| Definition | Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007295 |
| Length | 897,405 |
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The map label for this gene is 71893846
Identifier: 71893846
GI number: 71893846
Start: 634692
End: 635918
Strand: Reverse
Name: 71893846
Synonym: MHJ_0495
Alternate gene names: NA
Gene position: 635918-634692 (Counterclockwise)
Preceding gene: 71893847
Following gene: 71893845
Centisome position: 70.86
GC content: 23.06
Gene sequence:
>1227_bases TTGGTTGGCTCGGAAGCTTTTAAATTTTCATCCTCGCTTTATATTTATAAAATTACTGGAGATTTTTGACTAGTAACAAT TTTGTATCTTTTAATTCAACTACCAAGTTTAATAGTTTATTTATTTAGTACAAAAATTGTAAAACGCTGAGAAAATGATA AGTTAATTCTTCTAATTTCTGATCTTTTTAGTGCGCTTGTCCTTGGAATTTTACTTATTATTTTTTTCTTTGGTTTAGAT ATTAAAACTTATCAGTTTTCAATAATTTTGATTTTTTTTAACACTTTATTAGGTTTTATTCACTCTTTTCGTTTTATTTA TCTAAAAAATATTGTCTATTTTTTAGCCCAAAATCAGAAACAAATGGTAAATATTAATATTTTGTCTACTTTTGCAACTA GTATGGGATTTTTGCTTTCGGCTATTTTTGGACTTTTTTTATATACAAAGTTAGAATTTTACTGAATGATAATTTTTAAT TTATTTACTTATTTAGTTTCAGGATTTTTATATTATTCTTTAAAACTAAATTCCCAAAAAATCGAATTTAGTATGTTAGA TGAAAAACCTAAAAAAGTAATTCATAATTACCCAAAAATCAATTTTTATAAGTGGTTGTTTATTTTTTCAGGATCACTTG TAATTTCAATAATTATGATTCCGAAATTATCAGGATTTGCGCAATTTTTTAAATACATTAATTCAGGAATAAATTTAGAT CAAAAAAATTTAATTTATTATGATTTTCAAATTTGAGGACCTTATTTGAATATCGCTTTTTCTTTTGCCGCTGTTATTGG AACTCTTATAAATTTTTGACTTTCAAATAAAAAAGGTAAGATTTTTAATATTAATTTTCTAATTTTTCCTTTAATTTTAG TCCATCTTATTTGACTTATAATCCCTAAAAGCGCCAATATGCATTTCCAATTTTATAGTTATATTATAATTATTATATTT GTTCAAGTTTTATTTTCATTATTTTTGCCTTCTTTTTATAGTTTAAGTTATAATTTATTTACAAAAGAGAAATTCCATTT CCAAAATGGAATTCAACTAGCAGCAAGAATTATTTTTTCTAGCATTTTTTCAATTATTACAACCGCTATTACGCTAGTTA GTTCATATTTTTTTTCTTATCTGGTTTTTGTAATTGTGTTATCAGTTTTGTTGCTTATAAACTCTTATTCACTTTTTCGG ATTGCTGGCGGATTCAAAAAATATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTATTAAAAAATTTTTTCTATTTATTATGAATTTGCAAGGAAATTAATGACAAATTTCATTAAAAACGCCTGTAAATATA CAAGTTCATTAAATTTTTCC
Downstream 100 bases:
>100_bases GAAAAAAGTTTAAAAAATTTAAAAAAAAAGGAAAAAATAAGGAAAAATAGATTGTTTTTCATATTTTTGGTTAAAAAAAC AACTAATTTGGATTAGTTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 408; Mature: 408
Protein sequence:
>408_residues MVGSEAFKFSSSLYIYKITGDFWLVTILYLLIQLPSLIVYLFSTKIVKRWENDKLILLISDLFSALVLGILLIIFFFGLD IKTYQFSIILIFFNTLLGFIHSFRFIYLKNIVYFLAQNQKQMVNINILSTFATSMGFLLSAIFGLFLYTKLEFYWMIIFN LFTYLVSGFLYYSLKLNSQKIEFSMLDEKPKKVIHNYPKINFYKWLFIFSGSLVISIIMIPKLSGFAQFFKYINSGINLD QKNLIYYDFQIWGPYLNIAFSFAAVIGTLINFWLSNKKGKIFNINFLIFPLILVHLIWLIIPKSANMHFQFYSYIIIIIF VQVLFSLFLPSFYSLSYNLFTKEKFHFQNGIQLAARIIFSSIFSIITTAITLVSSYFFSYLVFVIVLSVLLLINSYSLFR IAGGFKKY
Sequences:
>Translated_408_residues MVGSEAFKFSSSLYIYKITGDF*LVTILYLLIQLPSLIVYLFSTKIVKR*ENDKLILLISDLFSALVLGILLIIFFFGLD IKTYQFSIILIFFNTLLGFIHSFRFIYLKNIVYFLAQNQKQMVNINILSTFATSMGFLLSAIFGLFLYTKLEFY*MIIFN LFTYLVSGFLYYSLKLNSQKIEFSMLDEKPKKVIHNYPKINFYKWLFIFSGSLVISIIMIPKLSGFAQFFKYINSGINLD QKNLIYYDFQI*GPYLNIAFSFAAVIGTLINF*LSNKKGKIFNINFLIFPLILVHLI*LIIPKSANMHFQFYSYIIIIIF VQVLFSLFLPSFYSLSYNLFTKEKFHFQNGIQLAARIIFSSIFSIITTAITLVSSYFFSYLVFVIVLSVLLLINSYSLFR IAGGFKKY >Mature_408_residues MVGSEAFKFSSSLYIYKITGDF*LVTILYLLIQLPSLIVYLFSTKIVKR*ENDKLILLISDLFSALVLGILLIIFFFGLD IKTYQFSIILIFFNTLLGFIHSFRFIYLKNIVYFLAQNQKQMVNINILSTFATSMGFLLSAIFGLFLYTKLEFY*MIIFN LFTYLVSGFLYYSLKLNSQKIEFSMLDEKPKKVIHNYPKINFYKWLFIFSGSLVISIIMIPKLSGFAQFFKYINSGINLD QKNLIYYDFQI*GPYLNIAFSFAAVIGTLINF*LSNKKGKIFNINFLIFPLILVHLI*LIIPKSANMHFQFYSYIIIIIF VQVLFSLFLPSFYSLSYNLFTKEKFHFQNGIQLAARIIFSSIFSIITTAITLVSSYFFSYLVFVIVLSVLLLINSYSLFR IAGGFKKY
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 46602; Mature: 46602
Theoretical pI: Translated: 10.08; Mature: 10.08
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 1.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 1.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVGSEAFKFSSSLYIYKITGDFLVTILYLLIQLPSLIVYLFSTKIVKRENDKLILLISDL CCCCHHHEECCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEHHHH FSALVLGILLIIFFFGLDIKTYQFSIILIFFNTLLGFIHSFRFIYLKNIVYFLAQNQKQM HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE VNINILSTFATSMGFLLSAIFGLFLYTKLEFYMIIFNLFTYLVSGFLYYSLKLNSQKIEF EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEE SMLDEKPKKVIHNYPKINFYKWLFIFSGSLVISIIMIPKLSGFAQFFKYINSGINLDQKN HHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC LIYYDFQIGPYLNIAFSFAAVIGTLINFLSNKKGKIFNINFLIFPLILVHLILIIPKSAN EEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC MHFQFYSYIIIIIFVQVLFSLFLPSFYSLSYNLFTKEKFHFQNGIQLAARIIFSSIFSII CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCEEHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TTAITLVSSYFFSYLVFVIVLSVLLLINSYSLFRIAGGFKKY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MVGSEAFKFSSSLYIYKITGDFLVTILYLLIQLPSLIVYLFSTKIVKRENDKLILLISDL CCCCHHHEECCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEHHHH FSALVLGILLIIFFFGLDIKTYQFSIILIFFNTLLGFIHSFRFIYLKNIVYFLAQNQKQM HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE VNINILSTFATSMGFLLSAIFGLFLYTKLEFYMIIFNLFTYLVSGFLYYSLKLNSQKIEF EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEE SMLDEKPKKVIHNYPKINFYKWLFIFSGSLVISIIMIPKLSGFAQFFKYINSGINLDQKN HHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC LIYYDFQIGPYLNIAFSFAAVIGTLINFLSNKKGKIFNINFLIFPLILVHLILIIPKSAN EEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC MHFQFYSYIIIIIFVQVLFSLFLPSFYSLSYNLFTKEKFHFQNGIQLAARIIFSSIFSII CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCEEHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TTAITLVSSYFFSYLVFVIVLSVLLLINSYSLFRIAGGFKKY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA