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The map label for this gene is mefE

Identifier: 71910263

GI number: 71910263

Start: 445794

End: 447002

Strand: Direct

Name: mefE

Synonym: M5005_Spy_0450

Alternate gene names: NA

Gene position: 445794-447002 (Clockwise)

Preceding gene: 71910262

Following gene: 71910269

Centisome position: 24.25

GC content: 30.11

Gene sequence:

>1209_bases
ATGAACAATAGGAAAAAAAATATTCAATATTTAGTGTATAGTAAAGTTATATATCGAATTGGCGATGTTATGTTTGATTT
TGCTAACAATACTTTTCTTGCTGGGCTTAATCCAGCGTCTCTATCATTAGTTGCAGTATATCAGTCTCTAGAAAGTGTCA
TAGGTGTTCTATTTAATTTATTTGGTGGAGTCATTGCAGACAGTTTCAAGCGGAAAAAAATTATTATTACTACAAATATC
TTATGTGGCACAGCTTGCTTAGTACTCTCGTTCCTAACAAAAGAGCAATGGTTGGTTTATGCCATTGTACTAACTAATGT
TATCTTGGCATTTATGAGTGCTTTTTCTAGTCCATCCTATAAAGCATTTACAAAAGAAATTGTTAAAAAAGATAGTATAT
CACAACTTAATTCATTGCTAGAGACAACAAGTACTGTAATCAAAGTAACAGTTCCTATGGTAGCAATTTTCTTATATAAG
CTACTTGGTATACACGGTGTATTACTATTGGATGGACTATCATTTCTAATAGCTGCTTTACTAATTTCCTTTATTTTACC
TGTTAATGACGAAGTGGTGATAAAGGAGAAGGTGACAATCAGAGAAATATTTAACGATTTAAAAATAGGATTTAAATATG
TTTACAGCCATAAGTCCATCTTTATTATTACCGTTCTTTCTGCACTTGTTAATTTTTTTCTAGCCGCTTATAATTTATTG
TTGCCCTATAGTAATCAAATGTTTGGAGAAATTTCAACTGGACTTTATGGCACTTTTTTAACAGCAGAAGCAATTGGTGG
ATTTATTGGGGCAATATTAAGTGGTTTTGTGAATAAAGAATTATCAAGTATGAGATTGATATTGTTTCTATCTTTATCAG
GACTGATGTTAATGTTAGCTCCCCCATTTTATATTATGTTTCATAATGCAATTATTTTAGCTTTGTCACCAGCTTTATTC
AGTTTATTTCTTTCCATCTTTAATATTCAATTTTTTTCTCTTGTCCAGAAAGATGTTGATAACGATTTTTTAGGGAGAGT
GTTTGGTATTATCTTTACAATAACTATTCTTTTTATGCCTATTGGGACTGGCTTTTTCTCGGTGGCATTAAATCCTAACA
ATAGCTTTAATCTTTTTATTATTGGTTCGTGCATTACTACATTGTCATTAGTATTTAGAATATTATTTAAAAAGTATAAT
ATTCGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTCAGTATGATTAACAAAAACATTTTTGCGAAAAAATATTTTTAAGTAATAAATTCAGTTAAAAGTTATTATATCTGA
AAATTTTAAAGGTCTTTAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAGTTAGTACTAAGTATTATTGAGAAAATTATTTTTTTTCAAAGTAAAGGCACTAAGTTGATCTGACTTACACATCTTAT
CAACTTAGTGCTTTTTTTAT

Product: macrolide-efflux protein

Products: NA

Alternate protein names: Transporter SP; ABC Transporter Permease; Permease; Efflux Protein; Transporter Protein; Facilitator Family Transporter; ABC Transporter Membrane-Spanning Permease

Number of amino acids: Translated: 402; Mature: 402

Protein sequence:

>402_residues
MNNRKKNIQYLVYSKVIYRIGDVMFDFANNTFLAGLNPASLSLVAVYQSLESVIGVLFNLFGGVIADSFKRKKIIITTNI
LCGTACLVLSFLTKEQWLVYAIVLTNVILAFMSAFSSPSYKAFTKEIVKKDSISQLNSLLETTSTVIKVTVPMVAIFLYK
LLGIHGVLLLDGLSFLIAALLISFILPVNDEVVIKEKVTIREIFNDLKIGFKYVYSHKSIFIITVLSALVNFFLAAYNLL
LPYSNQMFGEISTGLYGTFLTAEAIGGFIGAILSGFVNKELSSMRLILFLSLSGLMLMLAPPFYIMFHNAIILALSPALF
SLFLSIFNIQFFSLVQKDVDNDFLGRVFGIIFTITILFMPIGTGFFSVALNPNNSFNLFIIGSCITTLSLVFRILFKKYN
IR

Sequences:

>Translated_402_residues
MNNRKKNIQYLVYSKVIYRIGDVMFDFANNTFLAGLNPASLSLVAVYQSLESVIGVLFNLFGGVIADSFKRKKIIITTNI
LCGTACLVLSFLTKEQWLVYAIVLTNVILAFMSAFSSPSYKAFTKEIVKKDSISQLNSLLETTSTVIKVTVPMVAIFLYK
LLGIHGVLLLDGLSFLIAALLISFILPVNDEVVIKEKVTIREIFNDLKIGFKYVYSHKSIFIITVLSALVNFFLAAYNLL
LPYSNQMFGEISTGLYGTFLTAEAIGGFIGAILSGFVNKELSSMRLILFLSLSGLMLMLAPPFYIMFHNAIILALSPALF
SLFLSIFNIQFFSLVQKDVDNDFLGRVFGIIFTITILFMPIGTGFFSVALNPNNSFNLFIIGSCITTLSLVFRILFKKYN
IR
>Mature_402_residues
MNNRKKNIQYLVYSKVIYRIGDVMFDFANNTFLAGLNPASLSLVAVYQSLESVIGVLFNLFGGVIADSFKRKKIIITTNI
LCGTACLVLSFLTKEQWLVYAIVLTNVILAFMSAFSSPSYKAFTKEIVKKDSISQLNSLLETTSTVIKVTVPMVAIFLYK
LLGIHGVLLLDGLSFLIAALLISFILPVNDEVVIKEKVTIREIFNDLKIGFKYVYSHKSIFIITVLSALVNFFLAAYNLL
LPYSNQMFGEISTGLYGTFLTAEAIGGFIGAILSGFVNKELSSMRLILFLSLSGLMLMLAPPFYIMFHNAIILALSPALF
SLFLSIFNIQFFSLVQKDVDNDFLGRVFGIIFTITILFMPIGTGFFSVALNPNNSFNLFIIGSCITTLSLVFRILFKKYN
IR

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44784; Mature: 44784

Theoretical pI: Translated: 9.76; Mature: 9.76

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNNRKKNIQYLVYSKVIYRIGDVMFDFANNTFLAGLNPASLSLVAVYQSLESVIGVLFNL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGGVIADSFKRKKIIITTNILCGTACLVLSFLTKEQWLVYAIVLTNVILAFMSAFSSPSY
HHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
KAFTKEIVKKDSISQLNSLLETTSTVIKVTVPMVAIFLYKLLGIHGVLLLDGLSFLIAAL
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LISFILPVNDEVVIKEKVTIREIFNDLKIGFKYVYSHKSIFIITVLSALVNFFLAAYNLL
HHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPYSNQMFGEISTGLYGTFLTAEAIGGFIGAILSGFVNKELSSMRLILFLSLSGLMLMLA
CCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PPFYIMFHNAIILALSPALFSLFLSIFNIQFFSLVQKDVDNDFLGRVFGIIFTITILFMP
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGTGFFSVALNPNNSFNLFIIGSCITTLSLVFRILFKKYNIR
HCCCEEEEEECCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNNRKKNIQYLVYSKVIYRIGDVMFDFANNTFLAGLNPASLSLVAVYQSLESVIGVLFNL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGGVIADSFKRKKIIITTNILCGTACLVLSFLTKEQWLVYAIVLTNVILAFMSAFSSPSY
HHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
KAFTKEIVKKDSISQLNSLLETTSTVIKVTVPMVAIFLYKLLGIHGVLLLDGLSFLIAAL
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LISFILPVNDEVVIKEKVTIREIFNDLKIGFKYVYSHKSIFIITVLSALVNFFLAAYNLL
HHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPYSNQMFGEISTGLYGTFLTAEAIGGFIGAILSGFVNKELSSMRLILFLSLSGLMLMLA
CCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PPFYIMFHNAIILALSPALFSLFLSIFNIQFFSLVQKDVDNDFLGRVFGIIFTITILFMP
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGTGFFSVALNPNNSFNLFIIGSCITTLSLVFRILFKKYNIR
HCCCEEEEEECCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA