Definition Pseudomonas fluorescens Pf0-1 chromosome, complete genome.
Accession NC_007492
Length 6,438,405

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The map label for this gene is 77458653

Identifier: 77458653

GI number: 77458653

Start: 2780846

End: 2783395

Strand: Direct

Name: 77458653

Synonym: Pfl01_2428

Alternate gene names: NA

Gene position: 2780846-2783395 (Clockwise)

Preceding gene: 77458649

Following gene: 77458654

Centisome position: 43.19

GC content: 45.88

Gene sequence:

>2550_bases
ATGGCCGCGCATAGTGATGCAACAGGTTACCTTTTAGCTCACAGAGATTCAGTCAACGAAGCGTGGTTTCACGCGGTGTG
CGAAGCAGCAATAAACTCACTTGGAGGAAACCTCTCTCCAAACGAACTTGAGCGTCTCTGGAGGCTTTTTTGCGGACTAG
AAACCTTTGCACCAGTGGCAACTACTCCCCCTGCGCTGAAGACAAATGCACGTAATGCGATCCAACCGTTTCATCTGGAG
ACTCTGTCGGATTTCTCCGGATTCAAGAAGTTGAGTGGCACGCTGAGGCTGGATTTATCGAAACGTATTACACTGGTTTT
TGGTCGAAATGGGGCAGGGAAATCGAGCTTATGTCAGGCTCTTAAAATTTTGGCAAATCCAGAGAAGCCGAAAGAACCTC
TGAATAATGTTCGCTCTTCTAGCAAAAATATTCCTTCCTTTAGTTATAAGCTACGGGGTGGCTCAGTAGAAAATTGGACT
GAGTTGGACGGGTTTGGTGGGCAGTCTCAGGCACTAAAATATTTTGATTCGGCTGTCGCTCATAAACATATAAATAGTTC
AATTTCACCAGAAGCGGTAGTGGAGTTAAGTGCGTTTCGACTAGAGTGTTTCGACTATGCTCGGGAGTATTTGAAACAGT
TTCAGGCTTACGGTGTGTCTAAGGTTTTGGAGTGCCGGCAAGATACCGATAAGAAAATTTCTGAAATTAAGCTGAGCGTT
CATGCAGTTATAGATACAAATACTGGAGTTTTTAAGGATTGGAGTGCAATTAATTGCCAGCCTATGCTTTCTTGGATAGG
AACGGTGAGCTTTGGTGAGGAGAGGCGCCTTCAAAAGACAGAAAAGCAGGCAAGGTTGGAACAACTTAGGGGGGCGACGA
GCGCTGAGGGTCAGCAAGCCCTCAGTCTGAAAAAAAGTTTGCTAGGCCAAATAAAACAATCGTTATCAAATTTTGTTCAG
CAATGTATAGGTTTTTCATATCCTGCCTATAGCCAGATACTTTTTTCAATCCAGCAAAAACAGGCTGCAAGCGTTGAGTT
GGCAGGTGTTGTGTTCTCCAAAGAATTGGATGTGACGGGGCAACAGAGGCTTCTATTTGCAGCTGCTGCATTACGGCCAT
TTGTTCCCGCTGAGACCTGTCCGTTATGTCGCCAAAAACTAGAGGGTCAAGCTAATGCGCTCTTCCACGCCTTCCATAAT
CACTTGACTTCAACTATGCAAACGGAGCTTTCCGTACTAAATGTTCAGCAGAAGGATGAGCAATCCAAGAAAGAAATGAT
CGAGAGCTTCGCAGAGATAAATTATTCACAGTATTCGAGTGTTTTGGATATTGATTTCCTGCGTGCTGTTTCAGATCTTA
TCAAATTGGTCAAGGCTTCATTGCAAGTGCCTGTAATTGATCAGGCTGCGCTCGGCAATTATTCTCGGTATATCGAGCTG
AACTCTTTCGTTGAGACTATAAATGCAGAACACAACAAGGTAGCCTCAGCTTTGACGTTGGCGTCGAATGGATTGCAAGC
TCTAAACGAGGAAATTTCAAAGCTCACAACTGAAATTGGTGCGCTCAGCATAGACGAAGTCGCATATTCCGTGCGTCCTC
AAATCGAGGCGATATGCCAAAACGCAATCCACTTTGCAAGCGCCGCCAATAGTGTGGAGTCTTATAACTTCACTTCGCGC
CTGTCAGCGTTGACCGCACGAAAGAAGGATGCGCATACAGCGCTGGTGCTAAGTTCATTTGTACCGTATTTGGACGCCGA
GTATCGGAGACTTTGTGGTGCCTCGCTTGAGCAAATCGGTGTGCGCCTTGCTAACCAAGGGGCTGATGCGATAGTGCTCC
CGAAGATTGGTGATGAGCTGGTGCATCGCGTGCTGAGTGAAGGTGAACTCAAGATTCACGCGCTTGCCCTGTTCATGTGT
GAGGCAACGGTCGCACCGCATCAGGTTCTGGTTCTAGATGATCCAGTGACCAGCTTTGACTACAACTATATTTCTAATTT
TTGTGAGCGTCTGCGTGACTACGCTAAAGACAATACACAATCACAACTCATCGTACTGACACACAATTGGGACTTCTTTG
CGAACCTCCAGGCTACTTTAAATGGCTCGGGCCTGAGTGGATCCTTCTCAGTGCAAGTGCTGGAAGACTGTTCGACGGTG
TCCGAATACGTAGAGAAGTGGGAGGAGTTGTGTTTGCAGATTGATGGCTACATTGACCCGCAGATAGAGATCAGCCCTGA
TGAAAAATCCAAGCTTTCTGCTCTGCTAAGGCGTTTGGTGGAGAGACTTACGAATGCATATGTGTTCAATGAACAACGCC
ACCAGTACAAAATCAGAGCGTTGCAGGTCTCCAACTTTAAGGAGTTTGTGAAACTGGTGCCATTGCTTCCGGCAGAGGCG
GACAGACTTAAAGATTTGTATGCCAATCTGAGCCCGCTTGAACATGATGATATACGAAACTATTATTCCACTAAGTCTAT
ATATCAATTTGGCAGTTGGTATGATGAGATTAAGTCAATAAAAAATGCAGTTGAGGCGCGTCGTACTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGAGCTAATTGTATCGCTCAATATGCGTACCCCCAAACGTCATAGCGCTAATGGCATTGTGCTCCTATAGTGAATAAGTC
ATCAGCAAAAGGATGTCAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGTGTGATGTTCAAGGTTGATGGTGGCGCGATCTTTTATAAATATGGCTAATGTCACTTCTGTCATATGATCGGGGTGGG
GAATATTTCTAAAAAGAGGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 849; Mature: 848

Protein sequence:

>849_residues
MAAHSDATGYLLAHRDSVNEAWFHAVCEAAINSLGGNLSPNELERLWRLFCGLETFAPVATTPPALKTNARNAIQPFHLE
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DRLKDLYANLSPLEHDDIRNYYSTKSIYQFGSWYDEIKSIKNAVEARRT

Sequences:

>Translated_849_residues
MAAHSDATGYLLAHRDSVNEAWFHAVCEAAINSLGGNLSPNELERLWRLFCGLETFAPVATTPPALKTNARNAIQPFHLE
TLSDFSGFKKLSGTLRLDLSKRITLVFGRNGAGKSSLCQALKILANPEKPKEPLNNVRSSSKNIPSFSYKLRGGSVENWT
ELDGFGGQSQALKYFDSAVAHKHINSSISPEAVVELSAFRLECFDYAREYLKQFQAYGVSKVLECRQDTDKKISEIKLSV
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QCIGFSYPAYSQILFSIQQKQAASVELAGVVFSKELDVTGQQRLLFAAAALRPFVPAETCPLCRQKLEGQANALFHAFHN
HLTSTMQTELSVLNVQQKDEQSKKEMIESFAEINYSQYSSVLDIDFLRAVSDLIKLVKASLQVPVIDQAALGNYSRYIEL
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EATVAPHQVLVLDDPVTSFDYNYISNFCERLRDYAKDNTQSQLIVLTHNWDFFANLQATLNGSGLSGSFSVQVLEDCSTV
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DRLKDLYANLSPLEHDDIRNYYSTKSIYQFGSWYDEIKSIKNAVEARRT
>Mature_848_residues
AAHSDATGYLLAHRDSVNEAWFHAVCEAAINSLGGNLSPNELERLWRLFCGLETFAPVATTPPALKTNARNAIQPFHLET
LSDFSGFKKLSGTLRLDLSKRITLVFGRNGAGKSSLCQALKILANPEKPKEPLNNVRSSSKNIPSFSYKLRGGSVENWTE
LDGFGGQSQALKYFDSAVAHKHINSSISPEAVVELSAFRLECFDYAREYLKQFQAYGVSKVLECRQDTDKKISEIKLSVH
AVIDTNTGVFKDWSAINCQPMLSWIGTVSFGEERRLQKTEKQARLEQLRGATSAEGQQALSLKKSLLGQIKQSLSNFVQQ
CIGFSYPAYSQILFSIQQKQAASVELAGVVFSKELDVTGQQRLLFAAAALRPFVPAETCPLCRQKLEGQANALFHAFHNH
LTSTMQTELSVLNVQQKDEQSKKEMIESFAEINYSQYSSVLDIDFLRAVSDLIKLVKASLQVPVIDQAALGNYSRYIELN
SFVETINAEHNKVASALTLASNGLQALNEEISKLTTEIGALSIDEVAYSVRPQIEAICQNAIHFASAANSVESYNFTSRL
SALTARKKDAHTALVLSSFVPYLDAEYRRLCGASLEQIGVRLANQGADAIVLPKIGDELVHRVLSEGELKIHALALFMCE
ATVAPHQVLVLDDPVTSFDYNYISNFCERLRDYAKDNTQSQLIVLTHNWDFFANLQATLNGSGLSGSFSVQVLEDCSTVS
EYVEKWEELCLQIDGYIDPQIEISPDEKSKLSALLRRLVERLTNAYVFNEQRHQYKIRALQVSNFKEFVKLVPLLPAEAD
RLKDLYANLSPLEHDDIRNYYSTKSIYQFGSWYDEIKSIKNAVEARRT

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 94680; Mature: 94549

Theoretical pI: Translated: 6.47; Mature: 6.47

Prosite motif: PS00028 ZINC_FINGER_C2H2_1 ; PS00165 DEHYDRATASE_SER_THR

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
0.6 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
0.5 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAAHSDATGYLLAHRDSVNEAWFHAVCEAAINSLGGNLSPNELERLWRLFCGLETFAPVA
CCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCC
TTPPALKTNARNAIQPFHLETLSDFSGFKKLSGTLRLDLSKRITLVFGRNGAGKSSLCQA
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCHHHHHHH
LKILANPEKPKEPLNNVRSSSKNIPSFSYKLRGGSVENWTELDGFGGQSQALKYFDSAVA
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
HKHINSSISPEAVVELSAFRLECFDYAREYLKQFQAYGVSKVLECRQDTDKKISEIKLSV
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE
HAVIDTNTGVFKDWSAINCQPMLSWIGTVSFGEERRLQKTEKQARLEQLRGATSAEGQQA
EEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHH
LSLKKSLLGQIKQSLSNFVQQCIGFSYPAYSQILFSIQQKQAASVELAGVVFSKELDVTG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEHHHEEEECCCCCCC
QQRLLFAAAALRPFVPAETCPLCRQKLEGQANALFHAFHNHLTSTMQTELSVLNVQQKDE
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QSKKEMIESFAEINYSQYSSVLDIDFLRAVSDLIKLVKASLQVPVIDQAALGNYSRYIEL
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCHHHEEH
NSFVETINAEHNKVASALTLASNGLQALNEEISKLTTEIGALSIDEVAYSVRPQIEAICQ
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NAIHFASAANSVESYNFTSRLSALTARKKDAHTALVLSSFVPYLDAEYRRLCGASLEQIG
HHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
VRLANQGADAIVLPKIGDELVHRVLSEGELKIHALALFMCEATVAPHQVLVLDDPVTSFD
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YNYISNFCERLRDYAKDNTQSQLIVLTHNWDFFANLQATLNGSGLSGSFSVQVLEDCSTV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHHH
SEYVEKWEELCLQIDGYIDPQIEISPDEKSKLSALLRRLVERLTNAYVFNEQRHQYKIRA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEEEE
LQVSNFKEFVKLVPLLPAEADRLKDLYANLSPLEHDDIRNYYSTKSIYQFGSWYDEIKSI
EEHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNAVEARRT
HHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
AAHSDATGYLLAHRDSVNEAWFHAVCEAAINSLGGNLSPNELERLWRLFCGLETFAPVA
CCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCC
TTPPALKTNARNAIQPFHLETLSDFSGFKKLSGTLRLDLSKRITLVFGRNGAGKSSLCQA
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCHHHHHHH
LKILANPEKPKEPLNNVRSSSKNIPSFSYKLRGGSVENWTELDGFGGQSQALKYFDSAVA
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HKHINSSISPEAVVELSAFRLECFDYAREYLKQFQAYGVSKVLECRQDTDKKISEIKLSV
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NAIHFASAANSVESYNFTSRLSALTARKKDAHTALVLSSFVPYLDAEYRRLCGASLEQIG
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HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEEEE
LQVSNFKEFVKLVPLLPAEADRLKDLYANLSPLEHDDIRNYYSTKSIYQFGSWYDEIKSI
EEHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNAVEARRT
HHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA