTAAGTCTAT ATATCAATTTGGCAGTTGGTATGATGAGATTAAGTCAATAAAAAATGCAGTTGAGGCGCGTCGTACTTAG
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases CGTGTGATGTTCAAGGTTGATGGTGGCGCGATCTTTTATAAATATGGCTAATGTCACTTCTGTCATATGATCGGGGTGGG GAATATTTCTAAAAAGAGGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 849; Mature: 848
Protein sequence:
>849_residues MAAHSDATGYLLAHRDSVNEAWFHAVCEAAINSLGGNLSPNELERLWRLFCGLETFAPVATTPPALKTNARNAIQPFHLE TLSDFSGFKKLSGTLRLDLSKRITLVFGRNGAGKSSLCQALKILANPEKPKEPLNNVRSSSKNIPSFSYKLRGGSVENWT ELDGFGGQSQALKYFDSAVAHKHINSSISPEAVVELSAFRLECFDYAREYLKQFQAYGVSKVLECRQDTDKKISEIKLSV HAVIDTNTGVFKDWSAINCQPMLSWIGTVSFGEERRLQKTEKQARLEQLRGATSAEGQQALSLKKSLLGQIKQSLSNFVQ QCIGFSYPAYSQILFSIQQKQAASVELAGVVFSKELDVTGQQRLLFAAAALRPFVPAETCPLCRQKLEGQANALFHAFHN HLTSTMQTELSVLNVQQKDEQSKKEMIESFAEINYSQYSSVLDIDFLRAVSDLIKLVKASLQVPVIDQAALGNYSRYIEL NSFVETINAEHNKVASALTLASNGLQALNEEISKLTTEIGALSIDEVAYSVRPQIEAICQNAIHFASAANSVESYNFTSR LSALTARKKDAHTALVLSSFVPYLDAEYRRLCGASLEQIGVRLANQGADAIVLPKIGDELVHRVLSEGELKIHALALFMC EATVAPHQVLVLDDPVTSFDYNYISNFCERLRDYAKDNTQSQLIVLTHNWDFFANLQATLNGSGLSGSFSVQVLEDCSTV SEYVEKWEELCLQIDGYIDPQIEISPDEKSKLSALLRRLVERLTNAYVFNEQRHQYKIRALQVSNFKEFVKLVPLLPAEA DRLKDLYANLSPLEHDDIRNYYSTKSIYQFGSWYDEIKSIKNAVEARRT
Sequences:
>Translated_849_residues MAAHSDATGYLLAHRDSVNEAWFHAVCEAAINSLGGNLSPNELERLWRLFCGLETFAPVATTPPALKTNARNAIQPFHLE TLSDFSGFKKLSGTLRLDLSKRITLVFGRNGAGKSSLCQALKILANPEKPKEPLNNVRSSSKNIPSFSYKLRGGSVENWT ELDGFGGQSQALKYFDSAVAHKHINSSISPEAVVELSAFRLECFDYAREYLKQFQAYGVSKVLECRQDTDKKISEIKLSV HAVIDTNTGVFKDWSAINCQPMLSWIGTVSFGEERRLQKTEKQARLEQLRGATSAEGQQALSLKKSLLGQIKQSLSNFVQ QCIGFSYPAYSQILFSIQQKQAASVELAGVVFSKELDVTGQQRLLFAAAALRPFVPAETCPLCRQKLEGQANALFHAFHN HLTSTMQTELSVLNVQQKDEQSKKEMIESFAEINYSQYSSVLDIDFLRAVSDLIKLVKASLQVPVIDQAALGNYSRYIEL NSFVETINAEHNKVASALTLASNGLQALNEEISKLTTEIGALSIDEVAYSVRPQIEAICQNAIHFASAANSVESYNFTSR LSALTARKKDAHTALVLSSFVPYLDAEYRRLCGASLEQIGVRLANQGADAIVLPKIGDELVHRVLSEGELKIHALALFMC EATVAPHQVLVLDDPVTSFDYNYISNFCERLRDYAKDNTQSQLIVLTHNWDFFANLQATLNGSGLSGSFSVQVLEDCSTV SEYVEKWEELCLQIDGYIDPQIEISPDEKSKLSALLRRLVERLTNAYVFNEQRHQYKIRALQVSNFKEFVKLVPLLPAEA DRLKDLYANLSPLEHDDIRNYYSTKSIYQFGSWYDEIKSIKNAVEARRT >Mature_848_residues AAHSDATGYLLAHRDSVNEAWFHAVCEAAINSLGGNLSPNELERLWRLFCGLETFAPVATTPPALKTNARNAIQPFHLET LSDFSGFKKLSGTLRLDLSKRITLVFGRNGAGKSSLCQALKILANPEKPKEPLNNVRSSSKNIPSFSYKLRGGSVENWTE LDGFGGQSQALKYFDSAVAHKHINSSISPEAVVELSAFRLECFDYAREYLKQFQAYGVSKVLECRQDTDKKISEIKLSVH AVIDTNTGVFKDWSAINCQPMLSWIGTVSFGEERRLQKTEKQARLEQLRGATSAEGQQALSLKKSLLGQIKQSLSNFVQQ CIGFSYPAYSQILFSIQQKQAASVELAGVVFSKELDVTGQQRLLFAAAALRPFVPAETCPLCRQKLEGQANALFHAFHNH LTSTMQTELSVLNVQQKDEQSKKEMIESFAEINYSQYSSVLDIDFLRAVSDLIKLVKASLQVPVIDQAALGNYSRYIELN SFVETINAEHNKVASALTLASNGLQALNEEISKLTTEIGALSIDEVAYSVRPQIEAICQNAIHFASAANSVESYNFTSRL SALTARKKDAHTALVLSSFVPYLDAEYRRLCGASLEQIGVRLANQGADAIVLPKIGDELVHRVLSEGELKIHALALFMCE ATVAPHQVLVLDDPVTSFDYNYISNFCERLRDYAKDNTQSQLIVLTHNWDFFANLQATLNGSGLSGSFSVQVLEDCSTVS EYVEKWEELCLQIDGYIDPQIEISPDEKSKLSALLRRLVERLTNAYVFNEQRHQYKIRALQVSNFKEFVKLVPLLPAEAD RLKDLYANLSPLEHDDIRNYYSTKSIYQFGSWYDEIKSIKNAVEARRT
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 94680; Mature: 94549
Theoretical pI: Translated: 6.47; Mature: 6.47
Prosite motif: PS00028 ZINC_FINGER_C2H2_1 ; PS00165 DEHYDRATASE_SER_THR
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.8 %Cys (Translated Protein) 0.6 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.8 %Cys (Mature Protein) 0.5 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAAHSDATGYLLAHRDSVNEAWFHAVCEAAINSLGGNLSPNELERLWRLFCGLETFAPVA CCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCC TTPPALKTNARNAIQPFHLETLSDFSGFKKLSGTLRLDLSKRITLVFGRNGAGKSSLCQA CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCHHHHHHH LKILANPEKPKEPLNNVRSSSKNIPSFSYKLRGGSVENWTELDGFGGQSQALKYFDSAVA HHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH HKHINSSISPEAVVELSAFRLECFDYAREYLKQFQAYGVSKVLECRQDTDKKISEIKLSV HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE HAVIDTNTGVFKDWSAINCQPMLSWIGTVSFGEERRLQKTEKQARLEQLRGATSAEGQQA EEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHH LSLKKSLLGQIKQSLSNFVQQCIGFSYPAYSQILFSIQQKQAASVELAGVVFSKELDVTG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEHHHEEEECCCCCCC QQRLLFAAAALRPFVPAETCPLCRQKLEGQANALFHAFHNHLTSTMQTELSVLNVQQKDE HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QSKKEMIESFAEINYSQYSSVLDIDFLRAVSDLIKLVKASLQVPVIDQAALGNYSRYIEL HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCHHHEEH NSFVETINAEHNKVASALTLASNGLQALNEEISKLTTEIGALSIDEVAYSVRPQIEAICQ HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHH NAIHFASAANSVESYNFTSRLSALTARKKDAHTALVLSSFVPYLDAEYRRLCGASLEQIG HHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH VRLANQGADAIVLPKIGDELVHRVLSEGELKIHALALFMCEATVAPHQVLVLDDPVTSFD HHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCC YNYISNFCERLRDYAKDNTQSQLIVLTHNWDFFANLQATLNGSGLSGSFSVQVLEDCSTV HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHHH SEYVEKWEELCLQIDGYIDPQIEISPDEKSKLSALLRRLVERLTNAYVFNEQRHQYKIRA HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEEEE LQVSNFKEFVKLVPLLPAEADRLKDLYANLSPLEHDDIRNYYSTKSIYQFGSWYDEIKSI EEHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNAVEARRT HHHHHHCCC >Mature Secondary Structure AAHSDATGYLLAHRDSVNEAWFHAVCEAAINSLGGNLSPNELERLWRLFCGLETFAPVA CCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCC TTPPALKTNARNAIQPFHLETLSDFSGFKKLSGTLRLDLSKRITLVFGRNGAGKSSLCQA CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCHHHHHHH LKILANPEKPKEPLNNVRSSSKNIPSFSYKLRGGSVENWTELDGFGGQSQALKYFDSAVA HHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH HKHINSSISPEAVVELSAFRLECFDYAREYLKQFQAYGVSKVLECRQDTDKKISEIKLSV HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE HAVIDTNTGVFKDWSAINCQPMLSWIGTVSFGEERRLQKTEKQARLEQLRGATSAEGQQA EEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHH LSLKKSLLGQIKQSLSNFVQQCIGFSYPAYSQILFSIQQKQAASVELAGVVFSKELDVTG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEHHHEEEECCCCCCC QQRLLFAAAALRPFVPAETCPLCRQKLEGQANALFHAFHNHLTSTMQTELSVLNVQQKDE HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QSKKEMIESFAEINYSQYSSVLDIDFLRAVSDLIKLVKASLQVPVIDQAALGNYSRYIEL HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCHHHEEH NSFVETINAEHNKVASALTLASNGLQALNEEISKLTTEIGALSIDEVAYSVRPQIEAICQ HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHH NAIHFASAANSVESYNFTSRLSALTARKKDAHTALVLSSFVPYLDAEYRRLCGASLEQIG HHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH VRLANQGADAIVLPKIGDELVHRVLSEGELKIHALALFMCEATVAPHQVLVLDDPVTSFD HHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCC YNYISNFCERLRDYAKDNTQSQLIVLTHNWDFFANLQATLNGSGLSGSFSVQVLEDCSTV HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHHH SEYVEKWEELCLQIDGYIDPQIEISPDEKSKLSALLRRLVERLTNAYVFNEQRHQYKIRA HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEEEE LQVSNFKEFVKLVPLLPAEADRLKDLYANLSPLEHDDIRNYYSTKSIYQFGSWYDEIKSI EEHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNAVEARRT HHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA