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The map label for this gene is nuoL [H]

Identifier: 71892256

GI number: 71892256

Start: 597800

End: 599686

Strand: Reverse

Name: nuoL [H]

Synonym: BPEN_499

Alternate gene names: 71892256

Gene position: 599686-597800 (Counterclockwise)

Preceding gene: 71892257

Following gene: 71892255

Centisome position: 75.75

GC content: 30.42

Gene sequence:

>1887_bases
ATGAATTTACTTTTTTTAACTATACTTTTCCCGTTATTAGGATTCATTACGTTAGCTATTTCTCAAGGAAAATGGTCAGA
AAATACTTCTTCTATAATAGGAGTAGGCACGATAAGTGCATCAGCGTTGGTTACTATATACATCATATTTAATTTTTATT
GTAATTTTAGTAATGATGTTAATTTTGTGTTTGTGCAGGAACTTTGGACCTGGTTTACTATTAATGCCTTATGTATTACT
GTAGCACTTAGATTAGATGGGTTATCCTTAATCATGTTATCAGTAATTATTGGTGTTGGGTTTATCATTCATTTATATGC
CACTTGGTATATGAGTGGATGCGAAGGATATTCTCGTTTTTTTGCTTACACTAATTTATTTATGGCAAATATGGTGCTTT
TAGTGCTTTCAGATAATTTGTTATTGATGTATTTTGGATGGGAAGGCGTAGGACTGTGTAGTTATTTATTAATTGGATTT
TACTATTCTGATGCTAAGAATGGAATAGCAGCTTTAAAAGCATTTATTATTACTCGTTCTGGGGACATATGTTTGGTGTG
TGCGTTATTCATGATTTATGATCAATATCATACCTTGAGTTTTAGTAAATTACTAACGTTGGAACTAAAATGTTCATCAT
GTCATATTTTTAATGATATCACATGGATATCTTTTATGTTACTTATTGGAGCAATAGGTAAATCAGCTCAGTTACCCTTA
CAAAATTGGTTAACCAGTGCTATGGTTGGTCCAACCCCAGTGTCTGCATTGATTCACGCAGCTACTATGGTTACTTCTGG
GGTGTATTTAATAATTCGTATGAATAATTTTTTTTTAATGACTCCAAGTATTTTATACTTGACCGGTATTATTGGTTCAT
TAACTGTGATTTTATTTAGTTGTTCAGCGTTATTTCAAAGCAATATTAAAAAAATTTTAGCATATTCTACTATAAGTCAA
ATAGGATATATGTTTTTAGCACTCGGAGGCCGACATTGGGATGCAGCTATGTTTCATTTAGTAACACATGCTTTTTTTAA
AGCGTTGTTGTTTTTATCTGCAGGTTCATTAATCTACTCTTGTAGATATGAACAAAATATTTTTAAGATGGGAGGGTTAT
ATAAATTTATACCTTTAATTTACATTTGTTTTTTAATAGGTGGGGCATCTTTATCTGGAGTACCTATAATTACTGCTGGA
TTTTATTCAAAAGAAATGATCATGTTAAAAACATTAGCTAATCATGATTATTTTTTCTTGTTATCTGGAGTAATAGGAAT
GTTTTTAACACCTATTTATACGTTCCGAATGATTTTTGTTGTGTTTCATGGTGAGAAAAAAATAGAGCCACGTGTATGTA
ATAAAATCACTCAAAATTTACCTTTAATCTTATTGTTATTGTTATCGACGTTTATTGGTGGGTGGATCAAATTACCTTTG
TTAACAGATACTATAATTACTAACGTTAGTGAGGTGTATAATTATGGGCAAATATATCTTGAAATAATATCGGGACTTTT
AGTAACGTTCGGTATTTGGTTGGCGTCAATTTTTTGGATGGACTCTTCGAGCAGGATTACAGGAGAGATTATTAGACCTC
GTGTAACAGAAGTAATAGAACGATACATAGTATTGTTATGTTATTATGGATGGGGATTTGATTGGCTTTACAAATTGATA
TTTATAAAGCCATATTTATTTATAACAAAAAAATTATCTTATTCTGATCCAGTTGATGTAATCGTGAATGTTATCGTATC
GTTATTATGTTGGCTTAAGAATGGTTTGATATGTAGTGAAAATGGTAAGCTTAATTGGTATATAGTATCGATGAATATAG
GGGCAATTATGATATTAATCATGATATTAATTTATGATCGTCTGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTTATCTGCTTCTGAATCTGCAGTTTCTTTAGCATTATTACTTCAATTATATCGTCGTTATCATACATTGCATATTGAT
AATATTAGTGAGATGCGTGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATCAGTGTAATATTATTGGTATACAATATAAGGAAATATAAATATTTAATGTATGTGTTTTAGCGAGAAAAACAAAAAAT
AATATGTTATTAATTATCTT

Product: NADH dehydrogenase I chain L, membrane subunit

Products: NA

Alternate protein names: NADH dehydrogenase I subunit L; NDH-1 subunit L; NUO12 [H]

Number of amino acids: Translated: 628; Mature: 628

Protein sequence:

>628_residues
MNLLFLTILFPLLGFITLAISQGKWSENTSSIIGVGTISASALVTIYIIFNFYCNFSNDVNFVFVQELWTWFTINALCIT
VALRLDGLSLIMLSVIIGVGFIIHLYATWYMSGCEGYSRFFAYTNLFMANMVLLVLSDNLLLMYFGWEGVGLCSYLLIGF
YYSDAKNGIAALKAFIITRSGDICLVCALFMIYDQYHTLSFSKLLTLELKCSSCHIFNDITWISFMLLIGAIGKSAQLPL
QNWLTSAMVGPTPVSALIHAATMVTSGVYLIIRMNNFFLMTPSILYLTGIIGSLTVILFSCSALFQSNIKKILAYSTISQ
IGYMFLALGGRHWDAAMFHLVTHAFFKALLFLSAGSLIYSCRYEQNIFKMGGLYKFIPLIYICFLIGGASLSGVPIITAG
FYSKEMIMLKTLANHDYFFLLSGVIGMFLTPIYTFRMIFVVFHGEKKIEPRVCNKITQNLPLILLLLLSTFIGGWIKLPL
LTDTIITNVSEVYNYGQIYLEIISGLLVTFGIWLASIFWMDSSSRITGEIIRPRVTEVIERYIVLLCYYGWGFDWLYKLI
FIKPYLFITKKLSYSDPVDVIVNVIVSLLCWLKNGLICSENGKLNWYIVSMNIGAIMILIMILIYDRL

Sequences:

>Translated_628_residues
MNLLFLTILFPLLGFITLAISQGKWSENTSSIIGVGTISASALVTIYIIFNFYCNFSNDVNFVFVQELWTWFTINALCIT
VALRLDGLSLIMLSVIIGVGFIIHLYATWYMSGCEGYSRFFAYTNLFMANMVLLVLSDNLLLMYFGWEGVGLCSYLLIGF
YYSDAKNGIAALKAFIITRSGDICLVCALFMIYDQYHTLSFSKLLTLELKCSSCHIFNDITWISFMLLIGAIGKSAQLPL
QNWLTSAMVGPTPVSALIHAATMVTSGVYLIIRMNNFFLMTPSILYLTGIIGSLTVILFSCSALFQSNIKKILAYSTISQ
IGYMFLALGGRHWDAAMFHLVTHAFFKALLFLSAGSLIYSCRYEQNIFKMGGLYKFIPLIYICFLIGGASLSGVPIITAG
FYSKEMIMLKTLANHDYFFLLSGVIGMFLTPIYTFRMIFVVFHGEKKIEPRVCNKITQNLPLILLLLLSTFIGGWIKLPL
LTDTIITNVSEVYNYGQIYLEIISGLLVTFGIWLASIFWMDSSSRITGEIIRPRVTEVIERYIVLLCYYGWGFDWLYKLI
FIKPYLFITKKLSYSDPVDVIVNVIVSLLCWLKNGLICSENGKLNWYIVSMNIGAIMILIMILIYDRL
>Mature_628_residues
MNLLFLTILFPLLGFITLAISQGKWSENTSSIIGVGTISASALVTIYIIFNFYCNFSNDVNFVFVQELWTWFTINALCIT
VALRLDGLSLIMLSVIIGVGFIIHLYATWYMSGCEGYSRFFAYTNLFMANMVLLVLSDNLLLMYFGWEGVGLCSYLLIGF
YYSDAKNGIAALKAFIITRSGDICLVCALFMIYDQYHTLSFSKLLTLELKCSSCHIFNDITWISFMLLIGAIGKSAQLPL
QNWLTSAMVGPTPVSALIHAATMVTSGVYLIIRMNNFFLMTPSILYLTGIIGSLTVILFSCSALFQSNIKKILAYSTISQ
IGYMFLALGGRHWDAAMFHLVTHAFFKALLFLSAGSLIYSCRYEQNIFKMGGLYKFIPLIYICFLIGGASLSGVPIITAG
FYSKEMIMLKTLANHDYFFLLSGVIGMFLTPIYTFRMIFVVFHGEKKIEPRVCNKITQNLPLILLLLLSTFIGGWIKLPL
LTDTIITNVSEVYNYGQIYLEIISGLLVTFGIWLASIFWMDSSSRITGEIIRPRVTEVIERYIVLLCYYGWGFDWLYKLI
FIKPYLFITKKLSYSDPVDVIVNVIVSLLCWLKNGLICSENGKLNWYIVSMNIGAIMILIMILIYDRL

Specific function: NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain. The immediate electron acceptor for the enzyme in this species is believed to be ubiquinone. Couples the redox reaction to proton translocat

COG id: COG1009

COG function: function code CP; NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the complex I subunit 5 family [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI251831117, Length=399, Percent_Identity=37.593984962406, Blast_Score=239, Evalue=5e-63,
Organism=Escherichia coli, GI1788614, Length=614, Percent_Identity=53.5830618892508, Blast_Score=662, Evalue=0.0,
Organism=Escherichia coli, GI1788829, Length=449, Percent_Identity=30.9576837416481, Blast_Score=161, Evalue=1e-40,
Organism=Escherichia coli, GI1788827, Length=343, Percent_Identity=30.0291545189504, Blast_Score=106, Evalue=4e-24,
Organism=Escherichia coli, GI1788831, Length=392, Percent_Identity=27.5510204081633, Blast_Score=86, Evalue=9e-18,
Organism=Escherichia coli, GI1788613, Length=412, Percent_Identity=23.7864077669903, Blast_Score=82, Evalue=1e-16,
Organism=Escherichia coli, GI2367154, Length=319, Percent_Identity=27.5862068965517, Blast_Score=74, Evalue=4e-14,
Organism=Escherichia coli, GI145693160, Length=398, Percent_Identity=23.1155778894472, Blast_Score=72, Evalue=1e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001750
- InterPro:   IPR001516
- InterPro:   IPR003945
- InterPro:   IPR018393 [H]

Pfam domain/function: PF00361 Oxidored_q1; PF00662 Oxidored_q1_N [H]

EC number: =1.6.99.5 [H]

Molecular weight: Translated: 70914; Mature: 70914

Theoretical pI: Translated: 8.24; Mature: 8.24

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.4 %Cys     (Translated Protein)
3.7 %Met     (Translated Protein)
6.1 %Cys+Met (Translated Protein)
2.4 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
6.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNLLFLTILFPLLGFITLAISQGKWSENTSSIIGVGTISASALVTIYIIFNFYCNFSNDV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
NFVFVQELWTWFTINALCITVALRLDGLSLIMLSVIIGVGFIIHLYATWYMSGCEGYSRF
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
FAYTNLFMANMVLLVLSDNLLLMYFGWEGVGLCSYLLIGFYYSDAKNGIAALKAFIITRS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCC
GDICLVCALFMIYDQYHTLSFSKLLTLELKCSSCHIFNDITWISFMLLIGAIGKSAQLPL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHEEEEEEEECCEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
QNWLTSAMVGPTPVSALIHAATMVTSGVYLIIRMNNFFLMTPSILYLTGIIGSLTVILFS
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CSALFQSNIKKILAYSTISQIGYMFLALGGRHWDAAMFHLVTHAFFKALLFLSAGSLIYS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE
CRYEQNIFKMGGLYKFIPLIYICFLIGGASLSGVPIITAGFYSKEMIMLKTLANHDYFFL
EEHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCHHHH
LSGVIGMFLTPIYTFRMIFVVFHGEKKIEPRVCNKITQNLPLILLLLLSTFIGGWIKLPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCEEEHHH
LTDTIITNVSEVYNYGQIYLEIISGLLVTFGIWLASIFWMDSSSRITGEIIRPRVTEVIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHH
RYIVLLCYYGWGFDWLYKLIFIKPYLFITKKLSYSDPVDVIVNVIVSLLCWLKNGLICSE
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECC
NGKLNWYIVSMNIGAIMILIMILIYDRL
CCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNLLFLTILFPLLGFITLAISQGKWSENTSSIIGVGTISASALVTIYIIFNFYCNFSNDV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
NFVFVQELWTWFTINALCITVALRLDGLSLIMLSVIIGVGFIIHLYATWYMSGCEGYSRF
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
FAYTNLFMANMVLLVLSDNLLLMYFGWEGVGLCSYLLIGFYYSDAKNGIAALKAFIITRS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCC
GDICLVCALFMIYDQYHTLSFSKLLTLELKCSSCHIFNDITWISFMLLIGAIGKSAQLPL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHEEEEEEEECCEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
QNWLTSAMVGPTPVSALIHAATMVTSGVYLIIRMNNFFLMTPSILYLTGIIGSLTVILFS
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CSALFQSNIKKILAYSTISQIGYMFLALGGRHWDAAMFHLVTHAFFKALLFLSAGSLIYS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE
CRYEQNIFKMGGLYKFIPLIYICFLIGGASLSGVPIITAGFYSKEMIMLKTLANHDYFFL
EEHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCHHHH
LSGVIGMFLTPIYTFRMIFVVFHGEKKIEPRVCNKITQNLPLILLLLLSTFIGGWIKLPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCEEEHHH
LTDTIITNVSEVYNYGQIYLEIISGLLVTFGIWLASIFWMDSSSRITGEIIRPRVTEVIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHH
RYIVLLCYYGWGFDWLYKLIFIKPYLFITKKLSYSDPVDVIVNVIVSLLCWLKNGLICSE
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECC
NGKLNWYIVSMNIGAIMILIMILIYDRL
CCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7690854; 9205837; 9278503 [H]