| Definition | Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006360 |
| Length | 892,758 |
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The map label for this gene is potE
Identifier: 54020440
GI number: 54020440
Start: 345860
End: 347209
Strand: Reverse
Name: potE
Synonym: mhp300
Alternate gene names: NA
Gene position: 347209-345860 (Counterclockwise)
Preceding gene: 54020441
Following gene: 54020439
Centisome position: 38.89
GC content: 28.07
Gene sequence:
>1350_bases ATGTCTCAAAAAAAATCAAAAAATTTTCTAACTGAGAGGCAATTTATTTTTTATGGGCTTAATTACATCGTTGGATTTGG CTTTATTGCTACAATTTCAAATGTAATTAGTCAAGGTGTTTGAGGGATTTTAGTTTTTATTCTAACTTCGTTGATTACTC TAGCCGTAATTTTTGCTTTTGCAAGAGCAGGAAACAAATACCAATCTGAAGTTGGTGGATCATATGCATATGCCAAAAAA ACCTTCAAAAAAGAGATGGTATTCTTTCAAGGTTGGAATCAAATAAGTCAAATTATCCTTTTTTCAGGAACAACACCCTT ATTTTTTTCAAATCTATTAACATCTTTTGATCCTGAAAGAAAATGAATTTATGTTGCTATTTCTTTAGTAATTTATATTG GTCTTATTTTAACTAGTGCTTTTGGTTTTCGTCTTTCAAAGTGATTTGTATTTACAACTGCAATTTTTAAATGGCTAACT TTAGTAATTGGTTTTGGTTTAATTATTTACTTAATTAGCGAGTCAAAAAGTTATGGTCAAACTTTTAAAACAATTGCGCC TTTTAGTGTTTTGAGTCTTTCCGGGTCAGTTTTATCTTTTATTTATTCTTATGGCGGTTTTGAATCATTAGCGACAATTT CAAAGAATATCGAGACAAAAAGGTTCAAAAAGTTGATAATTTTAATCTTTTTAATCGTAATTTCTAGTTATTTTATTTTT TATATTATATTTTTAGGATTAGGACCAGAATATTTAGCAAACTTTGGACTTGAAGGGGTTTATAAAGCGCTTTGAGGTTC AGCAGGCACATCCCTTTTTACAATTGGGCTTACTTTTAATAGGATGTCAGGAGCATTTTCTTATGTCCAACCGCAAGCAA GATTTATTTCCCCTCTTGCAGAAGATGGTTTTTTACCTGCATTTTTAGCCAAAAAAAATAAATATAATGAGTATCAAAAT GCAATTTATTTAGTAGTTGTTGTTGCAATTTTTTCAAGTTTAGTTTTTACAATTATTCCGGAAATTCTTAGGATAGAAAA TTCTTTTAATACAATTTTAGCAGCCGGTAATATTTCATTTTTAGTCCAATATTTACTTACTATTTTTACAGTTTTGCTTT GAAAATGACGTAAAAATGAGAATATTCCAGTTTGGGAAATCATAATTTATATTTTAGGTATGTTAACCATTTTATTTACA CTTATTTTTTCTCAACTACCTTTTATTAGTAGTTCGAAAGAAGTGACTTTTGAACAATTTATCCCCATAATTAGTTATGC TTTTGCGATTTTAATTGGGTATATTGTTAAGTTTTCCGTTCAACTAACTAAAAAAAAGAAAAAAATATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CAAATTTTATTACCCTACAAAAAAAGTTTTTTATTTATGATAATATGGTATAATTTTAAAATTCTAACAAATTAAAATCT TTTAGGATAATAAGAACAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAGTAGTTAATTTTTTACTTATTTAATAAATGTTTATTATAGTTTTTCTAATTTTATGTTTTTATTTTAAAAATACCA GAAAAAAGTAAATTTTTTCC
Product: amino acid permease
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 449; Mature: 448
Protein sequence:
>449_residues MSQKKSKNFLTERQFIFYGLNYIVGFGFIATISNVISQGVWGILVFILTSLITLAVIFAFARAGNKYQSEVGGSYAYAKK TFKKEMVFFQGWNQISQIILFSGTTPLFFSNLLTSFDPERKWIYVAISLVIYIGLILTSAFGFRLSKWFVFTTAIFKWLT LVIGFGLIIYLISESKSYGQTFKTIAPFSVLSLSGSVLSFIYSYGGFESLATISKNIETKRFKKLIILIFLIVISSYFIF YIIFLGLGPEYLANFGLEGVYKALWGSAGTSLFTIGLTFNRMSGAFSYVQPQARFISPLAEDGFLPAFLAKKNKYNEYQN AIYLVVVVAIFSSLVFTIIPEILRIENSFNTILAAGNISFLVQYLLTIFTVLLWKWRKNENIPVWEIIIYILGMLTILFT LIFSQLPFISSSKEVTFEQFIPIISYAFAILIGYIVKFSVQLTKKKKKI
Sequences:
>Translated_449_residues MSQKKSKNFLTERQFIFYGLNYIVGFGFIATISNVISQGV*GILVFILTSLITLAVIFAFARAGNKYQSEVGGSYAYAKK TFKKEMVFFQGWNQISQIILFSGTTPLFFSNLLTSFDPERK*IYVAISLVIYIGLILTSAFGFRLSK*FVFTTAIFKWLT LVIGFGLIIYLISESKSYGQTFKTIAPFSVLSLSGSVLSFIYSYGGFESLATISKNIETKRFKKLIILIFLIVISSYFIF YIIFLGLGPEYLANFGLEGVYKAL*GSAGTSLFTIGLTFNRMSGAFSYVQPQARFISPLAEDGFLPAFLAKKNKYNEYQN AIYLVVVVAIFSSLVFTIIPEILRIENSFNTILAAGNISFLVQYLLTIFTVLL*K*RKNENIPVWEIIIYILGMLTILFT LIFSQLPFISSSKEVTFEQFIPIISYAFAILIGYIVKFSVQLTKKKKKI >Mature_448_residues SQKKSKNFLTERQFIFYGLNYIVGFGFIATISNVISQGV*GILVFILTSLITLAVIFAFARAGNKYQSEVGGSYAYAKKT FKKEMVFFQGWNQISQIILFSGTTPLFFSNLLTSFDPERK*IYVAISLVIYIGLILTSAFGFRLSK*FVFTTAIFKWLTL VIGFGLIIYLISESKSYGQTFKTIAPFSVLSLSGSVLSFIYSYGGFESLATISKNIETKRFKKLIILIFLIVISSYFIFY IIFLGLGPEYLANFGLEGVYKAL*GSAGTSLFTIGLTFNRMSGAFSYVQPQARFISPLAEDGFLPAFLAKKNKYNEYQNA IYLVVVVAIFSSLVFTIIPEILRIENSFNTILAAGNISFLVQYLLTIFTVLL*K*RKNENIPVWEIIIYILGMLTILFTL IFSQLPFISSSKEVTFEQFIPIISYAFAILIGYIVKFSVQLTKKKKKI
Specific function: Unknown
COG id: COG0531
COG function: function code E; Amino acid transporters
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To M.genitalium MG226 [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004841 - InterPro: IPR002293 [H]
Pfam domain/function: PF00324 AA_permease [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 49749; Mature: 49618
Theoretical pI: Translated: 10.21; Mature: 10.21
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 0.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 0.7 %Met (Mature Protein) 0.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSQKKSKNFLTERQFIFYGLNYIVGFGFIATISNVISQGVGILVFILTSLITLAVIFAFA CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RAGNKYQSEVGGSYAYAKKTFKKEMVFFQGWNQISQIILFSGTTPLFFSNLLTSFDPERK HCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCH IYVAISLVIYIGLILTSAFGFRLSKFVFTTAIFKWLTLVIGFGLIIYLISESKSYGQTFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH TIAPFSVLSLSGSVLSFIYSYGGFESLATISKNIETKRFKKLIILIFLIVISSYFIFYII HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLGLGPEYLANFGLEGVYKALGSAGTSLFTIGLTFNRMSGAFSYVQPQARFISPLAEDGF HHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHCHHHHHCCHHHHHCHHHCCCC LPAFLAKKNKYNEYQNAIYLVVVVAIFSSLVFTIIPEILRIENSFNTILAAGNISFLVQY CHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEECCCHHHHHHH LLTIFTVLLKRKNENIPVWEIIIYILGMLTILFTLIFSQLPFISSSKEVTFEQFIPIISY HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH AFAILIGYIVKFSVQLTKKKKKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure SQKKSKNFLTERQFIFYGLNYIVGFGFIATISNVISQGVGILVFILTSLITLAVIFAFA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RAGNKYQSEVGGSYAYAKKTFKKEMVFFQGWNQISQIILFSGTTPLFFSNLLTSFDPERK HCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCH IYVAISLVIYIGLILTSAFGFRLSKFVFTTAIFKWLTLVIGFGLIIYLISESKSYGQTFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH TIAPFSVLSLSGSVLSFIYSYGGFESLATISKNIETKRFKKLIILIFLIVISSYFIFYII HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLGLGPEYLANFGLEGVYKALGSAGTSLFTIGLTFNRMSGAFSYVQPQARFISPLAEDGF HHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHCHHHHHCCHHHHHCHHHCCCC LPAFLAKKNKYNEYQNAIYLVVVVAIFSSLVFTIIPEILRIENSFNTILAAGNISFLVQY CHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEECCCHHHHHHH LLTIFTVLLKRKNENIPVWEIIIYILGMLTILFTLIFSQLPFISSSKEVTFEQFIPIISY HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH AFAILIGYIVKFSVQLTKKKKKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8948633 [H]