Definition Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome.
Accession NC_006360
Length 892,758

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The map label for this gene is 54020495

Identifier: 54020495

GI number: 54020495

Start: 500902

End: 502794

Strand: Reverse

Name: 54020495

Synonym: mhp423

Alternate gene names: NA

Gene position: 502794-500902 (Counterclockwise)

Preceding gene: 54020496

Following gene: 54020494

Centisome position: 56.32

GC content: 26.15

Gene sequence:

>1893_bases
ATGAAAAAAATTAATTTTTCCCACTATTTTCGTTTACATACAAGACAAAAGTATTTCATCTGAAACAATTTAGATTCTAA
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TTGTGATATTATATTTAACCCATGTTTCGAATATAAAGATGCCGTAGCTCATTCTTCTGTATTTTTTGTATTTAATAAAA
AAATAAGCATCCTAAAATTATCAACTTCAACAAAAATTAAAGACTATTTAGCCGCAAATTGAAATTTTTGAATTACAACT
TATGCGCTTCGTGGATTTGGAAATGATCTTAATCCAATTGAAGAAGTTTCTTATTTTTTAATTGATACAGTTGAGAATCC
AAGAAAAAATCAAACTGAATTTTGTGAAACATTATGAGTTTCAACTAACAAGGGTGTCAAGTCAGTTTCAAAAGTAGATC
GTGAAGGTCCTTATTATTTTTTTGCAAAAAAAATCGCTAAACAAAACGGCCTTACACTTTTAGAGTTTAATAATCCTTAT
TTTCTTGAACAAAATCGTCTTGTTAAAAATCTTCTTAGAAACACAGTTAGTAGAAATTCACCAAAGCAGCCTAAAAAAAC
CAGAAAAATTATCAAAATGATTCCAATAATTGATGCTTTATCCGAAATCAAAGAGGCTAAAAACATAAAAACTTTTAGTC
CACCACAGATTTCTGATAATGGGAATTTTGAAAAAAATCCTGATTTTAATATGCTAATGACAAAATTTTATCCTCAACTT
GCAAATATTAGTGGTACCCTTTTAAAAGCAAAAGATGCTTTATCACTAATCGAAGACGAAGAAAAATTACTAACGCTTGA
AAAAAATTCTTTTTGATTTAATTTTTTTCAAGAAAATAATAGCATTATTATTAATCAAATTGAGGAATTAAAAAAATTTT
TACTAAATTTATATGCGAAAAAAATTGTCTGGTATGATTTTGAAGCTTTTTCCCTTCCATTTCCGCCAATTGATTATGTC
CAACCCTTTCAGCAAATTGTTTCCCAGGTTTCGATAGTTTTAACTAATAGAGGCCAAATTTTGAATCAAAATTTTTCAGA
TAGAAATCTTGTTTTTGATCCAAAAAATTATACTTGAGAAAATTTTTTCCTTATAATTGATAAAATTTATCATAAACATG
CCGATTTTTATGTGGTTTTTAATAAATCTTATGAACTCACTAGACTAAAAGAAATGCTTGAGATAATTTTCAAAAATTAT
CTTGAAAGACTTCCATATCATAAAGCAAAACAAAAATTAGAAGAATATGAGTTAAAAGTAGCTGAAATTATTAAAAAAAC
GATTGATTTAAAAGACCCTTTTGCGAAATATTGACTAGTAATCTCGGATCTTAAGGGCTGTTATTCAATTAAAAAAATTG
AAAATTTTATCACAAAATATAAATATAACCTTAAAAGATTAATAATCCCTTATAAACAATTAGCAATAAAAAACGGACTT
GAGGCGATGATCGAATCAATTGATCGTTATTTTAATTTTATTGGTGATAATCAGTGGGAAATAACAAGGAAAAATTTGCA
AATTTATTGCCAAAATGATGTAATTGCAATGATTATGGTCTGAGATTTTCTCAAATTTATTTATAAAAATGCAAATAATG
CGTCTAATATTAAGGTAATCAAACCCCAAAAAGTTACACTTTTTGAGAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGTAGTCGATTCACCAAATATTTTAAAAATTAAGCATTCGGTTTTAGAAAAAAAATTAGAAATTGATACATAATTTTTT
AAAATATTTGGTAGATCTAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGCTAAAAAAGTAACTTAATTAGTTTTTAGTTCGAGTAAATAATCCCTACCTTTTTTAGTAATCCTCCGACCACGCGAGG
TTTTCTCGATTAATTCCTTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 630; Mature: 630

Protein sequence:

>630_residues
MKKINFSHYFRLHTRQKYFIWNNLDSNFPENPDFDEENFENTVWNFEALSENPTDFSELHINIFKNFTTEFHTFIKKKYP
EKKICIVYPAEVEKKIAQTISFYKSGNCDIIFNPCFEYKDAVAHSSVFFVFNKKISILKLSTSTKIKDYLAANWNFWITT
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QPFQQIVSQVSIVLTNRGQILNQNFSDRNLVFDPKNYTWENFFLIIDKIYHKHADFYVVFNKSYELTRLKEMLEIIFKNY
LERLPYHKAKQKLEEYELKVAEIIKKTIDLKDPFAKYWLVISDLKGCYSIKKIENFITKYKYNLKRLIIPYKQLAIKNGL
EAMIESIDRYFNFIGDNQWEITRKNLQIYCQNDVIAMIMVWDFLKFIYKNANNASNIKVIKPQKVTLFEN

Sequences:

>Translated_630_residues
MKKINFSHYFRLHTRQKYFI*NNLDSNFPENPDFDEENFENTV*NFEALSENPTDFSELHINIFKNFTTEFHTFIKKKYP
EKKICIVYPAEVEKKIAQTISFYKSGNCDIIFNPCFEYKDAVAHSSVFFVFNKKISILKLSTSTKIKDYLAAN*NF*ITT
YALRGFGNDLNPIEEVSYFLIDTVENPRKNQTEFCETL*VSTNKGVKSVSKVDREGPYYFFAKKIAKQNGLTLLEFNNPY
FLEQNRLVKNLLRNTVSRNSPKQPKKTRKIIKMIPIIDALSEIKEAKNIKTFSPPQISDNGNFEKNPDFNMLMTKFYPQL
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QPFQQIVSQVSIVLTNRGQILNQNFSDRNLVFDPKNYT*ENFFLIIDKIYHKHADFYVVFNKSYELTRLKEMLEIIFKNY
LERLPYHKAKQKLEEYELKVAEIIKKTIDLKDPFAKY*LVISDLKGCYSIKKIENFITKYKYNLKRLIIPYKQLAIKNGL
EAMIESIDRYFNFIGDNQWEITRKNLQIYCQNDVIAMIMV*DFLKFIYKNANNASNIKVIKPQKVTLFEN
>Mature_630_residues
MKKINFSHYFRLHTRQKYFI*NNLDSNFPENPDFDEENFENTV*NFEALSENPTDFSELHINIFKNFTTEFHTFIKKKYP
EKKICIVYPAEVEKKIAQTISFYKSGNCDIIFNPCFEYKDAVAHSSVFFVFNKKISILKLSTSTKIKDYLAAN*NF*ITT
YALRGFGNDLNPIEEVSYFLIDTVENPRKNQTEFCETL*VSTNKGVKSVSKVDREGPYYFFAKKIAKQNGLTLLEFNNPY
FLEQNRLVKNLLRNTVSRNSPKQPKKTRKIIKMIPIIDALSEIKEAKNIKTFSPPQISDNGNFEKNPDFNMLMTKFYPQL
ANISGTLLKAKDALSLIEDEEKLLTLEKNSF*FNFFQENNSIIINQIEELKKFLLNLYAKKIVWYDFEAFSLPFPPIDYV
QPFQQIVSQVSIVLTNRGQILNQNFSDRNLVFDPKNYT*ENFFLIIDKIYHKHADFYVVFNKSYELTRLKEMLEIIFKNY
LERLPYHKAKQKLEEYELKVAEIIKKTIDLKDPFAKY*LVISDLKGCYSIKKIENFITKYKYNLKRLIIPYKQLAIKNGL
EAMIESIDRYFNFIGDNQWEITRKNLQIYCQNDVIAMIMV*DFLKFIYKNANNASNIKVIKPQKVTLFEN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To M.genitalium MG366 and M.pneumoniae MPN544 [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR021301 [H]

Pfam domain/function: PF11074 DUF2779 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 73044; Mature: 73044

Theoretical pI: Translated: 9.45; Mature: 9.45

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKINFSHYFRLHTRQKYFINNLDSNFPENPDFDEENFENTVNFEALSENPTDFSELHIN
CCCCCCHHEEEEECCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHH
IFKNFTTEFHTFIKKKYPEKKICIVYPAEVEKKIAQTISFYKSGNCDIIFNPCFEYKDAV
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHH
AHSSVFFVFNKKISILKLSTSTKIKDYLAANNFITTYALRGFGNDLNPIEEVSYFLIDTV
HCCCEEEEEECCEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCC
ENPRKNQTEFCETLVSTNKGVKSVSKVDREGPYYFFAKKIAKQNGLTLLEFNNPYFLEQN
CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHCCCCEEEEECCCEEECHH
RLVKNLLRNTVSRNSPKQPKKTRKIIKMIPIIDALSEIKEAKNIKTFSPPQISDNGNFEK
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC
NPDFNMLMTKFYPQLANISGTLLKAKDALSLIEDEEKLLTLEKNSFFNFFQENNSIIINQ
CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHCCCCEEEHH
IEELKKFLLNLYAKKIVWYDFEAFSLPFPPIDYVQPFQQIVSQVSIVLTNRGQILNQNFS
HHHHHHHHHHHHHHHHEEEECHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHCCCCCC
DRNLVFDPKNYTENFFLIIDKIYHKHADFYVVFNKSYELTRLKEMLEIIFKNYLERLPYH
CCCEEECCCCCCCCCEEEHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
KAKQKLEEYELKVAEIIKKTIDLKDPFAKYLVISDLKGCYSIKKIENFITKYKYNLKRLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPYKQLAIKNGLEAMIESIDRYFNFIGDNQWEITRKNLQIYCQNDVIAMIMVDFLKFIYK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH
NANNASNIKVIKPQKVTLFEN
CCCCCCCEEEECCCEEEEECC
>Mature Secondary Structure
MKKINFSHYFRLHTRQKYFINNLDSNFPENPDFDEENFENTVNFEALSENPTDFSELHIN
CCCCCCHHEEEEECCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHH
IFKNFTTEFHTFIKKKYPEKKICIVYPAEVEKKIAQTISFYKSGNCDIIFNPCFEYKDAV
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHH
AHSSVFFVFNKKISILKLSTSTKIKDYLAANNFITTYALRGFGNDLNPIEEVSYFLIDTV
HCCCEEEEEECCEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCC
ENPRKNQTEFCETLVSTNKGVKSVSKVDREGPYYFFAKKIAKQNGLTLLEFNNPYFLEQN
CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHCCCCEEEEECCCEEECHH
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IEELKKFLLNLYAKKIVWYDFEAFSLPFPPIDYVQPFQQIVSQVSIVLTNRGQILNQNFS
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DRNLVFDPKNYTENFFLIIDKIYHKHADFYVVFNKSYELTRLKEMLEIIFKNYLERLPYH
CCCEEECCCCCCCCCEEEHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
KAKQKLEEYELKVAEIIKKTIDLKDPFAKYLVISDLKGCYSIKKIENFITKYKYNLKRLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPYKQLAIKNGLEAMIESIDRYFNFIGDNQWEITRKNLQIYCQNDVIAMIMVDFLKFIYK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH
NANNASNIKVIKPQKVTLFEN
CCCCCCCEEEECCCEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11048724 [H]