Definition Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome, complete genome.
Accession NC_007295
Length 897,405

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The map label for this gene is 71893846

Identifier: 71893846

GI number: 71893846

Start: 634692

End: 635918

Strand: Reverse

Name: 71893846

Synonym: MHJ_0495

Alternate gene names: NA

Gene position: 635918-634692 (Counterclockwise)

Preceding gene: 71893847

Following gene: 71893845

Centisome position: 70.86

GC content: 23.06

Gene sequence:

>1227_bases
TTGGTTGGCTCGGAAGCTTTTAAATTTTCATCCTCGCTTTATATTTATAAAATTACTGGAGATTTTTGACTAGTAACAAT
TTTGTATCTTTTAATTCAACTACCAAGTTTAATAGTTTATTTATTTAGTACAAAAATTGTAAAACGCTGAGAAAATGATA
AGTTAATTCTTCTAATTTCTGATCTTTTTAGTGCGCTTGTCCTTGGAATTTTACTTATTATTTTTTTCTTTGGTTTAGAT
ATTAAAACTTATCAGTTTTCAATAATTTTGATTTTTTTTAACACTTTATTAGGTTTTATTCACTCTTTTCGTTTTATTTA
TCTAAAAAATATTGTCTATTTTTTAGCCCAAAATCAGAAACAAATGGTAAATATTAATATTTTGTCTACTTTTGCAACTA
GTATGGGATTTTTGCTTTCGGCTATTTTTGGACTTTTTTTATATACAAAGTTAGAATTTTACTGAATGATAATTTTTAAT
TTATTTACTTATTTAGTTTCAGGATTTTTATATTATTCTTTAAAACTAAATTCCCAAAAAATCGAATTTAGTATGTTAGA
TGAAAAACCTAAAAAAGTAATTCATAATTACCCAAAAATCAATTTTTATAAGTGGTTGTTTATTTTTTCAGGATCACTTG
TAATTTCAATAATTATGATTCCGAAATTATCAGGATTTGCGCAATTTTTTAAATACATTAATTCAGGAATAAATTTAGAT
CAAAAAAATTTAATTTATTATGATTTTCAAATTTGAGGACCTTATTTGAATATCGCTTTTTCTTTTGCCGCTGTTATTGG
AACTCTTATAAATTTTTGACTTTCAAATAAAAAAGGTAAGATTTTTAATATTAATTTTCTAATTTTTCCTTTAATTTTAG
TCCATCTTATTTGACTTATAATCCCTAAAAGCGCCAATATGCATTTCCAATTTTATAGTTATATTATAATTATTATATTT
GTTCAAGTTTTATTTTCATTATTTTTGCCTTCTTTTTATAGTTTAAGTTATAATTTATTTACAAAAGAGAAATTCCATTT
CCAAAATGGAATTCAACTAGCAGCAAGAATTATTTTTTCTAGCATTTTTTCAATTATTACAACCGCTATTACGCTAGTTA
GTTCATATTTTTTTTCTTATCTGGTTTTTGTAATTGTGTTATCAGTTTTGTTGCTTATAAACTCTTATTCACTTTTTCGG
ATTGCTGGCGGATTCAAAAAATATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATTAAAAAATTTTTTCTATTTATTATGAATTTGCAAGGAAATTAATGACAAATTTCATTAAAAACGCCTGTAAATATA
CAAGTTCATTAAATTTTTCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAAAAAGTTTAAAAAATTTAAAAAAAAAGGAAAAAATAAGGAAAAATAGATTGTTTTTCATATTTTTGGTTAAAAAAAC
AACTAATTTGGATTAGTTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 408; Mature: 408

Protein sequence:

>408_residues
MVGSEAFKFSSSLYIYKITGDFWLVTILYLLIQLPSLIVYLFSTKIVKRWENDKLILLISDLFSALVLGILLIIFFFGLD
IKTYQFSIILIFFNTLLGFIHSFRFIYLKNIVYFLAQNQKQMVNINILSTFATSMGFLLSAIFGLFLYTKLEFYWMIIFN
LFTYLVSGFLYYSLKLNSQKIEFSMLDEKPKKVIHNYPKINFYKWLFIFSGSLVISIIMIPKLSGFAQFFKYINSGINLD
QKNLIYYDFQIWGPYLNIAFSFAAVIGTLINFWLSNKKGKIFNINFLIFPLILVHLIWLIIPKSANMHFQFYSYIIIIIF
VQVLFSLFLPSFYSLSYNLFTKEKFHFQNGIQLAARIIFSSIFSIITTAITLVSSYFFSYLVFVIVLSVLLLINSYSLFR
IAGGFKKY

Sequences:

>Translated_408_residues
MVGSEAFKFSSSLYIYKITGDF*LVTILYLLIQLPSLIVYLFSTKIVKR*ENDKLILLISDLFSALVLGILLIIFFFGLD
IKTYQFSIILIFFNTLLGFIHSFRFIYLKNIVYFLAQNQKQMVNINILSTFATSMGFLLSAIFGLFLYTKLEFY*MIIFN
LFTYLVSGFLYYSLKLNSQKIEFSMLDEKPKKVIHNYPKINFYKWLFIFSGSLVISIIMIPKLSGFAQFFKYINSGINLD
QKNLIYYDFQI*GPYLNIAFSFAAVIGTLINF*LSNKKGKIFNINFLIFPLILVHLI*LIIPKSANMHFQFYSYIIIIIF
VQVLFSLFLPSFYSLSYNLFTKEKFHFQNGIQLAARIIFSSIFSIITTAITLVSSYFFSYLVFVIVLSVLLLINSYSLFR
IAGGFKKY
>Mature_408_residues
MVGSEAFKFSSSLYIYKITGDF*LVTILYLLIQLPSLIVYLFSTKIVKR*ENDKLILLISDLFSALVLGILLIIFFFGLD
IKTYQFSIILIFFNTLLGFIHSFRFIYLKNIVYFLAQNQKQMVNINILSTFATSMGFLLSAIFGLFLYTKLEFY*MIIFN
LFTYLVSGFLYYSLKLNSQKIEFSMLDEKPKKVIHNYPKINFYKWLFIFSGSLVISIIMIPKLSGFAQFFKYINSGINLD
QKNLIYYDFQI*GPYLNIAFSFAAVIGTLINF*LSNKKGKIFNINFLIFPLILVHLI*LIIPKSANMHFQFYSYIIIIIF
VQVLFSLFLPSFYSLSYNLFTKEKFHFQNGIQLAARIIFSSIFSIITTAITLVSSYFFSYLVFVIVLSVLLLINSYSLFR
IAGGFKKY

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46602; Mature: 46602

Theoretical pI: Translated: 10.08; Mature: 10.08

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVGSEAFKFSSSLYIYKITGDFLVTILYLLIQLPSLIVYLFSTKIVKRENDKLILLISDL
CCCCHHHEECCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEHHHH
FSALVLGILLIIFFFGLDIKTYQFSIILIFFNTLLGFIHSFRFIYLKNIVYFLAQNQKQM
HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE
VNINILSTFATSMGFLLSAIFGLFLYTKLEFYMIIFNLFTYLVSGFLYYSLKLNSQKIEF
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEE
SMLDEKPKKVIHNYPKINFYKWLFIFSGSLVISIIMIPKLSGFAQFFKYINSGINLDQKN
HHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
LIYYDFQIGPYLNIAFSFAAVIGTLINFLSNKKGKIFNINFLIFPLILVHLILIIPKSAN
EEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
MHFQFYSYIIIIIFVQVLFSLFLPSFYSLSYNLFTKEKFHFQNGIQLAARIIFSSIFSII
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCEEHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TTAITLVSSYFFSYLVFVIVLSVLLLINSYSLFRIAGGFKKY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MVGSEAFKFSSSLYIYKITGDFLVTILYLLIQLPSLIVYLFSTKIVKRENDKLILLISDL
CCCCHHHEECCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEHHHH
FSALVLGILLIIFFFGLDIKTYQFSIILIFFNTLLGFIHSFRFIYLKNIVYFLAQNQKQM
HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE
VNINILSTFATSMGFLLSAIFGLFLYTKLEFYMIIFNLFTYLVSGFLYYSLKLNSQKIEF
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEE
SMLDEKPKKVIHNYPKINFYKWLFIFSGSLVISIIMIPKLSGFAQFFKYINSGINLDQKN
HHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
LIYYDFQIGPYLNIAFSFAAVIGTLINFLSNKKGKIFNINFLIFPLILVHLILIIPKSAN
EEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
MHFQFYSYIIIIIFVQVLFSLFLPSFYSLSYNLFTKEKFHFQNGIQLAARIIFSSIFSII
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCEEHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TTAITLVSSYFFSYLVFVIVLSVLLLINSYSLFRIAGGFKKY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA